gene_id gene_type chromosome position strand clusternumber search_method unique_on_genome ltag_abundance stag_abundance TAG TAG.Num DIFF.P Ratio COUNT_E15_S.COUNT_E15_C.COUNT_E15ant.COUNT_E15_P.TAG.per.100000 COUNT_PN1.TAG.per.100000 COUNT_E15_S.COUNT_E15_C.COUNT_E15ant.COUNT_E15_P.TAG.count COUNT_PN1.TAG.count tagatatagg 1 7.963543028088e-28 0.135714285714286 38 280 50 97 tgaccccggg 2 7.286151837737e-14 5.95 238 40 311 14 NM_144513 refGene chr12 105137821 + 31142 graph_last l 111 313 agcttggcct 3 3.37192269542358e-12 0.0256410256410256 2 78 3 27 NM_011655 refGene chr17 35502124 - 58992 graph_last 171 1959 gcaggcactc 4 1.15275417824715e-11 2.72 408 150 533 52 NM_010838 refGene chr11 103995793 + 24313 graph_last l 32 165 atttctttgg 5 3.17946239385732e-10 0.130841121495327 14 107 18 37 NM_008220 refGene chr7 95961219 - 123777 graph_last 166 1031 tggatcctga 6 6.80511060983659e-10 8.58823529411765 146 17 191 6 cgtctgtgga 7 7.18665446742096e-10 0.22 33 150 43 52 tgtataaaaa 8 9.64672456189217e-10 0.217687074829932 32 147 42 51 cccttcttct 9 3.22898547880598e-09 12.8888888888889 116 9 152 3 NM_144513 refGene chr12 105132566 + 31142 graph_last l 163 355 agagcaaatg 10 6.3846190148023e-09 0.08 6 75 8 26 NM_022029 refGene chr9 38324022 - 136533 graph_last l 730 1545 cagctctgcc 11 8.00557088480313e-09 0.0192307692307692 1 52 1 18 agagcgaagt 12 1.22417092083027e-08 0.376923076923077 98 260 128 90 NM_022029 refGene chr9 38323531 - 136533 graph_last l 147 488 ttaccatact 13 1.27194205758658e-08 0.0363636363636364 2 55 2 19 cctttaatcc 14 4.25245373956545e-08 0.44478527607362 145 326 189 113 NM_008538 refGene chr10 38260031 + 11621 graph_last l 7 148 aactcctaag 15 1.17877700166711e-07 0.231404958677686 28 121 36 42 NM_009721 refGene chr1 167488231 + 7965 graph_last l 226 760 ttctagcata 16 1.97273763575261e-07 0.090909090909091 6 66 8 23 tctggacgcg 17 3.43332117107496e-07 Inf 71 0 93 0 agcagcccct 18 3.92790672869565e-06 0 0 35 0 12 ggcaagcccc 19 3.93321346681171e-06 3.03125 194 64 253 22 ctgcctgccc 20 4.38771953224921e-06 0.319727891156463 47 147 62 51 gcccgggaat 21 4.65317107154001e-06 2.82666666666667 212 75 277 26 NM_025285 refGene chr3 8633892 + 82940 graph_last l 93 328 ggtgatgatg 22 4.65317107154001e-06 0.28099173553719 34 121 44 42 ttgggccaga 23 4.65317107154001e-06 0.301470588235294 41 136 54 47 NM_144513 refGene chr12 105134045 + 31142 graph_last l 76 231 atcctaggtc 24 7.37979580238488e-06 0.090909090909091 5 55 7 19 NM_007589 refGene chr7 13970316 - 119114 graph_last l 222 685 atccgcaccc 25 1.24729259713817e-05 0.222222222222222 20 90 26 31 tctctctgtt 26 1.31943279528203e-05 0 0 32 0 11 ggtgagcctg 27 1.95014262609182e-05 7.33333333333333 88 12 115 4 agagtaatca 28 2.35123265378785e-05 0.166666666666667 11 66 14 23 NM_009468 refGene chr18 43989922 - 64437 graph_last 0 158 tatgatggac 29 8.37271282098612e-05 0.389937106918239 62 159 81 55 tgtatgtctt 30 9.35020447633929e-05 0.145454545454545 8 55 10 19 atcctggtaa 31 0.000120503675400092 0.134615384615385 7 52 9 18 ccttgctcaa 32 0.000120503675400092 0.208333333333333 15 72 20 25 cgccgccggc 33 0.000120503675400092 2.56 192 75 251 26 tcaataaagc 34 0.000173105641825924 0.217391304347826 15 69 19 24 ttgactttat 35 0.000173105641825924 0.318181818181818 35 110 46 38 gaaaatgaga 36 0.000228349734982117 Inf 47 0 62 0 AK084468 all_mrna chr5_random 7786726 - 109151 graph_last 0 188 gcactgttaa 37 0.000228349734982117 6 84 14 110 5 gtgctgaata 38 0.000228349734982117 Inf 47 0 61 0 cactgttgag 39 0.000232002169848211 0.212121212121212 14 66 18 23 NM_134094 refGene chr15 38057343 + 46351 graph_last l 115 228 ccctgggagc 40 0.000442609658971387 0.0625 2 32 2 11 NM_009234 refGene chr12 21785186 + 26716 graph_last 1 124 tggaggctcc 41 0.000486337180797267 7.44444444444444 67 9 88 3 ttcaaagagt 42 0.000486337180797267 0.19672131147541 12 61 16 21 NM_016891 refGene chr17 20487724 + 57555 graph_last l 94 407 ttttttgtgt 43 0.000486337180797267 0.253333333333333 19 75 25 26 NM_053071 refGene chr15 36415651 - 46234 graph_last l 399 1119 aatatgtgtg 44 0.000628983214295223 0.372881355932203 44 118 57 41 AF063095 knownGene chr12 87316486 - 30295 graph_last 12 93 cagacctcaa 45 0.000891585927769244 0.152173913043478 7 46 9 16 atggggttgg 46 0.00122597601023101 0.0857142857142857 3 35 4 12 NM_007930 refGene chr13 95527347 + 37152 graph_last l 190 375 tctgtatgtt 47 0.00138854603755869 0.229508196721311 14 61 18 21 NM_010315 refGene chr14 14746598 + 39376 graph_last l 7 37 cctttattct 48 0.00139751786514499 0.0625 2 32 3 11 NM_010838 refGene chr11 103992080 + 24313 graph_last l 123 477 gagagaagag 49 0.00142359288559744 0.41726618705036 58 139 76 48 gtggctcaca 50 0.00193398658011266 1.30854605993341 1179 901 1540 312 NM_016916 refGene chr2 158187789 + 80890 graph_last l 40 812 gggggagtgg 51 0.0024167779226861 1.70792079207921 345 202 451 70 NM_008302 refGene chr17 44965211 - 59486 graph_last 291 729 gtgagcccat 52 0.00271308947244693 3.57692307692308 93 26 122 9 tatttgcaaa 53 0.00271308947244693 15.6666666666667 47 3 62 1 AK051587 all_mrna chr3 121887645 + 88723 graph_second 0 86 ctctctcttg 54 0.00287731468030097 0.114285714285714 4 35 5 12 NM_018871 refGene chr5 134736729 - 107744 graph_last l 168 546 aatgtgagtc 55 0.00302066914984732 0.321428571428571 27 84 35 29 CF585278 all_est chr12 33782179 + 27240 graph_last 7 36 gagaaactga 56 0.00319252334747228 0 0 20 0 7 tatgtcacct 57 0.00319252334747228 0.15 6 40 8 14 gaacattgca 58 0.00347658932829035 0.09375 3 32 4 11 tactcattat 59 0.00347658932829035 0.204081632653061 10 49 13 17 BY657720 all_est chr6 8185411 - 110250 graph_last 0 102 ctgcctctgt 60 0.00426791253993137 8.83333333333333 53 6 69 2 NM_008696 refGene chr1 40712852 - 1780 graph_last l 7 38 ctagaagcag 61 0.00430161685831112 0.131578947368421 5 38 7 13 gcccccctct 62 0.00430161685831112 0.333333333333333 28 84 37 29 attttcagtt 63 0.00778565967766428 14 42 3 55 1 tagagactgc 64 0.00778565967766428 14 42 3 55 1 ggaagccact 65 0.00778911210748973 2.55102040816327 125 49 163 17 NM_175692 refGene chr2 159011790 + 80939 graph_last l 664 956 ccttaccgct 66 0.00802961644554073 0.125 4 32 5 11 NM_009238 refGene chr13 28837064 - 33570 graph_last 3 219 acaggcacga 67 0.00861589756550573 3.17241379310345 92 29 120 10 aaaaaaaaaa 68 0.00928614760310584 0.668235294117647 284 425 371 147 ccagtcctgg 69 0.0119316546536568 0.296875 19 64 25 22 ctccctcagg 70 0.0119316546536568 0 0 17 0 6 NM_010097 refGene chr5 103193388 - 105359 graph_last l 851 1707 ctgaggaagt 71 0.0119316546536568 0.209302325581395 9 43 12 15 NM_016843 refGene chr15 87130916 + 49033 graph_last l 13 32 tgaacggggc 72 0.0119316546536568 0 0 17 0 6 NM_026775 refGene chr12 81330718 - 29849 graph_last l 12 58 tgggatttat 73 0.0119316546536568 0 0 17 0 6 agactatgca 74 0.0125762206238673 0.0769230769230769 2 26 3 9 gcttttgtta 75 0.0125762206238673 0.0769230769230769 2 26 3 9 BC059845 all_mrna chr4_random 163545 + 99872 graph_last 59 175 agggccactg 76 0.0140944087192630 0.269230769230769 14 52 18 18 tgcccagtgc 77 0.0140944087192630 0.269230769230769 14 52 18 18 gtaagcaaaa 78 0.0141132636909866 3.23076923076923 84 26 110 9 NM_026769 refGene chr7 131959952 - 125952 graph_last l 32 121 cacactgcct 79 0.0144439998453064 0.0869565217391304 2 23 2 8 tttattgact 80 0.0149197503405596 0.05 1 20 1 7 aaaacagtgg 81 0.0167127599390615 0.489208633093525 68 139 89 48 aagaaaaaaa 82 0.0167127599390615 Inf 31 0 41 0 cccacaagct 83 0.0167127599390615 Inf 31 0 41 0 NM_009234 refGene chr12 21786977 + 26716 graph_last 1 196 gtgagtgttt 84 0.0173333471495418 4.75 57 12 75 4 aatttcccct 85 0.0177630399016656 0.232558139534884 10 43 13 15 NM_025482 refGene chr2 181400858 + 82485 graph_last l 34 183 cctctgtttg 86 0.0195926359026398 0.265306122448980 13 49 17 17 NM_026203 refGene chr10 21915572 + 10852 graph_last l 26 102 accctgctgt 87 0.020046963590966 0.137931034482759 4 29 5 10 ttttattttg 88 0.020046963590966 0.137931034482759 4 29 5 10 NM_017367 refGene chr5 94551679 - 104851 graph_last 131 360 tactgctgat 89 0.0213594003343543 7.33333333333333 44 6 58 2 taattttttt 90 0.0229239729965126 0.210526315789474 8 38 10 13 caaaaaaaaa 91 0.0236853264310543 Inf 30 0 39 0 NM_030082 refGene chr11 58547188 + 20275 graph_last l 16 79 ccgtgtccga 92 0.0236853264310543 Inf 30 0 39 0 NM_010498 refGene chrX 59947051 - 149023 graph_last 136 330 ttatggatct 93 0.0251999467510299 0.225 9 40 12 14 NM_144513 refGene chr12 105139339 + 31142 graph_last l 161 243 ctaagtaaaa 94 0.0265780913738859 0.115384615384615 3 26 4 9 ttctgggtag 95 0.0267779543719127 0.15625 5 32 7 11 aagaggcaag 96 0.0320502212865453 3.30434782608696 76 23 99 8 NM_028044 refGene chr3 124872028 + 88810 graph_last l 44 155 caggtttggg 97 0.0333878035706946 Inf 28 0 36 0 NM_007636 refGene chr10 120033751 - 16078 graph_last l 83 199 ggtctaattt 98 0.0333878035706946 Inf 28 0 36 0 NM_009829 refGene chr6 129062135 - 117072 graph_last l 3 63 cgctactccg 99 0.0337038508763339 Inf 28 0 37 0 NM_007874 refGene chr18 34560614 - 63762 graph_last l 64 151 gcttaagtgt 100 0.0337038508763339 0.0869565217391304 2 23 3 8 NM_018799 refGene chr4 128521019 + 97495 graph_last l 28 66 tctatctcag 101 0.0337038508763339 0.0869565217391304 2 23 3 8 NM_009441 refGene chr16 96203958 + 56249 graph_last l 67 224 ttttgagtga 102 0.0337038508763339 0.375 27 72 35 25 gtagtggaag 103 0.0353702920884321 0.210526315789474 8 38 11 13 NM_007467 refGene chr7 24336416 - 119935 graph_last l 177 495 gctatgagaa 104 0.0362325039368877 0.327586206896552 19 58 25 20 NM_025282 refGene chr13 81768319 + 36483 graph_last l 3 17 atcacattat 105 0.0363337878831649 0 0 14 0 5 cagaacccac 106 0.0363337878831649 3.76470588235294 64 17 84 6 ccttctgcct 107 0.0363337878831649 0 0 14 0 5 genomic chr19_random 15495638 + 0 unique_long l 1 7 gaggggcaag 108 0.0363337878831649 0 0 14 0 5 NM_146072 refGene chr16 89234221 - 55766 graph_last 2 10 gatagaggga 109 0.0363337878831649 0 0 14 0 5 NM_008060 refGene chr19 9056013 + 67898 graph_last l 3 11 gcagtgtact 110 0.0363337878831649 0 0 14 0 5 ggggttttat 111 0.0363337878831649 0 0 14 0 5 NM_019634 refGene chrX 9144283 + 147217 graph_last l 833 1167 tattaataaa 112 0.0363337878831649 0 0 14 0 5 NM_008113 refGene chr17 25793383 - 57991 graph_last l 42 84 tctgccagga 113 0.0363337878831649 0 0 14 0 5 tggattcatt 114 0.0363337878831649 0 0 14 0 5 BF472943 all_est chr1 38108441 - 1588 graph_last l 30 61 tgtgaggctc 115 0.0363337878831649 0 0 14 0 5 NM_007883 refGene chr18 20972896 + 63182 graph_last 140 717 aattcgcgga 116 0.0371124620794158 0.1 2 20 2 7 aggaaggcgg 117 0.0371124620794158 2.09375 134 64 175 22 NM_024186 refGene chr13 89915066 + 36756 graph_last l 2 19 catccggtca 118 0.0371124620794158 0.1 2 20 2 7 CA316586 all_est chr6 30663917 + 111294 graph_last l 20 85 gactcagtgg 119 0.0371124620794158 0.1 2 20 2 7 tgggttgtct 120 0.0386240350068143 1.51082251082251 349 231 456 80 aaatcctttc 121 0.040551536095525 0.359375 23 64 30 22 NM_009946 refGene chr13 54167181 + 35031 graph_last l 243 540 atgacaaaga 122 0.040551536095525 0.307692307692308 16 52 21 18 NM_011634 refGene chr9 110584487 + 141318 graph_last l 146 323 cctgtgggtc 123 0.040551536095525 0.1875 6 32 8 11 NM_008634 refGene chr13 97869372 + 37324 graph_last 0 16 atcaggagtg 124 0.0405663226434786 0.0588235294117647 1 17 1 6 AB071988 knownGene chr13 55851603 - 35223 graph_last l 10 91 cggtgtcccc 125 0.0415455369961636 Inf 26 0 34 0 gtggcacaca 126 0.042989163562721 Inf 27 0 35 0 NM_026081 refGene chrX 124376325 + 151508 graph_last l 100 223 acacttgttg 127 0.043893000890879 0.153846153846154 4 26 5 9 NM_007874 refGene chr18 34562364 - 63762 graph_last l 6 73 ctagggacag 128 0.043893000890879 0.153846153846154 4 26 5 9 gaaactaggt 129 0.043893000890879 0.153846153846154 4 26 5 9 NM_009389 refGene chr9 63768355 + 138375 graph_last b 8 40 tcgtcgtgcc 130 0.043893000890879 0.153846153846154 4 26 5 9 genomic chr9 22636872 - 0 unique_long l 9 119 acagtctatg 131 0.0442129555801992 0.327272727272727 18 55 24 19 tctgctaaag 132 0.0491694786008697 6.66666666666667 40 6 52 2 gtctgctgat 133 0.0558347474063877 2.30434782608696 106 46 139 16 gccttccaat 134 0.0571424726818499 2.65625 85 32 111 11 gccaagggtc 135 0.0575707264175842 2.72413793103448 79 29 103 10 atggctcaca 136 0.0596840829584341 Inf 24 0 32 0 M22432 knownGene chr9 81062019 - 139726 graph_last 4 62 caagtttgct 137 0.0596840829584341 Inf 24 0 32 0 NM_010487 refGene chr9 22639791 - 135759 graph_last l 26 97 ggatggctta 138 0.0596840829584341 Inf 24 0 32 0 NM_021391 refGene chr15 105855287 - 50401 graph_second l 59 182 gacactggat 139 0.0603286000302763 0.130434782608696 3 23 4 8 aagagtcttt 140 0.063227625502443 0.21875 7 32 9 11 aaaaaattga 141 0.0682220359640777 0.228571428571429 8 35 11 12 NM_010925 refGene chr10 80555240 - 13897 graph_last l 9 108 acctgcatct 142 0.0696079729452397 0.263157894736842 10 38 13 13 cctcctccag 143 0.0696079729452397 0.263157894736842 10 38 13 13 NM_008538 refGene chr10 38262710 - 11621 graph_last l 20 206 ggtgcccagt 144 0.0774327978827095 2.95652173913043 68 23 89 8 genomic chr10 95618767 + 0 unique_long l 44 105 tattaatatt 145 0.0801280010436228 0.192307692307692 5 26 6 9 NM_021477 refGene chr16 6894748 + 51276 graph_last l 15 66 ggtcttcctg 146 0.0802667549186286 0.1 2 20 3 7 AK030708 knownGene chr10 86847504 - 14428 graph_last l 5 42 tacccttgcc 147 0.0802667549186286 0.1 2 20 3 7 NM_025548 refGene chr7 24142854 - 119914 graph_last 20 67 tatgtaggac 148 0.0802667549186286 0.1 2 20 3 7 tgttaagaag 149 0.0802667549186286 0.1 2 20 3 7 NM_175162 refGene chr8 47049163 - 129791 graph_last 25 63 ttgtatatgt 150 0.0802667549186286 0.1 2 20 3 7 NM_145602 refGene chr8 96998185 + 132612 graph_last l 379 925 ccgccccttt 151 0.0909689663877535 0.206896551724138 6 29 8 10 NM_025735 refGene chr2 155903051 + 80638 graph_last l 170 382 ttcgggttgc 152 0.0909689663877535 0.206896551724138 6 29 8 10 gcctgtggtg 153 0.0952778461431475 0.379310344827586 22 58 29 20 tcttctcaca 154 0.0983462367727708 0.464285714285714 39 84 51 29 NM_178923 refGene chr16 91567074 + 55890 graph_last l 160 354 agaaacaaga 155 0.0987204266452904 0.289473684210526 11 38 14 13 NM_019699 refGene chr19 9946997 - 67959 graph_last l 31 182 agccaagaga 156 0.0987204266452904 0.289473684210526 11 38 14 13 NM_011520 refGene chr4 129500658 + 97598 graph_last b 57 223 ggcgctcgta 157 0.0987204266452904 0.289473684210526 11 38 14 13 ttatgaaatg 158 0.0987204266452904 0.257142857142857 9 35 12 12 aaattggagg 159 0.0991527499344243 0.117647058823529 2 17 2 6 CA316586 all_est chr6 30663632 + 111294 graph_last l 19 56 agaggagctg 160 0.0991527499344243 0.117647058823529 2 17 2 6 NM_007422 refGene chr1 181698653 - 8873 graph_last l 15 50 ccctcatccc 161 0.0991527499344243 0.117647058823529 2 17 2 6 NM_197988 refGene chr8 122517560 + 133997 graph_last 0 1074 ctaataaaag 162 0.0991527499344243 0.40625 26 64 34 22 NM_008745 refGene chr13 58919793 + 35397 graph_last l 24 60 ctgaagcccg 163 0.0991527499344243 0.117647058823529 2 17 2 6 NM_025363 refGene chr6 38635518 + 111893 graph_last l 23 88 gcaagggtga 164 0.0991527499344243 0.117647058823529 2 17 2 6 NM_010630 refGene chr15 78198019 + 48169 graph_last l 55 159 gtgacagagg 165 0.0991527499344243 0.117647058823529 2 17 2 6 NM_020252 refGene chr17 90850761 - 62103 graph_last l 25 76 taatgtgttg 166 0.0991527499344243 0.117647058823529 2 17 2 6 genomic chr9 69502315 - 0 unique_long l 14 46 tccagaaaat 167 0.0991527499344243 0.117647058823529 2 17 2 6 NM_009197 refGene chrX 93603418 - 150551 graph_last 2 14 aaacacagga 168 0.100353866080912 0 0 12 0 4 aaccgcgaat 169 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_053207 refGene chr8 126716435 - 134382 graph_second 6 13 aagtacagcc 170 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_023122 refGene chrX 154411423 - 152747 graph_last l 2 8 aatatacata 171 0.100353866080912 0 0 12 0 4 AI839905 all_est chrX 145838622 - 152391 graph_last l 12 31 acagtgcatt 172 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_018815 refGene chr6 92559047 + 114978 graph_last 0 8 agaaggaggg 173 0.100353866080912 0.0714285714285714 1 14 1 5 NM_007471 refGene chr16 86207432 - 55668 graph_last l 378 1097 atagctttct 174 0.100353866080912 0.381818181818182 21 55 27 19 NM_025740 refGene chr11 29119939 - 18514 graph_last l 19 106 atgagtctgt 175 0.100353866080912 0.173913043478261 4 23 5 8 cactttactt 176 0.100353866080912 0.0714285714285714 1 14 1 5 NM_016801 refGene chr5 133879181 + 107651 graph_last l 99 156 cagcgggagc 177 0.100353866080912 0.0714285714285714 1 14 1 5 cgcaacttgg 178 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_175012 refGene chr18 66101013 + 65570 graph_last b 6 16 cgcggctcgg 179 0.100353866080912 0 0 12 0 4 cgctggttcc 180 0.100353866080912 2.23255813953488 96 43 126 15 ctgcagcggc 181 0.100353866080912 0.0714285714285714 1 14 1 5 NM_153566 refGene chr4 123811833 + 97083 graph_last l 12 28 ctggatacta 182 0.100353866080912 0.0714285714285714 1 14 1 5 NM_011670 refGene chr5_random 2620508 + 109059 graph_last 5 44 ctgggccgtg 183 0.100353866080912 0.0714285714285714 1 14 1 5 NM_010311 refGene chr10 77157835 + 13630 graph_last l 10 32 gaactccccg 184 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_022997 refGene chr8 86197927 + 131907 graph_last l 4 20 gacattagat 185 0.100353866080912 0.0714285714285714 1 14 1 5 genomic chr5 134694843 + 0 unique_long l 5 12 gcaagaatag 186 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_172903 refGene chr7 72777515 - 122423 graph_last 0 64 gcaagtttga 187 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_018763 refGene chr9 97829313 - 140418 graph_last l 27 73 gccgtgctgg 188 0.100353866080912 0 0 12 0 4 genomic chr8 55036394 - 0 unique_long l 4 11 gctacctttc 189 0.100353866080912 0 0 12 0 4 gctccctcat 190 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_026481 refGene chr8 106976878 - 132961 graph_last l 26 72 gctgactctt 191 0.100353866080912 0 0 12 0 4 gcttttattt 192 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_019686 refGene chr9 56661323 - 137777 graph_last l 8 24 gtatcactta 193 0.100353866080912 0.0714285714285714 1 14 1 5 NM_009303 refGene chr15 81497528 + 48510 graph_last l 53 134 taagcaagag 194 0.100353866080912 0 0 12 0 4 taatatttaa 195 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_021896 refGene chr3 83927215 - 86252 graph_last l 18 75 tacggttcct 196 0.100353866080912 0.0714285714285714 1 14 1 5 NM_144892 refGene chr2 165613083 + 81339 graph_last l 78 141 tccatccagg 197 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_153545 refGene chr11 120276827 + 25607 graph_last l 50 74 tcccaggaaa 198 0.100353866080912 0.0714285714285714 1 14 1 5 NM_028207 refGene chr11 101637639 - 24017 graph_second 0 9 tccgtgggtg 199 0.100353866080912 0 0 12 0 4 AK085367 knownGene chr8 119157008 - 133821 graph_last l 14 28 tcttagttct 200 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_012010 refGene chrX 83950642 + 149980 graph_last 1 7 tgaaagtggt 201 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_173419 refGene chr14 53435335 - 41872 graph_last l 6 13 tgattttgag 202 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_133791 refGene chr8 47689575 - 129872 graph_last l 3 19 tgcccggtgt 203 0.100353866080912 0.0714285714285714 1 14 1 5 ttatttttag 204 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_052994 refGene chr10 62021810 + 12772 graph_last l 39 80 ttttagtaag 205 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_145614 refGene chr9 52671516 - 137570 graph_last l 5 37 ttttcagtgt 206 0.100353866080912 0 0 12 0 4 NM_175153 refGene chr9 67378684 + 138630 graph_last 1 19 tttttaaatg 207 0.100353866080912 0.0714285714285714 1 14 1 5 gaggctcaca 208 0.102192114415796 Inf 22 0 29 0 NM_009238 refGene chr13 28840468 - 33570 graph_second 0 27 gctgactacc 209 0.102192114415796 Inf 22 0 29 0 NM_013457 refGene chr5 33179806 + 101907 graph_last l 7 78 aaatatcgtt 210 0.102684218474361 0.192307692307692 5 26 7 9 AK080973 knownGene chr4 74397681 - 94336 graph_last l 26 94 gagtctcttc 211 0.102684218474361 0.192307692307692 5 26 7 9 tagggcaatc 212 0.102684218474361 3 60 20 79 7 tggatcagtc 213 0.103124977761016 1.82716049382716 148 81 193 28 NM_009308 refGene chr18 31774468 + 63593 graph_last l 12 50 gaacctgtgg 214 0.110580197911868 0.241379310344828 7 29 9 10 NM_009306 refGene chr10 111014393 - 15693 graph_last l 312 716 gacactcaat 215 0.110580197911868 0.241379310344828 7 29 9 10 NM_145385 refGene chr6 126864632 + 116927 graph_last l 150 428 gtcctataag 216 0.111675478399840 0.3 12 40 16 14 NM_019675 refGene chr14 58090309 + 42274 graph_last l 25 323 accaatgaaa 217 0.111717470081757 0.285714285714286 10 35 13 12 NM_153112 refGene chr7_random 1489652 - 126499 graph_last 117 251 tttgcacggt 218 0.111717470081757 0.285714285714286 10 35 13 12 NM_153782 refGene chr11 109333175 + 24799 graph_last l 138 265 ctagcttaca 219 0.112059537671476 0.25 8 32 11 11 NM_029570 refGene chr3 36808028 + 84223 graph_last l 7 37 cttcaacctg 220 0.122371492147257 0.15 3 20 4 7 gcctatccaa 221 0.122371492147257 0.15 3 20 4 7 NM_017469 refGene chr3 83866801 - 86251 graph_last l 59 125 ttaattgtgt 222 0.122371492147257 0.15 3 20 4 7 NM_009238 refGene chr13 28836829 - 33570 graph_last l 4 199 ccagctaatc 223 0.127890677613749 2.65384615384615 69 26 90 9 NM_008252 refGene chr8 57226066 + 130275 graph_last 5 83 tctgcaaagg 224 0.127890677613749 3.66666666666667 44 12 58 4 aacaatttgg 225 0.130053385639033 1.93442622950820 118 61 154 21 NM_008065 refGene chr16 86134860 + 55647 graph_last 65 333 aattagttgt 226 0.133251914749107 0.413793103448276 24 58 31 20 NM_008143 refGene chr11 48425607 - 19538 graph_last l 36 169 gctgcagttg 227 0.14281668706965 5.66666666666667 34 6 44 2 tgaaataaac 228 0.14281668706965 5.5 33 6 43 2 acagtgggga 229 0.142986587322214 Inf 20 0 26 0 ctgagcaaca 230 0.142986587322214 Inf 20 0 26 0 NM_008687 refGene chr4 80902645 - 94453 graph_last 3 55 tgcttgaaca 231 0.142986587322214 Inf 20 0 26 0 gattccgtga 232 0.143167532839269 1.71739130434783 158 92 207 32 NM_010267 refGene chr1 17332941 + 648 graph_last l 33 76 cagagtgtct 233 0.143470940039929 0.217391304347826 5 23 6 8 NM_009696 refGene chr7 16662924 - 119339 graph_last l 338 1356 catcgccagt 234 0.143470940039929 0.217391304347826 5 23 6 8 NM_026023 refGene chr11 40360087 + 19152 graph_last 2 83 gaaaaatatt 235 0.143470940039929 0.217391304347826 5 23 6 8 gccaagtgga 236 0.143470940039929 1.63716814159292 185 113 242 39 gggtaggggt 237 0.143470940039929 0.217391304347826 5 23 6 8 acatcataga 238 0.144118204845327 0.466666666666667 35 75 46 26 NM_025974 refGene chr9 122956983 + 142184 graph_last l 115 326 aaggcaaaga 239 0.144428115165644 0.381818181818182 21 55 28 19 tcttctaatc 240 0.156461088752704 0.230769230769231 6 26 8 9 NM_080433 refGene chr14 7678509 - 39040 graph_last l 4 52 acagcgtggg 241 0.157205240899142 9.33333333333333 28 3 36 1 gaggagggtg 242 0.157205240899142 9.33333333333333 28 3 36 1 ctgcatcgtt 243 0.162674286704273 0.387755102040816 19 49 25 17 NM_008729 refGene chr15 31786949 - 46004 graph_last l 24 59 gtcactcaac 244 0.164332359954591 0.117647058823529 2 17 3 6 NM_010698 refGene chr5 43614163 + 102391 graph_last l 19 63 taaagacaca 245 0.164332359954591 0.117647058823529 2 17 3 6 AK045826 knownGene chr19 6623406 + 67692 graph_last l 75 119 tacaagtacc 246 0.164332359954591 0.117647058823529 2 17 3 6 ttacagaaat 247 0.164332359954591 0.117647058823529 2 17 3 6 NM_013876 refGene chr4 108313676 - 96057 graph_last l 24 76 tttaaattgt 248 0.164332359954591 0.117647058823529 2 17 3 6 NM_007478 refGene chr15_random 24126540 + 50902 graph_last 209 358 tttaataact 249 0.164332359954591 0.117647058823529 2 17 3 6 NM_016774 refGene chr10 131366044 + 16755 graph_last l 1223 2180 caggccacac 250 0.168092935590321 2.28571428571429 80 35 104 12 ggatggggag 251 0.171676264258206 2.9 58 20 76 7 agaaggaggt 252 0.178517358844246 0.675324675324675 156 231 204 80 NM_009238 refGene chr13 28838650 - 33570 graph_last l 6 142 gggacctcgt 253 0.179684162802785 2.34375 75 32 98 11 NM_024212 refGene chr9 66553115 + 138568 graph_second 0 828 tggtgacaaa 254 0.179684162802785 2.34375 75 32 98 11 NM_178060 refGene chr11 98352551 + 23676 graph_last l 413 1055 tctgtagccc 255 0.187175686004918 0.598591549295775 85 142 111 49 NM_174851 refGene chr4 134484958 + 98075 graph_last 0 118 cctggaattt 256 0.187717701346231 5.16666666666667 31 6 41 2 NM_008683 refGene chr14 46790213 - 41409 graph_last l 42 362 tgtgcttccc 257 0.187717701346231 5.16666666666667 31 6 41 2 gtggctcata 258 0.187896676931413 5.33333333333333 32 6 42 2 Z36397 all_est chr15_random 6842715 - 50572 graph_last l 180 379 tggacaagct 259 0.197379272319731 0.522222222222222 47 90 62 31 NM_011655 refGene chr17 35502360 - 58992 graph_last s 3 35 aacgacctcg 260 0.197610996294065 Inf 19 0 25 0 NM_130863 refGene chr19_random 15495020 - 71388 graph_last l 31 106 accccttgtg 261 0.197610996294065 0.2 4 20 5 7 NM_011650 refGene chr1 120849495 - 5532 graph_last l 16 72 agcattggcg 262 0.197610996294065 Inf 19 0 25 0 NM_021273 refGene chr12 107236798 - 31356 graph_last 21 68 ccggcccaga 263 0.197610996294065 Inf 19 0 25 0 cctgaatgac 264 0.197610996294065 0.2 4 20 5 7 ctgccccaca 265 0.197610996294065 Inf 18 0 24 0 gtagctcaca 266 0.197610996294065 Inf 19 0 25 0 gtgactcaca 267 0.197610996294065 Inf 19 0 25 0 gtgccatatt 268 0.197610996294065 Inf 18 0 24 0 gtggcttaca 269 0.197610996294065 Inf 18 0 24 0 CA316586 all_est chr6 30666721 + 111294 graph_last l 30 123 tacttacaag 270 0.197610996294065 0.2 4 20 5 7 NM_009861 refGene chr4 136101390 - 98237 graph_last l 29 75 tatctgctta 271 0.197610996294065 0.2 4 20 5 7 atactgaagc 272 0.197835733866918 0.557692307692308 58 104 76 36 aaataaaaca 273 0.204883882623105 0.142857142857143 2 14 2 5 NM_016698 refGene chr5 114291683 - 106212 graph_last l 30 80 aaattggaca 274 0.204883882623105 0.275862068965517 8 29 11 10 acacagaaac 275 0.204883882623105 0.217391304347826 5 23 7 8 NM_177681 refGene chr5 142074881 + 108282 graph_last 0 15 acgacagaag 276 0.204883882623105 0.142857142857143 2 14 2 5 NM_008634 refGene chr13 97870964 + 37324 graph_last 20 91 acttcaatat 277 0.204883882623105 0.275862068965517 8 29 11 10 NM_144846 refGene chr15 65243265 - 47497 graph_last l 13 52 agaaaagtat 278 0.204883882623105 0.142857142857143 2 14 2 5 ataatggata 279 0.204883882623105 4.22222222222222 38 9 49 3 cacagctctg 280 0.204883882623105 0.142857142857143 2 14 2 5 genomic chr12 95770479 - 0 unique_long l 21 70 caggattcct 281 0.204883882623105 0.142857142857143 2 14 2 5 caggcccttg 282 0.204883882623105 0.142857142857143 2 14 2 5 NM_010828 refGene chr10 18446012 + 10611 graph_last s 1 20 cccgcctcgg 283 0.204883882623105 0.142857142857143 2 14 2 5 NM_133195 refGene chr18 26103515 - 63468 graph_last l 109 272 cgcgctctct 284 0.204883882623105 0.217391304347826 5 23 7 8 NM_133348 refGene chr4 150384877 + 99558 graph_last l 102 304 gacaccagag 285 0.204883882623105 0.275862068965517 8 29 11 10 NM_015816 refGene chr8 70946927 + 130970 graph_last l 20 174 gcggctcacc 286 0.204883882623105 8.66666666666667 26 3 34 1 gtcacaccac 287 0.204883882623105 0.275862068965517 8 29 11 10 NM_023122 refGene chrX 154409033 + 152747 graph_last l 28 172 gttggctcct 288 0.204883882623105 0.217391304347826 5 23 7 8 NM_008687 refGene chr4 80897419 - 94453 graph_last l 8 69 taacaagcct 289 0.204883882623105 8.66666666666667 26 3 34 1 NM_010017 refGene chr9 110841045 - 141352 graph_last l 21 70 tagagaggag 290 0.204883882623105 0.142857142857143 2 14 2 5 NM_010837 refGene chr7 90820373 - 123299 graph_last l 2 16 tagtgctccc 291 0.204883882623105 0.142857142857143 2 14 2 5 ttcattctta 292 0.204883882623105 0.142857142857143 2 14 2 5 ttggctgccc 293 0.204883882623105 2.125 85 40 111 14 NM_023168 refGene chr15 77451239 + 48079 graph_last l 216 503 tttcaaggga 294 0.204883882623105 0.342105263157895 13 38 17 13 NM_173781 refGene chr9 105684751 + 140958 graph_last l 395 705 ttggtcaaac 295 0.207756732842828 0.269230769230769 7 26 9 9 BC009091 knownGene chr19_random 7285586 - 71199 graph_last 1 5 aaaaagactc 296 0.217772290268782 0 0 9 0 3 aaaaagggtt 297 0.217772290268782 0 0 9 0 3 BX514180 all_est chr10 44079063 - 11989 graph_last 0 3 aaatttaaag 298 0.217772290268782 0 0 9 0 3 AK122236 knownGene chr12 108304804 + 31448 graph_last 8 42 aaatttgttc 299 0.217772290268782 0 0 9 0 3 aacccagagc 300 0.217772290268782 0 0 9 0 3 aagaatgtag 301 0.217772290268782 0.176470588235294 3 17 4 6 aagagaaacc 302 0.217772290268782 0.176470588235294 3 17 4 6 NM_011701 refGene chr2 13583593 + 72102 graph_last l 20 170 aaggaagaga 303 0.217772290268782 8 24 3 31 1 genomic chr5 135975983 + 0 unique_long l 2 6 aaggcaagta 304 0.217772290268782 0 0 9 0 3 aatataagag 305 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_026729 refGene chr11 114916501 + 25076 graph_last l 7 62 aatcactggc 306 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_008740 refGene chr11 103485771 - 24251 graph_last l 67 132 aattaattta 307 0.217772290268782 0 0 9 0 3 aatttcttgg 308 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_013635 refGene chr12 27668053 + 26961 graph_last l 32 64 acaaagtgtc 309 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 acaacaataa 310 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_153595 refGene chr10 89036907 + 14566 graph_last 19 42 acaagatttt 311 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_013540 refGene chr3 82528196 - 86190 graph_last l 7 21 acactttctt 312 0.217772290268782 0.176470588235294 3 17 4 6 NM_009898 refGene chr7_random 46673618 + 127457 graph_last 17 51 acagtgccta 313 0.217772290268782 0.176470588235294 3 17 4 6 NM_010111 refGene chr8 8671201 - 127784 graph_last l 7 61 acagttaagc 314 0.217772290268782 8 24 3 32 1 actataacca 315 0.217772290268782 0 0 9 0 3 AK005167 knownGene chr7 24244951 + 119924 graph_last l 55 397 actcctgtcc 316 0.217772290268782 0.492753623188406 34 69 44 24 NM_024477 refGene chr5 110283855 + 105898 graph_last 0 111 agcctgtcag 317 0.217772290268782 8 24 3 32 1 agcttgcctt 318 0.217772290268782 0 0 9 0 3 AI854083 all_est chr6 36936378 - 111753 graph_last l 2 10 ataagcttga 319 0.217772290268782 0 0 9 0 3 ataggcaaaa 320 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 atgagaatgg 321 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 AU255304 all_est chr7 54329684 - 121521 graph_last l 4 14 atgtactctt 322 0.217772290268782 0 0 9 0 3 atgtctctgt 323 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 AK038042 knownGene chr11 115842027 - 25204 graph_last l 10 62 attcttaaaa 324 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 attgagaaca 325 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_173439 refGene chr16 31943821 - 52908 graph_last l 5 21 attgctgtat 326 0.217772290268782 0 0 9 0 3 genomic chr4 153978639 - 0 unique_long l 3 7 attgggtata 327 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_011522 refGene chr17 24278928 - 57816 graph_last l 31 63 attgtgtatt 328 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_145553 refGene chr4 131785171 + 97804 graph_last 0 20 atttaaaaaa 329 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_022410 refGene chr15 79105966 + 48274 graph_last l 8 30 atttgactgg 330 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_178119 refGene chr1 91822089 + 4551 graph_last l 4 21 attttacgtt 331 0.217772290268782 0 0 9 0 3 caaaacatac 332 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_026211 refGene chr13 55372901 + 35178 graph_last l 17 61 caaacgacta 333 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 AY255603 knownGene chr9 109276396 - 141189 graph_last l 7 21 caaaggtgct 334 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_010411 refGene chr18 38054458 - 64117 graph_last l 53 97 caaggtgaac 335 0.217772290268782 0.25 5 20 6 7 cactcctaag 336 0.217772290268782 0 0 9 0 3 genomic chr2 158569848 + 0 unique_long l 25 75 cagtcctccc 337 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_010864 refGene chr9 77758330 + 139524 graph_last l 8 16 catatattca 338 0.217772290268782 0 0 9 0 3 catccacaag 339 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_177581 refGene chr5_random 18880823 + 109360 graph_last l 3 10 cattaacctt 340 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_019978 refGene chr3 56887987 + 85071 graph_last l 4 11 ccaagttggc 341 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_010487 refGene chr9 22636685 - 135759 graph_last l 76 222 ccagaaaata 342 0.217772290268782 0.368421052631579 14 38 18 13 NM_177751 refGene chrX 145856339 - 152396 graph_last l 18 32 ccaggcttta 343 0.217772290268782 0 0 9 0 3 genomic chr2 131320194 - 0 unique_long l 14 62 ccatcagtgg 344 0.217772290268782 0.176470588235294 3 17 4 6 cccacaaagg 345 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_019831 refGene chrX 91306980 - 150325 graph_last l 22 69 cccacccttg 346 0.217772290268782 0.25 5 20 6 7 NM_145556 refGene chr4 146738309 + 99182 graph_last 0 5 cccctggaaa 347 0.217772290268782 0 0 9 0 3 genomic chr7 52539336 + 0 unique_long l 4 15 ccgcttggac 348 0.217772290268782 0 0 9 0 3 cctcactgga 349 0.217772290268782 0 0 9 0 3 cctgtctccc 350 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_020009 refGene chr4 146670510 + 99166 graph_last l 13 33 cggggccaca 351 0.217772290268782 0 0 9 0 3 ctagtctttg 352 0.217772290268782 0.708171206225681 182 257 238 89 ctcaataaat 353 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_011791 refGene chr8 24662200 - 128728 graph_last 0 14 ctcagacagc 354 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_008538 refGene chr10 38262715 + 11621 graph_last 0 25 ctggcttctt 355 0.217772290268782 0.176470588235294 3 17 4 6 NM_031404 refGene chr5 135974053 + 107867 graph_last l 15 82 gaacgcaagt 356 0.217772290268782 0.3125 10 32 13 11 AA073739 all_est chr19 8897935 + 67877 graph_last l 10 47 gaagccagcc 357 0.217772290268782 0 0 9 0 3 gactctggct 358 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_009238 refGene chr13 28838773 - 33570 graph_second 0 23 gagaaactcc 359 0.217772290268782 Inf 17 0 22 0 NM_029555 refGene chr6 42357963 + 112149 graph_second 0 12 gagcaaccag 360 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_145587 refGene chr7 118305075 - 125072 graph_second 0 22 gaggcttaga 361 0.217772290268782 Inf 17 0 22 0 NM_016863 refGene chr12 4873131 - 26045 graph_last l 4 18 gagggacttg 362 0.217772290268782 0 0 9 0 3 gagtttagag 363 0.217772290268782 0 0 9 0 3 gatgaacccc 364 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_009746 refGene chr7 119758378 - 125247 graph_last 1 8 gatttcgtat 365 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_025388 refGene chr1 174972698 - 8448 graph_last 53 122 gccctggggc 366 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_153413 refGene chr9 109513400 + 141212 graph_last 2 11 gcctgagcac 367 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_008142 refGene chr4 153670850 + 99772 graph_last 2 87 gcgactggaa 368 0.217772290268782 Inf 17 0 22 0 NM_022423 refGene chr11 58530943 - 20273 graph_last l 162 323 gctcagctta 369 0.217772290268782 0.418604651162791 18 43 23 15 AA896727 all_est chr3 54020885 + 84913 graph_last 1 31 gctccaagga 370 0.217772290268782 0 0 9 0 3 gctgggaggt 371 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_008985 refGene chr1 76797240 - 3697 graph_last l 126 226 ggaagcagac 372 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 ggaggtgtct 373 0.217772290268782 0 0 9 0 3 ggcctgaggc 374 0.217772290268782 Inf 18 0 23 0 AK045826 knownGene chr19 6624527 + 67692 graph_last l 87 261 ggctccctgc 375 0.217772290268782 0.3125 10 32 13 11 ggctgctctg 376 0.217772290268782 Inf 17 0 22 0 ggcttcggtc 377 0.217772290268782 1.49019607843137 228 153 298 53 gggaaactaa 378 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_008855 refGene chr7 114713807 + 124872 graph_last l 88 121 gtcactctag 379 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_028950 refGene chr2 14998028 - 72176 graph_last 0 6 gtgaagtcag 380 0.217772290268782 0 0 9 0 3 gtgacagttt 381 0.217772290268782 0 0 9 0 3 gtgacctggc 382 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_153166 refGene chr17 28788461 - 58335 graph_last l 11 32 gtgatagtga 383 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_145596 refGene chr8 70109811 + 130866 graph_last 0 5 gtggcacact 384 0.217772290268782 0 0 9 0 3 AI838513 all_est chr1 137208174 - 6402 graph_last l 8 29 gtgtggccct 385 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_175212 refGene chr15 59927760 + 47233 graph_last l 39 85 taaactgggt 386 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 taaataaaga 387 0.217772290268782 0.176470588235294 3 17 4 6 taaattggat 388 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_144811 refGene chr15 81177041 + 48470 graph_last 0 7 taataaagaa 389 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_019406 refGene chr2 31298595 - 73309 graph_last l 58 96 taattaaatg 390 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_028707 refGene chr18 36207883 - 63935 graph_last l 7 35 tactactgta 391 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_025402 refGene chr11 120775513 + 25666 graph_last l 37 68 tagagcttta 392 0.217772290268782 0 0 9 0 3 tatacctgta 393 0.217772290268782 0 0 9 0 3 tatatacata 394 0.217772290268782 0.25 5 20 6 7 NM_007458 refGene chr7 37839274 - 120756 graph_second l 21 44 tatctcttct 395 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_010022 refGene chr3 119882053 + 88622 graph_last l 11 18 tatctgtata 396 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_026892 refGene chr9 122879003 + 142179 graph_last l 94 428 tatgttgcgg 397 0.217772290268782 2.7 54 20 71 7 NM_025277 refGene chr4 58794403 + 93598 graph_last l 54 86 tcacacgtat 398 0.217772290268782 0 0 9 0 3 genomic chr7 14003225 + 0 unique_long l 92 241 tcactttgcc 399 0.217772290268782 0.176470588235294 3 17 4 6 tccgtgggtt 400 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_011352 refGene chr9 60247794 + 138104 graph_last l 7 42 tcctaactta 401 0.217772290268782 0.176470588235294 3 17 4 6 tcctgaaata 402 0.217772290268782 0.307692307692308 8 26 10 9 NM_011785 refGene chr1 180948039 + 8786 graph_last 0 3 tctaccttta 403 0.217772290268782 0 0 9 0 3 tctatttaca 404 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_026700 refGene chr16 95363360 + 56182 graph_last l 11 31 tctcccttaa 405 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_028475 refGene chr3 92414398 - 86875 graph_last l 4 13 tctgtcccat 406 0.217772290268782 0 0 9 0 3 tctttctttt 407 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 AK034177 knownGene chr6 139815698 - 117726 graph_last l 12 24 tgaacaactt 408 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_198033 refGene chr2 29451283 + 73116 graph_last l 4 22 tgaataatct 409 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 genomic chr1 184526032 - 0 unique_long l 6 82 tgaccttcct 410 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_011627 refGene chr9 88576767 + 140001 graph_last 0 6 tgagtgcagc 411 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_172787 refGene chr10 27146708 - 11123 graph_last l 6 32 tgatatgaat 412 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 tgcaagaccc 413 0.217772290268782 0 0 9 0 3 BE952224 all_est chr4 124070462 + 97121 graph_last l 9 21 tggataattt 414 0.217772290268782 0 0 9 0 3 tgggctcctc 415 0.217772290268782 0 0 9 0 3 tgggtgtccc 416 0.217772290268782 0.176470588235294 3 17 4 6 tgggttgtgg 417 0.217772290268782 0.307692307692308 8 26 10 9 NM_029541 refGene chrX 124607824 + 151527 graph_last 4 30 tgtaacttac 418 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_178220 refGene chr7 92038340 - 123429 graph_last l 30 70 tgtgaagggc 419 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_011026 refGene chr5 121977418 + 106813 graph_second 2 10 tgtgtaatcc 420 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 tgtgttgaga 421 0.217772290268782 Inf 17 0 22 0 AK012697 knownGene chr5 122772560 - 106898 graph_last l 9 27 ttaatcagga 422 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_152804 refGene chr13 109184589 + 38028 graph_last l 10 45 ttagagaagt 423 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_138587 refGene chr6 22172879 - 110818 graph_last l 5 13 ttatggcagt 424 0.217772290268782 0 0 9 0 3 ttatgggaat 425 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_173780 refGene chrX 141691790 + 152251 graph_last 1 7 ttctgtctga 426 0.217772290268782 0 0 9 0 3 BE993913 all_est chrX 84016517 - 149990 graph_second 1 1 ttgaatagat 427 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_011241 refGene chr15 83217970 - 48702 graph_last 71 146 ttgggcctac 428 0.217772290268782 0.25 5 20 6 7 NM_009782 refGene chr1 157842554 - 7363 graph_last l 34 121 ttggtcaggt 429 0.217772290268782 0.307692307692308 8 26 10 9 NM_025556 refGene chr8 14593612 - 128179 graph_last l 25 66 ttgttgtggt 430 0.217772290268782 0 0 9 0 3 tttaacaaaa 431 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_022982 refGene chr16 17757201 + 51997 graph_last l 46 68 tttacagggt 432 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 tttagtttta 433 0.217772290268782 0 0 9 0 3 tttataaaat 434 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_016759 refGene chr11 102067093 - 24069 graph_last l 37 69 tttgttatag 435 0.217772290268782 0 0 9 0 3 NM_025942 refGene chr2 73487585 - 75725 graph_last l 38 80 ttttacagta 436 0.217772290268782 0.176470588235294 3 17 4 6 BC034283 knownGene chr13 92446699 - 36949 graph_last l 19 55 ttttcagtgg 437 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 ttttctattt 438 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_172449 refGene chr11 87346169 + 22822 graph_last l 39 56 ttttcttcgc 439 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_177466 refGene chr6 86719540 - 114494 graph_last l 16 60 ttttgagcac 440 0.217772290268782 0.0833333333333333 1 12 1 4 NM_026438 refGene chr10 63563394 + 12886 graph_last l 34 146 tttactgtgt 441 0.221323542570078 0.260869565217391 6 23 8 8 cccacaaggt 442 0.229853578372926 2.47826086956522 57 23 74 8 gaaaatatcc 443 0.238818921236366 4.66666666666667 28 6 37 2 NM_177188 refGene chr15_random 18413017 + 50810 graph_last 267 3986 gctgccctag 444 0.247583488530087 1.15813953488372 1245 1075 1626 372 ccttgaaata 445 0.252445057335792 0.34375 11 32 14 11 tctacaagaa 446 0.252445057335792 0.568421052631579 54 95 71 33 NM_008687 refGene chr4 80898000 - 94453 graph_last l 3 81 gactgataaa 447 0.269690405410824 3.77777777777778 34 9 45 3 NM_033610 refGene chr13 54537749 - 35079 graph_last l 191 518 aataaagcca 448 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 NM_133926 refGene chr6 115093840 - 116120 graph_last 0 36 agaggggttg 449 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 aggaaatgag 450 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 atgataatgg 451 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 NM_009409 refGene chr14 11705194 + 39241 graph_last l 58 166 attgcagact 452 0.286334402117698 7.33333333333333 22 3 29 1 ccaagggtcc 453 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 NM_019408 refGene chr19 46501920 - 70198 graph_last l 130 184 cccctaattt 454 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 cctttaatct 455 0.286334402117698 Inf 15 0 20 0 cttacatttc 456 0.286334402117698 Inf 15 0 20 0 gacagtaata 457 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 gccaaggcct 458 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 AK009092 knownGene chr5 99751450 - 105140 graph_last 29 80 gccgtgtgct 459 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 NM_026222 refGene chr3 34770123 + 84139 graph_last 1 26 gtgattttcc 460 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 gtggttcaca 461 0.286334402117698 Inf 15 0 20 0 AK052736 knownGene chr8 79829375 + 131489 graph_second 0 32 tgtactgtat 462 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 tgttaagatg 463 0.286334402117698 Inf 15 0 20 0 NM_009990 refGene chr5 133317336 - 107613 graph_last l 20 94 ttcggacaat 464 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 NM_008500 refGene chr2 36354993 - 73731 graph_last l 6 28 ttgtgctttg 465 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 genomic chr17 26602950 + 0 unique_long l 61 112 tttaataaac 466 0.286334402117698 0.142857142857143 2 14 3 5 NM_008862 refGene chr3 7518293 + 82902 graph_last l 52 241 ctcacataac 467 0.287392660288081 0.425 17 40 22 14 NM_008302 refGene chr17 44962223 - 59486 graph_second 3 29 gaagaggtgg 468 0.287392660288081 Inf 16 0 21 0 gtggcgcaca 469 0.287392660288081 Inf 16 0 21 0 tcctcttccc 470 0.287392660288081 0.425 17 40 22 14 ttcattataa 471 0.28937103897798 1.734375 111 64 145 22 gtgaaactaa 472 0.299408751235057 1.65384615384615 129 78 168 27 NM_008248 refGene chr11 54495461 + 20041 graph_last l 74 348 tccttggggg 473 0.299667273319280 0.482758620689655 28 58 37 20 NM_023429 refGene chr5 73246806 - 103823 graph_last l 272 558 ttgagggggg 474 0.311928175973884 0.394736842105263 15 38 19 13 atttttcttt 475 0.313903691652446 0.310344827586207 9 29 12 10 NM_025848 refGene chr9 52633577 - 137561 graph_last l 30 85 aagctcgaaa 476 0.314606693353192 0.235294117647059 4 17 5 6 NM_025542 refGene chr2 172905536 + 81856 graph_last l 10 54 acctttgtac 477 0.314606693353192 0.235294117647059 4 17 5 6 NM_019498 refGene chr2 28499439 + 73055 graph_last l 50 160 caatgctgta 478 0.314606693353192 0.304347826086957 7 23 9 8 cagacggaag 479 0.314606693353192 0.235294117647059 4 17 5 6 AK003177 knownGene chr3 134325739 + 89348 graph_last 15 60 cagatttagg 480 0.314606693353192 0.235294117647059 4 17 5 6 gcagccccta 481 0.314606693353192 0.304347826086957 7 23 9 8 NM_146083 refGene chr17 80910008 - 61430 graph_last l 15 47 ggccaaagag 482 0.314606693353192 0.235294117647059 4 17 5 6 NM_016743 refGene chr15 97285350 + 49595 graph_last l 127 271 gttacgtaac 483 0.314606693353192 0.304347826086957 7 23 9 8 gtttcaagag 484 0.314606693353192 0.235294117647059 4 17 5 6 NM_011492 refGene chr10 82440175 - 14048 graph_last l 37 175 tgcacaggct 485 0.314606693353192 0.235294117647059 4 17 5 6 tgctgagatc 486 0.314606693353192 0.235294117647059 4 17 5 6 aggccaagaa 487 0.317016319866919 0.25 5 20 7 7 atacttgaca 488 0.317016319866919 0.25 5 20 7 7 NM_134044 refGene chr12 83476305 - 30013 graph_last l 8 58 cctacactcc 489 0.317016319866919 0.25 5 20 7 7 gttgtgattt 490 0.317016319866919 4.5 27 6 35 2 NM_009320 refGene chr6 93295433 + 115017 graph_last l 16 47 tattttgtgg 491 0.317016319866919 0.25 5 20 7 7 AK014046 knownGene chr11 62096350 - 20634 graph_last l 16 62 tctctgaggt 492 0.317016319866919 0.25 5 20 7 7 NM_008112 refGene chr13 3314926 + 32298 graph_last l 80 154 ttttgtttat 493 0.317016319866919 0.25 5 20 7 7 cggttgctgg 494 0.31906767286555 4.66666666666667 28 6 36 2 NM_010895 refGene chr11 97910831 - 23629 graph_last b 21 98 tacgaggagc 495 0.33828766081436 3.44444444444444 31 9 41 3 AK085367 knownGene chr8 119156583 + 133821 graph_last l 39 190 cttcggttgt 496 0.342430337286623 0.394736842105263 15 38 20 13 gactgtgcca 497 0.350200269679403 3.66666666666667 33 9 43 3 genomic chr11 68662887 - 0 unique_long l 4 14 aaaactgggg 498 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_025808 refGene chr16 17130765 + 51924 graph_last l 20 55 aaacggtaag 499 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 aacgcgtgtg 500 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_194462 refGene chr5 3973741 + 100160 graph_last 0 11 aagccgagat 501 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_013854 refGene chr17 35652435 - 59005 graph_last l 9 26 aaggtggcgt 502 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 acacaataaa 503 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 acagtgcctg 504 0.384322656433683 7 21 3 28 1 acgctgaata 505 0.384322656433683 7 21 3 28 1 NM_009030 refGene chr4 128222925 - 97446 graph_last 68 191 actaactgtg 506 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 actctagcca 507 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 actgcagatg 508 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_008748 refGene chr7 134136739 - 126141 graph_last l 3 117 agacggatgt 509 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 agagttcaga 510 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 NM_011406 refGene chr17 82092536 - 61525 graph_last l 4 18 agccagaagc 511 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_008687 refGene chr4 80903153 - 94453 graph_last l 3 39 agccagccat 512 0.384322656433683 7 21 3 27 1 BC048668 knownGene chr16 38124538 + 53459 graph_last l 43 170 agggcactgg 513 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 NM_025804 refGene chr8 125253642 + 134250 graph_last 2 24 aggggcctag 514 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_027878 refGene chr10 90782898 + 14647 graph_last l 7 24 atctcagtag 515 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 caattcttta 516 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_025382 refGene chr4 133683735 - 98024 graph_last l 3 24 cactgcttcc 517 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 cagaccctac 518 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 BY238464 all_est chr2 118967939 + 78313 graph_last l 9 29 ccgagcgagg 519 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_010768 refGene chr10 83635026 + 14184 graph_last l 43 134 cctgggacac 520 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 BC049678 knownGene chr8 71178447 - 131010 graph_last l 24 83 cggctgtcgc 521 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 NM_009763 refGene chr5 42766418 - 102326 graph_last l 19 38 ctatttaaag 522 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 ctgtacgcag 523 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 ctgttaatac 524 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 AK013794 all_mrna chr7 73721823 + 122515 graph_last 2 13 cttaaacaaa 525 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 BY374659 all_est chr13 52272846 - 34920 graph_last l 74 162 gaaccagtta 526 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 AK090227 all_mrna chrX 132132840 - 151845 graph_last 2 10 gagattagtc 527 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 gcccaggctc 528 0.384322656433683 7 21 3 27 1 NM_172994 refGene chr5 35322766 + 102036 graph_last l 101 228 gccctagttt 529 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 gctctgtgtc 530 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 genomic chr13 81769209 - 0 unique_long l 7 14 gcttagggta 531 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_007999 refGene chr19 10130399 + 67962 graph_last 30 134 ggctttggag 532 0.384322656433683 7 21 3 28 1 gggcggagct 533 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 ggggctcaca 534 0.384322656433683 7 21 3 28 1 NM_182716 refGene chr1 135449108 - 6266 graph_last l 16 67 ggggtctgcc 535 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 ggtggctcac 536 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_153550 refGene chr16 35427449 + 53240 graph_second 0 15 ggttctcagt 537 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_153150 refGene chr16 17530303 - 51984 graph_last l 5 28 gtcaggtcac 538 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 gtcatagctg 539 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 gtgctcagtg 540 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 gtggggagcc 541 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 NM_028835 refGene chr6 116487900 - 116215 graph_last l 3 25 gtttgcctga 542 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_010014 refGene chr4 103601428 + 95607 graph_last l 4 42 gtttttggca 543 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 NM_011130 refGene chr8 21492512 - 128541 graph_last 2 9 tatgaatgtg 544 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_007529 refGene chr3 90072744 - 86600 graph_last l 49 205 tcagctgcct 545 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 genomic chr16 44061816 - 0 unique_long l 142 249 tctacacagt 546 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 tctgcttgga 547 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_054072 refGene chr18 37958141 + 64094 graph_last l 118 278 tctggagaca 548 0.384322656433683 0.421052631578947 16 38 21 13 tgcaagctga 549 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 NM_009457 refGene chrX 19235646 + 147564 graph_second 6 26 tgcgggcact 550 0.384322656433683 Inf 14 0 18 0 BC049852 knownGene chr7 15939737 + 119234 graph_last l 4 21 tgggcagcag 551 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_182991 refGene chr8 70745352 - 130941 graph_last l 49 119 ttctgagtat 552 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 ttctttctaa 553 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 ttgacaaact 554 0.384322656433683 0.166666666666667 2 12 2 4 NM_015753 refGene chr2 45292287 - 74261 graph_last l 13 58 cacgtgcctg 555 0.385236884284396 Inf 15 0 19 0 NM_008874 refGene chr19 6969259 + 67713 graph_second 0 21 cagaagctga 556 0.385236884284396 Inf 15 0 19 0 NM_010710 refGene chr2 38632312 + 73906 graph_last l 8 51 cgcacctcct 557 0.385236884284396 Inf 15 0 19 0 gtcgcaggca 558 0.385236884284396 Inf 15 0 19 0 NM_019802 refGene chr6 73476551 - 113867 graph_last 4 80 aaacgaaagt 559 0.389870366901469 0.379310344827586 11 29 14 10 NM_028871 refGene chr4 135120062 + 98142 graph_last 23 100 taagatttca 560 0.389870366901469 0.379310344827586 11 29 14 10 NM_009080 refGene chr11 68474567 + 20949 graph_last 145 795 tgggcatcca 561 0.396176505892714 0.653543307086614 83 127 108 44 ccccagccag 562 0.397996552990106 1.5 156 104 204 36 NM_175172 refGene chr19 58909380 - 70889 graph_last l 13 83 gggaattaaa 563 0.397996552990106 0.4 14 35 18 12 NM_053104 refGene chr15 78424273 - 48203 graph_last l 22 121 ttgctggctt 564 0.41142229569338 4.33333333333333 26 6 34 2 NM_021272 refGene chr10 60008899 + 12620 graph_last l 18 574 ggattttgat 565 0.411610182670887 0.595238095238095 50 84 65 29 NM_181548 refGene chrX 6480532 + 147056 graph_last l 175 1200 gcggggtcgc 566 0.416245316768845 0.307692307692308 8 26 11 9 AV070736 all_est chr1 94583963 - 4754 graph_last 83 220 tctgtgatgt 567 0.416245316768845 0.307692307692308 8 26 11 9 NM_146243 refGene chr11 19961775 + 18008 graph_last 22 71 cacacagact 568 0.418942964299105 0.3 6 20 8 7 NM_025893 refGene chrX 125569334 + 151577 graph_last l 196 375 catactatat 569 0.418942964299105 0.3 6 20 8 7 NM_007581 refGene chr15_random 8698033 - 50608 graph_last 94 176 ctccattaag 570 0.418942964299105 0.3 6 20 8 7 NM_009030 refGene chr4 128222930 + 97446 graph_last l 13 60 gagagtaaca 571 0.418942964299105 0.3 6 20 8 7 gctcctccct 572 0.418942964299105 0.3 6 20 8 7 taaaatttgt 573 0.418942964299105 0.3 6 20 8 7 NM_027320 refGene chr11 101122702 - 23970 graph_last l 22 73 tgggaagtgt 574 0.418942964299105 0.3 6 20 8 7 AK021267 knownGene chr11 6326115 - 17486 graph_last l 25 176 tgttgattgg 575 0.418942964299105 3.33333333333333 30 9 39 3 NM_008503 refGene chr17 24316262 - 57823 graph_last l 47 117 aacatcatcc 576 0.421124978204077 0.214285714285714 3 14 4 5 NM_019410 refGene chr3 59231425 - 85210 graph_last l 161 357 aagcgtgcag 577 0.421124978204077 0.45 18 40 23 14 NM_199022 refGene chr2 125929378 + 78833 graph_last l 25 72 cattaaataa 578 0.421124978204077 0.214285714285714 3 14 4 5 NM_029999 refGene chr17 73357998 + 61062 graph_last l 13 53 cctgttgtga 579 0.421124978204077 0.214285714285714 3 14 4 5 gcctagaact 580 0.421124978204077 0.214285714285714 3 14 4 5 NM_028659 refGene chr3 93044981 - 86956 graph_last 239 561 gcctcctccc 581 0.421124978204077 2.26086956521739 52 23 68 8 NM_021921 refGene chr15 91147347 - 49270 graph_last l 19 73 gcttttggga 582 0.421124978204077 0.214285714285714 3 14 4 5 ggctgcagcc 583 0.421124978204077 3 36 12 47 4 NM_172618 refGene chr17 29856015 - 58475 graph_last l 6 39 gtagatgtgg 584 0.421124978204077 0.214285714285714 3 14 4 5 NM_016703 refGene chr5 29292420 - 101545 graph_last l 15 40 tgaagatgcc 585 0.421124978204077 0.214285714285714 3 14 4 5 NM_011512 refGene chr2 27182459 - 72967 graph_last l 46 114 tgaagtaagg 586 0.421124978204077 0.214285714285714 3 14 4 5 NM_144859 refGene chr17 64373399 - 60598 graph_last l 135 233 tggatttctt 587 0.421124978204077 0.214285714285714 3 14 4 5 NM_028982 refGene chr6 136643905 + 117563 graph_last l 35 126 tggtgcggtg 588 0.421124978204077 0.214285714285714 3 14 4 5 tgttatgaga 589 0.421124978204077 0.214285714285714 3 14 4 5 NM_178703 refGene chr6 116077681 + 116195 graph_last l 76 354 tacgtttcta 590 0.42551869079921 0.294117647058824 5 17 6 6 tctgtaattg 591 0.42551869079921 0.294117647058824 5 17 6 6 ttagaacgtg 592 0.42551869079921 0.294117647058824 5 17 6 6 ttcgtccttt 593 0.42551869079921 0.294117647058824 5 17 6 6 NM_011889 refGene chr15 83848784 + 48775 graph_last 10 98 gtgtacatac 594 0.430431626341214 0.428571428571429 15 35 19 12 aagatcaaga 595 0.442389969891694 1.45454545454545 176 121 230 42 cctcggaaaa 596 0.442594983735951 0.546875 35 64 46 22 NM_019411 refGene chr11 51747475 + 19812 graph_last l 93 195 actgtagatg 597 0.46011443899635 0.346153846153846 9 26 12 9 caaggtgaca 598 0.46011443899635 0.680555555555556 98 144 128 50 NM_021539 refGene chr5 116409924 + 106398 graph_last l 42 141 ggatgtaccc 599 0.46011443899635 0.346153846153846 9 26 12 9 NM_007637 refGene chr15 31931318 + 46012 graph_last l 50 193 tcatagaaac 600 0.46011443899635 0.346153846153846 9 26 12 9 tgtgaagtag 601 0.46011443899635 0.346153846153846 9 26 12 9 tgtgtcattt 602 0.46011443899635 0.346153846153846 9 26 12 9 AV342873 all_est chr1 163471941 - 7703 graph_last l 4 23 aaaggatggg 603 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 aaataacaat 604 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_145563 refGene chr5 108982037 - 105766 graph_last 3 20 aaatgtgcac 605 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_009003 refGene chr8 125631605 + 134301 graph_last l 8 35 aacgtgagcg 606 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 aactgaacaa 607 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 aagaaaatag 608 0.465889959824433 0.583333333333333 42 72 55 25 NM_009112 refGene chr3 96450188 + 87150 graph_last l 19 59 aagcagaagg 609 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 aaggactgat 610 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_053246 refGene chr8 96147260 - 132535 graph_last l 3 31 aaggagatta 611 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 aatgtggcag 612 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 genomic chr17 28803936 - 0 unique_long l 9 26 acttcattgg 613 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 agctcttgta 614 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 aggaaactta 615 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_019442 refGene chr17 34484621 - 58888 graph_last 9 28 aggagccaat 616 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_011502 refGene chr19 11606418 + 68093 graph_last l 4 37 agtgagtgac 617 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 genomic chr12 60347856 + 0 unique_long l 4 24 agtggggtct 618 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_011865 refGene chr6 87941239 - 114590 graph_second 0 8 atccaactgt 619 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 BC046438 knownGene chr13 71509181 + 36073 graph_last l 9 20 atgatgtgca 620 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_011342 refGene chr3 100807621 + 87579 graph_last l 7 31 atgcacagat 621 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 atggcttaat 622 0.465889959824433 6.33333333333333 19 3 25 1 attacggtgg 623 0.465889959824433 0.538461538461538 28 52 36 18 NM_009722 refGene chr5 121477699 - 106753 graph_last l 81 231 atttcaggta 624 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 atttttgtat 625 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 caaatgaggc 626 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 cagcatcacc 627 0.465889959824433 1.96875 63 32 82 11 NM_080638 refGene chr7 119108898 + 125151 graph_last l 13 39 cagcattcag 628 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 cagcttctgc 629 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 genomic chr10 126155645 + 0 unique_long l 8 29 caggaggtca 630 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 AK032343 all_mrna chr7 71977154 + 122340 graph_last l 31 156 caggctgata 631 0.465889959824433 6.33333333333333 19 3 25 1 NM_009338 refGene chr17 13166480 - 57147 graph_last 6 30 cagttcaccc 632 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_028967 refGene chr19 6179959 - 67652 graph_last l 47 89 ccaaaaggaa 633 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 ccaggcggtg 634 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 cctgtattcc 635 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_144916 refGene chr6 73402412 + 113854 graph_last l 4 12 ccttagccta 636 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_026856 refGene chr5 105774526 - 105522 graph_last l 3 15 ctaagaaccg 637 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 genomic chr12 83328225 + 0 unique_long l 3 12 ctcagtccat 638 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 ctgctttctg 639 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_010875 refGene chr9 51510696 + 137508 graph_last 1 17 ctggtcttta 640 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 ctgtctggtt 641 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_007727 refGene chr15 94185949 + 49433 graph_last l 34 87 ctttaagatg 642 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_029810 refGene chr19 46888273 - 70244 graph_last l 2 17 ctttcattat 643 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_019880 refGene chr17 28964297 - 58352 graph_last l 10 27 ctttgccctg 644 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 gaaatgataa 645 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_027911 refGene chr9 21633387 - 135606 graph_last l 13 44 gaactgaaaa 646 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 gaagcaaaga 647 0.465889959824433 6.66666666666667 20 3 26 1 NM_172676 refGene chr2 181443433 - 82496 graph_last 1 13 gaagggggct 648 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 BE649911 all_est chr13 58923938 + 35413 graph_last l 27 89 gaatgtctct 649 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_133708 refGene chr1 76993848 + 3708 graph_last l 7 25 gacagtgaga 650 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 gagcgttttg 651 0.465889959824433 0.73170731707317 150 205 196 71 NM_011186 refGene chr14 45704939 - 41303 graph_second 0 7 gagtcattgt 652 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_133236 refGene chr6 8320530 + 110253 graph_last 14 29 gagtgacaaa 653 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 gcaactgggc 654 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 gcaatctgat 655 0.465889959824433 2.58823529411765 44 17 57 6 NM_053078 refGene chr18 33627441 + 63718 graph_last 0 6 gcacttatta 656 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 gctatgcaaa 657 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_008801 refGene chr1 88425290 - 4331 graph_last l 20 37 ggaacaaacc 658 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_016680 refGene chr7 16538177 + 119318 graph_last 1 11 ggaggcaggg 659 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 AK005166 knownGene chr9 111415950 - 141435 graph_last 0 6 gggactatgg 660 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_023173 refGene chr1 174644531 - 8404 graph_last l 4 11 gtggatgtca 661 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_009931 refGene chr8 11909162 - 127961 graph_last l 13 28 gtgtctgata 662 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_011707 refGene chr11 78072882 + 21953 graph_last l 20 59 gtgtgccagg 663 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_146008 refGene chr10 86935884 + 14433 graph_last l 3 18 gttgttttat 664 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 genomic chr9 97828473 - 0 unique_both b 10 18 taaagcgttg 665 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 taaatatata 666 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_025359 refGene chr12 30708262 - 27104 graph_last l 59 93 taacaaatag 667 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 taataaaatg 668 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 AY057898 knownGene chr10 124793682 - 16432 graph_last 2 18 taccattaca 669 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_175492 refGene chr11 105593087 + 24424 graph_last l 32 69 tatacagagc 670 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_148938 refGene chr15 9001386 - 45224 graph_last l 46 100 tatagaaagg 671 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 tatttcagtg 672 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_019942 refGene chrX 28238769 - 147895 graph_last l 17 49 tcaattttca 673 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 tcatccaatg 674 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_010404 refGene chr11 99931508 - 23830 graph_last l 9 50 tctgccagaa 675 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 AK049571 all_mrna chr17 84592004 - 61688 graph_second 0 33 tctgtttgtc 676 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 AK032292 knownGene chr7 113554762 + 124809 graph_last l 15 33 tgaaataaat 677 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 tgcctttaat 678 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_025959 refGene chr14 37093216 + 40740 graph_last l 11 32 tggcaatcaa 679 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_021432 refGene chr6 59384065 - 113145 graph_last l 124 244 tgtatccagt 680 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_009255 refGene chr1 81573344 - 3878 graph_last l 19 285 tgttcactaa 681 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_026448 refGene chr5 22338244 + 101092 graph_last l 13 91 ttaaactgtc 682 0.465889959824433 6.66666666666667 20 3 26 1 NM_009061 refGene chr1 147167009 - 6919 graph_last l 42 62 ttaccacata 683 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_013855 refGene chr17 23976949 + 57786 graph_second 0 21 ttataaactg 684 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_023858 refGene chr9 14018789 - 135264 graph_last l 4 12 ttataatctt 685 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 ttcactcagt 686 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 S76838 knownGene chr8 13715222 - 128080 graph_last 2 9 ttcagcagcg 687 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 AK013739 knownGene chr1 39488467 - 1712 graph_last l 16 48 ttgaaaccct 688 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_029870 refGene chr17 26374491 + 58052 graph_last 0 81 ttgaatgtaa 689 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_080461 refGene chr8 3408505 + 127585 graph_last l 4 19 ttgctgatcc 690 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 CK339473 all_est chr1 53427865 - 2273 graph_last l 33 64 ttgctttgaa 691 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_172827 refGene chr17 17012571 - 57456 graph_last l 19 38 tttaactata 692 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 NM_011801 refGene chr8 113461104 - 133515 graph_last l 25 71 tttccagcaa 693 0.465889959824433 0.111111111111111 1 9 1 3 ttttatgttt 694 0.465889959824433 0.683823529411765 93 136 121 47 NM_010025 refGene chrX 132123339 - 151844 graph_last l 3 70 agagaccaca 695 0.479462296607859 0.527272727272727 29 55 38 19 genomic chr7 124857190 + 0 unique_long l 14 81 aggagatgga 696 0.479462296607859 Inf 12 0 16 0 aggtgctgag 697 0.479462296607859 Inf 13 0 17 0 NM_013507 refGene chr7 102994114 - 124245 graph_last l 92 225 ataactgagt 698 0.479462296607859 3.11111111111111 28 9 37 3 atccggcgcc 699 0.479462296607859 3.11111111111111 28 9 37 3 atgtactcgg 700 0.479462296607859 Inf 12 0 16 0 caagtcttcc 701 0.479462296607859 0.384615384615385 10 26 13 9 NM_026859 refGene chr15 77986662 + 48143 graph_last l 54 191 cactgagtgt 702 0.479462296607859 Inf 12 0 16 0 NM_175488 refGene chr10 95970030 - 14952 graph_last 27 87 cagcttgcaa 703 0.479462296607859 Inf 13 0 17 0 NM_021551 refGene chr14 45995580 - 41332 graph_last l 184 393 ccaaccgtct 704 0.479462296607859 0.384615384615385 10 26 13 9 NM_027898 refGene chr7 25153876 - 120022 graph_last l 21 74 gaaccctggc 705 0.479462296607859 Inf 13 0 17 0 gagacggtgc 706 0.479462296607859 0.40625 13 32 17 11 gaggcttata 707 0.479462296607859 Inf 12 0 16 0 gcccccaatg 708 0.479462296607859 Inf 12 0 16 0 gggtgggaag 709 0.479462296607859 3.11111111111111 28 9 37 3 ggtaaacaat 710 0.479462296607859 Inf 12 0 16 0 NM_007984 refGene chr5 141879729 + 108268 graph_last l 22 88 ggtcttcaga 711 0.479462296607859 Inf 12 0 16 0 tatattttct 712 0.479462296607859 Inf 12 0 16 0 tgcagcactg 713 0.479462296607859 Inf 12 0 16 0 NM_012010 refGene chrX 83927636 + 149980 graph_last 14 45 ttccaataca 714 0.479462296607859 Inf 13 0 17 0 NM_011181 refGene chr4_random 167174 - 99874 graph_last 23 135 ttggtaatct 715 0.479462296607859 Inf 12 0 16 0 NM_008241 refGene chr12 44828389 + 27632 graph_last l 18 185 gagctatctg 716 0.487833954006105 2 58 29 76 10 aactgagggg 717 0.501290126328915 0.447368421052632 17 38 22 13 NM_010629 refGene chr1 167474293 + 7952 graph_last l 125 305 cagttattgt 718 0.501290126328915 0.447368421052632 17 38 22 13 NM_007393 refGene chr5 141627625 - 108227 graph_last 67 1238 gatacttgga 719 0.515048949673591 0.782006920415225 226 289 295 100 aatacttttg 720 0.518506100986591 0.347826086956522 8 23 10 8 NM_010723 refGene chr3 148114293 - 90070 graph_last l 41 232 acaaaggtta 721 0.518506100986591 0.347826086956522 8 23 10 8 gttgctgttt 722 0.518506100986591 0.347826086956522 8 23 10 8 NM_017368 refGene chr2 91631056 + 76800 graph_last l 6 28 aaacatacac 723 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 aaacccttaa 724 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_017472 refGene chr10 44143976 + 11990 graph_last l 45 113 aaagattaat 725 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 aacggtgttt 726 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 NM_153775 refGene chr8 124327700 + 134129 graph_last l 11 49 aagcaggaag 727 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 NM_173071 refGene chr4 128932627 + 97545 graph_last l 18 90 aagctgggct 728 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_153545 refGene chr11 120272391 + 25607 graph_last l 8 32 aaggctgcag 729 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_177298 refGene chr5 31109648 - 101730 graph_last l 15 38 aatttctcct 730 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_011857 refGene chr8 48179124 - 129903 graph_last 2 24 acccctctgt 731 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 NM_007595 refGene chr11 5867791 - 17440 graph_last l 89 194 accctctaaa 732 0.527365945394195 0.294117647058824 5 17 7 6 NM_008855 refGene chr7 114719529 + 124872 graph_last l 62 148 accggtattt 733 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_019707 refGene chr8 121032700 + 133851 graph_last 11 59 acgaacatca 734 0.527365945394195 0.294117647058824 5 17 7 6 NM_146243 refGene chr11 19961420 - 18008 graph_last l 19 78 actgttaaaa 735 0.527365945394195 0.294117647058824 5 17 7 6 NM_008165 refGene chr11 56925522 + 20133 graph_last l 9 93 agccacagtt 736 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_177614 refGene chr10 130368387 - 16662 graph_last l 11 55 agggtgagga 737 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 NM_175190 refGene chr2 32553095 - 73420 graph_last 54 93 agtacaatga 738 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_178395 refGene chr8 40180587 - 129445 graph_last l 15 60 atatgaaaat 739 0.527365945394195 0.294117647058824 5 17 7 6 atctgacgcc 740 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 atcttcctcc 741 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_024267 refGene chr14 46753817 - 41402 graph_last l 12 54 atgggcctca 742 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 NM_026122 refGene chr9 85866120 - 139919 graph_last l 21 50 caatttttct 743 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_009205 refGene chr17 85827608 - 61778 graph_last l 172 246 cataaagatt 744 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 genomic chr11 67258806 - 0 unique_long l 34 64 catagggtgc 745 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_177235 refGene chr1 34541314 - 1365 graph_last l 39 94 cccagcaaac 746 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 ctgctgtacc 747 0.527365945394195 0.294117647058824 5 17 7 6 ctggaagagg 748 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 ctggagctag 749 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_153581 refGene chr8 55141142 + 130191 graph_last l 32 101 gaaataacta 750 0.527365945394195 0.294117647058824 5 17 7 6 NM_008258 refGene chr11 115003044 - 25097 graph_last 24 285 gagaaagtct 751 0.527365945394195 1.90625 61 32 80 11 NM_008989 refGene chr18 36470200 + 63957 graph_last l 10 43 gatctcaagg 752 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 gattgatgca 753 0.527365945394195 0.294117647058824 5 17 7 6 NM_015827 refGene chr9 100985513 + 140652 graph_last l 21 46 gcctcccaaa 754 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 ggcaaaaagc 755 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 gggatataaa 756 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 NM_175260 refGene chr11 68387672 + 20928 graph_last 9 43 ggtttggaat 757 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_019649 refGene chr7 16587669 - 119324 graph_last l 31 100 gtgaagccaa 758 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 gtgaccttgt 759 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_029031 refGene chr11 72747651 - 21365 graph_last l 8 32 gtgcacgtct 760 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 gttggaaaca 761 0.527365945394195 0.294117647058824 5 17 7 6 NM_025303 refGene chr1 16611261 - 594 graph_last 7 28 tacaatcaga 762 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_126165 refGene chr8 108577067 + 133146 graph_last l 42 86 taggacactt 763 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 NM_022424 refGene chr5 29632580 - 101589 graph_last l 17 61 tcacctgcat 764 0.527365945394195 0.294117647058824 5 17 7 6 NM_018871 refGene chr5 134737023 + 107744 graph_last l 30 57 tcactatagc 765 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_021477 refGene chr16 6895625 + 51276 graph_last l 42 94 tcagaggtgt 766 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_007906 refGene chr2 180995866 - 82448 graph_last l 124 486 tctgcacctc 767 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 NM_013725 refGene chr7 38100510 - 120754 graph_last 141 373 tctgtgcacc 768 0.527365945394195 0.5625 36 64 47 22 tgctgaatca 769 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 NM_028117 refGene chr2 119198414 - 78340 graph_last 0 39 tgcttggcta 770 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 AV205517 all_est chr14 68107603 - 42855 graph_last l 56 129 tggccctctg 771 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 NM_175836 refGene chr11 29998268 - 18592 graph_last l 29 148 tggcttttct 772 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 AK129145 knownGene chr4 150502502 + 99571 graph_last l 14 84 tgggctgctg 773 0.527365945394195 0.294117647058824 5 17 7 6 tgtgtcaacc 774 0.527365945394195 0.488372093023256 21 43 28 15 NM_008139 refGene chr19 16285368 + 68305 graph_last l 46 89 tgttactctc 775 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_146200 refGene chr7 118690565 - 125113 graph_last l 7 25 ttacaacaag 776 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 genomic chr6 42782014 - 0 unique_long l 17 52 ttgaaagtgc 777 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 NM_017367 refGene chr5 94551931 + 104851 graph_last 8 22 tttctttggt 778 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 genomic chr16 21270920 + 0 unique_long l 12 55 tttgagtcct 779 0.527365945394195 0.166666666666667 2 12 3 4 NM_030680 refGene chr10_random 137448 - 17001 graph_last 12 52 ttttattggt 780 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 tttttgtagt 781 0.527365945394195 0.285714285714286 4 14 5 5 tgtagtgtaa 782 0.527956311980554 0.68503937007874 87 127 114 44 NM_177342 refGene chr19 47082444 - 70268 graph_last 322 850 taatactcaa 783 0.539717730137960 0.511627906976744 22 43 29 15 NM_009238 refGene chr13 28839679 - 33570 graph_last l 6 39 tccctgggca 784 0.539717730137960 0.423076923076923 11 26 14 9 ctcgagtctc 785 0.552390891393081 2.64285714285714 37 14 48 5 NM_023670 refGene chr6 49701833 - 112602 graph_last l 72 302 tggggaagag 786 0.552390891393081 2.57142857142857 36 14 47 5 NM_153526 refGene chr5_random 23332765 - 109461 graph_last 21 98 aacctcgctg 787 0.552565392173567 0.347826086956522 8 23 11 8 NM_146229 refGene chr9 117107277 + 141830 graph_last l 70 147 actttcaact 788 0.552565392173567 0.347826086956522 8 23 11 8 NM_008634 refGene chr13 97868504 - 37324 graph_last 77 416 cgcccgcccg 789 0.555264088889682 0.633333333333333 57 90 75 31 cctttggcaa 790 0.563725944525644 2.71428571428571 38 14 49 5 cagaagaaag 791 0.569331138769728 6 18 3 23 1 NM_009234 refGene chr12 21786108 + 26716 graph_last 1 74 cagagtgtag 792 0.569331138769728 6 18 3 23 1 BB871295 all_est chr14 56138477 + 42105 graph_last l 27 119 ggcagactgt 793 0.569331138769728 6 18 3 23 1 gttgaaatta 794 0.569331138769728 6 18 3 23 1 NM_019754 refGene chr16 46057984 - 54005 graph_last l 51 138 taagatgctg 795 0.569331138769728 6 18 3 23 1 NM_009672 refGene chr9 64726839 + 138431 graph_last l 35 106 tacctcgatg 796 0.569331138769728 6 18 3 23 1 Z36397 all_est chr15_random 6842828 + 50572 graph_last l 293 1449 tccgtggttg 797 0.569331138769728 0.783393501805054 217 277 284 96 gtgggcgtgt 798 0.589329083207024 1.52564102564103 119 78 156 27 ttcagctcga 799 0.59370493381904 0.652173913043478 60 92 78 32 NM_009234 refGene chr12 21783731 + 26716 graph_last 1 54 ctcttagcag 800 0.60759886897285 3 27 9 35 3 gccaaaccaa 801 0.608042907148745 3.66666666666667 22 6 29 2 NM_026313 refGene chr11 93881411 - 23162 graph_last l 9 61 ggctatgcca 802 0.608042907148745 3.66666666666667 22 6 29 2 NM_009005 refGene chr6 89403247 - 114757 graph_last l 21 116 gttaccggcc 803 0.608042907148745 3.66666666666667 22 6 29 2 NM_153808 refGene chr19 23452625 + 68731 graph_last 0 137 ttcaaaaaaa 804 0.608042907148745 3.66666666666667 22 6 29 2 NM_009227 refGene chr1 136480038 - 6340 graph_last 8 94 ctaaaaggag 805 0.617830854931113 3.83333333333333 23 6 30 2 tctgccctct 806 0.63183888171536 0.413793103448276 12 29 16 10 tgctgtgaaa 807 0.63183888171536 0.413793103448276 12 29 16 10 tctaccccat 808 0.631876922103303 0.5 20 40 26 14 attgtttatg 809 0.633671940241249 2 52 26 68 9 aaaaataaaa 810 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 AA152957 all_est chr5 110450981 + 105914 graph_last l 3 36 aaactgagtg 811 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 NM_016884 refGene chr14 43945073 - 41160 graph_last 4 27 aattcccgtg 812 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 aattcccttt 813 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 AK012553 knownGene chr2 107145879 + 77702 graph_last 8 28 accgacggtt 814 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 accttttctt 815 0.647707798523904 0.391304347826087 9 23 12 8 NM_198640 refGene chr12 108931591 - 31569 graph_last 0 21 agccacgggg 816 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 NM_009408 refGene chr2 161260208 + 81031 graph_last b 6 31 agcggggacc 817 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 atcggttcca 818 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 NM_013922 refGene chr11 50436366 - 19703 graph_last l 11 46 caaaagttta 819 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 NM_011751 refGene chr11 79967473 + 22170 graph_last l 6 44 ccacggtaga 820 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 NM_011531 refGene chr1 135390854 - 6259 graph_last l 7 39 ccagggggac 821 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 ccagtgcaga 822 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 BC052699 knownGene chr6 126842836 + 116923 graph_last l 9 54 ccgacgcccc 823 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 genomic chr11 114936877 + 0 unique_short s 0 123 cgctgatagg 824 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 gacccaccgc 825 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 NM_021549 refGene chr7 37815866 - 120715 graph_last l 19 86 gacctcatct 826 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 NM_020588 refGene chr1 137257395 - 6407 graph_last l 27 82 gagcagggga 827 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 gagtgattat 828 0.647707798523904 0.391304347826087 9 23 12 8 gattgtcaaa 829 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 gcaaaaaaaa 830 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 gcagcgtccg 831 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 gcgccgaaag 832 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 NM_177188 refGene chr15_random 18412680 + 50810 graph_last 6 30 gcttgctgcc 833 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 gtagcgcaca 834 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 NM_177270 refGene chr5 92464338 - 104668 graph_last 40 111 gtgactgttc 835 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 gtgcatccag 836 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 NM_025647 refGene chr4 113869312 - 96275 graph_last 38 114 gttacttgtt 837 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 tacacggagc 838 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 NM_008064 refGene chr11 118841324 - 25448 graph_last l 24 82 tacataatcc 839 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 NM_021535 refGene chr4 40784770 - 92391 graph_last l 12 70 tctgcgtcct 840 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 NM_026757 refGene chr11 69806545 - 21121 graph_last l 16 85 tgccctcgcc 841 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 tgtgaccccc 842 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 tgttcaatca 843 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 NM_010847 refGene chr19 53323764 + 70500 graph_last 29 74 tgttccctct 844 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 NM_178718 refGene chr15 68198891 + 47652 graph_last l 9 43 ttaaaactga 845 0.647707798523904 Inf 11 0 14 0 ttgcacactt 846 0.647707798523904 Inf 11 0 15 0 caccaccgtt 847 0.654219620793758 1.57377049180328 96 61 125 21 NM_023871 refGene chr2 30346412 - 73215 graph_last 18 64 attcaaatcc 848 0.676223333626837 0.448275862068966 13 29 17 10 NM_011968 refGene chr12 50762699 + 28033 graph_last l 37 125 cctgtctact 849 0.676223333626837 0.448275862068966 13 29 17 10 ctgctatccg 850 0.677974125625961 1.75 70 40 91 14 NM_010808 refGene chr2 156443008 + 80684 graph_last l 5 21 aaactcctgt 851 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_009059 refGene chr17 33557822 + 58793 graph_last 1 23 aaagtgggtg 852 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_008923 refGene chr5 137286500 - 107983 graph_last l 61 220 aactattaaa 853 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_026165 refGene chr18_random 1519575 + 66799 graph_last l 17 28 aagtaaggtg 854 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_133964 refGene chr10 83760581 + 14204 graph_last l 17 74 aataaaataa 855 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 aatgagacaa 856 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 NM_026887 refGene chrX 151955962 + 152652 graph_last 3 23 aatgttcctt 857 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 AF133818 knownGene chr3 161696867 + 90649 graph_last 0 50 aatttaagtg 858 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 AB016490 knownGene chr3 92649260 + 86894 graph_last l 23 53 acacagactt 859 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 acatttctgt 860 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_133801 refGene chr17 56988329 - 60299 graph_last l 15 47 accacaaagg 861 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 NM_021538 refGene chr10_random 161020 - 17004 graph_last 22 72 acgattcaga 862 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_008169 refGene chr2 25557785 - 72823 graph_last l 60 152 actagctctc 863 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 BC029810 knownGene chr7 93843129 + 123590 graph_last l 120 182 agaataaatc 864 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_178405 refGene chr1 176132176 - 8552 graph_last l 125 323 aggaaagcct 865 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 U65636 knownGene chr3 97587933 + 87247 graph_last l 2 26 aggccgctgg 866 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 agggacaggt 867 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 NM_023524 refGene chr7 3687528 - 118479 graph_last l 4 21 agggtgctgg 868 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_133737 refGene chr6 58201935 + 113084 graph_last l 16 40 aggtaaagga 869 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_031874 refGene chr9 22514478 - 135726 graph_last 0 11 aggtagaaga 870 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 aggttggccg 871 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 ataattctac 872 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_144896 refGene chr3 87616277 + 86417 graph_last l 5 19 atggtggcag 873 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_008160 refGene chr9 110981083 + 141375 graph_last 0 86 atggtgtttc 874 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 AU256308 all_est chr4 53386347 + 93312 graph_last l 4 17 atgtattcag 875 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_144800 refGene chr15 60223519 + 47251 graph_last l 3 13 attattagaa 876 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 atttcaaagc 877 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 atttgagttc 878 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 attttcatca 879 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 caagaccctg 880 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_133718 refGene chr9 82374375 - 139783 graph_last l 124 176 cagaatgctg 881 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_026213 refGene chr15 5250696 - 45004 graph_last l 21 53 cagatgtatg 882 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 caggaaagct 883 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 NM_133206 refGene chr8 113316144 + 133479 graph_last 4 51 caggataggt 884 0.692328161992611 0.4 8 20 10 7 NM_198420 refGene chr15 78244879 + 48182 graph_last l 4 23 cagtgcactg 885 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 ccaaaaaaaa 886 0.692328161992611 0.514285714285714 18 35 23 12 NM_183178 refGene chr17 55924524 + 60186 graph_last l 8 37 ccaacaactg 887 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_027915 refGene chr11 82965096 + 22353 graph_last l 41 89 ccaagcttga 888 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 ccacagggca 889 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_013662 refGene chr17 56051344 - 60197 graph_last l 18 51 ccacgtggcc 890 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_011680 refGene chr7 24878855 - 119987 graph_last l 18 116 cccgccaccc 891 0.692328161992611 5.33333333333333 16 3 21 1 NM_024427 refGene chr9 69500644 - 138896 graph_last 1 57 cccgtagccc 892 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 NM_019632 refGene chr2 149090498 - 80110 graph_last l 39 131 cccgtgacct 893 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 ccctgacttc 894 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 AY301068 knownGene chr10 26053645 - 11071 graph_last l 16 40 ccctgtaata 895 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_016925 refGene chr8 125083415 + 134242 graph_last 5 22 cctaccttcc 896 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_016909 refGene chr8 126836338 + 134395 graph_last l 47 96 cctggtaagt 897 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_026585 refGene chr6 117890386 + 116329 graph_last b 14 37 cggggccttc 898 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 NM_026993 refGene chr3 149812435 + 90163 graph_last l 12 40 ctactctcta 899 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 ctcatttcct 900 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_025351 refGene chr6 90834203 - 114882 graph_last b 56 105 ctcgagaaac 901 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 BC003217 knownGene chr17 62607777 - 60440 graph_last 28 64 ctgaaaaagt 902 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 genomic chr3 125974948 - 0 unique_long l 2 6 ctgaaatcca 903 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 BC051520 all_mrna chr2_random 6368419 + 82674 graph_last 0 15 ctgcctgcag 904 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_173400 refGene chr4 85304442 - 94706 graph_last 1 10 ctgttaagtg 905 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 cttaggcagc 906 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_008385 refGene chr4 123806814 - 97069 graph_last l 64 157 ctttgggggc 907 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 BC024678 knownGene chr5 77020270 + 104028 graph_last l 11 33 gaacttggaa 908 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 gaataataaa 909 0.692328161992611 0.741176470588235 126 170 165 59 gaattggaag 910 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_177049 refGene chr14 46207444 - 41370 graph_last l 62 211 gaatttggga 911 0.692328161992611 0.514285714285714 18 35 23 12 NM_026493 refGene chr1 10123852 - 322 graph_last l 28 88 gactgatgtc 912 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 NM_126165 refGene chr8 108578638 - 133146 graph_last l 16 52 gagaggagtg 913 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_013895 refGene chr10 83267018 - 14144 graph_last l 43 228 gagggcttgg 914 0.692328161992611 2.58333333333333 31 12 40 4 gagttatttt 915 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_178699 refGene chr4 153809550 + 99794 graph_last l 6 29 gccagaggct 916 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 gcccccgcat 917 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 AK014408 knownGene chr11 44190442 + 19304 graph_last l 42 79 gctacaggta 918 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 gcttgccctc 919 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_033509 refGene chr1 175860516 - 8514 graph_last 4 19 ggaatggtct 920 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 NM_009974 refGene chr8 96736483 - 132594 graph_last l 7 21 ggagatgaga 921 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_013512 refGene chr18 33979805 + 63737 graph_last l 2 20 ggaggcggtt 922 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 BM936517 all_est chr18 32418272 + 63652 graph_last 2 11 ggcagacagt 923 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_176973 refGene chr6 90295828 - 114835 graph_last l 43 235 ggcagcaaac 924 0.692328161992611 1.96153846153846 51 26 66 9 NM_031161 refGene chr9 123874771 - 142246 graph_last l 216 431 ggctggatgg 925 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_010784 refGene chr2 92547183 - 76924 graph_last b 6 45 ggcttccgcg 926 0.692328161992611 5.33333333333333 16 3 21 1 NM_010460 refGene chr11 95903970 + 23381 graph_last 0 19 ggggggtggg 927 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 gtatttaata 928 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 NM_144528 refGene chr10 82062156 - 13989 graph_last l 14 41 gtctgtggag 929 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 gtgatgaagc 930 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_145564 refGene chr5 117083771 + 106435 graph_last l 18 48 gtgggagtct 931 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 gttaaaagaa 932 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 NM_007790 refGene chr19 53236186 - 70495 graph_last l 4 31 gttaactgaa 933 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 NM_146084 refGene chr18 34656049 - 63766 graph_last l 19 55 gttagcagtg 934 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 NM_008973 refGene chr6 36811251 + 111736 graph_last 7 44 taaaaaagaa 935 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_025594 refGene chr18 36915908 + 64022 graph_last l 166 284 taacaggata 936 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 NM_019498 refGene chr2 28483400 + 73055 graph_last l 738 1036 taactttaag 937 0.692328161992611 0.4 8 20 10 7 NM_008666 refGene chr12 24561293 + 26811 graph_last l 15 29 taatgtttat 938 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 tacaaaaagc 939 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_172674 refGene chr2 156913705 + 80749 graph_last l 10 36 tacagactcg 940 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_011012 refGene chr2 181568928 + 82513 graph_last l 25 90 tagctagccc 941 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 tagtcaggga 942 0.692328161992611 0.514285714285714 18 35 23 12 NM_145393 refGene chr4 130860643 - 97687 graph_last 13 40 tagtgaatgt 943 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_019658 refGene chr19 53788622 - 70518 graph_second l 12 28 tagttccttc 944 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_133745 refGene chr10 35377401 + 11550 graph_last l 161 241 tatagctgta 945 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 NM_181750 refGene chr1 130934896 + 5979 graph_last l 77 108 tcaaaactat 946 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 tcactgtact 947 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 tcctataaag 948 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_009214 refGene chrX 145466932 - 152362 graph_last l 21 54 tccttgcttt 949 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 NM_011503 refGene chr8 3619530 + 127598 graph_last l 4 21 tcggaaatga 950 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 tcgtgattgt 951 0.692328161992611 0.571428571428571 28 49 36 17 NM_009861 refGene chr4 136115446 - 98237 graph_last l 11 41 tctcctgata 952 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_027324 refGene chr13 53858187 + 35020 graph_last l 16 48 tctgtgacaa 953 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 tcttaatgaa 954 0.692328161992611 0.514285714285714 18 35 23 12 NM_027949 refGene chr14 25798654 + 40131 graph_last l 10 37 tcttctctta 955 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 CK346937 all_est chr6 135531640 - 117451 graph_last 0 10 tcttcttaac 956 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_198610 refGene chr4 138900938 - 98461 graph_last l 29 73 tcttggcttc 957 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 AK082350 knownGene chr8 11308623 + 127900 graph_last l 8 19 tctttctgcc 958 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 tgaaaatgta 959 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 tgaaaccgcg 960 0.692328161992611 5.33333333333333 16 3 21 1 NM_146085 refGene chr18 36784870 - 64008 graph_last l 10 32 tgactgaggt 961 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 tgagcccaca 962 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 NM_153580 refGene chr7 118956363 + 125136 graph_last l 7 25 tgcaagcatc 963 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_030689 refGene chr15 81110420 - 48457 graph_last l 50 132 tgcagtgcac 964 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_011749 refGene chr16 33232157 + 53033 graph_last l 4 15 tgctacctag 965 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 tgctgcacgt 966 0.692328161992611 0.4 8 20 10 7 tgctgtgcat 967 0.692328161992611 2.58333333333333 31 12 40 4 NM_145732 refGene chr6 77967413 - 114015 graph_last 26 44 tggattctta 968 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 tggcaagcta 969 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_145465 refGene chr14 114360138 + 44472 graph_last l 5 24 tgggaacctt 970 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 tgtactggca 971 0.692328161992611 0.434782608695652 10 23 13 8 NM_011029 refGene chr9 122506722 + 142160 graph_last 0 327 tgtcatctag 972 0.692328161992611 0.434782608695652 10 23 13 8 tgtttcatac 973 0.692328161992611 0.357142857142857 5 14 6 5 NM_145587 refGene chr7 118304649 - 125072 graph_last l 18 112 tgtttgtaaa 974 0.692328161992611 0.534883720930233 23 43 30 15 AK090075 knownGene chr10 101772845 - 15250 graph_last 0 19 ttaaataaaa 975 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 ttaatattta 976 0.692328161992611 0.35 7 20 9 7 NM_024282 refGene chr1 182286220 + 8894 graph_last 4 38 ttacaacatt 977 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_133485 refGene chr10 3350620 + 9896 graph_last l 4 33 ttaggagcta 978 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 ttatctgtgt 979 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 BC017687 knownGene chrX 6381072 + 147039 graph_last l 11 36 ttcaatgttc 980 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 ttccctgaag 981 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 ttctaagaag 982 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_020050 refGene chr7 101779623 - 124151 graph_last l 61 95 ttctagaaca 983 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_009395 refGene chr11 78096024 - 21956 graph_last l 9 26 ttctaggcta 984 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 BF323184 all_est chr17 25418977 + 57928 graph_last l 74 194 ttctgtcagg 985 0.692328161992611 0.25 3 12 4 4 NM_010064 refGene chr2 71604471 + 75596 graph_last l 68 260 ttgatgccat 986 0.692328161992611 2.5 30 12 39 4 AK009207 knownGene chr7 124581210 + 125500 graph_last l 6 33 ttgtctccag 987 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_175266 refGene chr9 113882938 + 141650 graph_last l 48 97 ttgtggagtg 988 0.692328161992611 0.35 7 20 9 7 tttgtaatac 989 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 NM_175514 refGene chr2 84249596 + 76272 graph_last l 50 123 ttttggtgta 990 0.692328161992611 0.222222222222222 2 9 2 3 tgtaagtctg 991 0.701264593261866 2.88888888888889 26 9 34 3 caaaaataaa 992 0.71139985678162 0.558139534883721 24 43 31 15 NM_010327 refGene chr16 18226867 - 52048 graph_last l 220 602 ctccgttttg 993 0.71139985678162 0.558139534883721 24 43 31 15 NM_011112 refGene chr12 101396152 + 30934 graph_last 24 79 actggagttt 994 0.711814207672365 5.66666666666667 17 3 22 1 caaatgaagt 995 0.711814207672365 5.66666666666667 17 3 22 1 NM_008138 refGene chr9 110247498 - 141261 graph_last l 20 144 cagagatccc 996 0.711814207672365 3.5 21 6 27 2 NM_008546 refGene chr4 139894743 + 98526 graph_last 0 56 gaccacctct 997 0.711814207672365 3.5 21 6 27 2 NM_023279 refGene chr8 125273631 + 134257 graph_last l 131 600 tgagtccact 998 0.714258332068663 0.724409448818898 92 127 120 44 NM_011531 refGene chr1 135391752 - 6259 graph_last l 11 55 aaaagcaggc 999 0.72117207267089 3.5 21 6 28 2 NM_016759 refGene chr11 102066168 + 24069 graph_last l 40 181 ggaagtggtg 1000 0.72117207267089 3.5 21 6 28 2 NM_146019 refGene chr11 68914658 - 21006 graph_last l 49 176 gggaaccccc 1001 0.72117207267089 3.5 21 6 28 2 taatagctag 1002 0.72117207267089 0.603448275862069 35 58 46 20 NM_010771 refGene chr18 35750017 + 63875 graph_last l 102 298 tataatctgt 1003 0.72117207267089 0.5 19 38 25 13 NM_013608 refGene chr10 131323738 + 16744 graph_last l 94 328 tcgcaagcaa 1004 0.722166817433568 2.23529411764706 38 17 50 6 tgtgccaagt 1005 0.729639220445653 0.691588785046729 74 107 97 37 ggatttggct 1006 0.742095317376663 1.34645669291339 171 127 224 44 gcagggtggg 1007 0.756593900906756 1.86206896551724 54 29 70 10 tgaacccact 1008 0.756593900906756 0.46875 15 32 20 11 CD352670 all_est chr5 122023911 - 106823 graph_last l 33 377 aacttaaaaa 1009 0.758216430860858 0.423076923076923 11 26 15 9 gtctacagag 1010 0.758216430860858 0.423076923076923 11 26 15 9 genomic chr5_random 2615367 - 0 unique_long l 264 923 gcgccagctc 1011 0.762557503115397 1.53448275862069 89 58 116 20 tttctgtatg 1012 0.762568969446002 0.526315789473684 20 38 26 13 aaggtggaag 1013 0.76736897529534 1.55172413793103 90 58 118 20 aaaaacaaaa 1014 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_175473 refGene chr5 95660314 + 104920 graph_last 0 8 aaaagccttt 1015 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 aaaatattga 1016 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 aaaatgtata 1017 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_133352 refGene chr19 41277237 - 69785 graph_last 18 66 aaacattggg 1018 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_025665 refGene chr6 88092635 - 114620 graph_last l 3 26 aaacttgagg 1019 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 aaaggatgtt 1020 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 aaatgtgaat 1021 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_028325 refGene chrX 27525223 + 147861 graph_last l 21 48 aacaaatcca 1022 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_146145 refGene chr4 100013212 - 95410 graph_last l 10 21 aacaacattt 1023 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 aacaatattc 1024 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 aacacatttt 1025 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_013768 refGene chr14 45597238 - 41288 graph_last l 5 35 aacacttgac 1026 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_010192 refGene chr17 56188251 + 60209 graph_last l 15 38 aacccctttg 1027 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_010160 refGene chr2 6458596 - 71738 graph_last l 7 30 aaccgtttct 1028 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_007733 refGene chr1 24941145 + 1003 graph_last l 18 39 aacctacaag 1029 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_172266 refGene chr1 195567615 + 9722 graph_last l 17 43 aacgaacact 1030 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 aactgacatt 1031 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_026383 refGene chr4 134650829 - 98090 graph_last 1 14 aactgttttt 1032 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_019967 refGene chr4 67236071 + 93999 graph_last l 7 32 aagaagggtc 1033 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 aagaatgctt 1034 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 NM_026902 refGene chrX 29777112 + 147988 graph_last l 31 95 aagacaaagc 1035 0.774871596554963 0.461538461538462 12 26 16 9 NM_146200 refGene chr7 118708396 - 125113 graph_last l 12 36 aagattcgag 1036 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_007597 refGene chr11 49920656 + 19666 graph_last 0 4 aagccagctc 1037 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 aagcctcatt 1038 0.774871596554963 0.5 13 26 17 9 NM_016706 refGene chr11 88575162 + 22945 graph_last l 4 14 aagctaaagg 1039 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_008198 refGene chr17 34516598 + 58890 graph_last l 9 34 aagctggatt 1040 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 aaggagtttg 1041 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_011129 refGene chr11 87149368 + 22798 graph_second 3 12 aaggccctgc 1042 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_007714 refGene chr11 50906857 + 19742 graph_last l 21 77 aaggttgact 1043 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 C85381 all_est chr14 29267547 + 40403 graph_last l 6 17 aagtatgtct 1044 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 aagtttctga 1045 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_133833 refGene chr1 34872781 + 1393 graph_last 0 231 aataaagttg 1046 0.774871596554963 0.571428571428571 20 35 26 12 NM_178750 refGene chr2 179880965 + 82347 graph_last l 6 11 aatgtttgaa 1047 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_008817 refGene chr7 6530850 + 118679 graph_last l 27 91 acaagtgcgt 1048 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 acaattctgt 1049 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_019694 refGene chr5 32253922 - 101815 graph_last l 22 61 acacacaaga 1050 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_013672 refGene chr15 104525817 + 50259 graph_last 2 8 acacatcaag 1051 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_023275 refGene chr12 71318134 + 28940 graph_last 2 9 acaccccttc 1052 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_008098 refGene chr6 35451107 - 111690 graph_last 1 9 acacttaatg 1053 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 acagccgtgg 1054 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 acattggagg 1055 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 AB017136 knownGene chr7 73844109 - 122530 graph_last l 3 12 acattgtcaa 1056 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 BB754985 all_est chr6 122632802 - 116716 graph_last l 12 30 acccacaaga 1057 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 acccctgacc 1058 0.774871596554963 2.66666666666667 24 9 31 3 NM_130450 refGene chr3 133254904 + 89233 graph_last 5 27 accgggctgg 1059 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_008144 refGene chr19 9160629 - 67907 graph_last l 15 68 acctgcgcct 1060 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_008745 refGene chr13 58918489 + 35397 graph_last l 35 56 accttgctgt 1061 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_178769 refGene chr7 102299364 - 124191 graph_last b 11 78 acggcaccgc 1062 0.774871596554963 3.33333333333333 20 6 26 2 NM_172618 refGene chr17 29853960 - 58475 graph_last l 8 31 acgggctcac 1063 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_183426 refGene chr10 82360772 - 14035 graph_last l 3 7 actactgagg 1064 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_007983 refGene chr4 108821615 + 96076 graph_last 5 35 actgagaggt 1065 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 agaaagaaaa 1066 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_021368 refGene chr2 90387387 - 76683 graph_last 0 10 agaaagctct 1067 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_145100 refGene chr1 128567666 - 5845 graph_last l 4 32 agaacaaaaa 1068 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 agaaggactt 1069 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_024185 refGene chr2 12350814 - 72035 graph_last l 11 27 agaatctcta 1070 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_013557 refGene chr5 142779334 + 108344 graph_last l 5 18 agactcaatt 1071 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_019699 refGene chr19 9948273 - 67959 graph_last l 3 19 agactgaagt 1072 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_007487 refGene chr12 34890884 - 27279 graph_last l 3 13 agagaaatct 1073 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_145527 refGene chr2 91753611 - 76816 graph_last l 13 36 agaggacgga 1074 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 agagtaagaa 1075 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 agatccaact 1076 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_134094 refGene chr15 38059520 + 46351 graph_last l 9 35 agattttcct 1077 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_024457 refGene chr10 120856568 + 16149 graph_last 2 9 agcaagcaag 1078 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_018766 refGene chr2 180356067 + 82383 graph_last l 2 10 agcccagtcg 1079 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 agccctttgt 1080 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 agcgtggtgg 1081 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 AK011294 knownGene chr9 125527317 + 142378 graph_last 0 7 aggaaagtgg 1082 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 BX631115 all_est chr13 46275336 - 34561 graph_last l 17 31 aggaacagat 1083 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 aggaactgta 1084 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 aggacaaaat 1085 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 aggacaatat 1086 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 aggcccaggg 1087 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_020591 refGene chr11 68913064 + 21005 graph_last l 17 35 aggccttatt 1088 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_011969 refGene chr2 179848177 - 82346 graph_last l 53 162 aggcgggatc 1089 0.774871596554963 2.66666666666667 24 9 31 3 NM_007492 refGene chrX 83030764 + 149915 graph_last l 3 13 aggctggacc 1090 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_175930 refGene chr12 113764797 + 31667 graph_last l 10 25 agggagggtg 1091 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 AK005166 knownGene chr9 111425243 + 141435 graph_last l 19 60 agggccagga 1092 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 agggctgtgt 1093 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_172442 refGene chr19 12338492 - 68140 graph_last l 9 34 aggtgtacgt 1094 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_027672 refGene chr1 180660989 - 8783 graph_last 0 8 aggttaattt 1095 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_026796 refGene chr1 193544197 - 9569 graph_last 1 31 agttcacaga 1096 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 agtttgagga 1097 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ataacagatt 1098 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_181400 refGene chr3 111784441 + 88334 graph_last l 6 22 ataatttaaa 1099 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_144866 refGene chr18 35061604 - 63809 graph_last l 4 19 atacatttag 1100 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 atacttggaa 1101 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 atagaggcaa 1102 0.774871596554963 3.33333333333333 20 6 26 2 atagcatctg 1103 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 NM_144791 refGene chr1 159512864 + 7462 graph_last 2 10 atagttttta 1104 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_025333 refGene chr19 10425016 - 68003 graph_last l 5 15 atcaaaaagc 1105 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 atcaaccccg 1106 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_145465 refGene chr14 114392588 + 44472 graph_last l 10 41 atccagcaca 1107 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_008302 refGene chr17 44965350 - 59486 graph_second 0 11 atcgggcagt 1108 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_019392 refGene chr2 120088134 + 78448 graph_last l 17 40 atgaccctta 1109 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_172679 refGene chr3 37892046 + 84290 graph_last 2 12 atgccagaac 1110 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 atggaggcag 1111 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 atggaggtgc 1112 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 atggctcata 1113 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_009408 refGene chr2 161336122 + 81031 graph_last 4 28 atgggaaaat 1114 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_178616 refGene chr11 80044389 - 22179 graph_last l 3 15 atggggagag 1115 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 atgtctcccc 1116 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 attaaagatg 1117 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_024428 refGene chr17 74875697 - 61150 graph_last l 10 34 attcccctcc 1118 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_027867 refGene chr12 51216745 + 28087 graph_last l 6 29 attccgttag 1119 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_009861 refGene chr4 136099316 - 98237 graph_last l 16 71 attctttata 1120 0.774871596554963 0.411764705882353 7 17 9 6 genomic chr19 16287295 + 0 unique_long l 5 13 attgtaaatt 1121 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_008380 refGene chr13 15845809 + 32859 graph_last 5 12 attgtggagg 1122 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 atttattact 1123 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 AK089775 knownGene chr5 141866215 + 108266 graph_last 2 25 atttcacttt 1124 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 atttgtcagt 1125 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_026137 refGene chrX 6684053 - 147079 graph_last l 23 110 attttggggg 1126 0.774871596554963 0.4 8 20 11 7 caaaagaagg 1127 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 caaaggttaa 1128 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 genomic chr19 36982476 + 0 unique_long l 48 116 caaataaact 1129 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_027102 refGene chr9 38317297 - 136530 graph_last l 4 15 caaatgcgat 1130 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_011029 refGene chr9 122505330 + 142160 graph_last 3 22 caacaacaag 1131 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 genomic chr4 115609301 - 0 unique_long l 2 5 caaccctccc 1132 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_029572 refGene chr4 47808889 - 93063 graph_last 1 7 caagcggaag 1133 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 AA388134 all_est chr8 83911423 + 131702 graph_last l 7 19 caatctacaa 1134 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 cacaaataaa 1135 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_011914 refGene chr5 32400449 + 101823 graph_second 0 4 cacaaggaga 1136 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 cacaaggccc 1137 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 genomic chrX 132063425 - 0 unique_long l 5 13 cacaatccat 1138 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 cacacacaca 1139 0.774871596554963 0.5 13 26 17 9 caccaccggt 1140 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_172656 refGene chr1 60524068 + 2683 graph_last l 11 72 caccctgtgg 1141 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_175143 refGene chr9 111179378 + 141397 graph_last l 4 10 cactgaggtg 1142 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_053078 refGene chr18 33627007 - 63718 graph_last l 29 235 cactgtccct 1143 0.774871596554963 0.68 51 75 67 26 NM_199446 refGene chr8 86956517 + 131989 graph_last l 6 14 cagaaagagt 1144 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 cagactcagg 1145 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 cagactttgt 1146 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_016876 refGene chr9 21445046 - 135590 graph_last 32 95 cagccaaacc 1147 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 AK083408 knownGene chr9 106733089 + 141052 graph_last 0 3 cagcccctgg 1148 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 cagctgaagc 1149 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_145505 refGene chr19 57584252 + 70766 graph_last l 3 25 caggacaaag 1150 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 caggaggcag 1151 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 caggctaaac 1152 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 AK084677 all_mrna chr10 8658989 - 10203 graph_last 0 7 caggctcaca 1153 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_013525 refGene chr1 164605371 + 7804 graph_last l 31 97 cagtgactgc 1154 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 NM_008942 refGene chr11 96789914 - 23504 graph_last l 26 58 cataagaggt 1155 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_176988 refGene chr14 15383289 + 39424 graph_last 1 12 cataatattt 1156 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 BM570588 all_est chrX 118503773 + 151346 graph_last 3 6 cataatgtag 1157 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 catcagtcat 1158 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_020591 refGene chr11 68913687 + 21005 graph_last l 52 114 catctgtggg 1159 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_133722 refGene chr7 76354571 - 122669 graph_last 1 7 cattgaagaa 1160 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 cattgctttt 1161 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ccaaaccaaa 1162 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ccaagtggag 1163 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 BB825602 all_est chr6 39249470 - 111946 graph_last 0 35 ccaccactgg 1164 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_177735 refGene chr5 143487678 - 108399 graph_last l 31 144 ccaccattgt 1165 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 ccagaaatta 1166 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ccaggagagg 1167 0.774871596554963 0.552631578947368 21 38 27 13 genomic chr6 122210626 - 0 unique_long l 9 27 ccagggaggg 1168 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_178392 refGene chr12 69903706 + 28896 graph_last l 13 23 ccataggcca 1169 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ccattttctg 1170 0.774871596554963 5 15 3 20 1 cccagcctaa 1171 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 cccagctcca 1172 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 AK051528 all_mrna chr11 116477631 + 25266 graph_last 1 7 cccgtgaggc 1173 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_172993 refGene chr15 55148541 - 47003 graph_last 11 45 ccctcagtgc 1174 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 NM_172948 refGene chr11 116492226 + 25261 graph_last l 15 54 ccctcctcca 1175 0.774871596554963 0.478260869565217 11 23 14 8 NM_027629 refGene chr7 92444160 + 123455 graph_last l 8 29 ccgaaggttc 1176 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_021420 refGene chr2 164668293 - 81249 graph_last l 7 38 ccgccaaggg 1177 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_007828 refGene chr10 83563948 + 14173 graph_last b 8 51 ccgcgcaaca 1178 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 cctgaagatg 1179 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_025954 refGene chr17 24066635 + 57798 graph_last l 9 22 cctgaagctg 1180 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_021514 refGene chr15 100439762 + 49830 graph_last l 79 198 cctgcaacca 1181 0.774871596554963 0.411764705882353 7 17 9 6 cctgctctga 1182 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 cctgggcacc 1183 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 NM_007638 refGene chr6 86813362 - 114502 graph_last l 24 80 ccttattgtg 1184 0.774871596554963 0.411764705882353 7 17 9 6 NM_134155 refGene chr19 4862180 + 67492 graph_last l 26 73 ccttcgccct 1185 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 cctttagttc 1186 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_026776 refGene chr11 100923203 + 23949 graph_last l 21 52 cgcctgcaca 1187 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_016967 refGene chr16 92582327 + 55982 graph_last 3 102 cgcgctccct 1188 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 cggagaccct 1189 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_011185 refGene chr17 15128563 - 57300 graph_last l 175 362 cgggtcatat 1190 0.774871596554963 5 15 3 19 1 NM_009876 refGene chr7 135531689 - 126263 graph_last 2 36 cgtggatccc 1191 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_028835 refGene chr6 116538523 + 116215 graph_second 0 176 ctaaaaaaaa 1192 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_030225 refGene chr12 81129920 - 29823 graph_last l 7 14 ctaccagtgg 1193 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ctacgttctc 1194 0.774871596554963 5 15 3 19 1 NM_177561 refGene chr5_random 22728668 + 109447 graph_second l 5 13 ctactgtaac 1195 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ctaggcaaac 1196 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ctaggctttt 1197 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_008060 refGene chr19 9055901 - 67898 graph_last l 6 47 ctcactcttt 1198 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 ctctatttaa 1199 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_028194 refGene chr5 72743176 - 103784 graph_last l 6 13 ctctgagaag 1200 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 ctctgatgtg 1201 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 AK122307 knownGene chr11 102139984 - 24096 graph_last l 14 27 ctctggccgc 1202 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_172522 refGene chr9 67087884 - 138600 graph_last l 34 78 ctctgtattt 1203 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_146168 refGene chr6 58215121 - 113087 graph_last l 15 65 ctctttcttg 1204 0.774871596554963 0.411764705882353 7 17 9 6 NM_025434 refGene chr3 8973474 - 82960 graph_last l 7 27 ctgagacact 1205 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_023465 refGene chr4 147658869 + 99296 graph_last l 13 28 ctgaggaaga 1206 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 genomic chr2 127510118 - 0 unique_long l 2 13 ctgcaggcct 1207 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_028036 refGene chr18 36854954 - 64013 graph_last 0 30 ctgccctcca 1208 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_153160 refGene chr4 129229717 - 97566 graph_last l 15 49 ctggagcccc 1209 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_007990 refGene chr19 6104038 + 67634 graph_last l 18 60 ctgggaggta 1210 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_023134 refGene chr14 35775081 + 40665 graph_last 0 51 ctgtcagtgg 1211 0.774871596554963 0.4 8 20 11 7 ctgtcatttg 1212 0.774871596554963 3.16666666666667 19 6 25 2 ctgtggctgt 1213 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_134084 refGene chr14 20493077 + 39757 graph_last l 8 27 ctgttctcaa 1214 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_025814 refGene chr6 67903251 + 113525 graph_last l 27 246 cttaaggatc 1215 0.774871596554963 2.05 41 20 53 7 AK129466 knownGene chr6 86810887 + 114500 graph_last l 11 33 cttatgcagg 1216 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_011767 refGene chr15_random 2842098 - 50489 graph_last l 29 66 cttatgtctt 1217 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 cttcccactg 1218 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_007575 refGene chr16 10024134 - 51425 graph_last l 16 44 cttccctggc 1219 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 cttgcttcca 1220 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_011239 refGene chr16 17888859 - 52007 graph_last 0 5 cttgtccctt 1221 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_023162 refGene chr17 36706080 - 59095 graph_last l 13 56 ctttgttctc 1222 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_153056 refGene chr11 120181405 - 25596 graph_last l 8 32 gaaaagggaa 1223 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 gaaaggaaac 1224 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 NM_012014 refGene chr13 54519110 - 35074 graph_last l 11 43 gaaaggtcag 1225 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 NM_175015 refGene chr2 74302832 - 75802 graph_last 354 852 gaaatatatg 1226 0.774871596554963 0.612244897959184 30 49 39 17 NM_146157 refGene chr4 138361968 + 98421 graph_last l 6 28 gaaatgagat 1227 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_023324 refGene chr11 21048347 + 18098 graph_last 1 4 gaaatgtttg 1228 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 CF540728 all_est chr16 35052211 + 53196 graph_last l 11 58 gaaattgaaa 1229 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_153133 refGene chr10 131093549 - 16719 graph_last 0 11 gaacacacag 1230 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 CD771683 all_est chr6 6542670 - 110151 graph_last l 2 5 gaacatcttc 1231 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gaacttgcta 1232 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gaagatgctc 1233 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gaaggaacaa 1234 0.774871596554963 0.45 9 20 12 7 NM_011596 refGene chr5_random 46602863 + 109932 graph_last l 14 40 gaaggactag 1235 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gaagtactat 1236 0.774871596554963 2.41666666666667 29 12 38 4 NM_009129 refGene chr1 81220284 - 3857 graph_last l 55 117 gaattgatga 1237 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_026110 refGene chr16 92290052 - 55957 graph_last l 22 88 gaatttttac 1238 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_031842 refGene chr15 101661502 + 49950 graph_last l 28 76 gaccaaaatt 1239 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_031997 refGene chr19 22001220 - 68613 graph_last 1 9 gacgaagctg 1240 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_022433 refGene chr7 132862759 - 126014 graph_last 12 31 gactcagatt 1241 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gagaactttg 1242 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_146157 refGene chr4 138248385 + 98421 graph_second 0 5 gagaagtgct 1243 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_018770 refGene chr9 49855196 - 137345 graph_last l 14 48 gagacactaa 1244 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 NM_026238 refGene chr17 25379974 - 57923 graph_last 37 99 gagccctata 1245 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 gagctggtga 1246 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 AK077572 knownGene chr19 38237960 - 69610 graph_last l 21 51 gagtgattgt 1247 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 NM_133850 refGene chr2_random 3147483 - 82601 graph_last l 10 22 gagtgcctca 1248 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gagttttata 1249 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gatcaagagg 1250 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_011749 refGene chr16 33229185 + 53033 graph_last 7 21 gatccagagc 1251 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_011766 refGene chr15 41386574 - 46546 graph_last 0 16 gatggaataa 1252 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_054050 refGene chr2 30009731 + 73157 graph_last 0 4 gatgtcctca 1253 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gatttcccag 1254 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 NM_028259 refGene chr11 86062939 - 22667 graph_last 0 9 gattttaaaa 1255 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 genomic chr8 96314097 - 0 unique_long l 11 173 gcaaagcagc 1256 0.774871596554963 3.33333333333333 20 6 26 2 NM_028658 refGene chr17 89388037 - 62048 graph_last 1 8 gcaagggaga 1257 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gcacagcgct 1258 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 AI413427 all_est chr6 93301756 - 115026 graph_last l 8 18 gcaccactgt 1259 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_031174 refGene chr16 98603445 - 56375 graph_last l 10 55 gcacctgatg 1260 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 genomic chr5 147553463 + 0 unique_long l 7 19 gcactgacag 1261 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gcagagacat 1262 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gcagcaacca 1263 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_010699 refGene chr7 39733122 + 120908 graph_last 0 7 gcagcctctt 1264 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_007733 refGene chr1 24938231 + 1003 graph_last l 6 18 gccattaaaa 1265 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_138672 refGene chr14 25678082 + 40121 graph_last l 10 36 gcccacatcc 1266 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 gccccaggag 1267 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 gcctctgctg 1268 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_008451 refGene chr19 4929106 - 67502 graph_last l 68 118 gcctgacccc 1269 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gcctgcaaac 1270 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_009503 refGene chr4 42270287 - 92606 graph_last l 69 237 gcctgttcca 1271 0.774871596554963 2.33333333333333 28 12 37 4 NM_025567 refGene chr15 77978170 + 48141 graph_last l 205 434 gccttctcag 1272 0.774871596554963 0.5 13 26 17 9 NM_011297 refGene chr13_random 1842983 + 38627 graph_last 0 891 gcctttatga 1273 0.774871596554963 1.46153846153846 114 78 149 27 gcgaagctca 1274 0.774871596554963 0.709090909090909 78 110 102 38 gcggcagcgc 1275 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gcggcggctc 1276 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gcggcggggc 1277 0.774871596554963 5 15 3 19 1 AA139939 all_est chr3 90376105 - 86642 graph_last 0 39 gcgggggtgc 1278 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 genomic chr1 81489580 - 0 unique_long l 4 20 gctaacaagg 1279 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 gctccagcct 1280 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gctccagctg 1281 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 gctccctctg 1282 0.774871596554963 2.21428571428571 31 14 41 5 NM_134118 refGene chr8 84313000 - 131727 graph_last l 128 671 gctctccagc 1283 0.774871596554963 0.622950819672131 38 61 50 21 gctctttggg 1284 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gctgccctaa 1285 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 gctgtcacct 1286 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 gctgttaaag 1287 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_011512 refGene chr2 27188956 + 72967 graph_last l 13 32 gctttctctg 1288 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gctttgcttt 1289 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_028564 refGene chr8 106224614 + 132901 graph_last l 11 80 gctttgtttt 1290 0.774871596554963 0.411764705882353 7 17 9 6 NM_024439 refGene chr7 58524814 + 121731 graph_last l 35 65 gcttttatgg 1291 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 gcttttggag 1292 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_007838 refGene chr4 137089926 + 98329 graph_last 18 45 ggaaaatggc 1293 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ggaaacaggg 1294 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_016679 refGene chr9 21798794 - 135629 graph_last l 4 46 ggaataaaga 1295 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 NM_026614 refGene chr6 24390570 - 110909 graph_last 71 261 ggagccattg 1296 0.774871596554963 0.5 13 26 17 9 NM_007705 refGene chr10 82481863 + 14053 graph_last 2 14 ggaggatggc 1297 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_010880 refGene chr1 88232617 - 4315 graph_last l 6 16 ggaggctaaa 1298 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_028791 refGene chr17 29335946 + 58381 graph_last l 16 43 ggaggtccct 1299 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_153803 refGene chr9 27407141 + 135957 graph_last l 52 167 ggcaaaggct 1300 0.774871596554963 3.33333333333333 20 6 26 2 NM_008323 refGene chrX 63381310 - 149194 graph_second 0 21 ggcaacagga 1301 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 ggcaatcacc 1302 0.774871596554963 0.411764705882353 7 17 9 6 NM_025349 refGene chr10 83218075 + 14139 graph_second 7 67 ggcaatttta 1303 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_010906 refGene chr8 85585530 - 131845 graph_last l 40 167 ggcaggactc 1304 0.774871596554963 0.622950819672131 38 61 50 21 ggcccgtgtg 1305 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_172513 refGene chr1 60129766 + 2651 graph_last 36 129 ggcggctttg 1306 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 ggcgtcatcg 1307 0.774871596554963 3.33333333333333 20 6 26 2 ggctgcccta 1308 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 ggcttcgggt 1309 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gggaacgcac 1310 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 gggaatgatg 1311 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_026823 refGene chr1 138074987 - 6492 graph_last 1 5 gggacaacca 1312 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_010496 refGene chr12 19542546 - 26650 graph_last l 61 309 gggagcgaaa 1313 0.774871596554963 2 40 20 52 7 gggccctcct 1314 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gggcctgctc 1315 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_021387 refGene chr7 33471175 + 120436 graph_last l 8 34 gggcgccaag 1316 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 AK017387 knownGene chr16 90850534 - 55851 graph_second 0 4 gggctctggc 1317 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 BC019560 knownGene chr10 130328662 - 16651 graph_last l 7 58 ggggaagggc 1318 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 gggtttaatg 1319 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_172736 refGene chr7 4015506 - 118503 graph_second l 3 11 ggtagagcag 1320 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 CB526906 all_est chr8 27613070 - 128862 graph_last 1 10 ggtataatga 1321 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ggtcccctcc 1322 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ggtgaagctg 1323 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ggtgcccaga 1324 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_138579 refGene chr15 80350321 - 48365 graph_last 0 5 ggtggcgctg 1325 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ggttttcaag 1326 0.774871596554963 2.41666666666667 29 12 38 4 NM_008991 refGene chr3 125173184 + 88838 graph_last 0 7 gtaaaactga 1327 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gtactgacat 1328 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 gtagaacttt 1329 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gtaggatctt 1330 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_010893 refGene chr17 34596178 + 58898 graph_last l 7 16 gtcaaaatca 1331 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gtcagttaaa 1332 0.774871596554963 5 15 3 20 1 NM_020601 refGene chrX 67445347 + 149423 graph_last l 4 27 gtcctctttc 1333 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_145156 refGene chr19 43761940 - 69958 graph_last l 8 18 gtctgtgtat 1334 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_023328 refGene chr13 59235377 - 35436 graph_last l 4 15 gtgaaaattg 1335 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 gtgaccgaag 1336 0.774871596554963 1.78125 57 32 74 11 gtgactttgc 1337 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 AK052734 knownGene chr11 72496802 + 21327 graph_last l 10 30 gtgatcagca 1338 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 gtgatgagcc 1339 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_199322 refGene chr10 83160312 + 14127 graph_last l 12 31 gtgcatagtg 1340 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_145540 refGene chr3 92804766 - 86923 graph_last l 4 25 gtggaagtcc 1341 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gtggagcaca 1342 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 gtggccgaaa 1343 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gtggcgcacg 1344 0.774871596554963 2.05 41 20 54 7 gtggctcacc 1345 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_009986 refGene chr5 135192390 - 107785 graph_last 0 10 gtggctccaa 1346 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gtgggaggaa 1347 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_009468 refGene chr18 43985286 - 64437 graph_last l 5 199 gtgtgtgggt 1348 0.774871596554963 0.689655172413793 60 87 78 30 AB093219 knownGene chr17 46247346 - 59609 graph_last 2 27 gttagggtat 1349 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_198090 refGene chr2 76060988 + 75886 graph_last 2 8 gttattcttt 1350 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_145436 refGene chr11 104166958 + 24321 graph_last 2 12 gttcaaatgt 1351 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 genomic chr6 89403818 - 0 unique_short s 3 19 gttcgaccag 1352 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_144858 refGene chr17 56753887 + 60274 graph_last 6 36 gttgcccgtg 1353 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_009305 refGene chrX 6213381 + 147019 graph_last l 175 478 gttgggagct 1354 0.774871596554963 0.411764705882353 7 17 9 6 NM_023343 refGene chr1 93291700 - 4680 graph_last l 13 45 gttgtaaata 1355 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 gttgtgagtc 1356 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_008698 refGene chr11 4792057 + 17322 graph_last l 31 55 gttgtgctac 1357 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_025327 refGene chr3 91477511 - 86793 graph_last l 30 56 gtttataaac 1358 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_010181 refGene chr18 58111686 - 65139 graph_last 0 7 gtttttattt 1359 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_009270 refGene chr15 60667135 + 47298 graph_last l 22 61 taaatataag 1360 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_172806 refGene chr12 98337646 - 30760 graph_last l 7 23 taacactgac 1361 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 BB374373 all_est chr17 74654823 - 61125 graph_last 4 14 taactatgtt 1362 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_172736 refGene chr7 4015239 + 118503 graph_last l 58 127 taactggagg 1363 0.774871596554963 5 15 3 20 1 NM_019413 refGene chr16 74181707 + 55087 graph_last 1 29 taagaaacct 1364 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 BC021509 knownGene chr5 129831289 - 107354 graph_last l 9 40 taagaaataa 1365 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_028710 refGene chr11 109101896 - 24794 graph_last 0 4 taagcacagg 1366 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 AK047847 knownGene chr6 8969479 + 110282 graph_last l 10 29 taagttataa 1367 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 taataaataa 1368 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 taattaaaca 1369 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_009513 refGene chr13 25140178 - 33437 graph_last 262 360 taattttcca 1370 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_009793 refGene chr18 33373772 + 63709 graph_last l 25 59 tacaatgtga 1371 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tacacattgc 1372 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_008562 refGene chr3 98363562 + 87354 graph_last l 24 42 tacattctat 1373 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_012061 refGene chr14 7708680 - 39067 graph_last l 85 150 tacattgcac 1374 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 taccccacaa 1375 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_144921 refGene chr7 19693527 - 119495 graph_last 31 49 taccctctca 1376 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 NM_009866 refGene chr8 104169543 - 132808 graph_last l 15 34 tacgaaaatg 1377 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 BC021511 knownGene chr2 105018789 - 77566 graph_last l 8 33 tacggaaatg 1378 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 NM_009655 refGene chr16 52615345 + 54331 graph_last l 3 9 tactgcttga 1379 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_013540 refGene chr3 82523207 + 86190 graph_last 0 5 tagaatgcaa 1380 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_198111 refGene chr12 48649939 + 27846 graph_last l 44 78 tagagaggtg 1381 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_172429 refGene chr19 53330345 - 70501 graph_last 8 24 tagctgagtt 1382 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_019434 refGene chr10 78647167 + 13750 graph_last l 17 38 tagctgtctg 1383 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_008163 refGene chr11 115150356 + 25117 graph_last l 3 10 taggcctata 1384 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tagttaacag 1385 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_176836 refGene chr9 14057358 + 135265 graph_last l 4 16 tatagattaa 1386 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 tatatgtgta 1387 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_011428 refGene chr2 136924791 + 79540 graph_last l 1065 1589 tatattaaat 1388 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 NM_010787 refGene chr17 46131129 + 59602 graph_last 26 134 tatcactctg 1389 0.774871596554963 0.4 8 20 11 7 BF119423 all_est chr13 91596104 + 36886 graph_last l 41 65 tatcttccac 1390 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_011856 refGene chr11 35647975 - 18964 graph_last l 6 23 tatgaattgt 1391 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 tatgtgtgcg 1392 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 tatgtttttt 1393 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tattgaaata 1394 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 tatttattta 1395 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_011170 refGene chr2 132080742 + 79291 graph_last l 147 432 tattttgttt 1396 0.774871596554963 0.45 9 20 12 7 NM_011462 refGene chr13 50837966 + 34831 graph_last l 45 104 tcaaagagac 1397 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 NM_053199 refGene chr1 177195251 - 8600 graph_last l 32 61 tcaacttaaa 1398 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_008689 refGene chr3 139331893 + 89605 graph_last 40 72 tcaataaagg 1399 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_025558 refGene chr8 108718621 + 133158 graph_last l 2 14 tcacaaccac 1400 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 BU558383 all_est chr11 67258905 + 20870 graph_last 0 6 tcacaagctg 1401 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_010881 refGene chr12 4267887 - 26007 graph_last l 6 43 tcaccttcaa 1402 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tcacttgtca 1403 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_028099 refGene chr6 87359718 - 114535 graph_last 2 5 tcagaaagaa 1404 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_007756 refGene chr5 107494346 + 105667 graph_last l 178 537 tcagaggcct 1405 0.774871596554963 0.4 8 20 11 7 genomic chr7 34197200 - 0 unique_long l 6 17 tcagccattt 1406 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_080848 refGene chr2 27805288 - 72985 graph_last 0 28 tcagtgtgac 1407 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_031249 refGene chr19 30800591 - 69174 graph_last l 20 33 tcatatctag 1408 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_133872 refGene chr4 135330172 - 98179 graph_last l 17 49 tcatcagcta 1409 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 NM_133817 refGene chr1 34481941 - 1356 graph_last 2 18 tcattcaatt 1410 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_177100 refGene chr13 81841929 + 36491 graph_last l 6 57 tccaggggtg 1411 0.774871596554963 3.33333333333333 20 6 26 2 NM_007837 refGene chr10 130574535 + 16683 graph_last l 17 50 tccagtaaag 1412 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tccctgtggt 1413 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_177688 refGene chr6 138248292 + 117643 graph_last 15 66 tccgggcgag 1414 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_133206 refGene chr8 113315673 + 133479 graph_last l 5 11 tcctgaccct 1415 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_016804 refGene chr2 75270957 + 75844 graph_last l 24 67 tcctttgtac 1416 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 tcgcatttta 1417 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_023537 refGene chr4 107800569 + 95991 graph_last l 8 66 tcgtgccctg 1418 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tctaaataaa 1419 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 tctaccatcc 1420 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_011697 refGene chr19 6974894 - 67715 graph_last l 32 91 tctcacctca 1421 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_173748 refGene chr11 6004172 - 17451 graph_last l 17 39 tctccatcac 1422 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_173437 refGene chr1 138354334 - 6521 graph_last l 3 27 tctccatcca 1423 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 genomic chr3 92501894 - 0 unique_long l 2 7 tctgaagagg 1424 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_144530 refGene chr1 136498115 - 6343 graph_last 18 55 tctgagacag 1425 0.774871596554963 5 15 3 20 1 NM_134022 refGene chr11 70603244 - 21213 graph_last l 82 441 tctgatggaa 1426 0.774871596554963 0.63265306122449 31 49 40 17 NM_080448 refGene chr6 114827136 - 116098 graph_last 1 7 tcttttgcaa 1427 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tgaaccgtcc 1428 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 tgaatgatag 1429 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_026313 refGene chr11 93871818 - 23162 graph_last l 4 11 tgacctggat 1430 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_016898 refGene chr10 43054004 + 11901 graph_last l 10 29 tgactccttg 1431 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_010058 refGene chr7 15970768 + 119241 graph_last l 30 80 tgactgttca 1432 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_009441 refGene chr16 96222366 + 56249 graph_last l 65 151 tgagaactgc 1433 0.774871596554963 5 15 3 19 1 tgagagaaag 1434 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_145410 refGene chr17 25392056 - 57926 graph_last 40 121 tgagatggca 1435 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tgagctgtct 1436 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tgaggctctg 1437 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_008671 refGene chrX 93088958 - 150492 graph_last l 63 109 tgagttacag 1438 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tgatatttga 1439 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_027439 refGene chrX 11164881 + 147275 graph_last l 143 350 tgcaaatgga 1440 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 NM_080793 refGene chr3 52965022 - 84822 graph_last l 23 62 tgcaagaaag 1441 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_007971 refGene chr6 47845060 - 112413 graph_last 1 26 tgcagctttc 1442 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 NM_134014 refGene chr11 23195325 + 18254 graph_last l 9 30 tgcatatcat 1443 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_013664 refGene chr17 55944806 + 60188 graph_last l 28 114 tgccacgtgc 1444 0.774871596554963 5 15 3 20 1 NM_010925 refGene chr10 80555396 + 13897 graph_last 0 15 tgccagcctg 1445 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tgcccctgct 1446 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_026313 refGene chr11 93876271 + 23162 graph_second l 5 16 tgcctcagaa 1447 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_019837 refGene chr17 27213812 - 58135 graph_second l 12 59 tgcgatgaaa 1448 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 tgcgttattc 1449 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_011885 refGene chr7 22543696 - 119747 graph_last l 49 216 tgctgggatg 1450 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 AK052704 knownGene chr13 54811911 - 35098 graph_last l 9 24 tggaggcctg 1451 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_182841 refGene chr5 99184051 + 105094 graph_last 0 3 tggatatctt 1452 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tggatcaagt 1453 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 tggatgctgg 1454 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 genomic chr14 96001945 - 0 unique_long l 2 5 tggcccacaa 1455 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_175092 refGene chr5_random 18746989 - 109355 graph_last l 25 68 tggccggctg 1456 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_019431 refGene chr11 107397888 - 24662 graph_second l 9 66 tggcctttga 1457 0.774871596554963 0.517241379310345 15 29 19 10 NM_007644 refGene chr5 92853169 - 104718 graph_last l 48 140 tggcttacag 1458 0.774871596554963 5 15 3 19 1 NM_053078 refGene chr18 33627436 - 63718 graph_last 0 12 tgggaaaaaa 1459 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_146157 refGene chr4 138220479 - 98421 graph_last 14 36 tgggacgccc 1460 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tggggttctg 1461 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tgggtagagg 1462 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 tgtacacagt 1463 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_178405 refGene chr1 176130347 - 8552 graph_last l 75 235 tgtacttgaa 1464 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tgtagcattt 1465 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_007842 refGene chr1 156913008 - 7324 graph_last l 12 47 tgtagtttca 1466 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 tgtataaaat 1467 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 tgtcatcgga 1468 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_178795 refGene chr2 121579213 + 78592 graph_last l 63 153 tgtgactccc 1469 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_018815 refGene chr6 92558088 - 114978 graph_last l 9 18 tgtgatcctt 1470 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_017476 refGene chr17 31968141 - 58641 graph_last l 3 13 tgtgcgagag 1471 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tgtgcgtgtg 1472 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_009955 refGene chr14 58531839 - 42295 graph_last l 66 213 tgtgtagcca 1473 0.774871596554963 0.4 8 20 11 7 NM_026222 refGene chr3 34773437 + 84139 graph_last 3 10 tgtgtttcta 1474 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_025544 refGene chr4 125010799 - 97156 graph_last 0 8 tgttcttcat 1475 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_176841 refGene chr11 29406550 + 18533 graph_last l 7 262 tgttggtacg 1476 0.774871596554963 0.411764705882353 7 17 9 6 NM_178628 refGene chr12 65855046 + 28595 graph_last l 61 93 tgtttgagtt 1477 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tgtttttgtt 1478 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ttaaaaatgt 1479 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_178878 refGene chr5 28251467 - 101461 graph_last l 7 51 ttaaggggga 1480 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 ttaataaaag 1481 0.774871596554963 0.411764705882353 7 17 9 6 NM_053075 refGene chr5 22955215 - 101155 graph_last l 54 151 ttacactact 1482 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 NM_177906 refGene chr9 29592164 + 136011 graph_last l 29 65 ttacattgta 1483 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ttagatgttt 1484 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 NM_177788 refGene chr8 106790089 - 132945 graph_last l 6 23 ttagtcttgg 1485 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 AK019388 knownGene chr13 57917324 + 35327 graph_last 0 5 ttcaaatctc 1486 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_009668 refGene chr18 32621656 + 63661 graph_last l 84 207 ttcagggcgg 1487 0.774871596554963 0.478260869565217 11 23 14 8 ttcaggtggg 1488 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ttcattctag 1489 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 NM_016795 refGene chr17 28227597 - 58266 graph_last 3 13 ttcatttggg 1490 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ttcctcgggt 1491 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_031877 refGene chr10 42466965 - 11865 graph_last l 13 36 ttccttctga 1492 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_026977 refGene chr1 76698301 + 3685 graph_last l 39 78 ttctcttctc 1493 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 BC046606 knownGene chr5 111426378 - 105964 graph_last l 37 78 ttctggaata 1494 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 ttcttgttgg 1495 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ttgagctctg 1496 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_007985 refGene chr13 62180314 - 35584 graph_last 0 13 ttgatcttca 1497 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 AK048260 knownGene chr8 111573095 + 133351 graph_last l 19 45 ttgcagcaaa 1498 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ttgcctccca 1499 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_177013 refGene chr6 24821995 - 110937 graph_last l 9 31 ttgctccttt 1500 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ttgctcttca 1501 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 AK021160 knownGene chr9 114000545 + 141657 graph_last l 47 71 ttgctgctgc 1502 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 ttgctgtgtg 1503 0.774871596554963 Inf 9 0 12 0 NM_023431 refGene chr10 82588221 + 14065 graph_last 1 8 ttgcttggtg 1504 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 AI840093 all_est chr7 15829747 + 119220 graph_last l 5 36 ttggtgagtg 1505 0.774871596554963 5 15 3 19 1 NM_133771 refGene chr17 74777044 - 61128 graph_last 16 65 ttgtacaaca 1506 0.774871596554963 0.333333333333333 4 12 5 4 ttgtccagct 1507 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_023603 refGene chr4 125949966 - 97273 graph_last l 40 132 ttgtgtgctg 1508 0.774871596554963 0.55 22 40 29 14 ttgtgtgttt 1509 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_026879 refGene chr16 66233943 - 54823 graph_last l 10 36 tttaatgcca 1510 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_023126 refGene chr8 72596482 + 131137 graph_last l 3 15 tttacactga 1511 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tttacatttt 1512 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_008053 refGene chr3 35031084 + 84156 graph_last 10 22 tttagtcttc 1513 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tttattattt 1514 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_178620 refGene chr11 116356222 + 25259 graph_last l 5 10 tttccttatt 1515 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 BC046968 knownGene chr5 143048358 - 108379 graph_last l 17 41 tttctcagct 1516 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_026661 refGene chr2 157193613 + 80777 graph_last l 7 25 tttctggtgt 1517 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 tttgcatttt 1518 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tttggtttgg 1519 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 tttgtggttg 1520 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_010488 refGene chr4 109064409 - 96128 graph_last l 6 34 tttgttgtga 1521 0.774871596554963 Inf 10 0 13 0 ttttaaaata 1522 0.774871596554963 0.411764705882353 7 17 9 6 ttttatttaa 1523 0.774871596554963 0.222222222222222 2 9 3 3 NM_008996 refGene chr11 20125068 - 18028 graph_last 0 18 ttttcattta 1524 0.774871596554963 0.166666666666667 1 6 1 2 NM_173777 refGene chr9 21220572 - 135578 graph_last l 42 153 ttttctttcc 1525 0.774871596554963 0.352941176470588 6 17 8 6 NM_177589 refGene chr9 123344210 + 142205 graph_last l 53 134 tttttgaaca 1526 0.774871596554963 2.66666666666667 24 9 32 3 cttaaatctg 1527 0.777006335969978 0.517241379310345 15 29 20 10 NM_146128 refGene chr2 157390043 + 80791 graph_last l 129 258 ttgtgagaat 1528 0.777006335969978 0.517241379310345 15 29 20 10 NM_009156 refGene chr7 12912230 - 118959 graph_last l 721 1811 tttccaggtg 1529 0.782537162259648 0.740384615384615 77 104 100 36 gactgaatct 1530 0.79331253062859 2.25 27 12 35 4 aagccttgct 1531 0.802260193946582 2.33333333333333 28 12 36 4 tgtgttgtgt 1532 0.816065179274989 0.694444444444444 50 72 65 25 aaggtctgcc 1533 0.823365713311209 0.470588235294118 8 17 10 6 NM_025816 refGene chr6 53234427 + 112812 graph_last l 22 165 accactgata 1534 0.823365713311209 0.478260869565217 11 23 15 8 atattgaaga 1535 0.823365713311209 0.470588235294118 8 17 10 6 NM_178060 refGene chr11 98348447 + 23676 graph_last l 25 69 ccatcttgac 1536 0.823365713311209 0.470588235294118 8 17 10 6 NM_009451 refGene chr17 57065346 - 60309 graph_last l 97 280 cccagatatt 1537 0.823365713311209 0.470588235294118 8 17 10 6 gccttggtga 1538 0.823365713311209 0.478260869565217 11 23 15 8 ggcagacctt 1539 0.823365713311209 0.470588235294118 8 17 10 6 NM_011740 refGene chr15 37102344 - 46293 graph_last l 111 235 taaattagtc 1540 0.823365713311209 0.470588235294118 8 17 10 6 NM_013540 refGene chr3 82522444 - 86190 graph_last l 43 155 tgtactatgt 1541 0.823365713311209 0.478260869565217 11 23 15 8 NM_008721 refGene chr2 25675901 + 72840 graph_last l 142 341 gatagagagt 1542 0.845656764243542 0.551724137931034 16 29 21 10 aaaaagtacc 1543 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 aaactggaat 1544 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 aaagctacga 1545 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_011306 refGene chr17 33667350 - 58807 graph_last l 25 68 aagaagactg 1546 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_178376 refGene chr4 85302774 + 94704 graph_last l 17 89 aataaactta 1547 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_022423 refGene chr11 58531070 - 20273 graph_second 0 9 aatgtgctcg 1548 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_026785 refGene chr2 165384134 + 81312 graph_last 1 19 acatctggtg 1549 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 acattgaaaa 1550 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_025358 refGene chr6 128754392 - 117052 graph_last b 16 91 acccatcgga 1551 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 AK122383 knownGene chr4 149174539 - 99491 graph_last l 19 90 acctgcaaaa 1552 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 agaccccagg 1553 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 agcacgaccc 1554 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_026002 refGene chr15 34549312 + 46126 graph_last l 13 44 agcactagtg 1555 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 agctccccct 1556 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_146019 refGene chr11 68934888 - 21006 graph_last 10 33 aggcccctaa 1557 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_198640 refGene chr12 109045110 - 31569 graph_last 0 26 aggctctcca 1558 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_023858 refGene chr9 14017239 + 135264 graph_last l 15 37 agttagtctc 1559 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 agtttttgtt 1560 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_013700 refGene chr6 126743522 - 116908 graph_last 25 140 atgtgaataa 1561 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_007622 refGene chr11 96391602 - 23456 graph_last 7 33 attcaagaca 1562 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 cacaacgccg 1563 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 cagatagagc 1564 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 cagcgagctg 1565 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 AK018139 knownGene chr10 30087338 + 11302 graph_last l 24 47 cagcgctacg 1566 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 BC040802 knownGene chr1 189041664 + 9388 graph_last l 8 33 catcctgata 1567 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 catttgaagc 1568 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 ccaaacgtgt 1569 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 ccaatttttt 1570 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 AW413767 all_est chr6 145318496 - 117964 graph_last l 5 29 ccacaataag 1571 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_025284 refGene chr6 73996446 + 113918 graph_last 0 37 ccacgaggtg 1572 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 L31652 knownGene chrX 90352430 + 150261 graph_last l 7 33 ccagaaggcc 1573 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 genomic chr2 174204839 + 0 unique_long l 87 166 ccataaaaga 1574 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 genomic chr5 92466331 - 0 unique_long l 31 107 cccactgagt 1575 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_016686 refGene chr11 87644045 + 22842 graph_last 4 41 ccctatgttt 1576 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 cctgtaatcc 1577 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 cctttgatcc 1578 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_009041 refGene chr9 54126623 + 137643 graph_last l 9 39 cgaaggagaa 1579 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_011029 refGene chr9 122505801 + 142160 graph_last 2 12 cgaggtacta 1580 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_016903 refGene chr14 66316418 + 42711 graph_last l 57 194 ctcctgcagc 1581 0.857242698903415 2.44444444444444 22 9 29 3 NM_009768 refGene chr10 82015311 + 14067 graph_last 78 531 ctctgactta 1582 0.857242698903415 0.578947368421053 22 38 29 13 NM_011732 refGene chr4 118392530 + 96680 graph_last 13 38 ctgcatagat 1583 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_029077 refGene chr4 45792216 + 92915 graph_last 3 33 gaagaatccg 1584 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 gacctgaagc 1585 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_027268 refGene chr6 54972818 - 112934 graph_last l 5 99 gacgagattc 1586 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_019793 refGene chr9 58246662 - 137907 graph_last l 251 568 gagactagca 1587 0.857242698903415 2.55555555555556 23 9 30 3 gagcccatca 1588 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 gatgaggatg 1589 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_176902 refGene chr11 115943906 + 25214 graph_last 2 15 gatggccaga 1590 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_031879 refGene chr9 85659183 - 139904 graph_last l 6 22 gcacagtgat 1591 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_178624 refGene chr9 116584101 + 141769 graph_last l 13 60 gcaccagcag 1592 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 gcagagtgcg 1593 0.857242698903415 1.6875 54 32 70 11 gcatcgcagg 1594 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 gcggctcaca 1595 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_013782 refGene chr7 133315232 + 126067 graph_last l 35 97 gctcccttga 1596 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 AK129143 knownGene chr18 78789794 - 66286 graph_last 1 14 gctcgggagg 1597 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_198831 refGene chr7 92857849 + 123484 graph_last 52 122 ggatggagtt 1598 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_026365 refGene chr6 115207828 + 116137 graph_last l 33 67 ggcaagcaac 1599 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_172659 refGene chr2 27289981 + 72975 graph_last l 7 38 ggcactgtcc 1600 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_130893 refGene chr15_random 16325637 + 50753 graph_last l 28 120 ggccccctcc 1601 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 ggcctcctgg 1602 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 ggcctgcccc 1603 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 AK052522 all_mrna chr19 47201723 + 70280 graph_last 0 66 ggctgctcaa 1604 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_008541 refGene chr13 56517408 + 35272 graph_last l 3 30 gggagcctta 1605 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_134002 refGene chr10 83005505 + 14113 graph_last l 37 107 gggaggcctc 1606 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_010110 refGene chrX 88985124 + 150221 graph_second 0 13 gggggtggag 1607 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_145587 refGene chr7 118304654 + 125072 graph_last l 2 19 gggtaggaga 1608 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 BF465688 all_est chr17 29457036 - 58386 graph_last 0 20 ggtgacacgg 1609 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 AK122419 knownGene chr5 117855920 - 106497 graph_last l 13 35 ggtgactgtt 1610 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_145939 refGene chr16 20229070 - 52176 graph_last 1 32 ggtggaacgg 1611 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 ggtttatttt 1612 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_021519 refGene chr2 25828459 + 72856 graph_last l 161 295 gtcaaacgga 1613 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_175366 refGene chr7_random 13763294 + 126800 graph_last 0 26 gtcaaatact 1614 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_026156 refGene chr8 3587661 - 127592 graph_last l 11 54 gtcactcccc 1615 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_009234 refGene chr12 21780471 + 26716 graph_second 0 17 gtcagagaga 1616 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 gtgagcttgt 1617 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_016959 refGene chr3 88105443 + 86463 graph_last 3 19 gtgccgaccg 1618 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 gtgctctctg 1619 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 AI266922 all_est chr3 142144272 - 89767 graph_second 9 91 gtggctcacg 1620 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 gtggctcact 1621 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_011591 refGene chrX 6466896 + 147054 graph_last 3 21 gtgggctctg 1622 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_009234 refGene chr12 21786972 - 26716 graph_last 0 20 taaacacatc 1623 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 taatccgtac 1624 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_133733 refGene chr9 42367530 - 136826 graph_last 1 31 tactgggaga 1625 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 tacttgtatg 1626 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 tagcgtctca 1627 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 genomic chr19 46300927 + 0 unique_long l 12 39 tatggtacca 1628 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_015806 refGene chr9 77915236 - 139540 graph_last l 10 52 tcactgctca 1629 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 tcagacgcgg 1630 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 tcctacagtg 1631 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_029576 refGene chr19 4920615 - 67499 graph_last l 41 117 tcctttgtgc 1632 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_145839 refGene chr5 98390761 - 105044 graph_last l 4 27 tcttaaccgt 1633 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 BY534359 all_est chrX 84532804 + 150025 graph_last 0 72 tgagagaaaa 1634 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 AK129151 knownGene chr3 104498123 - 87776 graph_last 2 28 tgcagtcagt 1635 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 tgccaagggt 1636 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_133867 refGene chr3 111037301 + 88249 graph_last 71 181 tgccgttttg 1637 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 tgctgccatt 1638 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_021884 refGene chr7 39774152 - 120912 graph_last l 38 91 tgctgtcagc 1639 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 tggcagtgtt 1640 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 tggctcggtc 1641 0.857242698903415 1.26415094339623 201 159 262 55 NM_016787 refGene chr9 72480244 + 139083 graph_last l 27 89 tggttacgta 1642 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_133763 refGene chr2 165381905 + 81307 graph_last l 16 76 tggttctgtt 1643 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 tggtttctgg 1644 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_008737 refGene chr8 130397400 + 134614 graph_last 1 20 tgttcatact 1645 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 ttacataaaa 1646 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_010160 refGene chr2 6463548 - 71738 graph_last l 23 80 ttggtgcttc 1647 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_016895 refGene chr4 127924855 + 97412 graph_last l 10 59 tttggcccct 1648 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_008737 refGene chr8 130398440 + 134614 graph_last l 4 14 ttttgtaccc 1649 0.857242698903415 Inf 8 0 10 0 NM_009875 refGene chr6 136327709 + 117541 graph_last l 10 54 ttttgtgcat 1650 0.857242698903415 Inf 8 0 11 0 NM_026629 refGene chr6 55168250 + 112941 graph_last l 20 135 agagcaagga 1651 0.859547331643732 0.605263157894737 23 38 30 13 atttgattag 1652 0.8601379143119 0.5625 18 32 23 11 NM_018753 refGene chr2 164632157 + 81241 graph_last 103 410 cactgattta 1653 0.8601379143119 0.5625 18 32 23 11 NM_021713 refGene chr15 104421295 + 50250 graph_last 56 226 gaaatgatga 1654 0.8601379143119 0.5625 18 32 23 11 cctttgtgac 1655 0.861539594363866 0.521739130434783 12 23 16 8 NM_021554 refGene chr7 113129493 + 124785 graph_last l 60 191 ctaataaacg 1656 0.861539594363866 0.521739130434783 12 23 16 8 AK013511 knownGene chr17 66217284 - 60720 graph_last l 65 260 ctgcgagatt 1657 0.861539594363866 0.521739130434783 12 23 16 8 NM_019837 refGene chr17 27213139 - 58135 graph_last l 96 189 tatgtgccaa 1658 0.861539594363866 0.521739130434783 12 23 16 8 NM_007984 refGene chr5 141879724 - 108268 graph_last l 76 283 atagtaagct 1659 0.874706040728617 2.14285714285714 30 14 39 5 NM_009559 refGene chr17 36762321 + 59102 graph_last l 4 106 cacgacaccc 1660 0.879041934120777 1.9 38 20 49 7 ctcaacagca 1661 0.88468960370305 3 18 6 23 2 ggcccccaca 1662 0.88468960370305 3 18 6 23 2 NM_134101 refGene chr16 20286287 + 52183 graph_last l 67 197 gggagcgggc 1663 0.88468960370305 3 18 6 23 2 taggaggtaa 1664 0.88468960370305 3 18 6 23 2 cacaaacggt 1665 0.886232546455187 0.789115646258503 116 147 151 51 gcaataaatg 1666 0.891537496278944 1.48076923076923 77 52 101 18 NM_025441 refGene chr12 65193787 + 28531 graph_last 21 68 aaatgaaacc 1667 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 agagagagag 1668 0.894969832147955 0.5625 18 32 24 11 AK012247 knownGene chr17 88203504 + 61969 graph_last 56 154 agcaggtttt 1669 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 NM_178597 refGene chr14 15619980 - 39454 graph_last l 54 103 atgacataga 1670 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 NM_009242 refGene chr11 55019713 - 20083 graph_last l 148 698 caaactctca 1671 0.894969832147955 0.470588235294118 8 17 11 6 NM_024188 refGene chr15 4121571 + 44924 graph_last l 71 165 ccaatgcagc 1672 0.894969832147955 0.470588235294118 8 17 11 6 CD776524 all_est chr12 104600518 - 31125 graph_last l 29 106 ccagtctctt 1673 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 NM_025531 refGene chr2 175049259 - 81992 graph_last l 33 119 ctgtactgtg 1674 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 ctgtagactg 1675 0.894969832147955 0.470588235294118 8 17 11 6 cttagatgtt 1676 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 gaactgcagg 1677 0.894969832147955 0.470588235294118 8 17 11 6 NM_011486 refGene chr11 100552220 - 23906 graph_last 2 202 gcatcctgtt 1678 0.894969832147955 0.470588235294118 8 17 11 6 NM_023047 refGene chr5 29136342 + 101523 graph_last l 5 137 gccctatgct 1679 0.894969832147955 0.6 24 40 32 14 NM_026899 refGene chr4 153846956 + 99801 graph_last l 68 159 gcctgccctg 1680 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 NM_175543 refGene chr11 79268990 + 22077 graph_last l 39 112 gggctgggcc 1681 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 NM_010206 refGene chr8 24418477 + 128679 graph_last l 28 117 ggggagacgc 1682 0.894969832147955 3 18 6 24 2 NM_018801 refGene chr19 10374071 + 67978 graph_last l 64 194 ggggaggttg 1683 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 NM_172475 refGene chr2 4532338 + 71564 graph_last l 12 49 taaaatgatt 1684 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 NM_013680 refGene chrX 19406078 + 147587 graph_last l 55 199 tcattatgat 1685 0.894969832147955 0.470588235294118 8 17 11 6 NM_023871 refGene chr2 30346417 + 73215 graph_last 30 84 tcttaacgtc 1686 0.894969832147955 0.470588235294118 8 17 11 6 NM_080456 refGene chr16 93512171 + 56067 graph_last 0 59 tgacaatatt 1687 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 tgataaaagt 1688 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 NM_133886 refGene chr4 125657160 - 97254 graph_last l 381 1164 tggacactca 1689 0.894969832147955 0.470588235294118 8 17 11 6 tgggacgcca 1690 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 genomic chr17 62610388 - 0 unique_long l 6 51 tggggatgcg 1691 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 tgggtgtctt 1692 0.894969832147955 0.470588235294118 8 17 11 6 tgtgtttgtg 1693 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 NM_175134 refGene chr15 37287708 + 46308 graph_last l 86 224 tgttccacac 1694 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 NM_010308 refGene chr8 95252523 + 132442 graph_last 48 209 ttgggatgtt 1695 0.894969832147955 0.470588235294118 8 17 11 6 NM_144521 refGene chr11 59005277 - 20316 graph_last l 42 131 ttgtcacatc 1696 0.894969832147955 0.357142857142857 5 14 7 5 NM_009786 refGene chr1 163743500 - 7720 graph_last b 19 109 acgcgaaaac 1697 0.904123101159857 4.33333333333333 13 3 17 1 NM_199022 refGene chr2 125928783 + 78833 graph_last l 38 101 cattgtggaa 1698 0.904123101159857 4.33333333333333 13 3 17 1 NM_199151 refGene chr9 72494658 + 139089 graph_last l 15 90 cgactctgtt 1699 0.904123101159857 4.33333333333333 13 3 17 1 NM_178928 refGene chr18 61852238 + 65311 graph_last 0 138 gaaggttcta 1700 0.904123101159857 4.33333333333333 13 3 17 1 NM_146170 refGene chr6 87848631 + 114579 graph_last l 13 86 gagccagtat 1701 0.904123101159857 4.33333333333333 13 3 17 1 NM_023210 refGene chr3 98647838 + 87397 graph_last l 34 100 gggttctgac 1702 0.904123101159857 4.33333333333333 13 3 17 1 NM_133916 refGene chr5 139141607 + 108083 graph_last 20 86 gggtttccag 1703 0.904123101159857 4.33333333333333 13 3 17 1 BC031849 knownGene chr13 71875683 - 36100 graph_last l 20 141 tagtagtgga 1704 0.904123101159857 4.33333333333333 13 3 17 1 NM_026521 refGene chr15_random 24415953 + 50910 graph_last 77 171 tttagctgac 1705 0.904123101159857 4.33333333333333 13 3 17 1 gcctccaagg 1706 0.917066007505386 0.819512195121951 168 205 220 71 NM_028036 refGene chr18 36859867 - 64013 graph_last l 142 344 cagaatgtgc 1707 0.924335614090845 0.538461538461538 14 26 18 9 NM_016884 refGene chr14 43935722 - 41160 graph_last 11 70 attgccctgc 1708 0.929074043825436 4.66666666666667 14 3 18 1 NM_011492 refGene chr10 82439824 + 14048 graph_last l 15 81 ccgccctgcg 1709 0.929074043825436 4.66666666666667 14 3 18 1 genomic chr5 135809939 - 0 unique_long l 44 102 ccggcctccc 1710 0.929074043825436 4.66666666666667 14 3 18 1 BC043038 knownGene chr2 21127273 - 72547 graph_last l 24 91 cctgtgtgca 1711 0.929074043825436 4.66666666666667 14 3 18 1 NM_021399 refGene chr12 103477310 - 31002 graph_last l 5 29 ctatggaagg 1712 0.929074043825436 4.66666666666667 14 3 18 1 ctcttggctg 1713 0.929074043825436 4.66666666666667 14 3 18 1 NM_016805 refGene chr1 182364850 - 8917 graph_last l 23 78 gagtcagcat 1714 0.929074043825436 4.66666666666667 14 3 18 1 gcagctcaca 1715 0.929074043825436 4.66666666666667 14 3 18 1 NM_011278 refGene chr5 32900848 + 101872 graph_last l 86 183 ggtatcagtc 1716 0.929074043825436 4.66666666666667 14 3 18 1 cagatctttg 1717 0.943223640366463 0.708333333333333 51 72 66 25 aaactttgta 1718 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_027569 refGene chr11 93709672 + 23144 graph_last l 22 65 aaatatatat 1719 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 aacaagtcat 1720 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 aacttcttgt 1721 0.95602808965454 0.5 10 20 13 7 aagtgatggc 1722 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_133808 refGene chr1 95353819 - 4811 graph_last l 27 65 aatatggatg 1723 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 acggggagag 1724 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_032002 refGene chr9 57340402 + 137846 graph_last 1 14 acttaagaaa 1725 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_023605 refGene chr9 80630204 - 139690 graph_last l 16 63 acttagtggc 1726 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_133901 refGene chr5 143720224 + 108421 graph_last 13 34 agattagtcc 1727 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 aggtcgggtg 1728 0.95602808965454 1.32631578947368 126 95 165 33 attaaagccc 1729 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_052973 refGene chr12 47286565 - 27775 graph_last l 8 39 attaagacaa 1730 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_177698 refGene chr8 67679257 - 130732 graph_last l 40 136 caaacagtga 1731 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 caaatccaaa 1732 0.95602808965454 2.16666666666667 26 12 34 4 NM_008640 refGene chr12 9084302 - 26222 graph_last 25 107 caaccatcat 1733 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_030210 refGene chr5 124411318 + 107069 graph_last l 7 58 cacacctgta 1734 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 cagcaataaa 1735 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 caggagcgga 1736 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 BC056500 knownGene chr11 83961818 + 22445 graph_last 14 38 cagggttact 1737 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 cagtacaaat 1738 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 genomic chr13 37956715 + 0 unique_long l 14 34 cctctgatgc 1739 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_025285 refGene chr3 8633103 + 82940 graph_second 1 9 cgatatcagt 1740 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_008064 refGene chr11 118838109 + 25448 graph_last b 37 222 cgcccctgaa 1741 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 AK007352 knownGene chr4 137235208 + 98340 graph_last l 535 956 cggtctagtc 1742 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_182807 refGene chr10 126835352 + 16544 graph_last l 10 75 cgtatcaata 1743 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_026139 refGene chrX 123295619 - 151475 graph_last l 29 56 ctaaagaaac 1744 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 ctcaataaac 1745 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_007881 refGene chr6 126665846 - 116898 graph_last l 15 53 ctcatcaccc 1746 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 ctgagagcca 1747 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_178645 refGene chr11 76558320 + 21779 graph_last l 23 70 ctgcctcaca 1748 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 ctggctttca 1749 0.95602808965454 0.5 10 20 13 7 NM_175934 refGene chr17 35591909 - 59004 graph_last l 51 110 ctgggtaaag 1750 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 cttaaataaa 1751 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_009383 refGene chr7 120686136 + 125323 graph_last l 3 17 cttactatgg 1752 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 AK018295 knownGene chr18_random 3638804 + 66832 graph_last l 12 59 gaaacactat 1753 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 gaagaattct 1754 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_025394 refGene chr5 22035360 - 101074 graph_last 88 212 gaaggtgtat 1755 0.95602808965454 0.5 10 20 13 7 NM_029364 refGene chr10 124410646 + 16399 graph_last l 12 39 gaatgcaggg 1756 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 gacccagctc 1757 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 gaggcccaag 1758 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 gagttctctg 1759 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 NM_008717 refGene chr6 85114223 + 114381 graph_last 26 70 gataatacct 1760 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 gattgttgat 1761 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 gccgactaaa 1762 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 gctgcctcca 1763 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_198013 refGene chr11 87771670 + 22857 graph_last l 22 44 ggcacacagc 1764 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 AK129173 knownGene chr10_random 86612 + 16995 graph_last 15 59 ggcaccgcag 1765 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_178665 refGene chr16 24304354 + 52489 graph_last 0 85 ggcagagaag 1766 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 ggcatctgct 1767 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 ggctgtactg 1768 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 ggcttggttt 1769 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_018873 refGene chr11 97093300 - 23526 graph_last l 34 79 gggggttctc 1770 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_030225 refGene chr12 81127815 + 29823 graph_last l 26 69 gtaaaatgct 1771 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_008980 refGene chr2 130694706 + 79152 graph_last 37 87 gtccagacac 1772 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_018770 refGene chr9 49857439 - 137345 graph_last l 17 44 gtccttgtac 1773 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 NM_028105 refGene chr12 83930155 + 30055 graph_last l 9 37 gtgacacctt 1774 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 gtgactccca 1775 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 gtgatgcaaa 1776 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 AK077185 knownGene chr12 47193284 - 27751 graph_last l 6 30 gtgcaaatcc 1777 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_013597 refGene chr7 59788733 + 121796 graph_last l 75 125 taaaaccgtt 1778 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 taacattgta 1779 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 genomic chr5 120593837 + 0 unique_long l 2 17 tacatcatca 1780 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_013490 refGene chr19 3698277 + 67346 graph_last l 29 56 tacattaata 1781 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_007471 refGene chr16 86207600 - 55668 graph_last l 75 198 tatctttgga 1782 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 tcaactttca 1783 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 tccagaggcc 1784 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_019771 refGene chr2 144020106 - 79829 graph_last l 11 68 tgactgcctg 1785 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 tgagcatact 1786 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 NM_024213 refGene chr5 51970677 - 102794 graph_last l 16 48 tgagggtgtt 1787 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 tgattgttgg 1788 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 tgcacacaga 1789 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 tgctctgcct 1790 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 NM_023665 refGene chr4 133783144 + 98031 graph_last l 20 72 tgggcaaact 1791 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_175328 refGene chr10 105944432 + 15398 graph_last l 7 22 tggttggctg 1792 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_023326 refGene chr2 25973946 + 72877 graph_last l 20 61 ttaactgcct 1793 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_025673 refGene chr15 12386785 + 45378 graph_last l 15 49 ttaatagtgg 1794 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_015803 refGene chr14 51378500 - 41718 graph_last l 14 35 ttactgtgta 1795 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 ttagactcaa 1796 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_016802 refGene chr9 110978223 + 141363 graph_last 40 117 ttagttacct 1797 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_030702 refGene chr11 69244526 - 21048 graph_last 15 47 ttcagagggc 1798 0.95602808965454 0.333333333333333 3 9 4 3 NM_029979 refGene chr14 58039927 + 42269 graph_last l 27 94 tttgctgtgt 1799 0.95602808965454 0.428571428571429 6 14 8 5 NM_033561 refGene chr5 133448365 - 107623 graph_last l 83 309 cattgcgtgg 1800 0.958279653150826 0.6 21 35 27 12 aaaaactcta 1801 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 AF065991 knownGene chr10 18743590 - 10634 graph_last l 9 59 aaaaatgttg 1802 0.967863018022135 2.66666666666667 16 6 21 2 aaaataaaaa 1803 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_026283 refGene chr14 16687247 + 39560 graph_last l 15 34 aaaatccctg 1804 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_011699 refGene chr2 110030385 + 77796 graph_last l 9 36 aaacttcaga 1805 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 aaagaaaaaa 1806 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_009469 refGene chr5 109844911 + 105857 graph_last l 12 54 aaagcagtgc 1807 0.967863018022135 0.571428571428571 8 14 10 5 NM_028106 refGene chr13 93590067 + 37016 graph_last 5 18 aaatacttgt 1808 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_029166 refGene chr10 92174772 + 14741 graph_last l 9 28 aaatcgtata 1809 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 aaatgctcat 1810 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009212 refGene chr19 3092972 + 67273 graph_last 3 20 aaatttagga 1811 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_028217 refGene chr16 33753252 + 53134 graph_last 2 5 aacatatatt 1812 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_007410 refGene chr3 142379543 + 89786 graph_last l 11 62 aactaggcaa 1813 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 NM_009104 refGene chr12 19161361 + 26608 graph_last 1 20 aactgacata 1814 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_023735 refGene chr1 128078440 - 5827 graph_last l 56 214 aagaaaaagt 1815 0.967863018022135 2.33333333333333 21 9 28 3 aagaaaccag 1816 0.967863018022135 0.674418604651163 29 43 38 15 NM_011182 refGene chr5 142660068 + 108340 graph_last 0 13 aagaaatatc 1817 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 aagaattaga 1818 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 M22432 knownGene chr9 81062324 - 139726 graph_last 17 32 aagctttgag 1819 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_008302 refGene chr17 44963467 - 59486 graph_second l 18 35 aaggagaccc 1820 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 BC054403 knownGene chr11 118044118 - 25408 graph_last l 20 104 aagggcaaaa 1821 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_020580 refGene chr2 175011463 + 81985 graph_last l 7 37 aagggtttat 1822 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 aataaacttt 1823 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 aatacagtat 1824 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_172841 refGene chr1 12980328 - 424 graph_last 0 6 aatacttgat 1825 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_016805 refGene chr1 182364403 + 8917 graph_last 2 22 aatctggctg 1826 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 aatgatgcct 1827 0.967863018022135 0.576923076923077 15 26 20 9 NM_172992 refGene chr5 19051048 + 100868 graph_last 0 5 aatgtaagaa 1828 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 aattaattaa 1829 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 CF929608 all_est chr12 51042570 + 28064 graph_last 3 55 aattcaatta 1830 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 aatttattgc 1831 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 acaaaataaa 1832 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_027590 refGene chr8 68828850 + 130782 graph_last l 14 44 acaagcgctg 1833 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_023122 refGene chrX 154411688 + 152747 graph_last l 236 368 acagaattat 1834 0.967863018022135 0.571428571428571 8 14 10 5 acagctcaca 1835 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_139272 refGene chr8 126142879 + 134336 graph_last 2 11 acagtgtgcc 1836 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_015782 refGene chr7_random 453853 + 126418 graph_last 10 52 acatcgcctt 1837 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_024186 refGene chr13 89912798 + 36756 graph_last 1 9 acatcttaag 1838 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_133726 refGene chr15 82825023 - 48651 graph_last l 6 28 acccaattat 1839 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 accctcgggc 1840 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_013685 refGene chr18 70042134 + 65838 graph_last l 12 177 accgttctgt 1841 0.967863018022135 2 28 14 37 5 acctctctct 1842 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_183154 refGene chr12 79621565 + 29644 graph_last l 24 43 accttcagat 1843 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_134089 refGene chr15 77420911 + 48074 graph_last 1 28 acgctgtgca 1844 0.967863018022135 0.5 7 14 9 5 NM_172817 refGene chr15 78138753 - 48157 graph_last 0 8 acgttcctaa 1845 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_153581 refGene chr8 55141907 - 130191 graph_last l 13 35 actagtagtt 1846 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_011670 refGene chr5_random 2617542 - 109059 graph_second l 9 21 actccgtggc 1847 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 actcctccct 1848 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008692 refGene chr4 119895790 + 96803 graph_last 0 30 actctgggcc 1849 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 actgaattag 1850 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_013735 refGene chr2 121465159 - 78588 graph_last 0 12 acttatacct 1851 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_011552 refGene chr18 60870033 + 65230 graph_last 1 15 acttccaagg 1852 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_009062 refGene chr1 173495252 - 8325 graph_last l 77 118 actttgagat 1853 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_025478 refGene chr18 58849692 + 65147 graph_last 7 44 actttgtagg 1854 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_172683 refGene chr3 97581879 + 87240 graph_last l 4 18 agaactttgc 1855 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 AK129101 knownGene chr1 156265541 - 7258 graph_last l 7 31 agaatttggt 1856 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_017368 refGene chr2 91634573 + 76800 graph_last l 18 65 agagagcctg 1857 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_020520 refGene chr9 111306869 + 141423 graph_last 2 37 agagcactca 1858 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_010308 refGene chr8 95252518 - 132442 graph_second l 24 55 agagcgaggg 1859 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_011841 refGene chr11 61059895 + 20525 graph_last 1 14 agaggcagca 1860 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 AK031967 knownGene chr5 109145010 + 105782 graph_last 8 28 agagggacct 1861 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_011588 refGene chr7 10287113 - 118856 graph_last l 64 160 agaggtggtt 1862 0.967863018022135 0.55 11 20 14 7 NM_146154 refGene chr4 131712903 - 97795 graph_last l 3 20 agagttcttc 1863 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_175375 refGene chr18 36757608 + 64005 graph_last l 5 18 agatacatag 1864 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 agatccagct 1865 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 agatcttgcc 1866 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_028711 refGene chr17 43058742 - 59360 graph_last l 4 13 agcaaagggt 1867 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008707 refGene chr11 102692517 + 24151 graph_last l 31 88 agcactgcag 1868 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_026648 refGene chr8 121477835 - 133909 graph_last l 16 42 agcagatggt 1869 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BC049262 knownGene chr10 101669482 + 15243 graph_last 34 81 agcagtggtg 1870 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_017392 refGene chr3 111532090 - 88311 graph_second 0 12 agcatcaagg 1871 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_011865 refGene chr6 87941050 + 114590 graph_last 6 47 agccaaaaaa 1872 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_031408 refGene chr5_random 31027085 + 109595 graph_last l 4 14 agcctggaga 1873 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_053202 refGene chr6 100580612 - 115476 graph_last b 6 22 agcgcattct 1874 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 AA048288 all_est chr13 51173146 - 34871 graph_last l 21 71 agcgcctcag 1875 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_026896 refGene chr2 29793715 + 73139 graph_last l 4 19 agctgttaat 1876 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_010487 refGene chr9 22694824 - 135759 graph_last l 39 62 aggagaaaag 1877 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 aggaggagta 1878 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 aggcagacag 1879 0.967863018022135 1.13492063492063 429 378 560 131 aggccacagc 1880 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_025915 refGene chr11 68962291 - 21014 graph_last 7 39 agggcagaaa 1881 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_153529 refGene chr13 36703885 - 33999 graph_last l 49 153 aggggccggt 1882 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_021532 refGene chr12 67216150 + 28714 graph_last 1 13 agtagtagtt 1883 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_177672 refGene chr4 147828700 - 99311 graph_last 2 17 agtccagctg 1884 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 agtggtcaag 1885 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 agttaatgaa 1886 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_011597 refGene chr19 24138219 + 68780 graph_last l 4 18 agttatcaac 1887 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009156 refGene chr7 12915304 - 118959 graph_second l 8 17 agttccccgg 1888 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_024179 refGene chr18 38379793 + 64134 graph_last l 8 29 agttcttttt 1889 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_010487 refGene chr9 22637638 - 135759 graph_last l 12 37 agtttgcagg 1890 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_145151 refGene chr7 82371358 + 122878 graph_last l 10 32 agtttgtatt 1891 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BC042189 knownGene chr5 66386989 - 103471 graph_last l 5 12 atacatattc 1892 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_030723 refGene chr12 8894891 - 26200 graph_last l 4 9 atagtttgtg 1893 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_010310 refGene chr2 174705071 + 81983 graph_last 498 1272 atcaacaccg 1894 0.967863018022135 1.38181818181818 76 55 99 19 NM_183208 refGene chr14 20459126 + 39730 graph_last l 9 27 atcacaggtg 1895 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_153680 refGene chr5 29526410 - 101570 graph_last l 7 42 atcccttgca 1896 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_138666 refGene chr3 26284325 - 83641 graph_last l 16 33 atctttgctc 1897 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_146236 refGene chrX 125282745 + 151550 graph_last l 7 24 atgaatacat 1898 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_027309 refGene chr9 78164303 + 139565 graph_last l 23 51 atgactgtgg 1899 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_026977 refGene chr1 76686541 - 3685 graph_last 2 19 atgagagctg 1900 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_172468 refGene chr4 59654778 + 93677 graph_last l 3 17 atgagtggcc 1901 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_019400 refGene chr11 70549148 - 21202 graph_last l 73 202 atgatggaca 1902 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 NM_025628 refGene chr7 24582313 - 119954 graph_last 226 1081 atgcaactac 1903 0.967863018022135 0.690909090909091 38 55 50 19 NM_007988 refGene chr11 120360184 - 25618 graph_last l 15 88 atgcagggcc 1904 0.967863018022135 0.55 11 20 15 7 atgcgcaagg 1905 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_175251 refGene chr15 98368120 + 49697 graph_last l 4 37 atgctgagag 1906 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 NM_177751 refGene chrX 145844722 - 152396 graph_last 1 8 atggatgcgt 1907 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_026140 refGene chr7 114159805 + 124842 graph_last l 6 22 atgggccttt 1908 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_178854 refGene chr5 95265358 + 104890 graph_last l 3 12 atgtataggg 1909 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_177145 refGene chr3 100575769 - 87565 graph_last l 31 75 atgtgcagac 1910 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 atgttgagac 1911 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 attatatttt 1912 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_027287 refGene chr3 156132299 + 90410 graph_last 1 10 attccagcca 1913 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 attctgaaca 1914 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 attgcaattt 1915 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 attgtctttt 1916 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009011 refGene chr4 55070206 + 93392 graph_last 5 24 atttgagaag 1917 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_033474 refGene chr16 18012617 - 52029 graph_last l 28 66 caaaccacta 1918 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009870 refGene chr10 130337460 + 16653 graph_second 0 10 caaactgcat 1919 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 caaactttat 1920 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 genomic chr2 116134387 - 0 unique_long l 7 31 caaagatcct 1921 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 caaattaacc 1922 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 AW122360 all_est chr14 71016895 + 43033 graph_last l 10 22 caaattcctc 1923 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 caacaaaacc 1924 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_080633 refGene chr15 83461809 + 48679 graph_last l 115 306 caactgtatt 1925 0.967863018022135 0.571428571428571 8 14 10 5 caacttcaat 1926 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_009965 refGene chr11 77287082 - 21860 graph_last l 3 13 caaggcacac 1927 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008515 refGene chr1 93044437 + 4647 graph_last l 14 30 caagggtcac 1928 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008444 refGene chr2 154075944 + 80472 graph_last l 4 22 caagtcttgg 1929 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 caataaactg 1930 0.967863018022135 2 24 12 31 4 NM_021515 refGene chr2 32907534 - 73459 graph_second 0 44 cacacagcat 1931 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 NM_026467 refGene chr9 69425322 + 138888 graph_last l 20 143 cacagactgt 1932 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 genomic chr13 89917780 + 0 unique_long l 3 15 cacattgtta 1933 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 caccaccaca 1934 0.967863018022135 1.53125 49 32 64 11 caccacgacc 1935 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 caccccagtc 1936 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 cacccccaca 1937 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_010583 refGene chr11 45991197 + 19428 graph_second 0 9 cacgacctga 1938 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_025641 refGene chr4 114978432 - 96347 graph_last l 243 524 cacgggacca 1939 0.967863018022135 2 28 14 37 5 NM_009798 refGene chr4 138163850 + 98405 graph_last l 20 83 cactcgttag 1940 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_009768 refGene chr10 82015306 - 14067 graph_last l 24 49 cactggcctt 1941 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_026934 refGene chr2 84026358 + 76261 graph_last 13 46 cacttcctcc 1942 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_144871 refGene chr19 3622286 + 67325 graph_last l 24 69 cacttgcagt 1943 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 cagaacaatg 1944 0.967863018022135 2.66666666666667 16 6 21 2 NM_015735 refGene chr19 10550968 + 68008 graph_last l 7 18 cagaaccgac 1945 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 BC030909 all_mrna chr16 4782050 + 51185 graph_second 1 12 cagacaccaa 1946 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_011030 refGene chr10 61244763 + 12686 graph_last l 18 28 cagacgccag 1947 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 cagaggaagg 1948 0.967863018022135 0.571428571428571 8 14 10 5 NM_008687 refGene chr4 80902877 + 94453 graph_last 1 12 cagaggtaac 1949 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 BC044772 knownGene chr12 19450791 + 26628 graph_last l 10 26 cagccaccca 1950 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 cagcgcggga 1951 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_007595 refGene chr11 5909742 - 17440 graph_last 0 15 cagctggggg 1952 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_018741 refGene chr4 45100797 - 92863 graph_last 0 36 cagctttttt 1953 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 genomic chr2 136225363 - 0 unique_long l 13 44 cagggtacca 1954 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_009438 refGene chr7 38103462 + 120755 graph_last 1 8 caggtggtgc 1955 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_029787 refGene chr15 84806195 - 48854 graph_last l 2 40 cagtcttgag 1956 0.967863018022135 0.571428571428571 8 14 10 5 NM_172463 refGene chr1 95249248 - 4797 graph_last l 6 18 catctgagga 1957 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009481 refGene chrX 11203087 - 147308 graph_last l 10 41 catctgtgta 1958 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_013626 refGene chr1 99762346 + 4989 graph_second 0 80 cattggatac 1959 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 catttgaaaa 1960 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 NM_007462 refGene chr18 34531487 + 63749 graph_second l 15 22 ccaaaaaaga 1961 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009238 refGene chr13 28838778 + 33570 graph_second 0 10 ccaatgctcc 1962 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_178610 refGene chr10 114558327 - 15852 graph_last 19 53 ccacaactac 1963 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 ccacacaagc 1964 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 ccagccaaca 1965 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ccaggcagtg 1966 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_028754 refGene chr4 106756792 + 95885 graph_last l 24 89 ccagggtttg 1967 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 ccagtgcctg 1968 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 ccatcctacc 1969 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 cccaaggctg 1970 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_016701 refGene chr3 90065439 + 86598 graph_last 0 53 cccagaggag 1971 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 cccaggctct 1972 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_009271 refGene chr2 158097469 + 80874 graph_last l 49 96 cccaggcttg 1973 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_175934 refGene chr17 35599198 - 59004 graph_last l 5 60 cccagggtgt 1974 0.967863018022135 2.83333333333333 17 6 22 2 NM_173761 refGene chr2 180715940 - 82424 graph_last b 9 49 cccgacgccc 1975 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009755 refGene chr14 62028140 - 42526 graph_last l 17 34 ccctcctgtc 1976 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_011370 refGene chr7 48844066 - 121276 graph_last l 41 76 ccgaatattc 1977 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_153410 refGene chr2 26618590 - 72938 graph_last l 8 33 ccgacactac 1978 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_010162 refGene chr15 54179311 - 46921 graph_last l 19 43 ccgctgatcc 1979 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008447 refGene chr10 130503334 - 16675 graph_last b 181 743 ccggcgtgga 1980 0.967863018022135 0.620689655172414 18 29 24 10 NM_008241 refGene chr12 44849211 + 27632 graph_last 0 13 cctaaatttt 1981 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 cctacagtcc 1982 0.967863018022135 2.07142857142857 29 14 38 5 NM_027617 refGene chr3 150382493 - 90215 graph_last 0 7 cctactcatt 1983 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_016676 refGene chr12 3283787 - 25835 graph_last l 40 118 cctcactggt 1984 0.967863018022135 0.5 7 14 9 5 cctccagtct 1985 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_177782 refGene chr2 167181097 - 81470 graph_last l 2 21 cctcctgccc 1986 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 cctcgcacag 1987 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 cctctggtgt 1988 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 cctcttcccc 1989 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 cctgcaggtc 1990 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_177762 refGene chr6 88426957 + 114661 graph_last l 3 17 cctgtatggg 1991 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 cctgtcacat 1992 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_178111 refGene chr2 156014975 + 80642 graph_last l 26 73 cctgtgtatg 1993 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_145430 refGene chr11 77730916 - 21908 graph_last 0 23 ccttgatgcc 1994 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 cctttaattc 1995 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 cctttatttc 1996 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 cctttcaagc 1997 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_177784 refGene chr2 70126124 + 75495 graph_last 2 20 cgaaaggtaa 1998 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_027458 refGene chr9 69693271 - 138908 graph_last l 10 24 cgagcccctc 1999 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008060 refGene chr19 9080865 - 67898 graph_last b 90 266 cgatcccctt 2000 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 NM_053074 refGene chr7 37773215 + 120706 graph_last l 13 68 cgcgcgctgg 2001 0.967863018022135 0.5 7 14 9 5 NM_007835 refGene chr6 84323318 + 114272 graph_last l 44 213 cgcggcaggc 2002 0.967863018022135 2.83333333333333 17 6 22 2 NM_013559 refGene chr5 148461843 + 108790 graph_last l 4 29 cggaaatgaa 2003 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_153144 refGene chr11 84431588 + 22490 graph_last l 3 8 cggacttcca 2004 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BC056498 knownGene chr7 134061373 + 126130 graph_last b 31 160 cggattcgca 2005 0.967863018022135 2.33333333333333 21 9 28 3 genomic chr15 85458259 + 0 unique_long l 2 12 cgggaaccgc 2006 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 BC025839 knownGene chr17 66248885 + 60724 graph_last l 20 78 cgggctgcgg 2007 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 AK083224 knownGene chr14 86523813 - 43463 graph_last l 39 63 cgtccaggtt 2008 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008214 refGene chr18 36887413 - 64020 graph_last l 43 94 cgttgggctc 2009 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_144824 refGene chr11 69161993 + 21033 graph_last 4 30 ctacagagga 2010 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_177680 refGene chr5_random 1003610 + 109001 graph_last 9 17 ctactgaaca 2011 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ctactgacat 2012 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_144839 refGene chr14 13833193 - 39341 graph_last l 35 63 ctactgggaa 2013 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_176849 refGene chr8 8720011 + 127791 graph_last 1 14 ctagggtgaa 2014 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_172522 refGene chr9 67089160 - 138600 graph_last l 31 89 ctatggcttc 2015 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_145571 refGene chr6 84470782 + 114286 graph_last l 9 23 ctatgggctg 2016 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 ctcacaggca 2017 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008512 refGene chr10 130814379 - 16708 graph_last l 32 102 ctcagtatcc 2018 0.967863018022135 0.55 11 20 15 7 ctcagtggca 2019 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_015753 refGene chr2 45290945 - 74261 graph_last l 32 98 ctcgaataaa 2020 0.967863018022135 2.66666666666667 16 6 21 2 AK075830 knownGene chr16 8108129 - 51324 graph_last l 24 106 ctcgctaatg 2021 0.967863018022135 2.33333333333333 21 9 27 3 NM_133741 refGene chr9 124559102 + 142297 graph_last l 11 41 ctctgaggca 2022 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_018858 refGene chr5 116315654 + 106380 graph_last l 120 447 ctcttccccc 2023 0.967863018022135 0.721311475409836 44 61 58 21 NM_177357 refGene chr16 33714499 - 53107 graph_last l 5 15 ctgaagaagt 2024 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_022420 refGene chr7 111043611 + 124660 graph_last l 13 96 ctgagtttga 2025 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 AK005178 knownGene chr15 83817343 + 48774 graph_last l 23 74 ctgcacttcc 2026 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_019829 refGene chr19 9252464 - 67921 graph_last l 37 132 ctgcagccta 2027 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 AK045393 all_mrna chr4 86837269 + 94802 graph_second 0 10 ctgccctaga 2028 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_033608 refGene chr1 176356886 + 8567 graph_last 1 6 ctgccggccc 2029 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_030109 refGene chr19 5095990 - 67531 graph_last 24 118 ctgctaagca 2030 0.967863018022135 0.55 11 20 14 7 AA789610 all_est chr13 72179938 - 36121 graph_last 3 21 ctgctgtgct 2031 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 genomic chr5 148613610 + 0 unique_long l 9 16 ctggacaggc 2032 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_011492 refGene chr10 82454712 + 14048 graph_last 5 16 ctggacctgg 2033 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_175151 refGene chr15 60260499 + 47258 graph_last l 2 8 ctggatcaaa 2034 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BC023970 knownGene chr15 95347246 - 49526 graph_last l 13 27 ctggatttga 2035 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ctgggcgtgt 2036 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 ctgggtgcct 2037 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_009760 refGene chr7 130790036 - 125863 graph_last l 54 88 ctgtatatat 2038 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BF165174 all_est chr4 93990433 - 95085 graph_last l 10 19 ctgtcaattc 2039 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BC048535 knownGene chr2 120005536 + 78435 graph_last l 6 21 ctgtctgtag 2040 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_033444 refGene chr17 34714269 + 58915 graph_last l 3 15 ctgtgccctc 2041 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 ctgtgcttta 2042 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_026156 refGene chr8 3586476 + 127592 graph_last 2 35 ctgtgggggg 2043 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_009148 refGene chr6 33890335 + 111472 graph_last l 6 25 ctgtgttcag 2044 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_021504 refGene chr14 11516604 - 39213 graph_last 0 11 ctgttcagag 2045 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_173363 refGene chr12 107106677 + 31339 graph_last 13 63 cttgacacac 2046 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 NM_172441 refGene chrX 140902981 - 152206 graph_last l 15 44 cttgatgctt 2047 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008258 refGene chr11 115003715 - 25097 graph_last l 15 97 cttgggaact 2048 0.967863018022135 2.33333333333333 21 9 28 3 NM_146087 refGene chr18 61710820 + 65292 graph_last l 28 80 cttgtcagtt 2049 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 ctttccaata 2050 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 CF170812 all_est chr2 167511749 + 81497 graph_last l 13 34 ctttgatcag 2051 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_010431 refGene chr12 69866296 + 28887 graph_last l 13 25 ctttgttagt 2052 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_010306 refGene chr3 111247390 - 88264 graph_last l 6 28 cttttccttt 2053 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 cttttgtttt 2054 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 cttttttatt 2055 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009798 refGene chr4 138160487 + 98405 graph_last l 6 56 gaaaacaaaa 2056 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 AI390780 all_est chr4 11907783 - 91323 graph_last l 39 92 gaaacctcta 2057 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_021518 refGene chr4 8509605 + 91121 graph_last 7 25 gaaacttctg 2058 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_198249 refGene chr14 43853973 + 41155 graph_last 0 8 gaaagaaagg 2059 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009750 refGene chrX 124844890 + 151536 graph_last l 173 452 gaaagcaatg 2060 0.967863018022135 2 28 14 37 5 NM_080471 refGene chr4 32919178 - 92090 graph_last l 7 30 gaacttgtgt 2061 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_030723 refGene chr12 8896908 + 26200 graph_last l 24 55 gaactttaga 2062 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 gaagaaaatg 2063 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 gaagcagggc 2064 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_013456 refGene chr19 4681892 + 67463 graph_last l 29 72 gaagccagcg 2065 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 gaaggaaaaa 2066 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 gaatagtaat 2067 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_028012 refGene chr13 88298230 + 36703 graph_last 4 25 gaatgagata 2068 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_009614 refGene chr3 91583248 - 86805 graph_last l 42 111 gacactgtct 2069 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_175474 refGene chr5 120589290 + 106661 graph_last l 12 44 gacagggtat 2070 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008538 refGene chr10 38258973 - 11621 graph_last l 11 40 gacaggtttc 2071 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_029758 refGene chr12 12633366 + 26326 graph_last l 10 44 gacataaaat 2072 0.967863018022135 0.5 7 14 9 5 NM_007597 refGene chr11 49883883 + 19666 graph_last 0 29 gacatcagag 2073 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 gacccccccc 2074 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 gacctaatga 2075 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_013735 refGene chr2 121468576 - 78588 graph_last l 19 53 gaccttgtac 2076 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 gacgagatgg 2077 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_138583 refGene chr16 17906032 - 52011 graph_last l 25 53 gacgggtaac 2078 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 gagaaaggag 2079 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 gagaagaacc 2080 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 gagaagtctg 2081 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 gagacgacgg 2082 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_027407 refGene chr1 61531888 + 2778 graph_last l 6 16 gagagctttc 2083 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_134024 refGene chr11 100789952 + 23939 graph_last l 15 49 gagcagttcc 2084 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_145487 refGene chr17 35677650 + 59007 graph_last l 10 49 gagcccacag 2085 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_026511 refGene chr12 107277209 - 31366 graph_last l 11 32 gagcctaaat 2086 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_173374 refGene chr11 87611454 + 22839 graph_last l 11 86 gagcgggatc 2087 0.967863018022135 2 24 12 32 4 gagctgtaat 2088 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_029635 refGene chr2 102116719 + 77348 graph_last 5 21 gaggggatta 2089 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_022995 refGene chr2 173653554 - 81901 graph_last l 12 49 gaggggccgc 2090 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 gaggttaacc 2091 0.967863018022135 2.66666666666667 16 6 21 2 gagtatcttt 2092 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_175234 refGene chr4 21955215 + 91718 graph_last l 8 32 gatcaattgc 2093 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 gatcagaaaa 2094 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_009685 refGene chr7 97689819 - 123899 graph_last 148 378 gatcccctct 2095 0.967863018022135 0.576923076923077 15 26 20 9 gatgacttgc 2096 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 AK012088 knownGene chr1 80478595 + 3826 graph_last l 4 17 gatgccgaat 2097 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_145215 refGene chr5 133840258 + 107647 graph_last l 7 23 gatgctgtca 2098 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 gattggcagg 2099 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_019796 refGene chr9 91413676 - 140127 graph_last 14 65 gcaaacaatc 2100 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_173437 refGene chr1 138358972 - 6521 graph_last l 2 51 gcaaggctca 2101 0.967863018022135 0.620689655172414 18 29 24 10 NM_019816 refGene chr11 84002975 - 22479 graph_last l 2 13 gcacctattg 2102 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_172736 refGene chr7 4015234 - 118503 graph_last l 6 39 gcagaagggg 2103 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_026760 refGene chr8 85892624 + 131879 graph_last 18 92 gcagaagtga 2104 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 gcagaagttc 2105 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_027903 refGene chr7 38430807 + 120782 graph_last l 16 84 gcagacagtg 2106 0.967863018022135 0.571428571428571 8 14 10 5 NM_013881 refGene chr11 61347939 - 20565 graph_last l 9 23 gcagatcagc 2107 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_133790 refGene chr7 135143878 + 126210 graph_last l 10 37 gcagcaagaa 2108 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 gcagcacaaa 2109 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_011444 refGene chr6 145323379 - 117985 graph_last l 5 16 gcaggaatgc 2110 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 gcagtttaaa 2111 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 AA011761 all_est chr8 124312131 - 134126 graph_last l 22 52 gcataaattg 2112 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 gcatccagct 2113 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_019913 refGene chr15 79269778 - 48292 graph_last l 5 15 gccaaagtgg 2114 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 AK009957 knownGene chr10 32254639 + 11403 graph_last l 11 39 gccacagcct 2115 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_027559 refGene chr19 47906855 + 70338 graph_last 0 1 gccatagctg 2116 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_026780 refGene chr4 133793005 + 98033 graph_last l 13 71 gccgtcagcc 2117 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 gccgtgcctg 2118 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 gcctctgctt 2119 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009859 refGene chr9 25957122 + 135917 graph_last l 106 330 gcctcttgaa 2120 0.967863018022135 2.33333333333333 21 9 27 3 NM_016742 refGene chr9 21705900 - 135617 graph_last l 33 75 gcctgccccg 2121 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 AK090368 knownGene chr11 101952659 + 24054 graph_last l 6 23 gccttagcat 2122 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 gccttggttt 2123 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_021560 refGene chr3 17968391 + 83311 graph_last l 12 54 gcgatctgcc 2124 0.967863018022135 0.5 7 14 9 5 gcgcaggagt 2125 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 genomic chr1 163471946 + 0 unique_long l 14 49 gcgctgtagc 2126 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_153121 refGene chr3 97840519 + 87279 graph_last l 11 50 gcggcacagt 2127 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 AK014379 knownGene chr6 42782922 - 112182 graph_last l 27 71 gcggtccatt 2128 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_011975 refGene chr7 101561513 - 124129 graph_last 2 38 gcggtggcag 2129 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_026844 refGene chr8 118589733 - 133780 graph_last l 4 98 gcggttgaag 2130 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 AK129482 knownGene chr10 77327536 + 13648 graph_last l 7 37 gcgttgtcca 2131 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_177715 refGene chr14 95804794 + 43756 graph_last 2 8 gctatcaagt 2132 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 gctatccata 2133 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 AK048615 knownGene chr10 120379905 - 16111 graph_last 3 10 gctcaaggaa 2134 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 gctctccttg 2135 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 gctgctgctt 2136 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_178650 refGene chr19 3999389 + 67381 graph_last l 190 473 gctggcagcc 2137 0.967863018022135 2.07142857142857 29 14 38 5 gctgtcgtca 2138 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 gcttaaaaat 2139 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_025570 refGene chr4 153920308 + 99812 graph_last l 8 56 gcttaaagta 2140 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_144942 refGene chr15 103584191 - 50177 graph_last l 6 35 gcttgacata 2141 0.967863018022135 0.5 7 14 9 5 NM_008666 refGene chr12 24561769 - 26811 graph_second l 3 10 gcttgatgtt 2142 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_011528 refGene chr7 133471240 + 126088 graph_last l 28 104 gcttgtgacg 2143 0.967863018022135 2.66666666666667 16 6 21 2 gctttataaa 2144 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_146170 refGene chr6 87847609 + 114579 graph_last l 6 23 gctttggtct 2145 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 AA437526 all_est chr4 48180240 + 93095 graph_last 1 8 ggaaaggtga 2146 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_030689 refGene chr15 81112482 - 48457 graph_last l 53 154 ggaagaggca 2147 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_013540 refGene chr3 82524883 - 86190 graph_last 0 6 ggaatgaatg 2148 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009655 refGene chr16 52615235 - 54331 graph_last l 11 30 ggaccttttt 2149 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_146087 refGene chr18 61711569 - 65292 graph_last 3 10 ggagagacaa 2150 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 AK051474 knownGene chr17 45897175 - 59583 graph_last l 6 39 ggagagggga 2151 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 AK040979 all_mrna chr1 45458229 - 1989 graph_last 4 14 ggagatcttt 2152 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_007379 refGene chr2 25714940 + 72843 graph_last l 17 177 ggagcaggac 2153 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_011729 refGene chr1 45086095 + 1976 graph_last l 6 29 ggaggcaagg 2154 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 ggaggcttaa 2155 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ggaggctttt 2156 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 NM_010562 refGene chr7 97874520 + 123908 graph_last l 55 216 ggagggatca 2157 0.967863018022135 2.83333333333333 17 6 22 2 AK019388 knownGene chr13 57918161 + 35327 graph_last l 4 33 ggatccaagt 2158 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_009388 refGene chr14 25105474 + 40055 graph_last l 41 300 ggatgctggg 2159 0.967863018022135 1.65217391304348 38 23 50 8 NM_029802 refGene chr7 97767540 - 123904 graph_last l 9 33 ggatgtcctt 2160 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009284 refGene chr10 130936920 - 16712 graph_last l 9 31 ggcacaggac 2161 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_026324 refGene chr9 35749024 + 136300 graph_last l 3 20 ggcactcgtg 2162 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ggcagacaat 2163 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_024200 refGene chr3 33472519 + 84071 graph_last l 21 43 ggcatcatcg 2164 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_019696 refGene chr2_random 10706081 + 82752 graph_last l 2 17 ggcattactg 2165 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_177384 refGene chr2 33034480 + 73473 graph_last 9 30 ggcctgaatt 2166 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_175514 refGene chr2 84247209 + 76272 graph_last l 32 80 ggcgggaagc 2167 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 ggctatgtgc 2168 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_173867 refGene chr4 139599928 + 98508 graph_last 1 24 ggctattcac 2169 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_011317 refGene chr4 128632476 - 97517 graph_last 3 20 gggagctcca 2170 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 gggagggagg 2171 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_008734 refGene chr14 32873028 - 40503 graph_last l 3 19 gggcattcaa 2172 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_138682 refGene chr6 28666348 - 111051 graph_last l 8 38 gggcccactg 2173 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 gggcctcccc 2174 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_172890 refGene chr6 116009543 + 116186 graph_last l 18 93 gggctgggta 2175 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BC032982 knownGene chr14 20505021 + 39774 graph_last 0 8 gggcttccag 2176 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ggggctctgg 2177 0.967863018022135 0.55 11 20 14 7 gggggaaatc 2178 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_023526 refGene chr14 13623732 - 39306 graph_last 15 42 ggtaagaata 2179 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_023603 refGene chr4 125949971 + 97273 graph_last l 34 96 ggtcagctaa 2180 0.967863018022135 2.83333333333333 17 6 22 2 NM_027353 refGene chr7 119283550 - 125169 graph_last l 19 51 ggtccttgct 2181 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_080562 refGene chr2 130756334 - 79166 graph_last 3 15 ggtgcagtgc 2182 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ggtggggggg 2183 0.967863018022135 2.83333333333333 17 6 22 2 AK129136 knownGene chr7 110066244 - 124604 graph_last 14 41 gtaaagattg 2184 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_008842 refGene chr17 29127747 + 58363 graph_second 3 13 gtagcctgca 2185 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 gtaggacctg 2186 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BU611488 all_est chr2 154150399 - 80495 graph_last l 11 29 gtattactgc 2187 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 gtcaaatcat 2188 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_013685 refGene chr18 70038556 + 65838 graph_last l 50 154 gtcagatttt 2189 0.967863018022135 1.88235294117647 32 17 42 6 gtcagctgag 2190 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_008947 refGene chr12 95672134 + 30593 graph_last 10 50 gtcctggggg 2191 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 gtcctttttc 2192 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 NM_009207 refGene chr5 22598981 - 101123 graph_last l 15 72 gtcgctgagg 2193 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_025650 refGene chr10 82754647 - 14090 graph_last l 3 20 gtctacaagg 2194 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 gtctcatctg 2195 0.967863018022135 0.55 11 20 14 7 genomic chr17 44965216 + 0 unique_long l 16 43 gtctgcccgg 2196 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_011936 refGene chr8 92850356 + 132293 graph_last l 31 111 gtctgcttgt 2197 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009800 refGene chr7_random 30691348 - 127136 graph_last 3 13 gtctggtcca 2198 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_028166 refGene chr7_random 785131 - 126432 graph_second 0 87 gtgacaactg 2199 0.967863018022135 2.66666666666667 16 6 21 2 NM_133765 refGene chr8 123398296 - 134045 graph_last l 19 50 gtgagaaaat 2200 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_197987 refGene chr11 86779766 + 22758 graph_last l 8 40 gtgatagctt 2201 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_177608 refGene chr2 125992273 - 78837 graph_last l 36 72 gtgccaacag 2202 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_026757 refGene chr11 69809604 - 21121 graph_last l 84 286 gtgcgctaga 2203 0.967863018022135 0.55 11 20 15 7 NM_173784 refGene chr11 32416958 + 18750 graph_last l 10 58 gtgctggtaa 2204 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_026123 refGene chr1 38136881 + 1590 graph_last l 22 52 gtgctgtacg 2205 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BE955993 all_est chr8 70080544 - 130858 graph_last 0 7 gtgcttggaa 2206 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 gtggaaggag 2207 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_197988 refGene chr8 122502381 - 133997 graph_last 4 23 gtggacaatg 2208 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_181413 refGene chr17 27695946 + 58188 graph_last l 11 46 gtggacagtg 2209 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 gtggcccaca 2210 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 AK087820 knownGene chr4 142025979 - 98709 graph_last l 7 47 gtgggaccca 2211 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_025817 refGene chr6 54333615 + 112878 graph_second 0 21 gtgggctcac 2212 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 genomic chr5 136652053 + 0 unique_long l 2 13 gtgtacattc 2213 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_011914 refGene chr5 32399741 + 101823 graph_last 1 23 gtgtcactgt 2214 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_144796 refGene chr1 187003218 + 9286 graph_last l 26 63 gtgtcgtttc 2215 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 gtgtggtcac 2216 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_025855 refGene chr10 30236530 - 11311 graph_last 22 50 gtgttccctt 2217 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_023048 refGene chr6 5155867 - 110069 graph_last 0 84 gttaaaaaaa 2218 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_144925 refGene chr7 115212428 + 124918 graph_last 13 39 gttctcagga 2219 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_026398 refGene chr5 114264664 + 106207 graph_last l 17 73 gttgtgaagg 2220 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_147176 refGene chr13 91666306 + 36900 graph_last l 2 41 gtttctgtga 2221 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_017479 refGene chr14 16552888 + 39540 graph_last 10 39 taaaaaagca 2222 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 taaacactgt 2223 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_015819 refGene chrX 42688995 - 148431 graph_last l 19 54 taaatcccac 2224 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 taacagtcct 2225 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_080555 refGene chr4 104091991 + 95672 graph_last l 16 44 taaccatctg 2226 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_028634 refGene chr15 80953430 + 48428 graph_last l 14 40 taactgcctg 2227 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 AK010201 knownGene chr17 73265594 + 61059 graph_last l 8 45 taacttaagc 2228 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_080855 refGene chr8 123445396 - 134051 graph_last l 10 27 taactttata 2229 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 AK083512 knownGene chr8 86533231 - 131951 graph_last l 15 54 taagaattct 2230 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_025902 refGene chr3 139272492 - 89575 graph_last l 27 76 taagagctat 2231 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_008410 refGene chr14 64928263 - 42663 graph_last l 406 611 taagtagcaa 2232 0.967863018022135 2.83333333333333 17 6 22 2 NM_008251 refGene chr16 98082681 - 56348 graph_last l 29 115 taataaaaat 2233 0.967863018022135 2.66666666666667 16 6 21 2 NM_021881 refGene chr17 9967167 - 56956 graph_last l 4 22 taatgaaatt 2234 0.967863018022135 0.5 7 14 9 5 NM_013865 refGene chr2 157553357 - 80820 graph_last l 65 106 taatgtccct 2235 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_030685 refGene chr3 59913498 - 85247 graph_last l 21 69 taatttacct 2236 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_023670 refGene chr6 49718491 - 112602 graph_last l 10 23 tacaatgcct 2237 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_030265 refGene chr5 47332132 + 102540 graph_last l 37 63 tacagaaatc 2238 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BC048845 knownGene chr1 121952967 - 5592 graph_last 1 18 tacagtataa 2239 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tacataaaat 2240 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tacatagtgc 2241 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 tacccaggca 2242 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_026144 refGene chr4 132826757 - 97928 graph_last 0 12 tacgctgagg 2243 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_010023 refGene chr17 24032852 + 57793 graph_last l 9 51 tacttggaaa 2244 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 tagaccaggc 2245 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_008048 refGene chr5 77726702 - 104094 graph_last l 45 73 tagctttaaa 2246 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tagtgcatat 2247 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tagttttgtc 2248 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_011807 refGene chr7 84786715 + 123000 graph_last l 13 33 tatacacatt 2249 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tatgagacct 2250 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_010905 refGene chr4 97160917 + 95218 graph_last 3 16 tatggcaaca 2251 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_178090 refGene chr2 76778030 + 75931 graph_last l 6 42 tatggcagaa 2252 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_144912 refGene chr5 121388374 - 106736 graph_last l 23 67 tatgggatag 2253 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_178602 refGene chr9 73953704 - 139205 graph_last l 59 141 tatgtacaca 2254 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 tatgtgtgtg 2255 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_133656 refGene chr11 75277290 + 21624 graph_last l 64 118 tattgtatat 2256 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tcaaagaatt 2257 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_052976 refGene chrX 88394495 - 150213 graph_last l 3 25 tcaaagccta 2258 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tcaagatgat 2259 0.967863018022135 0.571428571428571 8 14 10 5 NM_134079 refGene chr14 15916542 - 39476 graph_last l 19 38 tcaataaata 2260 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_153595 refGene chr10 89048034 - 14566 graph_last l 36 61 tcacagacac 2261 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_011919 refGene chr8 12274256 + 127994 graph_last l 10 63 tcagcgagtg 2262 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 tccactggaa 2263 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_178616 refGene chr11 80044394 + 22179 graph_last l 18 48 tccagtccct 2264 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 CF901669 all_est chrUn_random 3536148 + 142725 graph_last l 86 142 tccccctcaa 2265 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_007794 refGene chr8 107045121 - 132995 graph_last l 66 88 tccctcctta 2266 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tcctctgtgg 2267 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_009291 refGene chr9 60478782 - 138120 graph_last l 14 64 tccttttcta 2268 0.967863018022135 0.565217391304348 13 23 17 8 genomic chr18 77487457 - 0 unique_long l 8 28 tcgctattac 2269 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_179203 refGene chr4 153854304 - 99803 graph_last l 8 27 tctacaagcc 2270 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_016926 refGene chr5 112874001 - 106052 graph_last l 14 35 tctagtacaa 2271 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_025976 refGene chr16 13266607 + 51657 graph_last 0 9 tctctaaaaa 2272 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tctgagtggt 2273 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_011956 refGene chr17 24477051 - 57842 graph_last l 10 62 tctggaacaa 2274 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_138657 refGene chr11 96982105 + 23518 graph_last 38 90 tctttttggg 2275 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_026584 refGene chr8 32955982 - 129096 graph_last l 13 28 tgaaatgtgc 2276 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BE947526 all_est chr1 121978274 - 5595 graph_last 0 34 tgaaccttga 2277 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_013889 refGene chr4 34859588 - 92203 graph_last l 4 14 tgaagttaga 2278 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_144843 refGene chr14 51456778 - 41734 graph_last l 11 39 tgaagttgaa 2279 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 genomic chr4 97160439 - 0 unique_long l 3 19 tgaatttttg 2280 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_174849 refGene chr5 29243446 + 101534 graph_last 2 10 tgacaaccat 2281 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tgaccggctg 2282 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_173405 refGene chr5 139491490 - 108111 graph_last l 24 72 tgagtagcaa 2283 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_011531 refGene chr1 135392036 - 6259 graph_second 2 11 tgatcattct 2284 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_010017 refGene chr9 110842071 - 141352 graph_last 1 14 tgatgctctt 2285 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_019711 refGene chr10 131405093 + 16759 graph_last 33 56 tgatgttcca 2286 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 tgcactggcc 2287 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tgcatatttg 2288 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_028398 refGene chr11 51226443 - 19763 graph_last l 13 121 tgcatcttat 2289 0.967863018022135 2 24 12 31 4 AK032356 knownGene chr6 18309573 - 110671 graph_last b 8 28 tgcgacttcg 2290 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 AF374267 knownGene chr15 83762102 + 48753 graph_last l 81 192 tgctggacgt 2291 0.967863018022135 2.83333333333333 17 6 22 2 NM_021452 refGene chr10 119400100 - 16023 graph_last l 22 40 tgctgtagca 2292 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tgcttcagac 2293 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_145456 refGene chr13 106337246 - 37821 graph_last l 6 23 tggaaactta 2294 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_007936 refGene chr1 79102102 - 3765 graph_last l 16 47 tggaaagttc 2295 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 tggaaccttg 2296 0.967863018022135 0.5 7 14 9 5 genomic chr1 125486993 - 0 unique_short s 0 24 tggcgaaaaa 2297 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 tggcgtgtgc 2298 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_008244 refGene chr11 120036784 + 25564 graph_last l 23 74 tggctcctgc 2299 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 tggctcgggt 2300 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BC043094 knownGene chr8 122376278 + 133986 graph_last l 3 14 tggctgaggg 2301 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 tggctgtgta 2302 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_172372 refGene chrX 6291577 + 147030 graph_last 33 178 tggggctggc 2303 0.967863018022135 0.565217391304348 13 23 17 8 tgggtgctac 2304 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_174852 refGene chr11 77601595 + 21899 graph_last l 6 26 tggtagagtg 2305 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tggtgcacgt 2306 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_025422 refGene chr2 60528693 + 74971 graph_last 0 22 tggtggctgg 2307 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_009716 refGene chr15 81637797 + 48533 graph_last 0 106 tgtaaaggag 2308 0.967863018022135 0.571428571428571 8 14 10 5 NM_026934 refGene chr2 84030522 + 76261 graph_last l 11 35 tgtaatttcc 2309 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tgtatctgga 2310 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_026829 refGene chr9 91718217 + 140141 graph_last 0 22 tgtccttctt 2311 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 tgtgagcctg 2312 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 tgtgtgcgtg 2313 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_054093 refGene chr5 113349182 + 106067 graph_last l 21 51 tgtgttccca 2314 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_025894 refGene chr11 107161890 + 24636 graph_last l 11 51 tgttagctcc 2315 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 BX518055 all_est chr18 73915699 - 65979 graph_last l 14 25 tgtttcctat 2316 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_026603 refGene chr5 122406038 + 106854 graph_last l 22 39 tgtttctaac 2317 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_026421 refGene chr5 99138773 - 105093 graph_last 33 162 ttaaacctca 2318 0.967863018022135 2 24 12 31 4 NM_172262 refGene chr13 47160716 - 34624 graph_last l 5 19 ttaaagagca 2319 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 ttaacactac 2320 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_009968 refGene chr3 158699904 + 90548 graph_last l 9 28 ttaagacctg 2321 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 genomic chr15 83849196 + 0 unique_long l 7 31 ttaagctggc 2322 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_178892 refGene chr3 67125765 + 85557 graph_last l 6 18 ttaccattgc 2323 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_033264 refGene chr9 114792119 - 141710 graph_last l 116 153 ttacttgatc 2324 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_026181 refGene chr7 29446307 + 120267 graph_last l 8 20 ttagaaggat 2325 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_134044 refGene chr12 83501553 + 30013 graph_last 0 49 ttagatattc 2326 0.967863018022135 2.66666666666667 16 6 21 2 NM_053207 refGene chr8 126711232 - 134382 graph_last l 10 35 ttaggactct 2327 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_177139 refGene chr2 50526160 + 74434 graph_last l 8 25 ttagtatggg 2328 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008783 refGene chr1 171898126 - 8300 graph_last l 2 17 ttatcagcca 2329 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_023314 refGene chr1 89130031 + 4388 graph_last l 8 40 ttatcctttg 2330 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 CB237272 all_est chr9 7182229 - 134949 graph_last 0 7 ttattcaatg 2331 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_145600 refGene chr8 83585316 - 131685 graph_last 4 20 ttcaccgttt 2332 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_026045 refGene chr2 4540854 - 71568 graph_last l 10 23 ttcacgaatg 2333 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ttcattgggc 2334 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_175272 refGene chr7 42267011 + 121059 graph_last 1 5 ttccagtcac 2335 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_175300 refGene chr2 25551995 + 72820 graph_last l 29 79 ttcctgtgcc 2336 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_133835 refGene chr2 26265237 - 72907 graph_last l 23 60 ttctgatcca 2337 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 ttcttgactt 2338 0.967863018022135 3.66666666666667 11 3 15 1 NM_008143 refGene chr11 48431601 - 19538 graph_last 39 63 ttcttgggga 2339 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 AK077438 knownGene chr4 125527683 + 97215 graph_last l 66 90 ttgaatgtga 2340 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BI739597 all_est chr4 146117545 - 99125 graph_last l 11 34 ttgacaagga 2341 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ttgagaatga 2342 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 ttgataatta 2343 0.967863018022135 0.5 7 14 9 5 NM_008684 refGene chr9 61149228 - 138195 graph_last l 3 24 ttgcattgct 2344 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BB675663 all_est chr14 51545025 + 41745 graph_last l 11 35 ttgctggttt 2345 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 ttggactgag 2346 0.967863018022135 0.586206896551724 17 29 22 10 NM_016908 refGene chr7 4567629 + 118553 graph_last l 23 85 ttggccaacc 2347 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ttggccttgg 2348 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 BC058104 knownGene chr18 75478854 - 66126 graph_last l 7 28 ttgggaaacc 2349 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_148930 refGene chr9 110375597 - 141279 graph_last l 14 43 ttgtagcctg 2350 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 NM_178405 refGene chr1 176177573 + 8552 graph_last l 59 203 ttgtaggaag 2351 0.967863018022135 0.5 7 14 9 5 NM_013931 refGene chr17 24486442 + 57845 graph_last 28 68 ttgtcagctc 2352 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_010443 refGene chr16 4246048 + 51121 graph_last l 38 79 ttgtttgcat 2353 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tttaaaatgt 2354 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tttaataaat 2355 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_018856 refGene chr4 153937503 + 99814 graph_last l 18 45 tttaatacaa 2356 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tttacacttc 2357 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 NM_008224 refGene chrX 63545679 - 149215 graph_last l 5 26 tttagtcaaa 2358 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 tttattcctc 2359 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 tttcacagca 2360 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tttctaaaaa 2361 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tttctgaagg 2362 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_025553 refGene chr19 4786076 + 67476 graph_last l 20 41 tttctgtaca 2363 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tttcttctct 2364 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 tttgctcttt 2365 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008908 refGene chr18 53697959 - 64884 graph_last 0 18 tttgtaaaaa 2366 0.967863018022135 Inf 7 0 9 0 AK039330 knownGene chr11 49605350 + 19625 graph_last l 10 23 tttgtacgcc 2367 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_178701 refGene chr5 104794424 - 105461 graph_last 1 6 tttgtagcat 2368 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_146211 refGene chr8 71962080 + 131093 graph_last l 8 23 tttgtattaa 2369 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ttttaattgg 2370 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ttttataaaa 2371 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_133993 refGene chr10 88288856 + 14516 graph_last 1 11 ttttcaggga 2372 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 ttttctatga 2373 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_008689 refGene chr3 139334103 + 89605 graph_last l 13 34 ttttgtgttc 2374 0.967863018022135 0.333333333333333 2 6 2 2 NM_019797 refGene chr9 68371211 + 138776 graph_last 0 8 tttttggcag 2375 0.967863018022135 Inf 6 0 8 0 tggttgctgg 2376 0.979740498439471 1.25 145 116 189 40 gggtttttat 2377 0.982597645082223 1.36206896551724 79 58 103 20 NM_010771 refGene chr18 35775688 + 63875 graph_last l 29 80 actatagtct 2378 0.991811837402558 4 12 3 16 1 NM_139294 refGene chr6 39691406 + 112004 graph_last l 102 255 actcggatgc 2379 0.991811837402558 4 12 3 16 1 aggctcattt 2380 0.991811837402558 4 12 3 16 1 NM_145130 refGene chr6 126639248 + 116885 graph_last l 14 119 ccaggaattc 2381 0.991811837402558 4 12 3 16 1 NM_008783 refGene chr1 171870570 - 8300 graph_last l 12 69 cccactgtca 2382 0.991811837402558 4 12 3 16 1 NM_011119 refGene chr10 131836655 - 16829 graph_last l 42 102 cggataacca 2383 0.991811837402558 4 12 3 16 1 NM_008707 refGene chr11 102658151 - 24151 graph_last 1 40 ctccctgccc 2384 0.991811837402558 4 12 3 16 1 NM_008568 refGene chr5 136636318 - 107939 graph_last l 5 49 ctgcactttt 2385 0.991811837402558 4 12 3 16 1 ctgctgcttc 2386 0.991811837402558 4 12 3 16 1 gcctcggggg 2387 0.991811837402558 4 12 3 16 1 gcctctggtg 2388 0.991811837402558 4 12 3 16 1 NM_025299 refGene chr18 80194194 + 66345 graph_last l 12 128 gcgagggagc 2389 0.991811837402558 4 12 3 16 1 NM_177876 refGene chr5 122967405 - 106929 graph_last l 8 69 ggagctccgg 2390 0.991811837402558 4 12 3 16 1 tccggggacg 2391 0.991811837402558 4 12 3 16 1 BY050640 all_est chr2 167679534 + 81520 graph_last l 17 124 tgcactattg 2392 0.991811837402558 4 12 3 16 1 tgctcgcaaa 2393 0.991811837402558 4 12 3 16 1 AK010485 knownGene chr15_random 13961085 + 50719 graph_last 1 27 aattctctgt 2394 0.994531077484848 0.608695652173913 14 23 18 8 AF093677 knownGene chr1 24786836 + 1000 graph_last 117 388 agtggaggac 2395 0.994531077484848 0.608695652173913 14 23 18 8 attttttttc 2396 0.994531077484848 0.608695652173913 14 23 18 8 NM_198613 refGene chr7 13784132 + 119083 graph_last l 87 238 cagttcgatg 2397 0.994531077484848 0.608695652173913 14 23 18 8 NM_010315 refGene chr14 14748274 + 39376 graph_last 0 24 aaaaaaaaac 2398 1 Inf 3 0 4 0 aaaaaaaaag 2399 1 1.66666666666667 5 3 7 1 aaaaaaaaat 2400 1 Inf 2 0 3 0 BE952106 all_est chr2 155044193 - 80539 graph_last 0 5 aaaaaaaaca 2401 1 Inf 2 0 3 0 NM_019565 refGene chr12 112090750 + 31588 graph_last 1 28 aaaaaaacta 2402 1 Inf 4 0 5 0 aaaaaaatag 2403 1 Inf 5 0 6 0 aaaaaacata 2404 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aaaaaataaa 2405 1 Inf 2 0 3 0 NM_008468 refGene chr4 128557548 + 97498 graph_last 2 10 aaaaaataga 2406 1 0.333333333333333 2 6 3 2 aaaaacaatc 2407 1 Inf 3 0 4 0 aaaaacagtg 2408 1 Inf 2 0 3 0 NM_181649 refGene chr17 79550813 + 61351 graph_last 1 9 aaaaaccaaa 2409 1 0.333333333333333 2 6 3 2 AK030698 knownGene chr17 3947254 + 56601 graph_second 1 8 aaaaagaaac 2410 1 Inf 2 0 3 0 BC049261 knownGene chr9 55291898 - 137676 graph_last 0 3 aaaaagcaaa 2411 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aaaaagcgaa 2412 1 1.33333333333333 4 3 5 1 aaaaagtcag 2413 1 Inf 2 0 3 0 NM_021399 refGene chr12 103478142 - 31002 graph_last l 7 26 aaaaagtggc 2414 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_146236 refGene chrX 125282740 - 151550 graph_last 0 10 aaaaatgaaa 2415 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AK089633 all_mrna chrUn_random 45728785 + 144410 graph_second 0 10 aaaaatgaga 2416 1 Inf 2 0 3 0 aaaaatgtgg 2417 1 1.66666666666667 5 3 6 1 aaaacaaaac 2418 1 Inf 5 0 6 0 aaaacaagcc 2419 1 Inf 2 0 3 0 NM_175480 refGene chr8 111725644 + 133369 graph_last 1 11 aaaacaatgt 2420 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aaaacagact 2421 1 Inf 3 0 4 0 aaaacagagg 2422 1 Inf 2 0 3 0 NM_010890 refGene chr9 75258934 + 139403 graph_last l 4 62 aaaacatctc 2423 1 2.66666666666667 8 3 11 1 AK037109 knownGene chr9 75131010 + 139390 graph_last 1 8 aaaacattca 2424 1 0.333333333333333 2 6 3 2 aaaacctgta 2425 1 Inf 2 0 3 0 NM_023878 refGene chr14 111989968 - 44318 graph_last l 2 8 aaaacgaacc 2426 1 Inf 3 0 4 0 AK122475 knownGene chr10 19318129 - 10688 graph_last l 6 21 aaaactacat 2427 1 Inf 2 0 3 0 aaaactccag 2428 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_010486 refGene chr4 89992635 + 94937 graph_last 0 7 aaaactcgct 2429 1 0.5 3 6 4 2 aaaactctgc 2430 1 Inf 5 0 7 0 NM_011070 refGene chr1 175200027 - 8455 graph_last l 26 59 aaaactgaag 2431 1 Inf 5 0 6 0 aaaagaaata 2432 1 1.66666666666667 5 3 6 1 aaaagaggaa 2433 1 1.5 21 14 27 5 aaaagatact 2434 1 1.66666666666667 5 3 6 1 aaaagatcta 2435 1 1 3 3 4 1 NM_134136 refGene chr18 62565073 - 65347 graph_last 4 18 aaaagattga 2436 1 Inf 3 0 4 0 aaaagcaaga 2437 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_026150 refGene chr11 3798558 + 17229 graph_last 0 6 aaaaggaaca 2438 1 Inf 2 0 3 0 aaaaggagat 2439 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_018739 refGene chr9 23092901 - 135808 graph_last 0 23 aaaaggatgt 2440 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_177462 refGene chr4 126037377 + 97281 graph_last l 2 10 aaaaggcatt 2441 1 Inf 2 0 3 0 NM_029793 refGene chr2 39317664 + 73988 graph_last 20 60 aaaaggcctt 2442 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_019570 refGene chr1 38750694 - 1632 graph_second 0 40 aaaaggttga 2443 1 Inf 2 0 3 0 aaaaggttgg 2444 1 Inf 2 0 3 0 NM_153573 refGene chr6 55110218 + 112939 graph_last 2 10 aaaagtgggg 2445 1 Inf 2 0 3 0 NM_026086 refGene chr2 151665731 - 80256 graph_last 1 10 aaaagttcct 2446 1 Inf 4 0 5 0 aaaataaaac 2447 1 Inf 5 0 7 0 aaaataaact 2448 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aaaataaagg 2449 1 1.83333333333333 11 6 15 2 NM_010344 refGene chr8 32911737 - 129089 graph_last 0 3 aaaataacac 2450 1 Inf 2 0 3 0 NM_011914 refGene chr5 32379660 + 101823 graph_last 0 13 aaaataatgt 2451 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_198160 refGene chr10 131766650 + 16811 graph_last 6 18 aaaatgaaac 2452 1 Inf 2 0 3 0 aaaatgaacc 2453 1 0.5 6 12 8 4 aaaatgctga 2454 1 Inf 2 0 3 0 aaaatggaac 2455 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_011239 refGene chr16 17844800 - 52007 graph_last 10 66 aaaatgtact 2456 1 1.83333333333333 11 6 14 2 aaaatgtcaa 2457 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aaaatgtgga 2458 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aaaattacag 2459 1 Inf 2 0 3 0 NM_008882 refGene chr1 198787755 + 9854 graph_last l 10 23 aaaattcatt 2460 1 Inf 4 0 5 0 NM_026456 refGene chr1 16814024 - 616 graph_last l 21 55 aaaattgcag 2461 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_008053 refGene chr3 35038626 - 84156 graph_last l 4 37 aaaattgctt 2462 1 2.66666666666667 8 3 10 1 genomic chr3 90897331 - 0 unique_long l 116 201 aaaattgtgt 2463 1 1.66666666666667 10 6 13 2 NM_029553 refGene chr12 94539216 + 30484 graph_last l 4 14 aaaatttgta 2464 1 Inf 2 0 3 0 aaacaatatt 2465 1 Inf 2 0 3 0 NM_027604 refGene chr10 126157237 - 16537 graph_last 1 7 aaacagaagt 2466 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aaacagaatg 2467 1 Inf 2 0 3 0 AK011796 knownGene chr9 97917739 - 140423 graph_last 1 12 aaacagatga 2468 1 Inf 4 0 5 0 NM_025811 refGene chr19 56541382 + 70694 graph_last l 3 10 aaacagatta 2469 1 Inf 2 0 3 0 NM_008960 refGene chr19 32627409 + 69335 graph_last 0 4 aaacatttag 2470 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008634 refGene chr13 97881760 - 37324 graph_last 35 132 aaaccagagc 2471 1 0.923076923076923 24 26 31 9 NM_011692 refGene chrX 65317027 - 149337 graph_last 0 7 aaaccccatt 2472 1 Inf 2 0 3 0 NM_010787 refGene chr17 46074819 - 59602 graph_last l 25 92 aaaccccctc 2473 1 0.444444444444444 4 9 5 3 aaaccctaaa 2474 1 Inf 2 0 3 0 aaaccctatc 2475 1 1.66666666666667 5 3 6 1 aaaccctgtc 2476 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_197993 refGene chr19 9042304 - 67892 graph_last 2 13 aaacctgaag 2477 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_020557 refGene chr12 20920997 + 26691 graph_last l 3 17 aaacctgaca 2478 1 Inf 2 0 3 0 NM_177266 refGene chr13 95455828 + 37146 graph_last 1 4 aaaccttgga 2479 1 Inf 2 0 3 0 aaaccttgtt 2480 1 0.666666666666667 2 3 2 1 genomic chr9 21964875 + 0 unique_long l 3 9 aaacgcccta 2481 1 Inf 2 0 3 0 NM_008717 refGene chr6 85104808 + 114381 graph_last 0 8 aaacgggatg 2482 1 Inf 4 0 5 0 NM_199147 refGene chr10 55593999 + 12442 graph_last l 5 22 aaactaatct 2483 1 Inf 5 0 7 0 aaactcaaga 2484 1 Inf 5 0 6 0 aaactgacat 2485 1 Inf 3 0 4 0 BC037443 knownGene chr9 62084469 + 138267 graph_last 0 7 aaactgacta 2486 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BQ550972 all_est chr14 33819801 - 40573 graph_second 0 46 aaactgactt 2487 1 1 3 3 4 1 NM_010837 refGene chr7 90803460 - 123299 graph_last l 18 60 aaactgtgct 2488 1 0.5 3 6 4 2 aaactttaag 2489 1 Inf 2 0 3 0 NM_016762 refGene chr15 34759228 + 46143 graph_last 0 7 aaagaaaaac 2490 1 Inf 2 0 3 0 BG065559 all_est chr5 103504238 + 105370 graph_last 1 10 aaagaaacat 2491 1 0.333333333333333 2 6 3 2 aaagaaagtt 2492 1 1 3 3 4 1 AK012697 knownGene chr5 122772882 - 106898 graph_last l 8 27 aaagaaatgt 2493 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aaagaagaaa 2494 1 Inf 5 0 6 0 aaagaagttg 2495 1 Inf 2 0 3 0 BE953070 all_est chr18 77587872 - 66224 graph_last l 2 6 aaagaataag 2496 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BC006733 knownGene chr11 35479770 + 18953 graph_last 1 8 aaagacacat 2497 1 Inf 2 0 3 0 aaagaccctg 2498 1 Inf 2 0 3 0 NM_030563 refGene chr8 87736091 - 132024 graph_last l 4 18 aaagacctga 2499 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aaagactttg 2500 1 1.66666666666667 5 3 6 1 aaagagctgg 2501 1 Inf 3 0 4 0 NM_145993 refGene chr15 83201662 + 48689 graph_last l 6 16 aaagaggcct 2502 1 Inf 2 0 3 0 NM_010487 refGene chr9 22639656 - 135759 graph_last l 16 64 aaagagggga 2503 1 1.16666666666667 14 12 18 4 NM_182990 refGene chr2 85411947 + 76355 graph_last l 9 24 aaagagtatg 2504 1 Inf 5 0 7 0 NM_153796 refGene chr19 45116496 - 70068 graph_last l 3 21 aaagagtctg 2505 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_028035 refGene chr6 52060901 + 112735 graph_last 10 88 aaagcaaagc 2506 1 0.5 3 6 4 2 NM_025343 refGene chr10 4283996 - 9963 graph_last 2 10 aaagcaccac 2507 1 Inf 3 0 4 0 aaagcacctt 2508 1 Inf 2 0 3 0 aaagcactga 2509 1 Inf 2 0 3 0 NM_026695 refGene chr7 36140047 + 120577 graph_last 11 43 aaagccaaga 2510 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_029626 refGene chr14 25549881 + 40096 graph_last l 3 10 aaagccagca 2511 1 Inf 3 0 4 0 aaagctcatc 2512 1 1 3 3 4 1 NM_010336 refGene chr4 58189154 - 93558 graph_last l 3 12 aaaggcaaag 2513 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_019444 refGene chr19 5656271 - 67592 graph_last l 7 19 aaagggatca 2514 1 0.666666666666667 2 3 3 1 genomic chr1 69627636 - 0 unique_long l 2 5 aaaggtactc 2515 1 0.666666666666667 2 3 2 1 genomic chr18 61701967 + 0 unique_long l 3 10 aaaggttagt 2516 1 1 3 3 4 1 aaaggttgct 2517 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aaagtaaaag 2518 1 Inf 3 0 4 0 genomic chr3 141547656 - 0 unique_long l 2 11 aaagtcaaat 2519 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aaagtcactt 2520 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_024427 refGene chr9 69511844 - 138896 graph_last l 9 27 aaagtcattg 2521 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_027810 refGene chr3 37522955 - 84281 graph_last 0 3 aaagtccttt 2522 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_153158 refGene chr4 59508430 + 93650 graph_last 0 7 aaagtcgatg 2523 1 1.33333333333333 4 3 5 1 aaagtgaaaa 2524 1 1 3 3 4 1 NM_026391 refGene chr7 130734895 - 125857 graph_last l 6 20 aaagtgaagg 2525 1 Inf 2 0 3 0 NM_023323 refGene chr10 41392092 - 11792 graph_last 6 13 aaagtgccca 2526 1 Inf 2 0 3 0 NM_013540 refGene chr3 82528650 - 86190 graph_second 0 7 aaagtgggcg 2527 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_011805 refGene chr2 180469418 - 82398 graph_last 2 11 aaagtgtcag 2528 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_133781 refGene chr1 87733661 + 4267 graph_last l 30 94 aaagtgtttc 2529 1 0.666666666666667 6 9 8 3 NM_019771 refGene chr2 144011101 + 79829 graph_last 1 11 aaagttcgga 2530 1 Inf 4 0 5 0 aaataaaaaa 2531 1 Inf 2 0 3 0 NM_009555 refGene chr17 22866295 - 57695 graph_last l 1 7 aaataaaacc 2532 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aaataaaata 2533 1 Inf 3 0 4 0 NM_013630 refGene chr17 24190306 - 57807 graph_last l 29 76 aaataaactg 2534 1 0.555555555555556 5 9 7 3 aaataaagat 2535 1 Inf 2 0 3 0 AA655495 all_est chr15 79783783 + 48321 graph_last l 53 168 aaataaagct 2536 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_021604 refGene chr4 154278673 - 99853 graph_last l 40 149 aaataaagtc 2537 1 1.55555555555556 14 9 18 3 aaataaataa 2538 1 Inf 5 0 7 0 aaataaatac 2539 1 0.666666666666667 8 12 10 4 aaataaatgt 2540 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aaataataat 2541 1 Inf 4 0 5 0 NM_018745 refGene chr15 39066010 - 46428 graph_last l 8 56 aaatagacgt 2542 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_177589 refGene chr9 123344205 - 142205 graph_last l 10 38 aaatagatcc 2543 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_026390 refGene chr1 130974940 + 5989 graph_last l 10 39 aaatagctgg 2544 1 1 6 6 8 2 NM_027807 refGene chr9 55700969 - 137719 graph_last 1 8 aaatatgcag 2545 1 Inf 4 0 5 0 genomic chr8 38746496 + 0 unique_long l 75 149 aaatatgtcg 2546 1 0.777777777777778 7 9 9 3 NM_008297 refGene chr10 59729632 - 12599 graph_last 1 13 aaatattaca 2547 1 Inf 5 0 6 0 NM_178721 refGene chr16 67401895 - 54849 graph_last l 9 59 aaatattcca 2548 1 0.916666666666667 11 12 14 4 NM_175565 refGene chr9 105897947 + 140984 graph_second 3 10 aaatccacaa 2549 1 Inf 2 0 3 0 aaatccccaa 2550 1 0.833333333333333 5 6 6 2 aaatctaaat 2551 1 0.444444444444444 4 9 5 3 BY670150 all_est chr2 82659386 + 76227 graph_second 0 4 aaatctctgt 2552 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aaatctgaaa 2553 1 Inf 3 0 4 0 aaatgaaaat 2554 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aaatgaggta 2555 1 Inf 2 0 3 0 aaatgcaata 2556 1 0.555555555555556 5 9 7 3 aaatgccata 2557 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008233 refGene chr17 56028819 + 60194 graph_last l 12 59 aaatggctat 2558 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_025695 refGene chr12 11492996 + 26293 graph_last 1 7 aaatggcttg 2559 1 Inf 3 0 4 0 aaatgtaaag 2560 1 Inf 5 0 7 0 U24233 knownGene chr5 33480345 + 101927 graph_last l 3 24 aaatgtatat 2561 1 1 3 3 4 1 aaattacccc 2562 1 Inf 2 0 3 0 NM_011123 refGene chrX 125410335 + 151562 graph_last 0 1107 aaattattgg 2563 1 1 3 3 4 1 aaattatttt 2564 1 Inf 2 0 3 0 aaattccttt 2565 1 0.416666666666667 5 12 7 4 aaattggatc 2566 1 0.333333333333333 2 6 3 2 aaattggcag 2567 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_175407 refGene chr10 44596673 - 12030 graph_last 15 58 aaattggggg 2568 1 0.642857142857143 9 14 12 5 NM_026446 refGene chr2 181536768 - 82509 graph_last l 2 7 aaattgtatt 2569 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_019737 refGene chr18 20988128 - 63192 graph_last 0 24 aaatttaagt 2570 1 0.5 3 6 4 2 aacaaaaaaa 2571 1 Inf 3 0 4 0 NM_078478 refGene chr14 31666620 - 40471 graph_last l 66 123 aacaaagcaa 2572 1 Inf 2 0 3 0 aacaaagtca 2573 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_007597 refGene chr11 49921032 + 19666 graph_second l 5 39 aacaaatgaa 2574 1 Inf 5 0 7 0 aacaacatca 2575 1 Inf 2 0 3 0 NM_175114 refGene chr9 123859088 + 142240 graph_last l 8 43 aacaactccc 2576 1 0.416666666666667 5 12 6 4 NM_010238 refGene chr17 33754051 - 58821 graph_last l 10 48 aacaactggc 2577 1 0.888888888888889 8 9 11 3 NM_019824 refGene chr5 121430049 + 106743 graph_last l 56 108 aacaagagtc 2578 1 0.583333333333333 7 12 9 4 NM_022656 refGene chr14 25722648 - 40123 graph_last l 3 15 aacaagcaag 2579 1 Inf 2 0 3 0 BC031849 knownGene chr13 71875848 - 36100 graph_last 1 6 aacaaggagt 2580 1 Inf 2 0 3 0 aacacaatca 2581 1 Inf 4 0 5 0 NM_009226 refGene chr18 10830238 + 62825 graph_last l 13 52 aacacacacc 2582 1 1.16666666666667 7 6 9 2 aacacaggac 2583 1 Inf 2 0 3 0 BC046438 knownGene chr13 71509423 + 36073 graph_last l 7 45 aacacaggtc 2584 1 Inf 5 0 6 0 NM_009125 refGene chr5 120507994 - 106649 graph_last l 24 64 aacacatcag 2585 1 0.777777777777778 7 9 9 3 aacacgcaca 2586 1 Inf 4 0 5 0 aacactatct 2587 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aacacttgga 2588 1 Inf 2 0 3 0 NM_010761 refGene chr2 121286727 + 78571 graph_last l 9 23 aacagaatta 2589 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AK014834 knownGene chr3 97029644 + 87179 graph_last 1 16 aacagacttt 2590 1 0.333333333333333 2 6 3 2 aacagcgccc 2591 1 Inf 2 0 3 0 NM_029841 refGene chr4 146059749 + 99115 graph_last l 4 14 aacagggagc 2592 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aacaggttca 2593 1 0.925 37 40 48 14 NM_009462 refGene chr8 121751541 + 133941 graph_last l 3 28 aacagtgggc 2594 1 Inf 5 0 6 0 aacatacaag 2595 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_007422 refGene chr1 181698999 + 8873 graph_last l 2 7 aacatactcc 2596 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aacatcatct 2597 1 2.33333333333333 14 6 18 2 aaccaaaaaa 2598 1 1.33333333333333 4 3 5 1 genomic chr11 98352465 - 0 unique_long l 8 25 aaccaagtaa 2599 1 Inf 2 0 3 0 NM_010890 refGene chr9 75252200 + 139403 graph_last l 9 20 aaccaccagg 2600 1 Inf 3 0 4 0 aaccagaaaa 2601 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aaccagaata 2602 1 1.33333333333333 4 3 5 1 AI787975 all_est chr4 84452734 + 94672 graph_last 0 55 aaccagcaaa 2603 1 1.83333333333333 11 6 15 2 aaccagcttg 2604 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aaccataggg 2605 1 Inf 2 0 3 0 BC052699 knownGene chr6 126842831 - 116923 graph_last l 137 519 aacccctgcc 2606 1 1.13580246913580 92 81 120 28 aacccgagtt 2607 1 Inf 3 0 4 0 NM_024231 refGene chr19 6126529 - 67639 graph_last l 4 23 aaccctcaca 2608 1 1 6 6 8 2 aaccctgctg 2609 1 0.5 3 6 4 2 NM_021284 refGene chr6 146776526 - 118055 graph_last l 16 71 aaccgtactg 2610 1 0.647058823529412 11 17 15 6 aaccgtgaat 2611 1 0.9 18 20 23 7 NM_008667 refGene chr1 53722045 - 2291 graph_last l 8 15 aaccgtttcc 2612 1 Inf 3 0 4 0 NM_010838 refGene chr11 103997916 - 24313 graph_last l 3 10 aacctcctgt 2613 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_009975 refGene chr17 34786027 + 58929 graph_last l 3 14 aacctcgagt 2614 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_021540 refGene chr11 49750785 + 19643 graph_last l 19 60 aacctctatg 2615 1 0.555555555555556 5 9 6 3 AI853248 all_est chr1 3209646 - 8 graph_last 0 7 aacctgatgt 2616 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_023336 refGene chr2 27714652 - 73019 graph_last l 8 50 aacctttctc 2617 1 2.33333333333333 14 6 18 2 AK007485 knownGene chr16 8349988 + 51355 graph_last l 4 6 aacctttctt 2618 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_009876 refGene chr7 135531987 + 126263 graph_last 0 3 aacgaaaggt 2619 1 Inf 2 0 3 0 NM_025329 refGene chr16 32139077 + 52939 graph_last 5 12 aacgacagct 2620 1 Inf 2 0 3 0 NM_010496 refGene chr12 19544136 - 26650 graph_last 0 6 aacgactgct 2621 1 Inf 2 0 3 0 NM_175091 refGene chr8 34095369 - 129173 graph_last 1 9 aacgagctgt 2622 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_021282 refGene chr7 132782731 - 125997 graph_last 0 235 aacgaggaat 2623 1 1 3 3 4 1 aacgccaacc 2624 1 Inf 2 0 3 0 NM_144954 refGene chr16 16692148 + 51876 graph_last 0 4 aacgccactt 2625 1 Inf 5 0 6 0 NM_010798 refGene chr10 78003266 - 13706 graph_last 129 474 aacgctgcca 2626 1 1.28571428571429 45 35 59 12 genomic chr5 19625506 - 0 unique_short s 0 13 aacggcctgc 2627 1 Inf 2 0 3 0 NM_009133 refGene chr2 181155372 - 82469 graph_last l 106 514 aacgggaggt 2628 1 1.28125 41 32 53 11 NM_010349 refGene chr10 51064923 - 12268 graph_last b 6 13 aacggtagtg 2629 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr7 19735827 - 0 unique_short s 0 6 aacggtgggg 2630 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_010315 refGene chr14 14746520 - 39376 graph_last l 59 298 aacggtgtat 2631 1 0.697674418604651 30 43 39 15 NM_144516 refGene chr13 9920954 - 32574 graph_last l 25 73 aacgtgaggt 2632 1 0.777777777777778 7 9 9 3 aacgttagct 2633 1 Inf 2 0 3 0 NM_008632 refGene chr1 68044557 - 3222 graph_second l 26 46 aactaactac 2634 1 Inf 2 0 3 0 NM_026626 refGene chr1 182522415 + 8924 graph_last 2 5 aactaatgta 2635 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AY263157 knownGene chr7 76217194 - 122664 graph_second 0 28 aactaattgt 2636 1 Inf 2 0 3 0 NM_153064 refGene chr1 175092629 - 8444 graph_last l 25 185 aactagaaaa 2637 1 0.647058823529412 11 17 15 6 NM_176954 refGene chr10 83830422 + 14214 graph_last b 2 11 aactagacgg 2638 1 Inf 4 0 5 0 AK030904 knownGene chr5 123271466 + 106963 graph_last 9 21 aactaggaag 2639 1 Inf 5 0 7 0 AK013082 knownGene chr11 106494843 - 24539 graph_last 0 6 aactcaaacc 2640 1 Inf 2 0 3 0 BC027663 knownGene chr8 96186253 - 132538 graph_last 2 6 aactcagact 2641 1 Inf 2 0 3 0 NM_019581 refGene chr17 45564171 + 59534 graph_last 1 40 aactcaggga 2642 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_009069 refGene chr3 90879490 + 86714 graph_last 1 18 aactcatcag 2643 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BY486646 all_est chr16 19895493 - 52141 graph_last 3 18 aactcatttg 2644 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BI080296 all_est chr4 44395266 - 92807 graph_last l 9 49 aactccaccc 2645 1 0.555555555555556 5 9 7 3 genomic chr2 31245341 - 0 unique_long l 10 29 aactccctcc 2646 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_021501 refGene chr10 83524609 - 14170 graph_last 2 18 aactcgccgg 2647 1 Inf 3 0 4 0 NM_134152 refGene chr19 12642203 - 68170 graph_last l 4 12 aactcggata 2648 1 Inf 4 0 5 0 aactgaaata 2649 1 Inf 3 0 4 0 NM_023374 refGene chr4 139856289 + 98521 graph_last l 46 124 aactgcacac 2650 1 0.666666666666667 4 6 5 2 aactgcagag 2651 1 0.888888888888889 8 9 11 3 NM_007596 refGene chr13 55409365 + 35186 graph_last l 16 34 aactgcttga 2652 1 2.33333333333333 7 3 9 1 aactggggat 2653 1 1 3 3 4 1 aactgggtct 2654 1 1.66666666666667 10 6 13 2 aactggtttg 2655 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aactgtccca 2656 1 Inf 5 0 7 0 NM_008284 refGene chr7 133344366 + 126074 graph_last l 25 79 aactgtccct 2657 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_018804 refGene chr3 90894774 - 86721 graph_last l 143 348 aactgtgtga 2658 1 2.33333333333333 14 6 18 2 NM_197981 refGene chr6 130302866 - 117184 graph_last l 4 27 aactgttggt 2659 1 0.5 3 6 4 2 NM_023876 refGene chr2 106228843 + 77656 graph_last 18 44 aacttaataa 2660 1 Inf 4 0 5 0 aacttcctgt 2661 1 1.33333333333333 4 3 5 1 aacttctctt 2662 1 1 3 3 4 1 NM_027098 refGene chr1 38576589 - 1625 graph_last 1 10 aacttctggg 2663 1 Inf 4 0 5 0 NM_010298 refGene chr3 82680369 - 86206 graph_last l 19 62 aacttgaaat 2664 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_018794 refGene chrX 63907096 + 149248 graph_last l 33 124 aacttgaggt 2665 1 0.666666666666667 4 6 5 2 aacttgatta 2666 1 2.66666666666667 8 3 10 1 AK044502 knownGene chr6 144698590 + 117947 graph_last l 34 96 aacttgcaat 2667 1 0.416666666666667 5 12 7 4 aacttggctg 2668 1 Inf 3 0 4 0 NM_007936 refGene chr1 79100950 - 3765 graph_last l 19 53 aactttaggt 2669 1 Inf 4 0 5 0 aactttgaca 2670 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_010470 refGene chr4 137020995 + 98319 graph_last l 45 142 aacttttaaa 2671 1 0.857142857142857 12 14 16 5 NM_025844 refGene chr9 18477078 + 135458 graph_last 3 50 aacttttgtt 2672 1 Inf 2 0 3 0 aacttttttt 2673 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aagaaaacat 2674 1 2.66666666666667 8 3 10 1 AK044911 all_mrna chr3 68678324 + 85643 graph_last 0 7 aagaaagata 2675 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aagaaaggag 2676 1 Inf 3 0 4 0 AK040793 all_mrna chrX 50688377 + 148793 graph_last 1 4 aagaaatgtg 2677 1 Inf 2 0 3 0 aagaaattga 2678 1 Inf 3 0 4 0 NM_053100 refGene chr19_random 5946893 - 71161 graph_last 0 5 aagaacacca 2679 1 Inf 2 0 3 0 aagaacagga 2680 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aagaactcac 2681 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aagaactgta 2682 1 Inf 3 0 4 0 aagaagaaga 2683 1 Inf 2 0 3 0 NM_009826 refGene chr1 6274251 + 162 graph_last 0 6 aagaagaatc 2684 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aagaagactt 2685 1 0.764705882352941 13 17 17 6 aagaagatgg 2686 1 Inf 4 0 5 0 NM_172941 refGene chr11 59083593 - 20327 graph_last 2 10 aagaagcctc 2687 1 1 3 3 4 1 aagaagggtg 2688 1 Inf 3 0 4 0 NM_013494 refGene chr8 64448971 - 130583 graph_second l 4 15 aagaagtcaa 2689 1 Inf 2 0 3 0 NM_030684 refGene chr7 96481250 - 123834 graph_last 0 6 aagaataaga 2690 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_027672 refGene chr1 180660158 - 8783 graph_last l 10 33 aagaatacaa 2691 1 0.555555555555556 5 9 6 3 aagaatagcc 2692 1 Inf 2 0 3 0 NM_025346 refGene chr11 51248298 + 19767 graph_last l 12 35 aagaatatca 2693 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_018748 refGene chr9 120937402 + 142048 graph_last 2 10 aagaatatga 2694 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_025426 refGene chr11 46066426 + 19436 graph_last 3 8 aagaatattc 2695 1 Inf 2 0 3 0 genomic chrX 151977467 - 0 unique_long l 15 24 aagaatggtt 2696 1 Inf 3 0 4 0 AA207681 all_est chr15 32763420 - 46053 graph_last 2 11 aagacagagc 2697 1 Inf 4 0 5 0 aagacagcca 2698 1 Inf 2 0 3 0 aagacagcta 2699 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_029295 refGene chr8 105803305 - 132865 graph_last 0 7 aagacatagt 2700 1 1.33333333333333 4 3 5 1 aagacatctg 2701 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aagaccaaaa 2702 1 Inf 4 0 5 0 aagacccacc 2703 1 1.33333333333333 8 6 10 2 NM_013782 refGene chr7 133312146 + 126067 graph_last 1 5 aagaccctcg 2704 1 Inf 2 0 3 0 NM_028439 refGene chr1 122653373 - 5657 graph_last l 69 344 aagacctatg 2705 1 0.615384615384615 16 26 21 9 aagacctttt 2706 1 Inf 3 0 4 0 NM_021399 refGene chr12 103478232 - 31002 graph_second s 0 3 aagacgcacg 2707 1 Inf 2 0 3 0 aagactcaga 2708 1 2 6 3 8 1 NM_134029 refGene chr11 59389736 - 20368 graph_last 16 40 aagactgtgt 2709 1 Inf 4 0 5 0 NM_134013 refGene chr11 30778502 + 18636 graph_last l 4 16 aagagaaaag 2710 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aagagaaaga 2711 1 0.666666666666667 6 9 8 3 NM_133195 refGene chr18 26103935 - 63468 graph_last l 96 185 aagagaacac 2712 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_023626 refGene chr6 21834721 + 110782 graph_second 0 18 aagagaagag 2713 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_026819 refGene chr14 46867064 - 41418 graph_last 14 39 aagagaaggt 2714 1 0.5 3 6 4 2 NM_026989 refGene chr3 162250930 - 90688 graph_last l 29 58 aagagagtgc 2715 1 3.66666666666667 11 3 14 1 NM_011668 refGene chr7 52386375 + 121425 graph_last l 5 12 aagagatttg 2716 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008122 refGene chr11 102464635 - 24127 graph_last 1 6 aagaggatcc 2717 1 Inf 2 0 3 0 AK010275 knownGene chr18 63058602 + 65367 graph_last 0 9 aagaggcaga 2718 1 Inf 3 0 4 0 NM_009986 refGene chr5 135109712 - 107785 graph_last b 2 5 aagaggcgac 2719 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AK011796 knownGene chr9 97898965 - 140423 graph_last l 8 18 aagagtcaga 2720 1 1.66666666666667 5 3 7 1 AK004785 knownGene chr10 110799841 - 15615 graph_second 0 6 aagagttaga 2721 1 Inf 3 0 4 0 aagagttatg 2722 1 Inf 3 0 4 0 aagatacggg 2723 1 Inf 2 0 3 0 NM_007566 refGene chr17 75280524 - 61202 graph_last l 3 29 aagatatggc 2724 1 0.666666666666667 6 9 8 3 aagatcaagg 2725 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AF283559 knownGene chrX_random 7963599 + 152995 graph_last 4 12 aagatcaagt 2726 1 Inf 2 0 3 0 aagatcagtg 2727 1 1 3 3 4 1 NM_022992 refGene chr6 98888650 + 115338 graph_last l 29 51 aagatcagtt 2728 1 1 3 3 4 1 NM_016916 refGene chr2 158187686 + 80890 graph_last 2 10 aagatcgaac 2729 1 Inf 2 0 3 0 aagatgaggg 2730 1 2.66666666666667 8 3 11 1 aagatgatat 2731 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_025573 refGene chr5 114427299 + 106230 graph_last l 16 34 aagatgcagc 2732 1 1.33333333333333 4 3 5 1 aagatgcatt 2733 1 2 6 3 8 1 aagatgggct 2734 1 Inf 3 0 4 0 aagatgtttc 2735 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_022979 refGene chr7 94452798 - 123656 graph_last l 3 9 aagattatgt 2736 1 Inf 3 0 4 0 aagattcaca 2737 1 Inf 5 0 6 0 NM_025333 refGene chr19 10473657 - 68003 graph_last l 8 17 aagcaaacac 2738 1 Inf 5 0 6 0 NM_019579 refGene chr12 74760438 + 29231 graph_last 3 9 aagcaaacta 2739 1 Inf 2 0 3 0 NM_019694 refGene chr5 32255261 - 101815 graph_last 1 7 aagcaaatca 2740 1 Inf 2 0 3 0 NM_177725 refGene chr2 30538181 + 73241 graph_last l 9 37 aagcaatccg 2741 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_175642 refGene chr1 25407750 - 1031 graph_last l 9 25 aagcacaatg 2742 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_153407 refGene chr15 102453833 + 50072 graph_last l 24 68 aagcactggt 2743 1 0.444444444444444 4 9 5 3 aagcactgtg 2744 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aagcagaaga 2745 1 Inf 3 0 4 0 NM_010718 refGene chr11 3242198 - 17171 graph_last l 3 16 aagcagacta 2746 1 0.333333333333333 2 6 3 2 aagcagactg 2747 1 Inf 3 0 4 0 aagcagcagc 2748 1 0.823529411764706 14 17 18 6 NM_178874 refGene chr1 135235664 - 6241 graph_last l 30 102 aagcaggaga 2749 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_053166 refGene chr11 48450753 + 19541 graph_last 1 10 aagcagggtc 2750 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_080560 refGene chr10 97926681 + 15105 graph_last 2 13 aagcatcaat 2751 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_145925 refGene chr10 79724211 + 13823 graph_last l 17 61 aagccacaga 2752 1 1.66666666666667 5 3 6 1 aagccaggct 2753 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_026148 refGene chr10 60298024 + 12641 graph_last 2 8 aagccagtct 2754 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aagccagtga 2755 1 Inf 2 0 3 0 NM_025334 refGene chr4 107721744 + 95990 graph_last l 14 46 aagccatttt 2756 1 0.333333333333333 2 6 3 2 aagcccaaag 2757 1 Inf 3 0 4 0 NM_009181 refGene chr7 66520103 - 122093 graph_last 0 22 aagccctccc 2758 1 0.555555555555556 5 9 7 3 aagccctctg 2759 1 Inf 3 0 4 0 NM_145531 refGene chr2 122299652 + 78671 graph_last 0 11 aagccctggg 2760 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_007991 refGene chr7 21800201 + 119670 graph_last 18 63 aagccgcagg 2761 1 2.66666666666667 8 3 11 1 NM_011734 refGene chr9 38428425 - 136537 graph_last l 16 41 aagcctttgt 2762 1 Inf 2 0 3 0 NM_181070 refGene chr18 7001564 - 62602 graph_last s 0 9 aagcgacatc 2763 1 Inf 2 0 3 0 NM_011247 refGene chr7 115058109 + 124908 graph_last l 5 16 aagcgattct 2764 1 Inf 2 0 3 0 NM_080638 refGene chr7 119106729 - 125151 graph_second 0 5 aagcgccata 2765 1 Inf 3 0 4 0 genomic chr10 130358538 + 0 unique_long l 2 16 aagcgctgta 2766 1 Inf 3 0 4 0 aagcggcagc 2767 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_021460 refGene chr19 34522541 - 69410 graph_last 4 16 aagctaaagc 2768 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_010487 refGene chr9 22637727 + 135759 graph_last 3 13 aagctaaatt 2769 1 Inf 2 0 3 0 AK082187 all_mrna chr11 93499618 + 23126 graph_last 0 2 aagctaaggt 2770 1 Inf 3 0 4 0 genomic chr16 6893620 + 0 unique_long l 16 39 aagctactgg 2771 1 Inf 2 0 3 0 NM_027389 refGene chr3 91115663 + 86744 graph_last l 6 21 aagctagccc 2772 1 Inf 2 0 3 0 aagctcagtt 2773 1 1.07692307692308 28 26 37 9 NM_008583 refGene chr19 6386147 + 67677 graph_last l 3 26 aagctccgac 2774 1 Inf 2 0 3 0 aagctcctgc 2775 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_029804 refGene chr17 33282527 - 58755 graph_last l 26 109 aagctgagtg 2776 1 1.07142857142857 15 14 20 5 NM_016978 refGene chr7 124284016 - 125497 graph_last l 19 65 aagctgccct 2777 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_024478 refGene chr5 34990292 + 102016 graph_last l 12 42 aagctgcttg 2778 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_018749 refGene chr15 79304835 - 48298 graph_last l 8 48 aagctggagg 2779 1 Inf 4 0 5 0 BX632753 all_est chr19 7087391 - 67733 graph_last l 3 10 aagctggccg 2780 1 Inf 2 0 3 0 NM_010349 refGene chr10 51066140 - 12268 graph_last 0 4 aagctgggag 2781 1 Inf 2 0 3 0 NM_010898 refGene chr11 4663827 - 17314 graph_last l 24 55 aagctggttt 2782 1 Inf 4 0 5 0 BC023180 knownGene chr8 111357119 + 133337 graph_last l 5 105 aagctgtgag 2783 1 2.5 15 6 19 2 U38501 knownGene chr5 16201084 - 100706 graph_last l 10 43 aagctgttcg 2784 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008138 refGene chr9 110248970 - 141261 graph_last l 12 26 aagctgtttg 2785 1 Inf 3 0 4 0 NM_177594 refGene chr14 54671491 - 41963 graph_last l 8 16 aagcttaaag 2786 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_025282 refGene chr13 81772421 + 36483 graph_last l 36 63 aagcttggat 2787 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_028876 refGene chr5_random 7435867 + 109140 graph_last 0 7 aaggaaaaaa 2788 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008595 refGene chr15 80100474 - 48342 graph_last 1 16 aaggaaaggc 2789 1 Inf 5 0 6 0 aaggaaatgg 2790 1 1.03636363636364 57 55 74 19 AF063095 knownGene chr12 87315969 - 30295 graph_last l 10 38 aaggaacacc 2791 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_197943 refGene chr11 74500267 + 21520 graph_last 1 5 aaggaactaa 2792 1 Inf 2 0 3 0 aaggaactca 2793 1 2.66666666666667 8 3 11 1 NM_008046 refGene chr13 113292789 - 38288 graph_last 0 16 aaggaagctg 2794 1 1.33333333333333 4 3 5 1 aaggaagtgg 2795 1 Inf 2 0 3 0 aaggacatca 2796 1 2 6 3 8 1 genomic chr19 61028497 + 0 unique_long l 47 111 aaggactatg 2797 1 1.33333333333333 4 3 5 1 aaggactgag 2798 1 1.33333333333333 4 3 5 1 aaggactttg 2799 1 1.66666666666667 5 3 7 1 aaggagaatt 2800 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr9 44684175 - 0 unique_long l 7 35 aaggagagtt 2801 1 0.416666666666667 5 12 7 4 NM_138592 refGene chr6 73361846 - 113852 graph_last l 7 37 aaggagcctg 2802 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_153134 refGene chr7_random 1453277 - 126493 graph_last l 3 45 aaggagctgt 2803 1 1.33333333333333 8 6 11 2 aaggaggaag 2804 1 Inf 2 0 3 0 aaggaggtgg 2805 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_008195 refGene chr7 38470610 + 120789 graph_last l 11 29 aaggagtacc 2806 1 Inf 3 0 4 0 NM_011104 refGene chr17 87406005 + 61895 graph_last l 31 56 aaggatagta 2807 1 Inf 3 0 4 0 NM_134086 refGene chr15 98545598 + 49712 graph_last l 12 40 aaggatatct 2808 1 0.916666666666667 11 12 14 4 aaggatgaca 2809 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_023312 refGene chr8 70094469 - 130862 graph_last l 90 351 aaggatgtgc 2810 1 1 14 14 18 5 aaggcaaatc 2811 1 Inf 4 0 5 0 aaggcacagc 2812 1 Inf 2 0 3 0 NM_152895 refGene chr1 137539545 - 6443 graph_last 1 9 aaggcacagg 2813 1 Inf 4 0 5 0 NM_032610 refGene chr7_random 1103029 + 126461 graph_last 0 4 aaggcacatt 2814 1 Inf 2 0 3 0 NM_021921 refGene chr15 91146519 - 49270 graph_last l 9 34 aaggcactgg 2815 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_172736 refGene chr7 4015125 - 118503 graph_last 6 26 aaggcagagg 2816 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_026578 refGene chr3 133461437 - 89285 graph_last 1 11 aaggcatctt 2817 1 Inf 4 0 5 0 NM_197988 refGene chr8 122517419 + 133997 graph_last 9 20 aaggccaacc 2818 1 Inf 5 0 7 0 NM_025840 refGene chr12 30797163 - 27119 graph_last l 10 73 aaggccttcc 2819 1 0.827586206896552 24 29 31 10 aaggcggagt 2820 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_153514 refGene chr14 61339296 - 42465 graph_last 6 13 aaggctatgt 2821 1 Inf 2 0 3 0 aaggctcaca 2822 1 3 9 3 12 1 aaggctccca 2823 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_027901 refGene chr5 29494221 - 101565 graph_last l 7 26 aaggctcctg 2824 1 0.777777777777778 7 9 9 3 NM_009211 refGene chr9 112837328 + 141531 graph_last 0 7 aaggctctga 2825 1 Inf 3 0 4 0 NM_019444 refGene chr19 5660215 - 67592 graph_last l 63 144 aaggcttatt 2826 1 Inf 3 0 4 0 NM_138681 refGene chr11 85386356 + 22605 graph_last l 12 39 aagggaagtg 2827 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_018740 refGene chr11 69540809 - 21096 graph_last l 10 41 aagggcttcc 2828 1 2 6 3 8 1 NM_020027 refGene chr17 34814955 - 58932 graph_last 15 63 aaggggaaag 2829 1 0.916666666666667 11 12 14 4 NM_010937 refGene chr3 106162531 + 87864 graph_last l 5 35 aaggggctga 2830 1 Inf 5 0 6 0 aaggggggca 2831 1 1.42857142857143 20 14 26 5 NM_018858 refGene chr5 116313062 + 106380 graph_last l 14 25 aagggtaatg 2832 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_177208 refGene chr9 89314704 - 140028 graph_last 1 20 aagggtactg 2833 1 0.5 3 6 4 2 NM_009673 refGene chr3 37400268 - 84270 graph_last 7 48 aagggtgctg 2834 1 Inf 2 0 3 0 NM_144901 refGene chr3 106152066 - 87862 graph_last 1 8 aaggtagagt 2835 1 Inf 2 0 3 0 NM_024218 refGene chr16 56401884 + 54408 graph_last 37 280 aaggtcgagc 2836 1 1.30769230769231 34 26 45 9 NM_009089 refGene chr11 69305426 - 21057 graph_last l 6 18 aaggtctctg 2837 1 Inf 5 0 7 0 NM_007788 refGene chr2 153024660 + 80345 graph_last l 11 56 aaggtcttta 2838 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_027007 refGene chr18 24516351 + 63365 graph_last l 5 16 aaggtgctca 2839 1 1 3 3 4 1 aagtaaagcg 2840 1 1.28571428571429 18 14 24 5 aagtaaatga 2841 1 Inf 2 0 3 0 BM209483 all_est chr14 47651302 - 41479 graph_last 0 3 aagtaacact 2842 1 Inf 2 0 3 0 NM_133218 refGene chr3 9563925 - 82994 graph_last l 10 33 aagtaagtct 2843 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_011543 refGene chr11 51871817 - 19827 graph_last l 19 86 aagtaagtgt 2844 1 0.666666666666667 8 12 11 4 AK129215 knownGene chr3 152724324 - 90280 graph_last 1 6 aagtagactc 2845 1 Inf 3 0 4 0 NM_053107 refGene chr1 43645644 + 1872 graph_last 1 11 aagtaggaaa 2846 1 Inf 2 0 3 0 NM_146054 refGene chr14 37249100 - 40748 graph_last l 7 30 aagtatgtga 2847 1 1 3 3 4 1 NM_025794 refGene chr3 81428166 - 86145 graph_last l 9 45 aagtatttgt 2848 1 0.444444444444444 4 9 5 3 aagtcaccag 2849 1 0.666666666666667 2 3 2 1 X57780 knownGene chrM 6812 - 142531 graph_second 74 139 aagtcattct 2850 1 Inf 5 0 7 0 NM_033134 refGene chr2 26650030 - 72943 graph_last l 5 14 aagtcccact 2851 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_175314 refGene chr6 94378197 + 115106 graph_second 0 6 aagtctttca 2852 1 Inf 2 0 3 0 NM_011993 refGene chr7 131196701 - 125878 graph_second 0 3 aagtgatgtt 2853 1 Inf 3 0 4 0 AK129484 knownGene chr3 39401265 - 84382 graph_last l 13 22 aagtgcagaa 2854 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011221 refGene chr11 6365872 - 17495 graph_last l 44 102 aagtgcagta 2855 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_029601 refGene chr12 82154853 + 29912 graph_last 2 16 aagtgcgaga 2856 1 Inf 3 0 4 0 NM_023773 refGene chr14 47792880 + 41490 graph_last 13 43 aagtgcgagg 2857 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_194348 refGene chr19 6307742 + 67662 graph_last l 15 25 aagtggaata 2858 1 Inf 3 0 4 0 NM_172290 refGene chr9 29662908 - 136058 graph_last l 87 145 aagtgtgaaa 2859 1 1 6 6 8 2 aagtgtgaag 2860 1 Inf 3 0 4 0 NM_173755 refGene chr11 116044302 - 25222 graph_last l 16 49 aagtgtggct 2861 1 1 3 3 4 1 NM_010181 refGene chr18 58113136 - 65139 graph_last 0 4 aagttcaacc 2862 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_023799 refGene chr19 45886725 - 70128 graph_last 6 19 aagttcagaa 2863 1 Inf 4 0 5 0 NM_018814 refGene chr12 77991152 + 29514 graph_last l 3 19 aagttcagtt 2864 1 1.33333333333333 4 3 5 1 aagttcgatg 2865 1 0.769230769230769 20 26 26 9 aagttcggag 2866 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aagttgaaag 2867 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aagttgcatt 2868 1 Inf 3 0 4 0 aagttgtcac 2869 1 Inf 2 0 3 0 AK049488 knownGene chrX 61417615 + 149088 graph_last 2 8 aagttgtttt 2870 1 Inf 2 0 3 0 NM_198021 refGene chr10 91993356 - 14728 graph_second 0 4 aagtttatta 2871 1 Inf 2 0 3 0 NM_031166 refGene chr13 48346797 + 34663 graph_second 3 22 aagtttcata 2872 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_145828 refGene chr11 94247605 - 23207 graph_last 3 10 aagtttccct 2873 1 Inf 2 0 3 0 NM_153567 refGene chr5 72785780 - 103800 graph_last l 2 16 aagtttgatt 2874 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_008538 refGene chr10 38259830 - 11621 graph_last l 8 146 aagtttgcaa 2875 1 1.34782608695652 31 23 41 8 aagttttcag 2876 1 1.33333333333333 8 6 11 2 NM_013911 refGene chr9 21199005 + 135572 graph_last l 145 281 aataaaaact 2877 1 1.16666666666667 14 12 18 4 AK032959 knownGene chr6 21993761 + 110784 graph_second 0 2 aataaaaagg 2878 1 Inf 2 0 3 0 NM_027406 refGene chr6 92139914 + 114942 graph_last l 13 46 aataaaaatt 2879 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aataaaagtg 2880 1 Inf 3 0 4 0 NM_007505 refGene chr18_random 17402882 - 67097 graph_last l 96 299 aataaaagtt 2881 1 1 12 12 16 4 aataaaatta 2882 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_022885 refGene chr13 99234699 - 37436 graph_second 0 21 aataaaattg 2883 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_178601 refGene chr1 35133065 + 1408 graph_last 4 22 aataaacgcc 2884 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_009418 refGene chr1 44895435 + 1955 graph_last l 10 25 aataaacgtg 2885 1 1 3 3 4 1 aataaactca 2886 1 Inf 5 0 6 0 aataaactgc 2887 1 0.888888888888889 8 9 10 3 aataaagaaa 2888 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aataaagagt 2889 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_153580 refGene chr7 118956666 + 125136 graph_last 0 3 aataaagccc 2890 1 Inf 3 0 4 0 NM_178777 refGene chr3 105047558 + 87803 graph_last 0 6 aataacttgt 2891 1 Inf 2 0 3 0 AK086893 all_mrna chr7 32508484 - 120405 graph_last 0 42 aataataata 2892 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aataatagta 2893 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_172262 refGene chr13 47145799 + 34624 graph_last 0 9 aataattggt 2894 1 Inf 3 0 4 0 aatacgtttt 2895 1 Inf 2 0 3 0 aatactgact 2896 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aatacttgga 2897 1 Inf 2 0 3 0 NM_022328 refGene chr17 56877521 - 60287 graph_last l 6 20 aatagacacg 2898 1 0.5 3 6 4 2 NM_019498 refGene chr2 28483315 + 73055 graph_second l 49 149 aatagtttga 2899 1 Inf 3 0 4 0 BY375428 all_est chr5 122811138 - 106903 graph_last 0 8 aatataaaaa 2900 1 Inf 2 0 3 0 NM_009048 refGene chr10 18858914 + 10646 graph_last 0 5 aatatataaa 2901 1 Inf 3 0 4 0 NM_027900 refGene chr10 130774999 + 16696 graph_last l 16 26 aatatattta 2902 1 1.33333333333333 4 3 5 1 BC029177 knownGene chr15 43621422 - 46642 graph_last 2 21 aatatcgaaa 2903 1 3.66666666666667 11 3 14 1 aatatgcata 2904 1 1.16666666666667 7 6 9 2 aatattccat 2905 1 Inf 2 0 3 0 AK030698 knownGene chr17 3947038 - 56601 graph_last l 3 10 aatcaaagtg 2906 1 0.666666666666667 2 3 3 1 genomic chr4 81226908 - 0 unique_short s 0 16 aatcaacccg 2907 1 Inf 4 0 5 0 BC048905 knownGene chr2 70040581 + 75473 graph_last 0 9 aatcaagccc 2908 1 1 3 3 4 1 NM_019868 refGene chrX 123097283 - 151456 graph_last 4 16 aatcacaagc 2909 1 Inf 2 0 3 0 NM_016874 refGene chr7 133406225 - 126086 graph_last l 2 10 aatcagaata 2910 1 Inf 2 0 3 0 NM_027815 refGene chr7 110878666 + 124657 graph_last 2 13 aatcatctgt 2911 1 Inf 2 0 3 0 aatcattcaa 2912 1 Inf 3 0 4 0 aatcattggg 2913 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026322 refGene chr14 55269500 - 42019 graph_last l 5 16 aatcatttgc 2914 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_026583 refGene chr5 3569042 + 100113 graph_last l 7 19 aatccaatag 2915 1 1 3 3 4 1 NM_009429 refGene chr14 67418290 + 42807 graph_last 0 6 aatccagatg 2916 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aatccagccc 2917 1 1 3 3 4 1 NM_178048 refGene chr8 112604015 + 133424 graph_last l 7 21 aatccccatt 2918 1 Inf 2 0 3 0 NM_012053 refGene chr15 78134217 + 48155 graph_last 84 491 aatcctgtgg 2919 1 0.753623188405797 52 69 68 24 aatccttgcc 2920 1 0.785714285714286 11 14 15 5 aatcgaaaag 2921 1 Inf 3 0 4 0 NM_033608 refGene chr1 176349477 + 8567 graph_last 0 5 aatcgtggga 2922 1 Inf 3 0 4 0 NM_016700 refGene chr14 27898629 - 40299 graph_last l 5 15 aatctacatt 2923 1 Inf 4 0 5 0 NM_019658 refGene chr19 53776108 - 70518 graph_last l 9 55 aatctgaaaa 2924 1 1.66666666666667 5 3 6 1 aatctgagga 2925 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aatctggaaa 2926 1 Inf 2 0 3 0 NM_172769 refGene chr9 43970792 - 136924 graph_last l 12 25 aatctggata 2927 1 Inf 2 0 3 0 CD804626 all_est chr1 69620931 - 3302 graph_last l 4 26 aatctgtcag 2928 1 0.333333333333333 2 6 3 2 aatcttcaag 2929 1 Inf 4 0 5 0 NM_175771 refGene chrX 71070636 - 149567 graph_second 0 9 aatctttaat 2930 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aatctttcct 2931 1 Inf 2 0 3 0 NM_175236 refGene chr1 9657067 - 281 graph_last 0 14 aatgaaaaaa 2932 1 Inf 3 0 4 0 aatgaaataa 2933 1 1 3 3 4 1 NM_153056 refGene chr11 120173107 - 25596 graph_last l 4 33 aatgaactgg 2934 1 0.5 3 6 4 2 aatgaagttc 2935 1 Inf 5 0 6 0 NM_145979 refGene chr6 127041202 + 116948 graph_last 0 8 aatgaatatt 2936 1 1 3 3 4 1 aatgaatcca 2937 1 Inf 3 0 4 0 NM_009768 refGene chr10 82014923 + 14067 graph_last l 17 61 aatgacaagg 2938 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_153599 refGene chr5 144844936 - 108502 graph_last 8 43 aatgacacaa 2939 1 1.33333333333333 8 6 11 2 aatgacctgg 2940 1 1.13970588235294 155 136 202 47 aatgagaagg 2941 1 0.555555555555556 5 9 6 3 aatgagctta 2942 1 Inf 4 0 5 0 aatgaggcca 2943 1 Inf 5 0 6 0 NM_026149 refGene chr15 44909935 + 46677 graph_last 1 18 aatgagtttc 2944 1 Inf 2 0 3 0 NM_130884 refGene chr2 130530736 + 79145 graph_last l 10 66 aatgataaaa 2945 1 1.11111111111111 10 9 13 3 CK382420 all_est chr10 73121218 + 13491 graph_last 1 4 aatgatgatt 2946 1 Inf 2 0 3 0 aatgatgcag 2947 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_177108 refGene chr4 82468248 + 94568 graph_last 0 2 aatgcagagg 2948 1 Inf 2 0 3 0 aatgcagtgc 2949 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aatgcatttt 2950 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aatgccaggt 2951 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AF156547 knownGene chrX 49870193 - 148750 graph_last 2 18 aatgccatct 2952 1 1 3 3 4 1 aatgccctag 2953 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_016882 refGene chr19 5237432 - 67550 graph_last 10 42 aatgcgaaca 2954 1 2 6 3 8 1 NM_029956 refGene chr5 113359388 - 106091 graph_last 1 16 aatgctacat 2955 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AA260761 all_est chr1 84671738 + 4030 graph_last l 6 25 aatgctctac 2956 1 Inf 2 0 3 0 NM_009920 refGene chr19 4914942 - 67497 graph_second 1 9 aatgctgaca 2957 1 Inf 4 0 5 0 aatgctggga 2958 1 Inf 2 0 3 0 NM_030700 refGene chrX 138507042 - 152044 graph_last 5 30 aatggaaatc 2959 1 1 3 3 4 1 NM_178686 refGene chr18 53959156 + 64907 graph_last l 9 13 aatggaacag 2960 1 Inf 2 0 3 0 aatggacgtc 2961 1 Inf 2 0 3 0 NM_172475 refGene chr2 4532237 - 71564 graph_last 0 5 aatggatatg 2962 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008487 refGene chr3 90799038 + 86700 graph_last l 14 79 aatggatgca 2963 1 1.66666666666667 15 9 19 3 BC019782 knownGene chr13 94915908 - 37110 graph_last l 2 9 aatggccctg 2964 1 Inf 2 0 3 0 aatggctagc 2965 1 1.66666666666667 15 9 19 3 NM_146253 refGene chr2 37705226 - 73801 graph_last 4 11 aatggctgtt 2966 1 0.666666666666667 2 3 3 1 BE949648 all_est chr13 43246792 - 34341 graph_last l 11 28 aatggctttg 2967 1 Inf 2 0 3 0 aatgggagct 2968 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr6 81115373 + 0 unique_long l 2 7 aatgggatgg 2969 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011869 refGene chr11 98288261 - 23668 graph_last l 15 35 aatggggagt 2970 1 Inf 2 0 3 0 CD350194 all_est chr6 32019643 - 111398 graph_last l 10 51 aatgggtgaa 2971 1 2.33333333333333 14 6 18 2 riB430101E24 rikenClones chr1 4572708 - 70 graph_second 0 5 aatgggtgtt 2972 1 Inf 2 0 3 0 BC046514 knownGene chr7 21192021 - 119611 graph_last l 17 51 aatgtagcgc 2973 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aatgtatggt 2974 1 Inf 2 0 3 0 NM_018785 refGene chr2 53349560 - 74591 graph_last 1 7 aatgtcagca 2975 1 Inf 2 0 3 0 NM_008924 refGene chr9 111368745 + 141428 graph_last l 2 16 aatgtcatct 2976 1 Inf 2 0 3 0 NM_145480 refGene chr16 22746292 + 52363 graph_last l 7 27 aatgtggctg 2977 1 Inf 3 0 4 0 aatgttgtac 2978 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_007610 refGene chr6 42490755 - 112163 graph_last 1 7 aatgtttcct 2979 1 0.333333333333333 2 6 3 2 aatgtttctg 2980 1 2.5 15 6 19 2 aattaaagtc 2981 1 Inf 4 0 5 0 NM_172961 refGene chr16 8176147 + 51329 graph_last l 21 66 aattaaatgt 2982 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_152801 refGene chrX 46884969 + 148639 graph_last 0 3 aattaacatt 2983 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aattaaggaa 2984 1 Inf 2 0 3 0 BB674281 all_est chr3 90690195 + 86687 graph_last 0 19 aattaatcaa 2985 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aattacaagc 2986 1 2 6 3 8 1 aattactatt 2987 1 0.666666666666667 6 9 8 3 NM_010771 refGene chr18 35749973 - 63875 graph_last l 11 27 aattagaagc 2988 1 Inf 2 0 3 0 BC054122 knownGene chr1 130509099 + 5939 graph_last l 12 28 aattagccat 2989 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_145066 refGene chr6 13631487 - 110464 graph_last 1 28 aattattggg 2990 1 0.416666666666667 5 12 7 4 NM_013709 refGene chr12 25538285 - 26842 graph_last 32 99 aattcaactg 2991 1 Inf 3 0 4 0 AK122383 knownGene chr4 149174669 - 99491 graph_last 4 9 aattcaagaa 2992 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_133242 refGene chr2 156804036 - 80731 graph_last 10 16 aattcacctt 2993 1 Inf 3 0 4 0 aattccgtga 2994 1 Inf 3 0 4 0 NM_013594 refGene chr18 74711598 + 66052 graph_last 3 7 aattgcactt 2995 1 Inf 3 0 4 0 NM_146105 refGene chr1 183671471 + 8997 graph_last 2 10 aattggagta 2996 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aattgtcatt 2997 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aattgttcaa 2998 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_010726 refGene chr2 4857118 + 71588 graph_last l 15 38 aatttaatta 2999 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aatttcaaaa 3000 1 0.948275862068966 55 58 72 20 NM_173399 refGene chr4 44283143 - 92796 graph_last 2 6 aatttcagcc 3001 1 Inf 2 0 3 0 aatttccaga 3002 1 Inf 2 0 3 0 NM_183204 refGene chr13 43721032 + 34376 graph_last l 2 8 aatttctaga 3003 1 1.33333333333333 4 3 5 1 aatttgaaag 3004 1 Inf 2 0 3 0 NM_181278 refGene chr13 55477090 + 35197 graph_last l 3 18 aatttgatct 3005 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_011751 refGene chr11 79977099 + 22170 graph_last l 10 40 aatttggtcg 3006 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_011874 refGene chr7_random 41613533 - 127334 graph_last l 22 68 aattttacaa 3007 1 0.416666666666667 5 12 6 4 aattttcact 3008 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_030018 refGene chr16 93010284 - 56022 graph_last l 8 31 aattttgttt 3009 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_023516 refGene chr6 29112565 + 111101 graph_last 1 4 aatttttcta 3010 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_019989 refGene chrX 99090623 + 150793 graph_last l 11 44 aatttttgtt 3011 1 1.16666666666667 7 6 9 2 acaaaaaaaa 3012 1 Inf 3 0 4 0 NM_010211 refGene chrX 46437157 + 148620 graph_last l 37 60 acaaaaactc 3013 1 0.833333333333333 5 6 6 2 acaaaaccaa 3014 1 Inf 3 0 4 0 NM_009790 refGene chr12 95767982 + 30604 graph_last l 461 1256 acaaacttag 3015 1 0.833333333333333 60 72 79 25 acaaataaac 3016 1 0.705882352941177 12 17 16 6 NM_011695 refGene chr14 16734347 + 39565 graph_last 47 123 acaaattatg 3017 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_053199 refGene chr1 177199349 - 8600 graph_last l 17 81 acaacaaaat 3018 1 Inf 5 0 7 0 NM_009070 refGene chr17 24014142 + 57790 graph_second 3 12 acaacaggcg 3019 1 0.666666666666667 2 3 2 1 acaacattca 3020 1 1 3 3 4 1 BC046962 knownGene chr7 5104210 - 118609 graph_last l 23 73 acaaccccca 3021 1 1 3 3 4 1 NM_016744 refGene chr2 80196841 - 76137 graph_last l 49 73 acaacctatg 3022 1 0.666666666666667 2 3 3 1 acaactggtg 3023 1 Inf 2 0 3 0 NM_026646 refGene chr7 133498165 + 126093 graph_second l 16 45 acaagacaca 3024 1 Inf 3 0 4 0 NM_030066 refGene chrX 123212056 + 151465 graph_last l 15 29 acaagagagc 3025 1 Inf 3 0 4 0 NM_027216 refGene chr11 113166780 + 24952 graph_last l 7 20 acaagcacaa 3026 1 Inf 3 0 4 0 NM_009261 refGene chr2 37872108 - 73833 graph_last l 11 22 acaagcgctt 3027 1 Inf 2 0 3 0 BC058645 knownGene chr8 105969060 - 132879 graph_last 6 16 acaaggctgc 3028 1 Inf 2 0 3 0 NM_023190 refGene chr14 45734984 - 41307 graph_last l 6 39 acaagggact 3029 1 2.16666666666667 13 6 17 2 NM_013719 refGene chr2 118746150 + 78295 graph_last 3 19 acaaggtaaa 3030 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_008468 refGene chr4 128541872 - 97498 graph_last 2 6 acaagtgaaa 3031 1 Inf 3 0 4 0 acaagtttct 3032 1 0.666666666666667 2 3 2 1 acaataaaca 3033 1 Inf 3 0 4 0 acaataaacc 3034 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr2_random 7241822 + 0 unique_long l 4 9 acaataattt 3035 1 Inf 2 0 3 0 NM_172606 refGene chr15 32066308 + 46028 graph_last l 31 70 acaatcctat 3036 1 0.416666666666667 5 12 6 4 acaatggcat 3037 1 Inf 4 0 5 0 acaatgttcc 3038 1 1 6 6 8 2 BE948845 all_est chr10 132159898 - 16875 graph_last l 4 24 acacaatcca 3039 1 Inf 3 0 4 0 CA949071 all_est chr7 24897743 - 119999 graph_last 0 4 acacaattcc 3040 1 Inf 3 0 4 0 NM_011365 refGene chr12 4757583 - 26035 graph_second 0 5 acacacaaaa 3041 1 Inf 2 0 3 0 acacacacaa 3042 1 0.666666666666667 2 3 3 1 acacacacac 3043 1 Inf 3 0 4 0 acacactgga 3044 1 Inf 2 0 3 0 acacagaaat 3045 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_019402 refGene chr14 45987519 - 41330 graph_last 10 109 acacattatt 3046 1 0.785714285714286 11 14 14 5 acaccattcc 3047 1 0.666666666666667 2 3 2 1 acaccctgga 3048 1 Inf 3 0 4 0 NM_178718 refGene chr15 68177713 + 47652 graph_last 2 10 acacgaacag 3049 1 1.33333333333333 4 3 5 1 genomic chr13 71065301 + 0 unique_short s 1 51 acacgacgta 3050 1 0.5 3 6 4 2 AA146212 all_est chrX 93982597 - 150566 graph_last 1 10 acactgcaac 3051 1 0.666666666666667 2 3 2 1 acactgccca 3052 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_023232 refGene chr5 122573502 - 106873 graph_last l 8 16 acactgtgtg 3053 1 1 3 3 4 1 acacttgcta 3054 1 1 3 3 4 1 NM_145629 refGene chrX 65568515 - 149357 graph_last l 35 62 acacttttga 3055 1 Inf 2 0 3 0 NM_172606 refGene chr15 32064071 - 46028 graph_last 0 2 acacttttgg 3056 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BB771769 all_est chr10 89198068 + 14574 graph_last 18 44 acacttttgt 3057 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_023672 refGene chr4 105908056 + 95788 graph_last l 21 82 acactttttg 3058 1 1.16666666666667 14 12 18 4 NM_009338 refGene chr17 13179411 + 57147 graph_last 6 22 acagaaagtg 3059 1 Inf 3 0 4 0 AK122398 knownGene chr15 38548081 - 46378 graph_last l 23 51 acagaacggc 3060 1 0.833333333333333 5 6 7 2 acagaatata 3061 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_025480 refGene chr5 36689213 + 102130 graph_last l 7 26 acagaatcgt 3062 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_178081 refGene chr1 53927709 - 2312 graph_last l 7 45 acagacaagg 3063 1 0.5 3 6 4 2 acagacactt 3064 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_153414 refGene chr14 56762441 + 42178 graph_last 2 15 acagacatcc 3065 1 Inf 3 0 4 0 acagacattt 3066 1 Inf 2 0 3 0 acagactgtc 3067 1 Inf 4 0 5 0 acagagaaca 3068 1 Inf 2 0 3 0 NM_144873 refGene chr19 29787664 + 69126 graph_last l 14 35 acagagatgt 3069 1 1.66666666666667 5 3 7 1 acagatcaga 3070 1 Inf 4 0 5 0 acagatgata 3071 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_027342 refGene chr16 35819694 + 53275 graph_last l 12 27 acagatgtca 3072 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_009867 refGene chr2 179707435 + 82311 graph_last l 3 13 acagattccc 3073 1 1 3 3 4 1 NM_134078 refGene chr14 61267104 - 42458 graph_last 9 30 acagccacac 3074 1 1.33333333333333 4 3 5 1 acagccagaa 3075 1 Inf 3 0 4 0 BB355482 all_est chr3 138107617 + 89537 graph_last 2 6 acagcccttc 3076 1 Inf 2 0 3 0 CK339473 all_est chr1 53449613 - 2273 graph_last l 3 19 acagcgtatt 3077 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_009156 refGene chr7 12912473 - 118959 graph_second l 9 95 acaggaagga 3078 1 1.88888888888889 17 9 22 3 NM_010717 refGene chr5 133484366 - 107627 graph_last l 13 61 acaggaatga 3079 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_019464 refGene chr3 148612783 - 90112 graph_last 0 4 acaggagtgt 3080 1 Inf 2 0 3 0 NM_028392 refGene chr18 43302393 - 64388 graph_last l 21 102 acaggctcct 3081 1 1.41176470588235 24 17 31 6 BU519104 all_est chr1 55701322 + 2401 graph_last l 2 7 acagtaactg 3082 1 Inf 3 0 4 0 acagtagaag 3083 1 Inf 2 0 3 0 NM_011856 refGene chr11 35648117 - 18964 graph_last l 9 42 acagtcacca 3084 1 Inf 3 0 4 0 NM_133975 refGene chr1 86543891 - 4131 graph_second 1 3 acagtcgggc 3085 1 Inf 2 0 3 0 acagtctcgc 3086 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_178601 refGene chr1 35125389 - 1408 graph_last 1 12 acagtgacgt 3087 1 Inf 5 0 6 0 NM_028834 refGene chr2 137023764 - 79563 graph_last l 8 26 acagtgcaat 3088 1 0.666666666666667 2 3 2 1 acagtgcttg 3089 1 0.857142857142857 12 14 16 5 NM_010497 refGene chr1 66764681 + 3174 graph_last 1 20 acagttaatt 3090 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_178337 refGene chr13 13758315 - 32771 graph_last l 14 29 acagttcaaa 3091 1 Inf 2 0 3 0 acagttccag 3092 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_009441 refGene chr16 96139035 - 56249 graph_last 10 50 acagttgatt 3093 1 0.416666666666667 5 12 6 4 NM_133195 refGene chr18 26104576 - 63468 graph_last l 50 115 acataaagat 3094 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_173364 refGene chr9 125233362 - 142346 graph_last l 15 50 acataagagt 3095 1 0.5 3 6 4 2 NM_011188 refGene chr5 19904678 + 100919 graph_last l 46 110 acatacaatt 3096 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_172836 refGene chr19 29480005 - 69090 graph_last l 4 16 acatcactct 3097 1 0.666666666666667 2 3 2 1 acatcattct 3098 1 0.666666666666667 2 3 2 1 acatcctgtt 3099 1 Inf 2 0 3 0 NM_029456 refGene chr19 3259537 - 67295 graph_last b 8 32 acatcgcgta 3100 1 2 6 3 8 1 NM_021516 refGene chr12 107222018 + 31347 graph_last l 7 27 acattaaagt 3101 1 1 3 3 4 1 acattaagat 3102 1 Inf 2 0 3 0 acattccacc 3103 1 Inf 2 0 3 0 NM_023191 refGene chr9 56833980 - 137798 graph_last l 12 42 acattcctca 3104 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_022989 refGene chr2 53425169 + 74604 graph_last l 3 13 acattgccta 3105 1 Inf 2 0 3 0 acatttaaaa 3106 1 1 3 3 4 1 acatttacag 3107 1 Inf 3 0 4 0 acatttataa 3108 1 Inf 4 0 5 0 NM_010160 refGene chr2 6465097 - 71738 graph_last l 17 51 acatttattg 3109 1 0.666666666666667 2 3 3 1 acatttcaat 3110 1 1.11111111111111 10 9 13 3 AI639789 all_est chr19 41635325 + 69821 graph_last 1 13 acattttgga 3111 1 0.666666666666667 2 3 3 1 acatttttgt 3112 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_153574 refGene chr6 59412621 - 113148 graph_last 1 168 accaaaaaaa 3113 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BG066445 all_est chr12 5092042 - 26065 graph_last l 3 8 accaaaacca 3114 1 Inf 2 0 3 0 NM_009829 refGene chr6 129065716 - 117072 graph_last l 2 16 accaaaacgc 3115 1 3.33333333333333 10 3 13 1 accaaactcc 3116 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_053104 refGene chr15 78448098 - 48203 graph_second 0 3 accaacaaga 3117 1 Inf 2 0 3 0 accaacagag 3118 1 0.666666666666667 2 3 3 1 genomic chr19 38937917 + 0 unique_long l 3 9 accaacggag 3119 1 0.666666666666667 2 3 3 1 accaagatct 3120 1 0.78688524590164 48 61 63 21 NM_007668 refGene chr5 22576974 - 101122 graph_last l 4 45 accaagctgc 3121 1 1.33333333333333 8 6 11 2 accaaggaaa 3122 1 Inf 2 0 3 0 accaagtgta 3123 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_153560 refGene chr2 32841586 + 73452 graph_last l 7 21 accacaacca 3124 1 Inf 2 0 3 0 AK086339 knownGene chr5 129879636 - 107355 graph_last 0 3 accacagcaa 3125 1 Inf 2 0 3 0 AK004695 knownGene chr9 46115901 - 137070 graph_last l 9 36 accacagttc 3126 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_026441 refGene chr4 129041306 + 97553 graph_last l 15 39 accaccaaaa 3127 1 Inf 2 0 3 0 BX524978 all_est chr4 40730224 + 92387 graph_last 0 43 accaccacaa 3128 1 Inf 3 0 4 0 NM_153781 refGene chr2 151562814 + 80231 graph_last l 26 86 accacccttc 3129 1 1.66666666666667 5 3 7 1 BC048228 knownGene chr7 14018907 + 119121 graph_last l 20 71 accactccca 3130 1 0.333333333333333 2 6 3 2 accagagcag 3131 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_028777 refGene chr11 116662426 + 25278 graph_second 0 2 accagcctgg 3132 1 Inf 2 0 3 0 NM_027151 refGene chr10 130560058 - 16681 graph_last l 11 24 accagctgtc 3133 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_146107 refGene chr1 37395857 - 1542 graph_last l 58 114 accagggcct 3134 1 Inf 2 0 3 0 NM_011634 refGene chr9 110606143 + 141318 graph_last 1 7 accagtttac 3135 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026810 refGene chr9 113832204 - 141649 graph_last l 4 13 accatccaag 3136 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026274 refGene chr8 95858359 - 132503 graph_last l 12 53 accatcctct 3137 1 2.66666666666667 8 3 11 1 accattcttc 3138 1 1.5 9 6 12 2 AA529976 all_est chr4 131809155 + 97805 graph_last 0 8 acccaaaacc 3139 1 Inf 2 0 3 0 NM_146009 refGene chr10 103090429 - 15325 graph_last l 4 16 acccacaaat 3140 1 1 3 3 4 1 NM_024219 refGene chr8 121047724 + 133890 graph_last l 28 112 acccaggctg 3141 1 3.33333333333333 10 3 13 1 acccagtcgg 3142 1 Inf 2 0 3 0 NM_025789 refGene chr17 7422402 + 56847 graph_last 7 49 acccatccag 3143 1 0.666666666666667 6 9 8 3 NM_010911 refGene chr2 156748936 - 80726 graph_last l 18 35 accccaatca 3144 1 Inf 2 0 3 0 NM_019537 refGene chr16 97944591 - 56326 graph_last l 4 25 accccaggtg 3145 1 0.666666666666667 2 3 3 1 accccccccc 3146 1 Inf 4 0 5 0 acccctaata 3147 1 Inf 3 0 4 0 NM_029023 refGene chr11 88507717 - 22934 graph_last l 14 35 acccgcactt 3148 1 0.666666666666667 2 3 3 1 acccgccggg 3149 1 Inf 4 0 5 0 acccgcctgc 3150 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_008866 refGene chr1 4879083 + 87 graph_last 11 20 accctagaat 3151 1 Inf 2 0 3 0 accctatgct 3152 1 1 3 3 4 1 NM_011588 refGene chr7 10287745 - 118856 graph_second 2 10 accctcccaa 3153 1 Inf 2 0 3 0 NM_007438 refGene chr7_random 37879260 + 127284 graph_second 0 104 accctcctcc 3154 1 0.7 14 20 18 7 NM_173741 refGene chr17 25429952 + 57931 graph_last 0 4 accctcgtgg 3155 1 Inf 2 0 3 0 NM_010092 refGene chr7 21808145 + 119671 graph_last 3 9 accctgcccc 3156 1 Inf 2 0 3 0 AI875489 all_est chr9 82357362 - 139776 graph_last 1 10 accctgcctg 3157 1 Inf 2 0 3 0 accctgctta 3158 1 Inf 3 0 4 0 NM_012053 refGene chr15 78132801 + 48155 graph_last 6 12 accctggccg 3159 1 Inf 5 0 6 0 accctgtgaa 3160 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_016715 refGene chr5 108522692 + 105718 graph_last 3 30 accctgtgac 3161 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_023053 refGene chr17 66053952 - 60697 graph_last b 6 32 accgacaact 3162 1 0.833333333333333 5 6 6 2 AK007352 knownGene chr4 137234621 + 98340 graph_second l 344 642 accgacaagg 3163 1 0.5 6 12 8 4 accgcggctg 3164 1 Inf 2 0 3 0 NM_177911 refGene chr9 125469391 - 142375 graph_last 1 13 accgctgcgt 3165 1 Inf 3 0 4 0 NM_030245 refGene chr1 169990731 - 8174 graph_last l 7 32 accgtgactc 3166 1 0.666666666666667 6 9 8 3 NM_172678 refGene chr3 37043443 + 84252 graph_last 0 46 accgtgaggg 3167 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_007523 refGene chr17 26650934 - 58085 graph_last l 4 20 acctacttca 3168 1 0.5 3 6 4 2 NM_025841 refGene chr5 142251236 + 108304 graph_last l 9 47 acctatattg 3169 1 Inf 4 0 5 0 acctatgtag 3170 1 1 3 3 4 1 acctatttgt 3171 1 1 3 3 4 1 NM_016686 refGene chr11 87641994 + 22842 graph_last l 5 24 acctcacctt 3172 1 1.5 9 6 12 2 NM_008746 refGene chr7 70669792 - 122257 graph_last l 7 22 acctcatttc 3173 1 0.666666666666667 2 3 2 1 acctccagcc 3174 1 Inf 3 0 4 0 BB821033 all_est chr10 4919290 - 9992 graph_last 0 11 acctccagga 3175 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_133350 refGene chr5 29202901 + 101526 graph_last l 62 125 acctccaggc 3176 1 1.66666666666667 5 3 7 1 acctccctac 3177 1 Inf 5 0 6 0 acctcctcat 3178 1 1.33333333333333 4 3 5 1 acctctcaga 3179 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_029850 refGene chr5 122247013 + 106834 graph_last l 7 20 acctctgaac 3180 1 Inf 5 0 6 0 NM_021529 refGene chr12 50730641 + 28021 graph_last l 2 10 acctctgtcc 3181 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011790 refGene chr9 111222764 - 141415 graph_last l 12 38 acctgaccag 3182 1 Inf 4 0 5 0 NM_007522 refGene chr19 6930387 - 67710 graph_last l 21 74 acctgccacc 3183 1 1 3 3 4 1 acctgctggt 3184 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_133947 refGene chr7 94347997 + 123633 graph_last l 8 26 acctggtagg 3185 1 Inf 3 0 4 0 NM_009353 refGene chr8 108601935 - 133150 graph_last l 7 18 acctgtaaaa 3186 1 0.666666666666667 2 3 3 1 BB581062 all_est chr7 97884882 - 123911 graph_last 1 8 acctgtggcc 3187 1 0.5 3 6 4 2 NM_008696 refGene chr1 40711625 + 1780 graph_last l 5 19 accttaggca 3188 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_007516 refGene chr5 99070199 + 105088 graph_last 0 6 accttatcta 3189 1 Inf 2 0 3 0 NM_025448 refGene chr3 90737559 + 86695 graph_last l 27 66 accttgccct 3190 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_009458 refGene chr11 51618899 - 19798 graph_last l 2 13 accttgggtc 3191 1 Inf 3 0 4 0 NM_007567 refGene chr9 110731493 - 141341 graph_last l 39 78 accttgtgaa 3192 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_011638 refGene chr16 32342366 + 52949 graph_last l 34 68 acctttactg 3193 1 1.33333333333333 4 3 5 1 acctttggaa 3194 1 1 3 3 4 1 genomic chr9 22549201 + 0 unique_long l 2 6 acctttgtgg 3195 1 Inf 2 0 3 0 NM_008981 refGene chr14 7576070 + 39022 graph_last 1 12 accttttcat 3196 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_144806 refGene chr11 61301021 - 20552 graph_last l 12 54 acctttttag 3197 1 2.66666666666667 8 3 10 1 NM_053168 refGene chr11 58553814 + 20282 graph_last l 3 16 acgaatggtt 3198 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_008440 refGene chr1 94966737 - 4783 graph_last l 8 37 acgaattgtg 3199 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_019978 refGene chr3 56878025 - 85071 graph_last 1 6 acgacaacaa 3200 1 Inf 2 0 3 0 acgacaagct 3201 1 Inf 3 0 4 0 NM_009124 refGene chr13 45614776 + 34511 graph_last l 3 11 acgactgatg 3202 1 0.666666666666667 2 3 2 1 acgagcagca 3203 1 Inf 2 0 3 0 acgcaactgt 3204 1 1 3 3 4 1 acgcagaatg 3205 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_009940 refGene chr7 110551206 - 124634 graph_last 13 39 acgcagagct 3206 1 1.66666666666667 5 3 6 1 acgcagtggc 3207 1 Inf 2 0 3 0 NM_177176 refGene chr4 97162076 + 95245 graph_last 2 15 acgcagtggg 3208 1 1 3 3 4 1 NM_029810 refGene chr19 47024121 + 70244 graph_last l 46 157 acgcatctgt 3209 1 1 17 17 22 6 NM_133676 refGene chr14 42721147 - 41088 graph_last l 13 52 acgccacaat 3210 1 0.833333333333333 5 6 6 2 acgccattgg 3211 1 2.66666666666667 8 3 10 1 acgcctccct 3212 1 Inf 2 0 3 0 AK032100 knownGene chr11 114297454 - 25010 graph_last s 0 22 acgcgggtcg 3213 1 Inf 2 0 3 0 acgctttcag 3214 1 Inf 3 0 4 0 acggactgta 3215 1 1 3 3 4 1 NM_024462 refGene chr4 118315221 + 96672 graph_last l 5 63 acggagctgg 3216 1 0.8 16 20 21 7 NM_134015 refGene chr11 32644966 + 18773 graph_last l 36 122 acggctttgt 3217 1 3.33333333333333 10 3 13 1 acgggaaaaa 3218 1 Inf 5 0 7 0 NM_178631 refGene chr3 13949517 + 83169 graph_second 0 146 acgggcaaaa 3219 1 0.88235294117647 15 17 19 6 acggtagagt 3220 1 Inf 3 0 4 0 NM_175113 refGene chr2 132958252 - 79366 graph_last 1 11 acggtgactt 3221 1 Inf 3 0 4 0 acgtagaccc 3222 1 Inf 5 0 7 0 NM_009308 refGene chr18 31773220 - 63593 graph_last 1 28 acgtatttaa 3223 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_023144 refGene chrX 91351065 - 150328 graph_last l 9 26 acgtctccat 3224 1 Inf 4 0 5 0 BC024662 knownGene chr8 85108232 - 131801 graph_last l 36 62 acgtggtaat 3225 1 1 3 3 4 1 NM_013538 refGene chr6 126762126 + 116911 graph_last 0 15 acgtgtctgt 3226 1 Inf 4 0 5 0 BB816300 all_est chrUn_random 25796099 - 143681 graph_last l 22 106 acgtttgtgg 3227 1 0.666666666666667 8 12 11 4 U70442 knownGene chr2 153137906 + 80366 graph_last s 0 25 acgttttccg 3228 1 2.66666666666667 8 3 10 1 actaaaaaaa 3229 1 Inf 2 0 3 0 NM_010178 refGene chr4 134644556 + 98089 graph_last 1 9 actaaaaaat 3230 1 Inf 3 0 4 0 NM_028136 refGene chr3 64012307 - 85422 graph_last l 10 30 actaaacagt 3231 1 0.5 3 6 4 2 NM_009715 refGene chr2 74210891 - 75787 graph_last l 28 91 actaaaccat 3232 1 2 6 3 8 1 actaattaag 3233 1 0.333333333333333 2 6 3 2 actacagaag 3234 1 Inf 2 0 3 0 actacataca 3235 1 Inf 2 0 3 0 actacctacc 3236 1 Inf 5 0 6 0 actacttctg 3237 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_134010 refGene chr10 120790334 - 16144 graph_last 4 18 actagaggag 3238 1 Inf 3 0 4 0 NM_030201 refGene chr16 76899703 - 55282 graph_last l 5 19 actagcttgg 3239 1 1 3 3 4 1 genomic chr14 26871103 - 0 unique_long l 17 58 actagtaaag 3240 1 Inf 2 0 3 0 L42341 knownGene chr2 66155298 + 75254 graph_last l 5 21 actataacat 3241 1 0.666666666666667 2 3 3 1 actatcacct 3242 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr18 36472287 + 0 unique_long l 4 14 actatcatct 3243 1 0.666666666666667 2 3 2 1 actattatcc 3244 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr19 46300922 - 0 unique_long l 4 44 actcaaatgg 3245 1 3.33333333333333 10 3 13 1 actcaataaa 3246 1 Inf 5 0 6 0 NM_029759 refGene chr4 133381178 - 97992 graph_last 0 34 actcactcag 3247 1 0.666666666666667 2 3 3 1 actcagtaaa 3248 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AB093226 knownGene chr8 92182170 + 132247 graph_last 2 10 actcagtctt 3249 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_009871 refGene chr11 80052353 - 22184 graph_last l 18 70 actcatcaga 3250 1 1.11111111111111 10 9 13 3 NM_134126 refGene chr17 24693816 + 57864 graph_last 3 22 actccaaata 3251 1 1 3 3 4 1 actccagctg 3252 1 Inf 2 0 3 0 NM_146251 refGene chr2 25329142 + 72787 graph_last l 20 115 actcccttca 3253 1 0.588235294117647 10 17 13 6 NM_008165 refGene chr11 56927756 + 20133 graph_last l 35 102 actccgggga 3254 1 0.777777777777778 7 9 9 3 actccggtct 3255 1 Inf 5 0 6 0 NM_053173 refGene chr17 26569374 + 58068 graph_last l 8 20 actcctaatg 3256 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_009790 refGene chr12 95769007 + 30604 graph_last l 442 827 actcggagcc 3257 1 1.34482758620690 39 29 51 10 NM_019423 refGene chr13 41230612 - 34233 graph_last l 4 21 actcgggtgg 3258 1 Inf 2 0 3 0 actctagctg 3259 1 Inf 2 0 3 0 NM_010477 refGene chr1 56388630 - 2455 graph_last 2 11 actctcgcct 3260 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026603 refGene chr5 122406282 + 106854 graph_last l 7 40 actctgaatt 3261 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_172918 refGene chr9 20041928 + 135508 graph_last 1 4 actctggccg 3262 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_021295 refGene chr1 68581398 - 3279 graph_last l 61 135 actctgtgta 3263 1 0.666666666666667 8 12 11 4 actgaagcaa 3264 1 Inf 2 0 3 0 NM_008502 refGene chr11 60285270 + 20463 graph_last l 9 32 actgaagtca 3265 1 Inf 4 0 5 0 NM_029826 refGene chr18 76984131 + 66184 graph_last l 13 24 actgactcac 3266 1 Inf 2 0 3 0 NM_027915 refGene chr11 82868613 + 22353 graph_last 7 29 actgactcca 3267 1 Inf 4 0 5 0 actgactggc 3268 1 Inf 2 0 3 0 NM_182650 refGene chr6 51937183 + 112726 graph_last 0 8 actgagataa 3269 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026626 refGene chr1 182514572 + 8924 graph_last 1 5 actgaggaag 3270 1 Inf 2 0 3 0 NM_009743 refGene chr2 153524240 - 80405 graph_last l 8 40 actgagggac 3271 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_178602 refGene chr9 73953709 + 139205 graph_last l 17 28 actgaggttt 3272 1 0.666666666666667 2 3 2 1 actgagtctc 3273 1 Inf 4 0 5 0 NM_026669 refGene chr15 101353787 + 49918 graph_last l 41 132 actgagttcc 3274 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_177645 refGene chr1 68297363 - 3243 graph_last 1 8 actgatatta 3275 1 Inf 2 0 3 0 NM_172695 refGene chr4 93617608 - 95050 graph_last l 14 55 actgattgca 3276 1 2 6 3 8 1 NM_033563 refGene chr1 65626632 - 3076 graph_last 1 11 actgcaaagt 3277 1 Inf 3 0 4 0 NM_009468 refGene chr18 43985320 + 64437 graph_last 0 19 actgcatcag 3278 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_172545 refGene chr2 25057345 + 72770 graph_second 0 12 actgcattat 3279 1 1.66666666666667 5 3 6 1 genomic chr8 24570410 + 0 unique_long l 3 11 actgccaact 3280 1 Inf 2 0 3 0 NM_007933 refGene chr11 70224063 - 21160 graph_last 1 13 actgccaaga 3281 1 1.66666666666667 5 3 6 1 actgccctcc 3282 1 Inf 4 0 5 0 NM_026161 refGene chr2 91506459 + 76781 graph_last l 63 250 actgcctgct 3283 1 1 6 6 8 2 actgcgtgag 3284 1 0.666666666666667 2 3 2 1 actgcgttcc 3285 1 Inf 2 0 3 0 NM_153580 refGene chr7 118957076 + 125136 graph_last 22 61 actgctccca 3286 1 0.888888888888889 8 9 10 3 actgctgtgt 3287 1 1 3 3 4 1 NM_019802 refGene chr6 73475733 - 113867 graph_last l 14 117 actgcttgcc 3288 1 0.705882352941177 12 17 16 6 NM_008468 refGene chr4 128539595 - 97498 graph_last 1 10 actgctttcc 3289 1 Inf 3 0 4 0 NM_023202 refGene chr17 33473772 + 58776 graph_last 76 216 actgcttttc 3290 1 1.33333333333333 8 6 10 2 actgcttttt 3291 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_028020 refGene chr4 154002149 + 99824 graph_last l 10 16 actggattac 3292 1 0.666666666666667 2 3 2 1 actggcaaaa 3293 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_133733 refGene chr9 42365508 - 136826 graph_last 2 33 actggctcca 3294 1 1.55555555555556 14 9 18 3 NM_008910 refGene chr12 68708107 + 28812 graph_last l 55 166 actggctggg 3295 1 1.08333333333333 13 12 17 4 NM_008698 refGene chr11 4791429 + 17322 graph_last l 15 57 actggctgtt 3296 1 1 9 9 12 3 actgggatga 3297 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_178777 refGene chr3 105046858 + 87803 graph_last 1 12 actggtgcgc 3298 1 Inf 5 0 7 0 actggtgtac 3299 1 0.5 3 6 4 2 genomic chr2 121006923 - 0 unique_long l 9 17 actgtagcca 3300 1 Inf 2 0 3 0 AK016565 knownGene chr10 121784986 - 16181 graph_last 1 7 actgtcacac 3301 1 0.666666666666667 2 3 2 1 actgtcagtt 3302 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_008077 refGene chr2 70875296 + 75549 graph_last 0 2 actgtcctac 3303 1 Inf 2 0 3 0 actgtgacca 3304 1 Inf 3 0 4 0 NM_025927 refGene chr11 96912491 - 23512 graph_last l 4 9 actgtgaggg 3305 1 Inf 2 0 3 0 NM_026245 refGene chr2 129269830 + 79064 graph_last 3 8 actgtggcaa 3306 1 Inf 2 0 3 0 actgtggctt 3307 1 0.666666666666667 2 3 2 1 actgtgggta 3308 1 Inf 2 0 3 0 actgtgtctg 3309 1 1.66666666666667 5 3 7 1 actgtgtctt 3310 1 0.5 3 6 4 2 NM_028099 refGene chr6 87356905 - 114535 graph_last 0 3 actgttcaaa 3311 1 0.666666666666667 2 3 2 1 acttaaaaaa 3312 1 Inf 2 0 3 0 NM_008425 refGene chr11 110737775 + 24857 graph_second 0 3 acttacctgg 3313 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_007521 refGene chr4 32698889 + 92023 graph_last 1 7 acttactgat 3314 1 Inf 3 0 4 0 acttcagact 3315 1 Inf 5 0 6 0 acttcagcca 3316 1 1.83333333333333 22 12 29 4 NM_028190 refGene chr17 25879477 + 58002 graph_last l 23 49 acttcccacc 3317 1 2 6 3 8 1 acttccctca 3318 1 1.83333333333333 11 6 15 2 BB436356 all_est chr18 74015042 - 65989 graph_last 0 7 acttcctata 3319 1 0.5 3 6 4 2 NM_011751 refGene chr11 79974640 - 22170 graph_second 0 13 acttcctcgt 3320 1 1 3 3 4 1 acttctgtaa 3321 1 Inf 5 0 7 0 NM_198653 refGene chr1 188929132 - 9377 graph_last l 10 34 acttcttcag 3322 1 1 3 3 4 1 BF458034 all_est chr14 7674984 - 39038 graph_last 0 5 acttgaagtt 3323 1 Inf 2 0 3 0 acttgaggac 3324 1 Inf 2 0 3 0 acttgcgaat 3325 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_025879 refGene chr13 102632042 + 37637 graph_last l 10 30 acttgctcta 3326 1 Inf 2 0 3 0 NM_053092 refGene chr8 113696436 + 133540 graph_last l 6 17 acttgtaact 3327 1 Inf 2 0 3 0 NM_198247 refGene chr1 196822513 - 9779 graph_last 0 16 acttgtgttg 3328 1 Inf 2 0 3 0 actttaaatt 3329 1 0.666666666666667 2 3 2 1 actttaatcc 3330 1 1 6 6 8 2 actttacaat 3331 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_177407 refGene chr18 61114313 + 65252 graph_last l 176 327 actttatatg 3332 1 0.333333333333333 2 6 3 2 actttatcaa 3333 1 0.333333333333333 2 6 3 2 actttcctaa 3334 1 0.666666666666667 2 3 3 1 actttcctct 3335 1 Inf 2 0 3 0 NM_175123 refGene chr2 91892865 + 76831 graph_last 14 34 actttctttc 3336 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_029582 refGene chr16 10523007 - 51504 graph_last l 9 31 actttgatat 3337 1 Inf 2 0 3 0 actttgtttc 3338 1 Inf 3 0 4 0 acttttagcg 3339 1 Inf 2 0 3 0 NM_019553 refGene chr10 64476031 - 12952 graph_last 3 10 acttttcaaa 3340 1 0.666666666666667 2 3 2 1 acttttctct 3341 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_144925 refGene chr7 115213113 + 124918 graph_last 13 47 actttttggc 3342 1 2.66666666666667 8 3 10 1 agaaaaaaaa 3343 1 1.11111111111111 10 9 13 3 NM_027093 refGene chr2 140314400 + 79664 graph_last l 2 34 agaaaaaata 3344 1 0.5 3 6 4 2 agaaaagaca 3345 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agaaaataaa 3346 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr2 136136837 + 0 unique_long l 6 22 agaaaatcct 3347 1 Inf 2 0 3 0 NM_019570 refGene chr1 38748898 + 1632 graph_last 2 14 agaaaccaag 3348 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_009555 refGene chr17 22867476 - 57695 graph_last l 2 5 agaaacttga 3349 1 Inf 2 0 3 0 agaaagaagc 3350 1 Inf 2 0 3 0 agaaagatgg 3351 1 0.333333333333333 2 6 3 2 BC051399 knownGene chr11 84545212 - 22510 graph_last l 16 28 agaaagtaga 3352 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agaaataaaa 3353 1 0.444444444444444 4 9 5 3 agaaataaat 3354 1 Inf 4 0 5 0 BE686238 all_est chr10 5038103 - 10005 graph_second 0 12 agaaatgaaa 3355 1 0.666666666666667 2 3 3 1 agaaatttaa 3356 1 Inf 5 0 7 0 NM_026582 refGene chr3 164308980 + 90754 graph_last l 7 13 agaaatttta 3357 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agaacaacaa 3358 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_007697 refGene chr6 105396974 + 115725 graph_last l 6 33 agaacaacac 3359 1 0.583333333333333 7 12 9 4 NM_145492 refGene chr18 13861382 + 62992 graph_last 0 5 agaacagttc 3360 1 Inf 2 0 3 0 agaactatgc 3361 1 Inf 5 0 6 0 BC064456 all_mrna chr7 23852334 + 119876 graph_last 1 10 agaactcaat 3362 1 Inf 4 0 5 0 AK036375 knownGene chr2 157636220 - 80833 graph_last 1 40 agaactgtac 3363 1 0.833333333333333 5 6 7 2 agaactttcc 3364 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_177111 refGene chr14 22034556 + 39895 graph_last l 3 12 agaagacaca 3365 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_026322 refGene chr14 55513891 + 42019 graph_second 0 3 agaagcaaag 3366 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_175109 refGene chr15 81642098 - 48534 graph_last l 10 28 agaagcaccg 3367 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_025468 refGene chr18 66044917 + 65561 graph_last l 48 117 agaagcagtt 3368 1 1.16666666666667 7 6 9 2 genomic chr15 82344891 + 0 unique_long l 2 14 agaagctaaa 3369 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_027379 refGene chr7 105422408 - 124385 graph_last l 25 36 agaagcttag 3370 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011400 refGene chr4 118251420 + 96665 graph_last l 25 70 agaaggacct 3371 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_172592 refGene chr13 102235484 - 37599 graph_last l 3 8 agaaggagcg 3372 1 Inf 4 0 5 0 agaaggcccc 3373 1 Inf 2 0 3 0 agaagtgttt 3374 1 0.652173913043478 15 23 19 8 NM_016711 refGene chr9 78100348 - 139564 graph_last l 18 77 agaagttagt 3375 1 1.33333333333333 8 6 10 2 NM_009024 refGene chr11 98576934 - 23715 graph_last 1 14 agaagttgct 3376 1 Inf 2 0 3 0 NM_178637 refGene chr19 5460618 + 67578 graph_last l 9 53 agaatgacag 3377 1 2.66666666666667 8 3 10 1 NM_025980 refGene chr2 25449537 + 72797 graph_last l 4 22 agaatggcag 3378 1 1 3 3 4 1 agaatgtcag 3379 1 0.666666666666667 2 3 3 1 BC034120 knownGene chr17 79336178 + 61337 graph_last l 4 10 agaatgtggg 3380 1 Inf 2 0 3 0 agaatgttat 3381 1 1 3 3 4 1 NM_011386 refGene chr3 32045804 - 84007 graph_last l 4 12 agaattactt 3382 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_172677 refGene chr3 16111636 + 83247 graph_last l 14 25 agaatttaaa 3383 1 Inf 4 0 5 0 NM_025282 refGene chr13 81771805 + 36483 graph_last l 9 23 agaatttcag 3384 1 Inf 3 0 4 0 AK005538 all_mrna chr4 11916425 + 91324 graph_last 0 6 agaatttcca 3385 1 Inf 2 0 3 0 agaattttga 3386 1 Inf 3 0 4 0 NM_008142 refGene chr4 153671475 - 99772 graph_second 8 82 agacaaaaaa 3387 1 1.16666666666667 14 12 18 4 NM_011858 refGene chr7 88999716 + 123147 graph_last l 7 21 agacaaagcg 3388 1 2 6 3 8 1 agacaaagtt 3389 1 1 9 9 12 3 AK122204 knownGene chr2 92236623 + 76871 graph_last l 43 102 agacaactaa 3390 1 0.666666666666667 6 9 8 3 agacaagctg 3391 1 0.75 15 20 19 7 NM_010110 refGene chrX 88984944 + 150221 graph_last 3 13 agacaatgct 3392 1 Inf 4 0 5 0 NM_019995 refGene chr3 56137347 - 85012 graph_last l 10 25 agacacaaat 3393 1 Inf 3 0 4 0 agacactgtc 3394 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_013522 refGene chr8 41089850 - 129529 graph_last l 6 22 agacacttct 3395 1 Inf 5 0 6 0 agacagataa 3396 1 1.33333333333333 4 3 5 1 agacattggt 3397 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BQ555792 all_est chr2 162136344 - 81096 graph_last l 4 18 agaccaaagt 3398 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agaccaggag 3399 1 Inf 2 0 3 0 agacccctgc 3400 1 Inf 3 0 4 0 NM_133216 refGene chr19 52847562 - 70462 graph_last l 22 63 agaccctcct 3401 1 0.333333333333333 2 6 3 2 agaccctctc 3402 1 Inf 4 0 5 0 NM_021608 refGene chr7 114227348 + 124860 graph_last 23 101 agaccctgct 3403 1 3 9 3 12 1 agaccctgtc 3404 1 2.5 15 6 19 2 NM_146157 refGene chr4 138248561 + 98421 graph_last l 15 47 agacctctgg 3405 1 Inf 4 0 5 0 NM_007794 refGene chr8 107206516 + 132995 graph_last 1 27 agacctgtaa 3406 1 0.666666666666667 2 3 3 1 agaccttgtc 3407 1 Inf 2 0 3 0 NM_144519 refGene chr3 33424911 + 84068 graph_last l 4 30 agactacctg 3408 1 0.333333333333333 2 6 3 2 genomic chr15 80765184 - 0 unique_long l 14 54 agactccaca 3409 1 0.647058823529412 11 17 15 6 agactgtaaa 3410 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_013680 refGene chrX 19405906 + 147587 graph_last 4 12 agactgtctt 3411 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_025650 refGene chr10 82754690 + 14090 graph_last 1 11 agacttttat 3412 1 Inf 3 0 4 0 agagaaaaag 3413 1 Inf 4 0 5 0 NM_053204 refGene chr6 121455554 - 116586 graph_last 1 3 agagaacgcg 3414 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_030722 refGene chr4 129455130 + 97592 graph_last l 14 40 agagaatacc 3415 1 Inf 5 0 7 0 NM_010884 refGene chr15 68449038 - 47673 graph_last l 16 53 agagacaagg 3416 1 0.416666666666667 5 12 6 4 agagacacca 3417 1 1.91666666666667 23 12 30 4 NM_023178 refGene chr4 116584958 - 96537 graph_last b 3 30 agagacggcg 3418 1 2.66666666666667 8 3 11 1 AK044781 knownGene chr3 132565114 - 89209 graph_last 2 7 agagactcag 3419 1 Inf 3 0 4 0 agagactctt 3420 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_029519 refGene chr14 113610109 + 44424 graph_last 0 24 agagagaaac 3421 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_027192 refGene chr2 129345184 + 79076 graph_last l 4 20 agagagagaa 3422 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_026113 refGene chr10 41416155 - 11799 graph_last 0 5 agagagagca 3423 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_013885 refGene chr4 133993660 - 98039 graph_last 23 65 agagagcgtt 3424 1 Inf 5 0 6 0 BB153665 all_est chr6 32911427 - 111459 graph_last 0 8 agagcagaaa 3425 1 Inf 2 0 3 0 BB646563 all_est chr5 117729705 + 106493 graph_last 0 2 agagcagaag 3426 1 Inf 2 0 3 0 NM_178379 refGene chr11 63535362 - 20744 graph_last 1 16 agagcagaca 3427 1 1.33333333333333 4 3 5 1 agagcagaga 3428 1 2 12 6 16 2 NM_152895 refGene chr1 137500655 + 6443 graph_last 0 4 agagcagagg 3429 1 Inf 2 0 3 0 NM_025813 refGene chr3 69176346 + 85684 graph_last l 6 19 agagcaggga 3430 1 Inf 2 0 3 0 BU522569 all_est chr11 68970314 + 21015 graph_last l 12 33 agagcccggc 3431 1 0.888888888888889 8 9 11 3 agagccgtcc 3432 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_176841 refGene chr11 29362053 + 18533 graph_last 0 6 agagcctctt 3433 1 Inf 2 0 3 0 agagctcttg 3434 1 Inf 2 0 3 0 agagctgtgg 3435 1 1.28571428571429 18 14 23 5 BC003348 knownGene chr9 14530104 + 135287 graph_last l 4 24 agagcttctt 3436 1 1 3 3 4 1 NM_009685 refGene chr7 97689431 + 123899 graph_last l 11 49 agagcttgtt 3437 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_133887 refGene chr4 131739623 - 97798 graph_last 2 17 agagctttga 3438 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_145568 refGene chr6 72229515 + 113719 graph_last 1 6 agaggaaaag 3439 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011305 refGene chr2 28031928 + 73032 graph_last 2 18 agaggagaga 3440 1 Inf 2 0 3 0 NM_021448 refGene chr18 25209702 - 63413 graph_last l 15 39 agaggatgtt 3441 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_007513 refGene chr5 147342206 - 108697 graph_last l 2 10 agaggattgt 3442 1 Inf 4 0 5 0 NM_177763 refGene chr6 114924706 - 116104 graph_last l 16 45 agaggcttct 3443 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_199021 refGene chr1 125961264 - 5774 graph_last 3 15 agagggcaga 3444 1 Inf 3 0 4 0 NM_009530 refGene chrX 95781080 - 150669 graph_last s 3 10 agagggcgaa 3445 1 Inf 5 0 6 0 NM_011445 refGene chr7 107617038 - 124491 graph_last l 4 14 agagggctca 3446 1 Inf 2 0 3 0 NM_053076 refGene chr19 7418315 - 67781 graph_last l 109 357 agagggtttt 3447 1 1 17 17 22 6 agaggtgtag 3448 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026407 refGene chr16 38365486 + 53492 graph_last l 9 32 agaggttgcc 3449 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_011247 refGene chr7 115089701 + 124908 graph_last l 5 18 agaggttttg 3450 1 Inf 3 0 4 0 agagtaatac 3451 1 Inf 4 0 5 0 NM_152810 refGene chr17 44807535 - 59470 graph_last 2 12 agagtgactt 3452 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agagtgagga 3453 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_008538 refGene chr10 38260000 + 11621 graph_last 1 6 agataagcag 3454 1 Inf 3 0 4 0 agatagattt 3455 1 0.666666666666667 2 3 3 1 agatatgctt 3456 1 Inf 3 0 4 0 genomic chr14 48083563 + 0 unique_long l 3 27 agatattaaa 3457 1 Inf 2 0 3 0 NM_021457 refGene chr5 4739319 - 100174 graph_last 2 13 agatcatcta 3458 1 Inf 2 0 3 0 agatccagat 3459 1 Inf 3 0 4 0 genomic chr16 3563115 - 0 unique_long l 2 7 agatcctcat 3460 1 Inf 3 0 4 0 NM_145473 refGene chr15 83497045 + 48723 graph_last l 21 54 agatcctctt 3461 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_024258 refGene chr16 88846659 - 55746 graph_second 0 3 agatccttcc 3462 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_029823 refGene chrX 124568308 + 151525 graph_last l 18 93 agatcgtatg 3463 1 2 6 3 8 1 agatctatac 3464 1 0.923076923076923 24 26 32 9 NM_013929 refGene chr12 108220305 + 31441 graph_last 6 23 agatctgtgg 3465 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_013613 refGene chr2 57340583 - 74721 graph_last l 10 25 agatgagtca 3466 1 1.66666666666667 5 3 6 1 agatgtattt 3467 1 0.5 3 6 4 2 agatgtgttt 3468 1 Inf 2 0 3 0 NM_013719 refGene chr2 118746145 - 78295 graph_last l 88 188 agattactgt 3469 1 1.44444444444444 13 9 17 3 agatttgatg 3470 1 Inf 2 0 3 0 agattttaag 3471 1 Inf 2 0 3 0 NM_177600 refGene chr2 105265384 - 77584 graph_last l 9 43 agcaaaatat 3472 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_026222 refGene chr3 34772052 + 84139 graph_last l 8 23 agcaaagata 3473 1 0.666666666666667 4 6 5 2 AK078964 knownGene chr18 69900496 + 65810 graph_second 0 45 agcaaatcca 3474 1 0.666666666666667 6 9 8 3 NM_013510 refGene chr2 157168721 + 80770 graph_last l 17 64 agcaacatca 3475 1 0.416666666666667 5 12 6 4 NM_009166 refGene chr19 40428341 - 69723 graph_last l 2 19 agcaacatta 3476 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_023058 refGene chr17 23327731 - 57728 graph_last l 14 43 agcaaccttg 3477 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agcaagcccg 3478 1 Inf 2 0 3 0 NM_023547 refGene chr6 84248622 - 114260 graph_second l 5 11 agcaagctgt 3479 1 Inf 4 0 5 0 agcaataatg 3480 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_182716 refGene chr1 135443605 - 6266 graph_last l 17 65 agcaatgaaa 3481 1 1 6 6 8 2 BC019560 knownGene chr10 130327629 - 16651 graph_last l 2 25 agcaattaaa 3482 1 Inf 4 0 5 0 agcaattcat 3483 1 Inf 2 0 3 0 NM_018788 refGene chr14 56774939 - 42183 graph_last 1 59 agcacaaagg 3484 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agcacacaat 3485 1 1.22222222222222 11 9 15 3 NM_175217 refGene chr5 141386797 + 108208 graph_last 0 5 agcacagaat 3486 1 Inf 3 0 4 0 AA607899 all_est chr2 119877739 + 78422 graph_last l 73 275 agcagagaat 3487 1 0.88235294117647 15 17 19 6 NM_008302 refGene chr17 44962129 + 59486 graph_last 11 26 agcagagagc 3488 1 Inf 3 0 4 0 agcagagtgc 3489 1 Inf 3 0 4 0 NM_025909 refGene chr4 102225942 + 95593 graph_last 0 4 agcagcacag 3490 1 Inf 3 0 4 0 NM_026115 refGene chr2 71782529 + 75622 graph_last l 6 21 agcagctgga 3491 1 Inf 2 0 3 0 NM_020508 refGene chr17 31874909 - 58619 graph_last l 11 35 agcagcttgc 3492 1 1.33333333333333 4 3 5 1 agcaggacca 3493 1 0.416666666666667 5 12 7 4 agcaggctgg 3494 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008874 refGene chr19 6969392 + 67713 graph_last 25 267 agcagggatc 3495 1 0.956521739130435 44 46 57 16 NM_009990 refGene chr5 133344008 - 107613 graph_last 0 23 agcagtatgt 3496 1 Inf 5 0 6 0 NM_020615 refGene chr2 10001291 - 71910 graph_second l 5 9 agcatctatg 3497 1 Inf 2 0 3 0 NM_172601 refGene chr14 44122445 - 41186 graph_last l 2 11 agcattccgc 3498 1 Inf 2 0 3 0 NM_008908 refGene chr18 53698117 + 64884 graph_last 3 36 agcattctgg 3499 1 0.333333333333333 2 6 3 2 agcatttaat 3500 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agccaaacaa 3501 1 Inf 5 0 6 0 NM_029282 refGene chr2 158607551 - 80911 graph_last 7 22 agccaaacac 3502 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_028408 refGene chr1 185555338 + 9177 graph_last 1 15 agccaaagca 3503 1 Inf 3 0 4 0 NM_025824 refGene chr1 59939485 + 2632 graph_last 8 38 agccaaatac 3504 1 0.5 3 6 4 2 NM_019586 refGene chr4 33167339 + 92112 graph_last l 15 51 agccaaccga 3505 1 1 3 3 4 1 NM_013830 refGene chr13 34847342 + 33900 graph_last 8 25 agccaagggt 3506 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AK008522 knownGene chr11 75036905 + 21596 graph_second 0 3 agccacctct 3507 1 Inf 2 0 3 0 NM_033264 refGene chr9 114846763 + 141710 graph_last 1 7 agccacgcgc 3508 1 Inf 2 0 3 0 NM_019444 refGene chr19 5656968 - 67592 graph_last l 14 27 agccagagat 3509 1 Inf 2 0 3 0 agccagccag 3510 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AK032878 knownGene chr10 81781878 - 13968 graph_second 0 2 agccaggtga 3511 1 Inf 2 0 3 0 NM_025575 refGene chr2 165078604 + 81279 graph_last l 18 78 agccatcata 3512 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_009775 refGene chr15 85214077 - 48895 graph_last l 7 36 agccattcta 3513 1 0.666666666666667 4 6 5 2 agcccagatc 3514 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agcccaggag 3515 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_007388 refGene chr9 22735533 - 135764 graph_last l 31 91 agcccatcaa 3516 1 1.33333333333333 8 6 10 2 agccccacca 3517 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AK082233 knownGene chr1 16742273 - 608 graph_last l 7 21 agccctattg 3518 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agccctcttc 3519 1 Inf 5 0 6 0 NM_172704 refGene chr4 150094948 + 99503 graph_last l 26 71 agccctgcct 3520 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_178632 refGene chr1 195410956 + 9703 graph_last l 5 29 agccctggat 3521 1 Inf 3 0 4 0 agcccttgaa 3522 1 Inf 4 0 5 0 agccgaacca 3523 1 Inf 2 0 3 0 AK082744 knownGene chr5 113142405 - 106074 graph_last l 9 56 agccgccttc 3524 1 Inf 3 0 4 0 NM_053074 refGene chr7 37759718 - 120706 graph_last l 12 46 agccggccaa 3525 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AK009522 knownGene chr4 41565351 - 92499 graph_last l 21 64 agccgtgtat 3526 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_181582 refGene chr11 69488579 - 21088 graph_second 7 27 agcctacaga 3527 1 Inf 5 0 7 0 NM_178623 refGene chr11 5698820 + 17417 graph_last l 4 24 agcctagcct 3528 1 Inf 4 0 5 0 NM_007871 refGene chr9 22113090 - 135653 graph_last l 9 28 agcctcaagg 3529 1 Inf 2 0 3 0 NM_173741 refGene chr17 25429085 - 57931 graph_last l 29 72 agcctccctt 3530 1 Inf 2 0 3 0 agcctgatgg 3531 1 Inf 3 0 4 0 NM_178242 refGene chr5 141719479 + 108235 graph_last 1 19 agcctggcgg 3532 1 3.33333333333333 10 3 13 1 NM_027545 refGene chr9 3324600 + 134785 graph_last l 4 10 agcgaattga 3533 1 Inf 2 0 3 0 NM_009186 refGene chr16 21896442 - 52309 graph_second 1 7 agcgacagcg 3534 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_028419 refGene chr12 100571945 + 30887 graph_last b 12 57 agcgcgtccc 3535 1 Inf 4 0 5 0 NM_008379 refGene chr11 96746110 - 23495 graph_last 7 23 agctaagtaa 3536 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_011908 refGene chr5 147244991 - 108693 graph_last l 35 93 agctaatttc 3537 1 1 3 3 4 1 NM_013490 refGene chr19 3675852 + 67346 graph_last 1 8 agctagctat 3538 1 Inf 2 0 3 0 NM_144915 refGene chr5 142287840 - 108317 graph_last 1 9 agctagctga 3539 1 Inf 2 0 3 0 NM_172579 refGene chr12 78419716 + 29546 graph_last l 52 103 agctagggcc 3540 1 Inf 5 0 6 0 NM_028643 refGene chr14 49039024 - 41633 graph_last l 6 45 agctcaccaa 3541 1 2 6 3 8 1 NM_024196 refGene chr2 153056636 + 80355 graph_last l 8 26 agctcagggt 3542 1 1.66666666666667 5 3 7 1 BC052790 knownGene chr14 46159891 - 41354 graph_last 5 19 agctcccagc 3543 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_010697 refGene chr19 46298369 + 70172 graph_last 1 5 agctcggggg 3544 1 Inf 3 0 4 0 agctctatag 3545 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agctctgggg 3546 1 1 6 6 8 2 NM_054040 refGene chr17 3121841 - 56519 graph_last 1 4 agctctggtg 3547 1 Inf 2 0 3 0 agctgaaagt 3548 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_145476 refGene chr15 88303742 - 49143 graph_last l 12 29 agctgagccg 3549 1 Inf 3 0 4 0 NM_145125 refGene chr16 98034869 - 56337 graph_last l 8 33 agctgatgta 3550 1 1.66666666666667 5 3 7 1 agctgcaaaa 3551 1 Inf 2 0 3 0 agctgctggc 3552 1 Inf 3 0 4 0 AK050594 knownGene chr12 66960672 + 28695 graph_last l 5 15 agctgctgtt 3553 1 1 3 3 4 1 agctggaggc 3554 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011252 refGene chrX 47032260 - 148647 graph_last l 2 7 agctggatta 3555 1 Inf 3 0 4 0 agctggctgc 3556 1 Inf 5 0 6 0 NM_008251 refGene chr16 98086461 - 56348 graph_last 1 6 agctgggcag 3557 1 Inf 5 0 6 0 NM_009438 refGene chr7 38103328 - 120755 graph_last l 18 121 agctggggtt 3558 1 1.77777777777778 16 9 21 3 NM_008687 refGene chr4 80899931 + 94453 graph_last l 2 27 agctggtggt 3559 1 1.33333333333333 12 9 16 3 NM_133735 refGene chr5 144217265 - 108466 graph_last 0 10 agctgtaagg 3560 1 1.33333333333333 4 3 5 1 agctgtacag 3561 1 0.714285714285714 10 14 13 5 agctgtgctg 3562 1 0.583333333333333 7 12 9 4 AK014235 knownGene chr10 124604628 - 16423 graph_last 7 22 agctgtgggg 3563 1 Inf 2 0 3 0 NM_019422 refGene chr4 117341079 + 96618 graph_last l 4 17 agcttcgggc 3564 1 Inf 3 0 4 0 genomic chr11 29364032 + 0 unique_long l 3 9 agcttgagaa 3565 1 Inf 3 0 4 0 NM_177221 refGene chr5_random 22362641 + 109435 graph_last l 15 32 agcttgggtg 3566 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_020271 refGene chr15 80263035 + 48356 graph_last l 29 99 agctttctgg 3567 1 0.555555555555556 5 9 7 3 AK088459 knownGene chr3 29529768 + 83838 graph_last l 11 55 agctttttct 3568 1 3.33333333333333 10 3 13 1 aggaaaaaaa 3569 1 Inf 4 0 5 0 aggaaaattg 3570 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008443 refGene chr11 53223469 + 19933 graph_last 2 8 aggaaacaaa 3571 1 Inf 2 0 3 0 NM_176849 refGene chr8 8721176 - 127791 graph_last l 13 39 aggaaaggat 3572 1 2.33333333333333 7 3 9 1 AK030527 knownGene chr3 84218074 + 86256 graph_last l 14 32 aggaaaggcg 3573 1 Inf 2 0 3 0 aggaacagga 3574 1 0.583333333333333 7 12 9 4 NM_025866 refGene chr15 46555679 - 46731 graph_last 0 8 aggaagaatt 3575 1 Inf 3 0 4 0 X82786 knownGene chr7 127513684 - 125742 graph_last 0 10 aggaagatca 3576 1 Inf 5 0 6 0 NM_011596 refGene chr5_random 46593812 + 109932 graph_last 0 5 aggaagcagt 3577 1 1 3 3 4 1 aggaagcggc 3578 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_009104 refGene chr12 19161356 - 26608 graph_last 1 13 aggaagctag 3579 1 Inf 3 0 4 0 NM_029432 refGene chr2 130945921 - 79188 graph_last 1 24 aggaagctga 3580 1 0.666666666666667 8 12 11 4 BB656711 all_est chr17 63967079 + 60568 graph_last 0 4 aggaaggagg 3581 1 Inf 2 0 3 0 NM_138679 refGene chr3 91129633 - 86759 graph_last l 31 50 aggaagtccc 3582 1 Inf 2 0 3 0 AK039419 all_mrna chr1 121922923 + 5591 graph_second 0 19 aggaagttga 3583 1 Inf 2 0 3 0 NM_008086 refGene chr13 59957873 - 35469 graph_last 0 8 aggaatccac 3584 1 Inf 3 0 4 0 NM_172717 refGene chr5 109196309 + 105797 graph_last 2 6 aggaattgga 3585 1 Inf 2 0 3 0 AK048611 knownGene chr9 67857011 + 138704 graph_second 0 66 aggacaccgc 3586 1 2.11111111111111 19 9 25 3 aggacagcaa 3587 1 2.33333333333333 14 6 18 2 NM_015751 refGene chr8 80326073 - 131531 graph_last l 8 33 aggaccatat 3588 1 1 3 3 4 1 NM_172275 refGene chr5 120112769 - 106607 graph_last l 26 94 aggacggagg 3589 1 1 12 12 16 4 NM_025852 refGene chr10 82915385 - 14098 graph_last l 7 20 aggacggtgg 3590 1 Inf 5 0 6 0 NM_133724 refGene chr5 35129535 + 102024 graph_last l 6 16 aggactccag 3591 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_198191 refGene chr2 32845746 + 73456 graph_last l 19 59 aggacttctg 3592 1 0.333333333333333 2 6 3 2 aggagaagtt 3593 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aggagagtgt 3594 1 0.555555555555556 5 9 6 3 aggagccctg 3595 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_153538 refGene chr13 59567057 - 35456 graph_last 2 6 aggaggaaag 3596 1 Inf 3 0 4 0 aggaggaaga 3597 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_198007 refGene chr10 52678191 + 12329 graph_last 0 2 aggaggagtg 3598 1 Inf 2 0 3 0 aggaggcaag 3599 1 Inf 2 0 3 0 NM_027421 refGene chr11 85772891 - 22646 graph_last 2 7 aggataattt 3600 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_178935 refGene chrX 150802047 - 152608 graph_last 0 4 aggatatgaa 3601 1 Inf 2 0 3 0 aggatcaatg 3602 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_028270 refGene chr4 45093313 + 92856 graph_last s 0 4 aggatcgcca 3603 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aggatctcag 3604 1 1.66666666666667 5 3 6 1 genomic chr11 51748482 + 0 unique_long l 9 72 aggatgcttg 3605 1 0.714285714285714 10 14 13 5 NM_021438 refGene chr19 5321943 + 67558 graph_last 1 9 aggattgccg 3606 1 Inf 3 0 4 0 NM_009238 refGene chr13 28838951 + 33570 graph_last l 3 12 aggcaaaatc 3607 1 2 6 3 8 1 aggcaagaca 3608 1 Inf 2 0 3 0 NM_029581 refGene chr5 145838798 - 108572 graph_last l 3 25 aggcacagtg 3609 1 Inf 3 0 4 0 AK051233 all_mrna chr14 16044346 + 39487 graph_last 0 26 aggcagaggc 3610 1 0.666666666666667 6 9 8 3 NM_133831 refGene chr7 12959477 + 118963 graph_last l 20 94 aggcaggccg 3611 1 1.33333333333333 12 9 16 3 NM_019833 refGene chr2 26905139 + 72954 graph_last l 9 41 aggcagtgca 3612 1 0.833333333333333 5 6 6 2 aggcagtgtg 3613 1 Inf 2 0 3 0 NM_145385 refGene chr6 126863966 + 116927 graph_second 2 6 aggcatctgt 3614 1 Inf 2 0 3 0 aggcattgaa 3615 1 Inf 5 0 7 0 NM_172271 refGene chr3 110606742 - 88220 graph_last l 79 150 aggcattgtc 3616 1 Inf 2 0 3 0 BB627809 all_est chr5 22340815 + 101105 graph_last l 12 16 aggcatttta 3617 1 Inf 2 0 3 0 aggccaagcc 3618 1 Inf 2 0 3 0 aggccagtgg 3619 1 Inf 2 0 3 0 aggccctatc 3620 1 Inf 2 0 3 0 aggccctggg 3621 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aggcctcatt 3622 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_020270 refGene chr9 59553385 - 138028 graph_second 3 15 aggcctgagg 3623 1 1.66666666666667 5 3 7 1 aggcctggct 3624 1 1.41666666666667 17 12 22 4 aggccttaaa 3625 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_009584 refGene chr5 19858761 - 100918 graph_last 7 15 aggcgataca 3626 1 Inf 2 0 3 0 aggcggaagt 3627 1 0.666666666666667 2 3 3 1 aggcggacag 3628 1 Inf 2 0 3 0 BF225761 all_est chr13 21269636 + 33119 graph_second 0 61 aggctctgtc 3629 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_145927 refGene chr12 72853851 + 29105 graph_last 0 25 aggctcttcc 3630 1 2 6 3 8 1 aggctgctgg 3631 1 Inf 3 0 4 0 NM_172406 refGene chr1 60430119 - 2676 graph_last l 7 98 aggcttctta 3632 1 Inf 4 0 5 0 agggaaaaaa 3633 1 0.75 15 20 19 7 NM_172619 refGene chr17 33184877 + 58734 graph_last 0 3 agggaaaggg 3634 1 Inf 2 0 3 0 NM_024222 refGene chr9 117615376 - 141880 graph_last l 6 31 agggaaataa 3635 1 Inf 2 0 3 0 agggaagtgc 3636 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_054039 refGene chrX 6155154 - 147014 graph_last 2 17 agggaagttc 3637 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008144 refGene chr19 9176105 - 67907 graph_last l 4 29 agggaatctg 3638 1 0.444444444444444 4 9 5 3 agggaccctg 3639 1 Inf 2 0 3 0 agggagatcg 3640 1 Inf 2 0 3 0 NM_026498 refGene chr7 71266031 - 122278 graph_last l 23 63 agggagtggg 3641 1 0.777777777777778 7 9 9 3 agggagttcc 3642 1 Inf 3 0 4 0 AK090368 knownGene chr11 101953203 + 24054 graph_last l 15 58 agggcagagg 3643 1 1.16666666666667 7 6 9 2 agggccatcc 3644 1 Inf 2 0 3 0 AK028183 knownGene chr2 30233775 + 73205 graph_last l 11 48 agggcctgtg 3645 1 1.83333333333333 11 6 15 2 NM_020004 refGene chr11 100368729 - 23871 graph_last l 11 37 aggggccttg 3646 1 0.416666666666667 5 12 7 4 BC054125 knownGene chr7 27753999 - 120107 graph_last 0 7 agggggctcc 3647 1 Inf 2 0 3 0 NM_144926 refGene chr7 119061530 + 125141 graph_last l 41 119 agggggcttt 3648 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_026877 refGene chr11 120261921 + 25603 graph_last 0 7 aggggttggg 3649 1 Inf 2 0 3 0 agggtccaaa 3650 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agggtctgag 3651 1 Inf 2 0 3 0 NM_026877 refGene chr11 120241986 + 25603 graph_last l 4 21 agggtgatgc 3652 1 Inf 5 0 7 0 agggtgcagt 3653 1 Inf 3 0 4 0 genomic chr11 80043972 - 0 unique_long l 4 23 agggtgcttc 3654 1 2.33333333333333 7 3 9 1 agggtggcgg 3655 1 Inf 3 0 4 0 agggttgtct 3656 1 Inf 3 0 4 0 W08413 all_est chr6 35208035 + 111668 graph_last 1 17 agggtttcct 3657 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_016886 refGene chrX 32998454 + 148054 graph_last l 59 114 aggtatgtac 3658 1 Inf 2 0 3 0 NM_029850 refGene chr5 122246815 - 106834 graph_last l 2 12 aggtatttaa 3659 1 0.416666666666667 5 12 6 4 aggtccacag 3660 1 0.5 6 12 8 4 NM_178884 refGene chr1 77061508 + 3711 graph_last l 5 13 aggtccctac 3661 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011078 refGene chr13 48885899 - 34696 graph_last l 12 31 aggtctaagg 3662 1 Inf 5 0 6 0 aggtgaacca 3663 1 1 3 3 4 1 NM_138660 refGene chr11 98391018 + 23682 graph_last l 12 38 aggtgctatc 3664 1 0.666666666666667 8 12 10 4 BB829995 all_est chr10 44457017 - 12015 graph_last 0 4 aggtgctgaa 3665 1 Inf 3 0 4 0 aggtggagct 3666 1 0.666666666666667 2 3 2 1 aggtggctta 3667 1 2 6 3 8 1 NM_178923 refGene chr16 91570167 - 55890 graph_last 2 9 aggtgtacag 3668 1 Inf 2 0 3 0 NM_026998 refGene chr12 50188040 - 27976 graph_second l 5 18 aggtgttcct 3669 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_029157 refGene chr4 123686743 + 97064 graph_last l 9 28 aggtgtttgg 3670 1 Inf 2 0 3 0 aggttctgcc 3671 1 2.33333333333333 7 3 9 1 aggttgaagt 3672 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_025701 refGene chr8 3658295 + 127603 graph_last l 4 14 aggttgagtg 3673 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_025578 refGene chr6 93712651 + 115067 graph_last l 24 62 aggtttatac 3674 1 Inf 3 0 4 0 aggtttcttt 3675 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_173761 refGene chr2 180716318 - 82424 graph_last l 4 10 aggtttgggc 3676 1 Inf 3 0 4 0 NM_175177 refGene chr16 31163739 + 52796 graph_last l 13 39 agtaaacaga 3677 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_175394 refGene chr17 13124036 - 57142 graph_last l 4 24 agtaacaaca 3678 1 1.16666666666667 7 6 9 2 AK016259 knownGene chr6 86027945 - 114447 graph_last l 5 30 agtaacccac 3679 1 Inf 2 0 3 0 agtaactgca 3680 1 0.333333333333333 2 6 3 2 agtaaggact 3681 1 Inf 4 0 5 0 genomic chr13 13841210 + 0 unique_long l 8 17 agtaatgcca 3682 1 Inf 2 0 3 0 agtacacaga 3683 1 Inf 3 0 4 0 NM_021718 refGene chr19 11297504 + 68071 graph_last 0 35 agtacattca 3684 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agtaccaagg 3685 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_182805 refGene chr15 78229481 + 48175 graph_last 1 6 agtactcctg 3686 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_145519 refGene chr1 95569831 - 4825 graph_last b 45 111 agtactcgaa 3687 1 1.22222222222222 11 9 14 3 genomic chr17 5723249 - 0 unique_long l 2 7 agtagatgcc 3688 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_019758 refGene chr2 91482476 + 76776 graph_last l 4 11 agtagcttag 3689 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AU080981 all_est chr12 62026743 - 28401 graph_last l 3 8 agtagggaga 3690 1 Inf 2 0 3 0 NM_025911 refGene chr6 149146523 + 118228 graph_last l 9 22 agtagtttgg 3691 1 Inf 2 0 3 0 NM_011351 refGene chr3 97871771 + 87283 graph_last 1 12 agtatcaggg 3692 1 1 3 3 4 1 CA451281 all_est chr17 34611718 - 58900 graph_last 0 30 agtattagac 3693 1 1.66666666666667 10 6 13 2 agtatttaaa 3694 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BB195205 all_est chr15 21933738 - 45635 graph_last 0 45 agtcaaaaaa 3695 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_134101 refGene chr16 20285713 + 52183 graph_second 0 3 agtcaagtag 3696 1 Inf 2 0 3 0 CF893244 all_est chr15 67380247 - 47620 graph_last l 14 33 agtcactgta 3697 1 Inf 5 0 6 0 NM_029494 refGene chr7_random 12780925 + 126774 graph_second 1 13 agtcagcagt 3698 1 Inf 2 0 3 0 NM_025847 refGene chr14 25606730 + 40115 graph_last l 3 14 agtcatcagg 3699 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_011266 refGene chr8 70331596 + 130896 graph_last l 6 29 agtccaaata 3700 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_025533 refGene chr7 38055579 + 120747 graph_last l 6 14 agtccaatgc 3701 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_172465 refGene chrX 39492425 - 148286 graph_last l 2 14 agtccacttt 3702 1 Inf 2 0 3 0 agtcccatct 3703 1 Inf 4 0 5 0 agtcctgatt 3704 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agtcctggat 3705 1 1.22222222222222 11 9 14 3 NM_021324 refGene chr7 3996551 + 118502 graph_last l 6 39 agtctcctgg 3706 1 Inf 2 0 3 0 agtctcgagg 3707 1 Inf 2 0 3 0 NM_025882 refGene chr6 83762016 - 114220 graph_last 1 13 agtcttgtgt 3708 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_007395 refGene chr15 103241266 + 50142 graph_last l 4 15 agtctttgca 3709 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_007824 refGene chr4 6194717 - 91029 graph_second 0 13 agtcttttaa 3710 1 0.666666666666667 2 3 3 1 agtgaagaat 3711 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_025709 refGene chr2 34977265 - 73642 graph_last l 5 11 agtgacccca 3712 1 Inf 2 0 3 0 NM_173048 refGene chr11 115113591 - 25047 graph_last l 13 28 agtgactgcc 3713 1 Inf 2 0 3 0 NM_023670 refGene chr6 49721743 - 112602 graph_last 4 14 agtgatgtag 3714 1 0.5 3 6 4 2 agtgattcca 3715 1 1.16666666666667 7 6 9 2 agtgcaggtg 3716 1 1.33333333333333 4 3 5 1 AA591962 all_est chr18 77484755 - 66217 graph_last l 3 15 agtgcctttg 3717 1 Inf 5 0 7 0 NM_172596 refGene chr14 15585155 + 39445 graph_last 0 4 agtgctaggc 3718 1 Inf 2 0 3 0 agtgctggag 3719 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_144516 refGene chr13 9921913 - 32574 graph_second l 3 12 agtgcttgta 3720 1 Inf 2 0 3 0 AK039562 knownGene chr8 92133709 + 132212 graph_last 1 4 agtggaagag 3721 1 Inf 2 0 3 0 NM_007864 refGene chr11 69616555 + 21106 graph_last l 23 85 agtggaaggt 3722 1 Inf 3 0 4 0 agtggaggga 3723 1 0.777777777777778 7 9 9 3 NM_144896 refGene chr3 87616418 + 86417 graph_last 0 7 agtggagtgt 3724 1 Inf 2 0 3 0 agtggcaaat 3725 1 Inf 4 0 5 0 BQ086849 all_est chr7 24700093 + 119971 graph_second 1 9 agtggcccag 3726 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_080559 refGene chr4 132984179 - 97947 graph_last l 23 118 agtggcctgc 3727 1 0.5 3 6 4 2 NM_153457 refGene chr12 68119328 - 28767 graph_last l 138 580 agtgggggtg 3728 1 1.05263157894737 40 38 52 13 agtggtttgc 3729 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_008043 refGene chr19 41882778 + 69833 graph_last 2 9 agtgtaaggt 3730 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agtgtatctg 3731 1 0.5 3 6 4 2 NM_025545 refGene chr4 40734177 - 92388 graph_last 1 4 agtgtcagca 3732 1 Inf 2 0 3 0 NM_013931 refGene chr17 24492055 - 57845 graph_last l 56 126 agtgtgacgt 3733 1 0.555555555555556 5 9 7 3 agtgtggaat 3734 1 Inf 5 0 6 0 agtgtgtgtg 3735 1 Inf 4 0 5 0 agtgtttgca 3736 1 Inf 3 0 4 0 NM_146194 refGene chr7 82467126 + 122883 graph_last l 25 65 agttaagcat 3737 1 1 3 3 4 1 NM_025527 refGene chr18 34551769 + 63761 graph_last 10 38 agttacttga 3738 1 Inf 5 0 7 0 NM_028031 refGene chr7 41513473 + 120987 graph_last 1 13 agttactttt 3739 1 Inf 3 0 4 0 AV354113 all_est chr9 77994705 + 139547 graph_last l 9 18 agttattttg 3740 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BF012684 all_est chr8 110972231 + 133308 graph_second 0 14 agttcaagcc 3741 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agttcaaggc 3742 1 0.555555555555556 5 9 7 3 agttcaattc 3743 1 Inf 2 0 3 0 NM_028152 refGene chr19 41995328 - 69845 graph_last l 6 33 agttcacctg 3744 1 1.66666666666667 5 3 7 1 agttccagga 3745 1 Inf 2 0 3 0 agttccaggc 3746 1 Inf 3 0 4 0 agttcgaggc 3747 1 Inf 5 0 6 0 agttcttcca 3748 1 1 6 6 8 2 NM_019444 refGene chr19 5659903 - 67592 graph_last l 67 129 agttggaaac 3749 1 1 3 3 4 1 AK035077 knownGene chr9 103578470 - 140855 graph_last l 2 11 agttgttctc 3750 1 Inf 2 0 3 0 AK017507 knownGene chr4 21831884 + 91710 graph_last l 17 36 agtttaaggg 3751 1 1 3 3 4 1 NM_177609 refGene chr7_random 12437047 - 126764 graph_last l 6 14 agtttagatt 3752 1 0.666666666666667 2 3 2 1 agtttgaagc 3753 1 Inf 2 0 3 0 agtttgagac 3754 1 Inf 2 0 3 0 agtttgaggc 3755 1 Inf 3 0 4 0 NM_029850 refGene chr5 122248056 + 106834 graph_second 1 24 agtttggtgg 3756 1 Inf 3 0 4 0 NM_010864 refGene chr9 77762942 + 139524 graph_last l 39 101 agtttttcac 3757 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_008883 refGene chrX 63947142 + 149251 graph_last l 4 16 agtttttctt 3758 1 Inf 4 0 5 0 agttttttgg 3759 1 Inf 2 0 3 0 ataaaaacac 3760 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ataaaaactc 3761 1 Inf 2 0 3 0 ataaaaatag 3762 1 Inf 3 0 4 0 ataaaacata 3763 1 Inf 5 0 6 0 ataaaactga 3764 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_144844 refGene chr14 116003486 - 44611 graph_last l 2 6 ataaaatcac 3765 1 Inf 2 0 3 0 NM_024195 refGene chr9 89834296 + 140061 graph_last l 3 17 ataaactaag 3766 1 1 3 3 4 1 NM_177689 refGene chr6 16916999 + 110599 graph_last 0 10 ataaactgca 3767 1 Inf 2 0 3 0 ataaacttct 3768 1 Inf 5 0 6 0 NM_025969 refGene chr18 84662917 - 66597 graph_last 1 15 ataaactttt 3769 1 Inf 4 0 5 0 NM_011499 refGene chr6 139193552 + 117702 graph_last l 20 47 ataaagtaac 3770 1 1.66666666666667 5 3 7 1 ataacaaaat 3771 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_010312 refGene chr5_random 31028043 - 109596 graph_last 3 10 ataaccgtgt 3772 1 Inf 5 0 6 0 ataactgata 3773 1 Inf 2 0 3 0 NM_023324 refGene chr11 21047992 + 18098 graph_last l 10 44 ataactgatc 3774 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_010863 refGene chr1 53007721 - 2240 graph_last l 6 22 ataagaagag 3775 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BC046973 knownGene chr11 106745253 - 24561 graph_last l 2 18 ataagaggag 3776 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_016752 refGene chr11 94975239 + 23278 graph_last l 38 101 ataagggatt 3777 1 0.888888888888889 8 9 10 3 NM_009655 refGene chr16 52616237 - 54331 graph_last l 7 17 ataataggtc 3778 1 Inf 4 0 5 0 NM_016747 refGene chrX 90655077 + 150286 graph_last l 42 100 ataatagttg 3779 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_008632 refGene chr1 68005568 + 3222 graph_last 0 4 ataatctcat 3780 1 1 3 3 4 1 atacaataaa 3781 1 0.5 3 6 4 2 atacaccaga 3782 1 0.666666666666667 2 3 2 1 atacacgaaa 3783 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_016805 refGene chr1 182364347 - 8917 graph_last l 19 44 atacactcca 3784 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_172867 refGene chr4 54760244 + 93371 graph_last l 3 13 ataccaacca 3785 1 0.5 3 6 4 2 NM_009122 refGene chr17 51354341 - 59958 graph_last l 9 23 ataccagaaa 3786 1 Inf 5 0 6 0 NM_028768 refGene chr9 101920057 - 140707 graph_last l 7 21 ataccgtgtt 3787 1 1.66666666666667 5 3 6 1 AK031989 knownGene chr6 150866622 + 118344 graph_last 0 5 atacctcact 3788 1 Inf 3 0 4 0 atacctgaaa 3789 1 Inf 3 0 4 0 NM_176898 refGene chr17 6016250 - 56722 graph_last l 12 27 atacctgggg 3790 1 Inf 4 0 5 0 ataccttctg 3791 1 0.666666666666667 2 3 2 1 atactaacgt 3792 1 0.9 18 20 23 7 atactgagtt 3793 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_011239 refGene chr16 17852330 - 52007 graph_last 0 8 atacttccac 3794 1 Inf 2 0 3 0 NM_013886 refGene chr7 74119174 + 122552 graph_second 0 4 atagaaaaaa 3795 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_007632 refGene chr17 47051725 - 59732 graph_last 1 27 atagaaatgg 3796 1 1 3 3 4 1 AK044144 all_mrna chr6 6535067 - 110148 graph_last 1 11 atagaagatg 3797 1 0.333333333333333 2 6 3 2 atagacgcaa 3798 1 0.96551724137931 28 29 37 10 NM_026377 refGene chr19 47738057 - 70326 graph_last 0 4 atagactgca 3799 1 Inf 2 0 3 0 NM_013705 refGene chr7 23320026 + 119814 graph_last l 5 12 atagactggc 3800 1 0.666666666666667 2 3 2 1 atagactgta 3801 1 Inf 2 0 3 0 atagagaaat 3802 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_054070 refGene chr8 125353046 + 134268 graph_last l 3 13 atagagctct 3803 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_015765 refGene chr2 3410042 - 71496 graph_last l 3 7 atagagtgtt 3804 1 Inf 2 0 3 0 NM_177782 refGene chr2 167180121 - 81470 graph_last l 11 39 atagattttt 3805 1 Inf 5 0 7 0 atagcagcac 3806 1 1 14 14 18 5 NM_021281 refGene chr3 98256903 + 87330 graph_last l 63 113 atagccccaa 3807 1 Inf 2 0 3 0 NM_008927 refGene chr9 66560849 - 138570 graph_last l 70 140 atagctgggc 3808 1 Inf 2 0 3 0 NM_175246 refGene chr4 124031212 + 97116 graph_last l 5 24 ataggcaaag 3809 1 0.666666666666667 2 3 2 1 atatacataa 3810 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_025648 refGene chr8 85728822 + 131860 graph_last l 7 19 atataggctg 3811 1 1 3 3 4 1 NM_133672 refGene chr10 64350730 - 12937 graph_last 6 19 atatataaaa 3812 1 1 3 3 4 1 atatatctca 3813 1 Inf 2 0 3 0 NM_177274 refGene chr3 161359254 + 90591 graph_last 0 16 atatatgcaa 3814 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AK048913 all_mrna chr15_random 5160234 + 50542 graph_last 0 3 atatcacctg 3815 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_029466 refGene chr2 15084639 + 72179 graph_last l 5 29 atatccattt 3816 1 0.833333333333333 5 6 6 2 atatgagagt 3817 1 0.666666666666667 2 3 2 1 atatgtcaga 3818 1 Inf 2 0 3 0 atatgtcagg 3819 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_025708 refGene chr16 8188591 - 51335 graph_last l 3 14 atatgtttcc 3820 1 Inf 2 0 3 0 NM_013540 refGene chr3 82541367 - 86190 graph_last l 2 21 atattgccag 3821 1 3.66666666666667 11 3 14 1 NM_019464 refGene chr3 148608554 - 90112 graph_last l 11 26 atatttcctc 3822 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_024188 refGene chr15 4123115 + 44924 graph_last l 27 75 atatttttta 3823 1 0.5 3 6 4 2 atcaaaaaaa 3824 1 Inf 2 0 3 0 atcaaagaca 3825 1 Inf 3 0 4 0 atcaaagttc 3826 1 Inf 2 0 3 0 NM_172586 refGene chr13 23243411 - 33258 graph_last 1 12 atcaacctca 3827 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_023396 refGene chr2 54285955 - 74630 graph_last l 4 24 atcaacttcc 3828 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_007909 refGene chr10 82533938 - 14055 graph_last 2 13 atcaaggggg 3829 1 Inf 2 0 3 0 NM_019978 refGene chr3 56944517 + 85071 graph_last l 37 91 atcaataaat 3830 1 Inf 2 0 3 0 atcacagccg 3831 1 Inf 2 0 3 0 atcacaggca 3832 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_009822 refGene chr4 13828973 + 91400 graph_last 0 4 atcaccacgg 3833 1 Inf 2 0 3 0 atcactccaa 3834 1 0.416666666666667 5 12 6 4 atcagaactt 3835 1 Inf 5 0 7 0 atcagcttcc 3836 1 Inf 3 0 4 0 NM_010760 refGene chr4 106740667 + 95882 graph_last 5 22 atcaggaaag 3837 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_178880 refGene chr16 93114447 + 56030 graph_last l 9 27 atcagtacta 3838 1 0.5 6 12 8 4 NM_008098 refGene chr6 35451578 - 111690 graph_last l 25 63 atcagtctat 3839 1 Inf 2 0 3 0 U65636 knownGene chr3 97585791 - 87247 graph_last 33 172 atcagtggct 3840 1 1.66666666666667 10 6 13 2 NM_027997 refGene chrUn_random 16223849 + 143221 graph_last 0 10 atcagtgtga 3841 1 Inf 2 0 3 0 NM_028044 refGene chr3 124871919 + 88810 graph_last l 5 43 atcagtgtgc 3842 1 Inf 2 0 3 0 NM_010124 refGene chr10 63312254 - 12862 graph_last l 6 33 atcagtttgt 3843 1 1.33333333333333 4 3 5 1 atcatacaag 3844 1 Inf 3 0 4 0 NM_009029 refGene chr14 64760607 - 42649 graph_last l 7 18 atcatcacac 3845 1 Inf 2 0 3 0 NM_181391 refGene chr4 3870547 + 90968 graph_last l 4 19 atccaaagaa 3846 1 Inf 3 0 4 0 NM_011405 refGene chr14 45453557 + 41276 graph_last l 5 36 atccaagtca 3847 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_175272 refGene chr7 42320452 + 121059 graph_last l 10 28 atccaataaa 3848 1 Inf 2 0 3 0 atccacaaac 3849 1 Inf 2 0 3 0 atccacagtc 3850 1 Inf 3 0 4 0 NM_024203 refGene chr17 15086437 + 57293 graph_last l 7 23 atccagaaca 3851 1 Inf 4 0 5 0 NM_027257 refGene chr10 131678604 - 16796 graph_last l 28 69 atccaggcgt 3852 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_145139 refGene chr15 80437860 + 48377 graph_last l 14 45 atccatattg 3853 1 3.66666666666667 11 3 14 1 NM_028048 refGene chr11 68543913 - 20955 graph_last 6 21 atcccaacct 3854 1 Inf 2 0 3 0 atccccaatg 3855 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_145142 refGene chr1 39558272 - 1717 graph_last l 20 35 atccccaggg 3856 1 1 3 3 4 1 atcccccccc 3857 1 Inf 2 0 3 0 NM_133934 refGene chr6 89243406 - 114731 graph_last 2 8 atccccctct 3858 1 Inf 3 0 4 0 NM_139304 refGene chr3 92770852 + 86909 graph_second 0 2 atccctccca 3859 1 Inf 2 0 3 0 atccgaaaga 3860 1 0.871287128712871 88 101 115 35 atccgggctt 3861 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_013557 refGene chr5 142750491 + 108344 graph_last l 7 25 atccgttgcc 3862 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_010267 refGene chr1 17333606 - 648 graph_last 2 28 atcctaaaaa 3863 1 2.33333333333333 7 3 9 1 atcctataag 3864 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_013931 refGene chr17 24490336 + 57845 graph_last l 23 49 atcctcgctg 3865 1 Inf 3 0 4 0 NM_007657 refGene chr6 127332221 - 116988 graph_last l 10 50 atcctgtgct 3866 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_182650 refGene chr6 51940539 - 112726 graph_last 0 4 atcctgtgga 3867 1 0.666666666666667 2 3 2 1 atccttcccc 3868 1 Inf 3 0 4 0 BE291849 all_est chr11 21255465 + 18136 graph_last 0 5 atccttctct 3869 1 Inf 3 0 4 0 NM_021496 refGene chr16 46773395 - 54060 graph_second 0 4 atcctttgta 3870 1 Inf 4 0 5 0 NM_177640 refGene chr19 18879699 + 68484 graph_last l 5 12 atcctttttt 3871 1 Inf 2 0 3 0 NM_028003 refGene chr15 99953414 + 49791 graph_last b 8 22 atcggacgtt 3872 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_183171 refGene chr9 37655139 + 136457 graph_last b 58 291 atcgggcgca 3873 1 1.55 31 20 40 7 NM_172396 refGene chr8 73106800 - 131193 graph_last 9 25 atcgtactgt 3874 1 1 3 3 4 1 NM_007839 refGene chr5 51468944 + 102762 graph_last l 27 99 atcgttgtaa 3875 1 0.777777777777778 7 9 9 3 atctacaaaa 3876 1 1 3 3 4 1 NM_013660 refGene chr13 51445795 - 34891 graph_last 0 3 atctaccatt 3877 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_130455 refGene chr10 82281261 - 14020 graph_last l 10 28 atctacttct 3878 1 Inf 3 0 4 0 NM_198304 refGene chr2 30618654 + 73247 graph_last l 3 14 atctattctt 3879 1 Inf 2 0 3 0 NM_026851 refGene chr14 45520384 + 41280 graph_last l 54 107 atctcaaacc 3880 1 1.66666666666667 5 3 6 1 atctcaataa 3881 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_148673 refGene chr11 43071200 - 19280 graph_last 3 9 atctccttca 3882 1 Inf 2 0 3 0 BC004580 knownGene chr5_random 40831775 + 109787 graph_last l 34 62 atctccttgg 3883 1 Inf 5 0 6 0 atctcgagag 3884 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_029091 refGene chr17 46030905 - 59599 graph_last l 3 13 atctctactt 3885 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_030220 refGene chr11 96491532 - 23476 graph_last l 4 26 atctctgcaa 3886 1 Inf 5 0 6 0 atctctttgt 3887 1 1 3 3 4 1 NM_172947 refGene chr11 101826505 - 24036 graph_last 2 18 atctcttttc 3888 1 Inf 3 0 4 0 NM_024182 refGene chr18 12373821 + 62920 graph_last l 4 25 atctgaagtg 3889 1 Inf 3 0 4 0 atctgactcc 3890 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_172528 refGene chr9 80082959 - 139642 graph_last 0 13 atctggtttt 3891 1 1.66666666666667 5 3 6 1 atctgtactc 3892 1 0.833333333333333 10 12 13 4 BI732828 all_est chr1 185995585 - 9205 graph_last 3 12 atctgtccag 3893 1 Inf 2 0 3 0 atctgtccat 3894 1 Inf 5 0 6 0 atctgtggct 3895 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_010595 refGene chr6 128564638 - 117035 graph_last l 78 117 atctgttcat 3896 1 Inf 2 0 3 0 NM_139144 refGene chrX 91554986 + 150360 graph_last l 10 45 atcttatgtg 3897 1 1.11111111111111 10 9 13 3 NM_133962 refGene chr8 3367254 + 127568 graph_last l 6 18 atcttcgcct 3898 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_057173 refGene chr7 101207009 + 124114 graph_last l 2 15 atcttgtgcc 3899 1 Inf 5 0 6 0 NM_018761 refGene chr4 56563502 + 93435 graph_last 0 8 atctttaata 3900 1 Inf 2 0 3 0 atctttctgg 3901 1 0.869565217391304 20 23 26 8 X57780 knownGene chrM 14229 - 142531 graph_last l 14 53 atgaaatgtt 3902 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_053202 refGene chr6 100581528 - 115476 graph_last 1 7 atgaaattcc 3903 1 Inf 3 0 4 0 NM_008302 refGene chr17 44963893 + 59486 graph_last l 27 50 atgaacacac 3904 1 Inf 5 0 6 0 atgaacctat 3905 1 0.666666666666667 6 9 8 3 NM_026932 refGene chr4 117737959 + 96627 graph_last l 7 21 atgaatgcca 3906 1 Inf 3 0 4 0 NM_133676 refGene chr14 42732257 + 41088 graph_last l 7 48 atgaatgccc 3907 1 1.5 9 6 12 2 NM_194262 refGene chr13 13960504 + 32784 graph_last l 8 33 atgaattatg 3908 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_007851 refGene chr8_random 1787175 + 134752 graph_last 0 3 atgaattgtc 3909 1 Inf 2 0 3 0 NM_028038 refGene chr8 107535614 - 133040 graph_last 3 14 atgaattgtt 3910 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_080428 refGene chr3 86938433 + 86386 graph_last l 8 55 atgaattttg 3911 1 0.5 3 6 4 2 atgaccaaag 3912 1 0.666666666666667 2 3 2 1 atgaccctgg 3913 1 Inf 5 0 6 0 NM_025417 refGene chr9 59260969 - 138006 graph_last l 16 56 atgactgctt 3914 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_026422 refGene chr2 36389501 - 73733 graph_last l 16 48 atgacttggg 3915 1 0.666666666666667 2 3 3 1 X57780 knownGene chrM 6727 - 142531 graph_second 44 78 atgagaacag 3916 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AK129105 knownGene chr14 29203418 + 40390 graph_last 1 9 atgagacagg 3917 1 Inf 2 0 3 0 BB042553 all_est chr14 68005215 - 42842 graph_last 0 8 atgagatctg 3918 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_009536 refGene chr11 75330638 - 21637 graph_last l 6 50 atgagcgtag 3919 1 0.888888888888889 8 9 11 3 NM_009010 refGene chr8 85694974 - 131851 graph_last l 6 39 atgaggggaa 3920 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_012052 refGene chr7 91582444 + 123372 graph_last l 8 20 atgagtacag 3921 1 Inf 2 0 3 0 atgagtcagc 3922 1 Inf 2 0 3 0 atgataatga 3923 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_016722 refGene chr8 124468201 + 134145 graph_last l 8 62 atgatccagg 3924 1 Inf 5 0 7 0 NM_009965 refGene chr11 77289070 + 21860 graph_last l 3 10 atgatctttc 3925 1 0.666666666666667 2 3 2 1 atgatgatag 3926 1 0.5 3 6 4 2 atgatgatga 3927 1 2 6 3 8 1 atgatggtag 3928 1 1.22222222222222 11 9 15 3 NM_010693 refGene chr4 128470517 - 97487 graph_last 0 6 atgatggtct 3929 1 Inf 2 0 3 0 atgattcata 3930 1 Inf 2 0 3 0 NM_025638 refGene chr11 86619855 - 22739 graph_last l 10 34 atgcaaacct 3931 1 1.83333333333333 11 6 14 2 NM_145480 refGene chr16 22747252 - 52363 graph_last 0 7 atgcaattat 3932 1 Inf 3 0 4 0 atgcagactt 3933 1 0.88235294117647 15 17 20 6 atgcagagac 3934 1 Inf 5 0 7 0 atgcagaggc 3935 1 Inf 4 0 5 0 BB700466 all_est chr9 56939823 + 137803 graph_last 4 14 atgcagggca 3936 1 0.666666666666667 2 3 3 1 atgcagtttt 3937 1 Inf 2 0 3 0 NM_018770 refGene chr9 49855201 + 137345 graph_last l 32 105 atgcatcctt 3938 1 1.83333333333333 11 6 15 2 NM_172694 refGene chr4 68935646 - 94064 graph_last l 20 43 atgcatttct 3939 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_175836 refGene chr11 30006168 - 18592 graph_last l 3 12 atgcattttt 3940 1 Inf 2 0 3 0 atgccaagga 3941 1 Inf 2 0 3 0 atgccaggct 3942 1 Inf 3 0 4 0 atgccccctg 3943 1 Inf 2 0 3 0 NM_010223 refGene chr8 70775594 + 130947 graph_last 0 93 atgccccgcg 3944 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_025844 refGene chr9 18459114 + 135458 graph_last 4 9 atgccctaaa 3945 1 Inf 3 0 4 0 NM_145221 refGene chr14 21508415 - 39847 graph_last b 4 15 atgccgcaat 3946 1 0.5 3 6 4 2 genomic chr8 124756589 - 0 unique_long l 13 43 atgccgccaa 3947 1 Inf 3 0 4 0 NM_175638 refGene chr11 100940694 - 23951 graph_last 0 5 atgcctggga 3948 1 1 3 3 4 1 atgcgagtga 3949 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_134167 refGene chr6 67277823 - 113470 graph_last 0 32 atgctaaaaa 3950 1 0.5 3 6 4 2 genomic chr2 45416976 - 0 unique_long l 2 9 atgctcacgc 3951 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_027216 refGene chr11 113168925 - 24952 graph_last l 12 48 atgctcctcc 3952 1 Inf 3 0 4 0 NM_021551 refGene chr14 45995840 + 41332 graph_last 2 16 atgctgagga 3953 1 Inf 5 0 6 0 atgctggaaa 3954 1 Inf 2 0 3 0 NM_172442 refGene chr19 12340932 - 68140 graph_second 0 4 atgctgtttc 3955 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_024448 refGene chr17 66734858 + 60762 graph_last l 18 47 atgcttctca 3956 1 0.5 3 6 4 2 atgctttaaa 3957 1 0.666666666666667 2 3 2 1 atggaaagga 3958 1 Inf 5 0 7 0 BC057380 knownGene chr13 76235135 + 36294 graph_last l 8 23 atggactatg 3959 1 1.33333333333333 4 3 5 1 AL360388 all_est chr12 4974376 + 26061 graph_second 0 11 atggagcggg 3960 1 1 3 3 4 1 NM_133991 refGene chrX 6801112 - 147102 graph_last l 2 40 atggaggaaa 3961 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_175372 refGene chr7 4305957 - 118526 graph_last 1 7 atggaggtca 3962 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AK089659 all_mrna chrX 153066360 - 152716 graph_last 0 5 atggatgatc 3963 1 Inf 3 0 4 0 atggcaattt 3964 1 2.16666666666667 13 6 17 2 NM_024499 refGene chr10 83415390 - 14155 graph_last l 39 135 atggcatcag 3965 1 1.07142857142857 15 14 20 5 NM_013663 refGene chr17 28687748 + 58322 graph_last l 5 17 atggcatctc 3966 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_008302 refGene chr17 44962627 - 59486 graph_second 6 16 atggccaaaa 3967 1 Inf 2 0 3 0 atggccagga 3968 1 Inf 2 0 3 0 atggccgtag 3969 1 0.5 3 6 4 2 atggcgcctc 3970 1 Inf 2 0 3 0 atggctacgg 3971 1 0.833333333333333 5 6 6 2 BC048535 knownGene chr2 119975780 + 78435 graph_last l 6 33 atggctatgg 3972 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_027389 refGene chr3 91046321 - 86744 graph_last 5 15 atggctcact 3973 1 0.666666666666667 2 3 3 1 atggctccca 3974 1 0.888888888888889 8 9 10 3 NM_021296 refGene chr18 61836551 - 65310 graph_last 2 14 atggctgtca 3975 1 Inf 3 0 4 0 NM_026784 refGene chr3 91712484 + 86824 graph_last l 26 75 atgggcaggc 3976 1 Inf 5 0 6 0 NM_009974 refGene chr8 96731400 - 132594 graph_last l 19 52 atgggcagtt 3977 1 1 3 3 4 1 NM_177798 refGene chr10 120052239 - 16079 graph_last l 2 8 atgggtacaa 3978 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011160 refGene chr19 30252810 - 69156 graph_last 0 5 atgggtacat 3979 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_010875 refGene chr9 51513638 - 137508 graph_last l 5 46 atgggtacca 3980 1 0.888888888888889 8 9 11 3 NM_027016 refGene chr3 31714208 + 83982 graph_last l 55 162 atgggtcatc 3981 1 1.22222222222222 11 9 15 3 BC033455 knownGene chr5 129191499 + 107307 graph_last 10 30 atggtcacta 3982 1 0.5 3 6 4 2 atggtccata 3983 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_019805 refGene chr5 121468467 + 106749 graph_last b 10 27 atggtccgga 3984 1 Inf 5 0 6 0 NM_172562 refGene chr11 83639447 - 22433 graph_last 3 18 atggtctgtc 3985 1 0.666666666666667 2 3 2 1 atggtgactc 3986 1 Inf 2 0 3 0 atggtgatgt 3987 1 0.88235294117647 15 17 20 6 AK021354 all_mrna chr6 122098866 + 116653 graph_last 0 7 atggtgcaca 3988 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AK030904 knownGene chr5 123272476 + 106963 graph_last l 2 23 atggtgctac 3989 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_024192 refGene chr19 46520451 - 70199 graph_last l 66 166 atggtggaca 3990 1 0.666666666666667 8 12 11 4 atggtggatt 3991 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_011341 refGene chr4 154126850 + 99835 graph_last l 28 62 atggtggttc 3992 1 Inf 3 0 4 0 NM_009322 refGene chr2 62202656 + 75069 graph_last l 25 52 atgtaaccac 3993 1 0.777777777777778 7 9 9 3 NM_025441 refGene chr12 65193782 - 28531 graph_last 7 32 atgtaacgac 3994 1 0.5 3 6 4 2 genomic chr14 29266576 - 0 unique_long l 3 14 atgtaactat 3995 1 0.5 3 6 4 2 NM_019678 refGene chr16 57132255 - 54453 graph_last l 52 78 atgtactaaa 3996 1 Inf 4 0 5 0 atgtagtagt 3997 1 1.92857142857143 27 14 35 5 NM_025509 refGene chr3 134292460 - 89342 graph_last l 32 119 atgtatgaaa 3998 1 2 6 3 8 1 NM_007944 refGene chr8 72752711 - 131158 graph_last l 8 46 atgtatgcat 3999 1 Inf 5 0 7 0 AK129377 knownGene chr5 23426185 - 101201 graph_last 0 7 atgtattttt 4000 1 Inf 2 0 3 0 atgtcaaaat 4001 1 Inf 3 0 4 0 atgtcagtca 4002 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_011034 refGene chr4 115611121 - 96430 graph_last 1 7 atgtcatagg 4003 1 Inf 2 0 3 0 atgtcatcaa 4004 1 0.75 24 32 32 11 NM_028791 refGene chr17 29274254 + 58381 graph_last l 7 23 atgtcatttc 4005 1 0.666666666666667 2 3 2 1 atgtcgctct 4006 1 Inf 3 0 4 0 NM_009705 refGene chr12 75146462 - 29266 graph_last l 40 79 atgtctaagc 4007 1 0.5 3 6 4 2 atgtctcaaa 4008 1 0.895953757225434 155 173 202 60 NM_175675 refGene chr5 28996236 + 101504 graph_last l 3 10 atgtctgcag 4009 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AV313996 all_est chr3 52002663 - 84737 graph_last 0 3 atgtcttcta 4010 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_028074 refGene chr11 105912956 + 24477 graph_last l 37 83 atgtgaaatg 4011 1 0.5 3 6 4 2 NM_026203 refGene chr10 21914538 + 10852 graph_last l 6 25 atgtgacgtc 4012 1 Inf 3 0 4 0 NM_172298 refGene chr7 30823357 + 120317 graph_last l 2 13 atgtgactct 4013 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_023220 refGene chr2 127141945 - 78909 graph_last l 8 23 atgtgccaat 4014 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_011034 refGene chr4 115607891 + 96430 graph_last 78 188 atgtggtgtg 4015 1 0.833333333333333 5 6 7 2 atgtgtgcaa 4016 1 0.571428571428571 8 14 11 5 atgtgttctg 4017 1 Inf 2 0 3 0 AK034974 all_mrna chr2 53183992 + 74573 graph_last 0 77 atgttaaaaa 4018 1 1.83333333333333 11 6 14 2 NM_025279 refGene chr13 58182021 - 35372 graph_second 1 37 atgttagtta 4019 1 Inf 2 0 3 0 NM_028407 refGene chr14 31395439 - 40448 graph_last l 8 31 atgttcagct 4020 1 Inf 2 0 3 0 NM_026268 refGene chr10 101843403 + 15276 graph_last l 21 89 atgttcgtgg 4021 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AB093212 knownGene chr11 45535729 + 19398 graph_last l 12 56 atgttctgtt 4022 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_029402 refGene chr18 3435862 + 62399 graph_last l 29 108 atgttgctgc 4023 1 2.66666666666667 8 3 10 1 NM_013836 refGene chr15 84464246 + 48815 graph_last l 15 30 atgttggggc 4024 1 Inf 3 0 4 0 NM_008163 refGene chr11 115151094 - 25117 graph_last 4 40 atgtttaagg 4025 1 0.5 3 6 4 2 NM_133206 refGene chr8 113315152 + 133479 graph_last 2 18 atgtttggct 4026 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_026187 refGene chr1 76763310 + 3689 graph_last 10 41 atgtttgggg 4027 1 2.33333333333333 7 3 9 1 atgtttgtgc 4028 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_025814 refGene chr6 67908500 + 113525 graph_last 0 3 atgttttatc 4029 1 Inf 2 0 3 0 attaaaaaaa 4030 1 Inf 4 0 5 0 NM_011529 refGene chr2 62043491 + 75051 graph_last l 4 22 attaaatgac 4031 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_021504 refGene chr14 11585804 + 39213 graph_last 0 2 attaaatgct 4032 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr14 28864622 + 0 unique_long l 31 227 attaacttgg 4033 1 1.05882352941176 18 17 23 6 attaagaggg 4034 1 Inf 2 0 3 0 attaaggaaa 4035 1 0.333333333333333 2 6 3 2 attaataaaa 4036 1 0.666666666666667 2 3 3 1 attaatcaaa 4037 1 0.916666666666667 11 12 15 4 attaatcaat 4038 1 Inf 5 0 6 0 attaattatg 4039 1 Inf 3 0 4 0 attaattttg 4040 1 0.666666666666667 4 6 5 2 BC021509 knownGene chr5 129833260 - 107354 graph_last 1 33 attacagcca 4041 1 0.857142857142857 12 14 16 5 attacttact 4042 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_007635 refGene chr5 93471669 + 104780 graph_last l 3 12 attactttct 4043 1 0.666666666666667 2 3 3 1 attagacaga 4044 1 Inf 2 0 3 0 NM_008881 refGene chr6 90767660 - 114864 graph_last l 4 28 attagctgtc 4045 1 0.416666666666667 5 12 7 4 BC027311 knownGene chr9 66015752 + 138533 graph_last l 9 20 attagggaaa 4046 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_015762 refGene chr10 85188763 - 14329 graph_last 3 13 attagttacc 4047 1 Inf 4 0 5 0 AK037592 knownGene chr16 56452393 - 54418 graph_last 13 36 attagtttcc 4048 1 0.5 3 6 4 2 NM_011100 refGene chr3 150650490 - 90234 graph_last l 58 130 attatctttt 4049 1 1 6 6 8 2 NM_153581 refGene chr8 55141977 + 130191 graph_last l 8 26 attatgcatt 4050 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_134025 refGene chr11 82855504 - 22350 graph_last 0 5 attatgcgga 4051 1 Inf 2 0 3 0 AK077185 knownGene chr12 47138541 + 27751 graph_last l 3 6 attatgtgcg 4052 1 Inf 3 0 4 0 NM_021883 refGene chr4 45404429 - 92886 graph_last 2 12 attatgtgtt 4053 1 Inf 2 0 3 0 NM_027287 refGene chr3 156149277 + 90410 graph_last l 3 24 attattgtaa 4054 1 1.33333333333333 4 3 5 1 attcaagttt 4055 1 Inf 2 0 3 0 NM_030249 refGene chr3 108119607 - 88050 graph_last l 3 16 attcacaatt 4056 1 0.666666666666667 2 3 3 1 attcacagcc 4057 1 0.666666666666667 2 3 2 1 attcatcact 4058 1 Inf 2 0 3 0 NM_019431 refGene chr11 107396633 - 24662 graph_last l 3 14 attccaccta 4059 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_029478 refGene chr11 86255209 - 22689 graph_last b 31 157 attccacgcg 4060 1 0.583333333333333 7 12 9 4 attccagaaa 4061 1 Inf 3 0 4 0 NM_133887 refGene chr4 131740461 - 97798 graph_last l 2 10 attccatctc 4062 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BC052463 knownGene chr10 73355731 + 13509 graph_last l 7 16 attcgtgcca 4063 1 Inf 3 0 4 0 NM_145962 refGene chr11 35432419 - 18936 graph_second 2 16 attctaacac 4064 1 Inf 2 0 3 0 attctccagg 4065 1 Inf 2 0 3 0 attctccagt 4066 1 1.23076923076923 96 78 126 27 attctctcca 4067 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_009722 refGene chr5 121480887 - 106753 graph_last l 18 64 attctctgga 4068 1 1.66666666666667 5 3 7 1 attctgagga 4069 1 Inf 2 0 3 0 NM_010838 refGene chr11 103997447 - 24313 graph_last l 19 79 attctgtttg 4070 1 0.833333333333333 10 12 13 4 NM_008017 refGene chr4 52128900 + 93249 graph_last 0 5 attgaagaag 4071 1 Inf 2 0 3 0 BB428724 all_est chr6 18307258 - 110665 graph_last 0 8 attgaatatt 4072 1 0.666666666666667 2 3 2 1 attgattaaa 4073 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_133697 refGene chr5 64944338 + 103345 graph_last 0 62 attgattaat 4074 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr8 113141368 - 0 unique_long l 4 12 attgcaaagt 4075 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026729 refGene chr11 114915952 + 25076 graph_last 0 3 attgccgagg 4076 1 Inf 2 0 3 0 NM_013834 refGene chr8 22345312 + 128587 graph_last 0 8 attgcctata 4077 1 2.33333333333333 7 3 9 1 attgcttaga 4078 1 0.8 28 35 36 12 NM_026395 refGene chr4 153187858 - 99714 graph_last l 30 67 attgcttttg 4079 1 2 6 3 8 1 NM_008632 refGene chr1 68044382 - 3222 graph_last 0 44 attggcattt 4080 1 1.66666666666667 5 3 6 1 attggcttaa 4081 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_026556 refGene chr11 87540370 - 22835 graph_last l 134 341 attggggtgg 4082 1 0.88235294117647 15 17 20 6 genomic chr2 6461984 - 0 unique_long l 8 27 attggtgtta 4083 1 0.333333333333333 2 6 3 2 AK045021 knownGene chr4 120251326 - 96844 graph_last 0 5 attgtatatg 4084 1 0.666666666666667 2 3 2 1 attgtcattg 4085 1 0.416666666666667 5 12 7 4 genomic chr13 118318815 - 0 unique_long l 7 26 attgtgatta 4086 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_019702 refGene chr10 22190492 + 10870 graph_last l 6 18 attgttagat 4087 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_013826 refGene chr13 113678400 + 38296 graph_last 8 73 atttaaacag 4088 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_019638 refGene chr6 132983733 - 117357 graph_last l 7 36 atttaagaag 4089 1 2.66666666666667 8 3 11 1 atttaagtat 4090 1 0.666666666666667 2 3 3 1 atttaataaa 4091 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_176849 refGene chr8 8736544 - 127791 graph_last l 8 21 atttactgtc 4092 1 1 6 6 8 2 atttagaggt 4093 1 1.55555555555556 14 9 18 3 NM_178624 refGene chr9 116583940 + 141769 graph_last 10 31 atttatggaa 4094 1 1.66666666666667 5 3 6 1 AK018139 knownGene chr10 30121296 + 11302 graph_last 1 6 atttatgtct 4095 1 Inf 3 0 4 0 atttcagaaa 4096 1 Inf 3 0 4 0 atttccagag 4097 1 Inf 2 0 3 0 NM_026369 refGene chr1 156203375 + 7249 graph_last b 20 105 atttcccgag 4098 1 0.647058823529412 11 17 14 6 atttcgagca 4099 1 Inf 3 0 4 0 NM_008138 refGene chr9 110246845 - 141261 graph_last l 32 210 atttgaaata 4100 1 1.5 21 14 28 5 NM_030675 refGene chr5 3854118 + 100143 graph_last l 6 28 atttgaataa 4101 1 1 3 3 4 1 NM_144915 refGene chr5 142286068 - 108317 graph_last 6 36 atttgcacac 4102 1 1 3 3 4 1 NM_032003 refGene chr17 43478453 + 59388 graph_last l 23 87 atttgcatta 4103 1 1 3 3 4 1 NM_025482 refGene chr2 181364401 + 82485 graph_last l 3 11 atttggagag 4104 1 0.666666666666667 2 3 3 1 atttgtatct 4105 1 1 9 9 12 3 NM_010243 refGene chr4 25601015 - 91868 graph_last 9 20 atttgtatgt 4106 1 0.5 3 6 4 2 NM_009982 refGene chr7 80439224 + 122790 graph_last 0 12 atttgtcagc 4107 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_028475 refGene chr3 92467195 - 86875 graph_last 1 10 atttgtctct 4108 1 Inf 5 0 6 0 NM_178048 refGene chr8 112607312 - 133424 graph_last l 5 16 atttgttatt 4109 1 0.666666666666667 2 3 3 1 genomic chr3 41797775 - 0 unique_long l 2 11 attttaaagg 4110 1 Inf 2 0 3 0 NM_027494 refGene chr5 122743814 - 106895 graph_last 0 32 attttaataa 4111 1 0.333333333333333 2 6 3 2 attttaatat 4112 1 Inf 2 0 3 0 NM_198300 refGene chr19 37108645 - 69527 graph_last l 10 16 attttagatg 4113 1 0.666666666666667 2 3 3 1 attttatact 4114 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AK011097 knownGene chr2 76330317 - 75918 graph_last 1 5 attttataga 4115 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008402 refGene chr2 84108166 + 76271 graph_last 0 7 attttatatt 4116 1 Inf 3 0 4 0 genomic chr17 75280743 + 0 unique_long l 7 28 attttattct 4117 1 0.5 3 6 4 2 AW210516 all_est chr10 27774684 - 11172 graph_last 0 3 attttcaagt 4118 1 Inf 3 0 4 0 attttcaatt 4119 1 Inf 3 0 4 0 attttctcaa 4120 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_028720 refGene chr16 4503037 - 51161 graph_last l 29 119 attttgtgca 4121 1 1.66666666666667 10 6 13 2 attttgtggg 4122 1 0.666666666666667 2 3 2 1 atttttacct 4123 1 1 3 3 4 1 NM_178665 refGene chr16 24600285 + 52489 graph_last 0 21 atttttcctg 4124 1 Inf 2 0 3 0 BM935473 all_est chr17 26602945 - 58073 graph_last l 35 109 atttttctgt 4125 1 0.6 12 20 16 7 NM_133732 refGene chr9 15477028 - 135364 graph_last l 12 31 atttttgagg 4126 1 0.5 3 6 4 2 attttttatt 4127 1 0.666666666666667 2 3 3 1 caaaaaaata 4128 1 Inf 5 0 6 0 caaaaactgt 4129 1 Inf 2 0 3 0 NM_029850 refGene chr5 122246820 + 106834 graph_last l 10 22 caaaaatatc 4130 1 Inf 3 0 4 0 NM_053202 refGene chr6 100581533 + 115476 graph_second 1 4 caaaaatatt 4131 1 Inf 2 0 3 0 NM_144530 refGene chr1 136496171 - 6343 graph_last 33 61 caaaaatgac 4132 1 1.66666666666667 5 3 6 1 caaaaattat 4133 1 Inf 2 0 3 0 caaaacaggc 4134 1 0.666666666666667 2 3 2 1 caaaactatg 4135 1 0.666666666666667 2 3 3 1 caaaactgta 4136 1 2 12 6 16 2 AK083512 knownGene chr8 86533802 - 131951 graph_last 0 11 caaaacttgt 4137 1 0.666666666666667 2 3 2 1 caaaagaaag 4138 1 2 6 3 8 1 NM_028242 refGene chrX 46711356 + 148633 graph_last l 6 41 caaaagaata 4139 1 2 6 3 8 1 caaaagaatc 4140 1 0.833333333333333 5 6 6 2 caaaagaatt 4141 1 Inf 3 0 4 0 NM_025814 refGene chr6 67903246 - 113525 graph_last l 13 27 caaaagcttt 4142 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr6 73927095 + 0 unique_long l 7 45 caaaaggctc 4143 1 1 3 3 4 1 caaaaggtct 4144 1 Inf 2 0 3 0 caaaataaat 4145 1 0.666666666666667 2 3 2 1 caaaatacat 4146 1 0.869565217391304 20 23 26 8 NM_016686 refGene chr11 87645048 + 22842 graph_last l 10 31 caaaatactg 4147 1 1 3 3 4 1 AK122383 knownGene chr4 149172714 - 99491 graph_last l 79 157 caaaatgttt 4148 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_175255 refGene chr11 51317474 - 19792 graph_last l 12 36 caaacaatgt 4149 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_015818 refGene chr1 36808675 + 1480 graph_last l 5 71 caaacacaac 4150 1 1 9 9 12 3 NM_176930 refGene chr12 39626466 + 27513 graph_last 0 3 caaacagaca 4151 1 Inf 2 0 3 0 AU258835 all_est chr19 10131926 + 67964 graph_last 0 12 caaacaggca 4152 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_145599 refGene chr8 78224911 - 131420 graph_last 0 10 caaacagtgg 4153 1 Inf 3 0 4 0 caaacatagc 4154 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_010895 refGene chr11 97909687 + 23629 graph_last l 8 36 caaaccctcc 4155 1 1.33333333333333 8 6 11 2 NM_177730 refGene chr4 4693426 + 90991 graph_second 0 7 caaacctaaa 4156 1 Inf 2 0 3 0 NM_031179 refGene chr1 56302543 - 2445 graph_last l 29 113 caaactgaag 4157 1 1 26 26 34 9 NM_027287 refGene chr3 156149820 + 90410 graph_last 0 11 caaactgtat 4158 1 0.666666666666667 2 3 2 1 caaacttctg 4159 1 0.75 9 12 12 4 NM_011239 refGene chr16 17860287 - 52007 graph_last 3 12 caaagaagca 4160 1 Inf 2 0 3 0 caaagacaac 4161 1 1.33333333333333 4 3 5 1 AK129143 knownGene chr18 78788467 - 66286 graph_last l 4 21 caaagagctg 4162 1 3.33333333333333 10 3 13 1 caaagcgtgt 4163 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr13 21330966 + 0 unique_long l 12 32 caaagtgtgg 4164 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_007964 refGene chr5 106852100 - 105612 graph_last l 9 69 caaagttaca 4165 1 Inf 4 0 5 0 caaataaaaa 4166 1 0.666666666666667 2 3 2 1 genomic chr4 123480209 - 0 unique_long l 3 22 caaataaaag 4167 1 Inf 2 0 3 0 AI007149 all_est chr16 98602815 + 56374 graph_last 0 4 caaataaagg 4168 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_134027 refGene chr11 97735794 - 23607 graph_last l 9 45 caaataaatt 4169 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_009122 refGene chr17 51353683 - 59958 graph_last l 14 26 caaataagct 4170 1 Inf 2 0 3 0 NM_011185 refGene chr17 15128315 - 57300 graph_last l 20 87 caaataccca 4171 1 2.66666666666667 8 3 11 1 caaatatgtt 4172 1 1.78571428571429 25 14 33 5 caaatcagaa 4173 1 1.66666666666667 5 3 7 1 caaatccaac 4174 1 Inf 2 0 3 0 caaatccaat 4175 1 Inf 2 0 3 0 NM_133236 refGene chr6 8324520 + 110253 graph_last l 17 27 caaatccccc 4176 1 Inf 4 0 5 0 NM_020575 refGene chr2 60514790 + 74964 graph_last 3 20 caaatgaaca 4177 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_027338 refGene chr8 21076186 + 128506 graph_last l 14 40 caaatgataa 4178 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_012056 refGene chr6 57338417 + 113039 graph_last l 12 62 caaatgctgt 4179 1 Inf 4 0 5 0 caaatgtact 4180 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_133942 refGene chr7 122990909 + 125450 graph_last l 2 14 caaatgtgcc 4181 1 0.444444444444444 4 9 5 3 caaattaaaa 4182 1 1 3 3 4 1 NM_007566 refGene chr17 75280998 + 61202 graph_last l 33 50 caaattcttc 4183 1 Inf 3 0 4 0 NM_007413 refGene chr11 61837149 + 20603 graph_last 2 41 caaattggag 4184 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AK083224 knownGene chr14 85651486 - 43463 graph_last l 20 57 caacaaaacg 4185 1 1 3 3 4 1 NM_011353 refGene chr13 98561971 + 37374 graph_last 1 6 caacaaaagc 4186 1 Inf 2 0 3 0 caacacacaa 4187 1 0.416666666666667 5 12 6 4 AU256844 all_est chr7 57187751 - 121644 graph_last l 33 92 caacacacag 4188 1 1 12 12 16 4 genomic chr1 57057789 + 0 unique_long l 5 11 caacacagtt 4189 1 Inf 3 0 4 0 NM_007394 refGene chr2 58680270 - 74785 graph_last l 4 20 caacaccacc 4190 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_007971 refGene chr6 47859558 - 112413 graph_second 0 8 caacacccaa 4191 1 Inf 3 0 4 0 caacacttgg 4192 1 Inf 3 0 4 0 NM_018737 refGene chrX 151054225 + 152626 graph_last l 20 37 caacagaacc 4193 1 Inf 3 0 4 0 NM_145969 refGene chr14 21167369 - 39829 graph_last l 7 18 caacataaaa 4194 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_027425 refGene chr10 64912342 - 13009 graph_last 6 32 caacatcgat 4195 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_016785 refGene chr13 47085257 - 34619 graph_last l 13 23 caacattcag 4196 1 Inf 2 0 3 0 BQ746693 all_est chr2 164033938 + 81188 graph_last l 4 9 caaccaaggg 4197 1 Inf 2 0 3 0 NM_023662 refGene chr8 41024709 + 129515 graph_last l 7 24 caaccgtgta 4198 1 Inf 2 0 3 0 NM_183321 refGene chr7 24520374 - 119945 graph_last 0 22 caacgttgga 4199 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_008477 refGene chr14 39433242 + 40901 graph_second 0 3 caactactta 4200 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_053092 refGene chr8 113687507 - 133540 graph_last 10 76 caactatggt 4201 1 1.66666666666667 5 3 7 1 AK030316 knownGene chrX 147505328 + 152449 graph_last l 25 78 caactgagaa 4202 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_010072 refGene chr2 168794983 - 81616 graph_last l 24 75 caagaattga 4203 1 2.33333333333333 7 3 9 1 caagaccagt 4204 1 Inf 2 0 3 0 NM_010344 refGene chr8 32911804 + 129089 graph_last l 15 36 caagacggaa 4205 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_009274 refGene chr5 21761619 + 101027 graph_last 0 6 caagagctgt 4206 1 Inf 3 0 4 0 NM_023799 refGene chr19 45889195 - 70128 graph_last l 64 233 caagaggcac 4207 1 1.77777777777778 16 9 21 3 genomic chr1 24050576 - 0 unique_long l 8 30 caagatatgg 4208 1 Inf 5 0 7 0 caagattaga 4209 1 Inf 2 0 3 0 caagcaaaac 4210 1 0.666666666666667 4 6 5 2 caagcaaaat 4211 1 Inf 2 0 3 0 caagcaaaca 4212 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_178739 refGene chrX 36106463 + 148205 graph_last 1 7 caagcaagaa 4213 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_177333 refGene chr13 71723237 - 36088 graph_last l 6 31 caagcaagcc 4214 1 1 6 6 8 2 NM_021462 refGene chr10 83030666 - 14117 graph_last l 10 22 caagcacttt 4215 1 Inf 4 0 5 0 caagccacac 4216 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr11 23262580 + 0 unique_long l 5 20 caagccagtc 4217 1 0.666666666666667 4 6 5 2 S66385 knownGene chr16 3552696 - 51052 graph_last l 6 23 caagcgctat 4218 1 Inf 3 0 4 0 NM_025482 refGene chr2 181399879 + 82485 graph_last l 38 91 caagctcatc 4219 1 2.33333333333333 7 3 9 1 caagctgcaa 4220 1 1 3 3 4 1 genomic chr6 32020922 - 0 unique_long l 9 23 caagcttacc 4221 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_020273 refGene chr4 130897543 - 97695 graph_last l 5 13 caagcttctg 4222 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_009383 refGene chr7 120685858 - 125323 graph_last l 10 44 caaggaaatg 4223 1 Inf 2 0 3 0 NM_025544 refGene chr4 125012322 + 97156 graph_last l 28 83 caaggagcta 4224 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_011074 refGene chr5 4789540 - 100191 graph_last l 7 31 caaggatgaa 4225 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_178650 refGene chr19 3999384 - 67381 graph_last l 4 26 caaggctgga 4226 1 Inf 4 0 5 0 NM_138755 refGene chr2 92977579 + 76964 graph_last 0 13 caagggcaaa 4227 1 Inf 4 0 5 0 NM_011789 refGene chr10 82662007 + 14076 graph_second 0 5 caagggccat 4228 1 Inf 4 0 5 0 caaggggaca 4229 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_013922 refGene chr11 50436543 - 19703 graph_last 0 22 caaggtgtga 4230 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_009500 refGene chr2 27531250 - 72998 graph_last l 11 25 caagtcaggg 4231 1 0.5 3 6 4 2 caagtgcact 4232 1 Inf 3 0 4 0 caagtggtac 4233 1 Inf 2 0 3 0 NM_021278 refGene chrX 155230346 + 152783 graph_last l 30 91 caagttcttt 4234 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_145615 refGene chr9 57598110 - 137852 graph_last l 27 59 caagttggtc 4235 1 Inf 5 0 7 0 NM_013668 refGene chrX 139976642 + 152165 graph_last 1 13 caagttgtcc 4236 1 Inf 5 0 7 0 NM_023336 refGene chr2 27714838 - 73019 graph_second l 8 21 caagtttacc 4237 1 0.5 3 6 4 2 NM_007729 refGene chr3 117533442 + 88532 graph_last 2 5 caagttttga 4238 1 Inf 2 0 3 0 NM_175255 refGene chr11 51417047 + 19792 graph_last l 4 67 caataaaaca 4239 1 0.666666666666667 6 9 8 3 caataaagtc 4240 1 Inf 2 0 3 0 caataagaga 4241 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AK019388 knownGene chr13 57917174 - 35327 graph_last l 70 248 caatagaatt 4242 1 0.953488372093023 41 43 54 15 NM_010421 refGene chr9 62025744 + 138265 graph_last 141 536 caatagagac 4243 1 0.930232558139535 40 43 52 15 NM_025446 refGene chr10 13651632 - 10429 graph_last l 21 111 caatcgtgac 4244 1 1.16666666666667 7 6 9 2 BB648566 all_est chr16 78805457 + 55407 graph_last 0 8 caatgcagcc 4245 1 Inf 2 0 3 0 caatgctgcc 4246 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_133215 refGene chr11 87176620 + 22801 graph_last l 15 62 caatgtgctg 4247 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_177821 refGene chr15 83144564 + 48678 graph_last 5 23 caattaaggt 4248 1 1 3 3 4 1 NM_138679 refGene chr3 91188709 + 86759 graph_last l 3 9 caattactcc 4249 1 Inf 3 0 4 0 caattagttg 4250 1 1 3 3 4 1 caattcaaat 4251 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_145517 refGene chr1 54598135 + 2355 graph_last l 5 16 caattcaatt 4252 1 Inf 2 0 3 0 NM_025919 refGene chr4 134829454 - 98114 graph_last 0 4 caatttcttc 4253 1 Inf 2 0 3 0 cacaaaaaaa 4254 1 Inf 2 0 3 0 cacaaaagtc 4255 1 1.58333333333333 19 12 25 4 genomic chr8 127775554 - 0 unique_short s 0 4 cacaaacggc 4256 1 Inf 2 0 3 0 cacaaacggg 4257 1 Inf 2 0 3 0 cacaaagccc 4258 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cacaaatatt 4259 1 Inf 2 0 3 0 cacaacctag 4260 1 Inf 2 0 3 0 NM_029868 refGene chr4 115501615 + 96414 graph_last 2 15 cacaagggaa 4261 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cacaagggtg 4262 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_029935 refGene chr7 124368714 - 125502 graph_last 0 26 cacaaggtct 4263 1 Inf 2 0 3 0 cacaatggta 4264 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cacaatttgg 4265 1 Inf 2 0 3 0 cacacaaaaa 4266 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_017475 refGene chr4 122860410 - 97014 graph_last 0 4 cacacaacaa 4267 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_013847 refGene chr15 80374801 - 48370 graph_last l 5 27 cacacaatcc 4268 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cacacacaaa 4269 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cacacacata 4270 1 0.666666666666667 2 3 2 1 CK371716 all_est chr7 110512608 - 124630 graph_last 0 4 cacacacctt 4271 1 Inf 2 0 3 0 cacacacgca 4272 1 1 3 3 4 1 NM_016862 refGene chr19 55509561 - 70624 graph_last 1 73 cacacactca 4273 1 1.33333333333333 8 6 10 2 cacacagcaa 4274 1 Inf 4 0 5 0 NM_148948 refGene chr12 100223393 - 30856 graph_last l 14 36 cacacagcta 4275 1 Inf 2 0 3 0 NM_145446 refGene chr12 81227257 - 29836 graph_last 0 5 cacacaggag 4276 1 Inf 2 0 3 0 cacacagtac 4277 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_177646 refGene chr1 89884374 - 4476 graph_last 0 22 cacacagtgg 4278 1 0.777777777777778 7 9 9 3 cacacataca 4279 1 Inf 2 0 3 0 cacacatatg 4280 1 Inf 2 0 3 0 AK077185 knownGene chr12 47138536 - 27751 graph_last l 14 43 cacacccttg 4281 1 1.33333333333333 4 3 5 1 cacacgcaca 4282 1 Inf 2 0 3 0 BC030299 all_mrna chr9 16111154 - 135388 graph_last l 6 21 cacactcacc 4283 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_025317 refGene chr10 83636838 - 14185 graph_last l 10 64 cacactcgaa 4284 1 Inf 4 0 5 0 NM_009836 refGene chr3 90467959 + 86658 graph_last 20 143 cacagaacca 4285 1 1.5 18 12 24 4 cacagactca 4286 1 Inf 2 0 3 0 AA838983 all_est chr4_random 7289172 + 100009 graph_last 1 4 cacagagcca 4287 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cacagctatg 4288 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cacaggagag 4289 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cacaggtcag 4290 1 1.22222222222222 11 9 15 3 NM_010754 refGene chr18 76459019 - 66162 graph_last l 2 12 cacaggtggc 4291 1 Inf 3 0 4 0 NM_029870 refGene chr17 26408414 + 58052 graph_last l 15 30 cacaggttac 4292 1 Inf 2 0 3 0 AK035411 all_mrna chrX 88686906 - 150212 graph_second 0 7 cacaggttca 4293 1 Inf 3 0 4 0 NM_144519 refGene chr3 33417331 + 84068 graph_last 0 6 cacagttagt 4294 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008187 refGene chr8 96703922 - 132584 graph_last l 12 39 cacagttgtg 4295 1 0.333333333333333 2 6 3 2 cacataccca 4296 1 Inf 3 0 4 0 cacatagagg 4297 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026000 refGene chr5 122116769 + 106827 graph_last l 4 16 cacatagtac 4298 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cacatcaata 4299 1 2 6 3 8 1 AK017869 knownGene chr5 77473447 + 104074 graph_last l 13 47 cacattaata 4300 1 Inf 4 0 5 0 NM_010569 refGene chr4 48045478 - 93069 graph_last 3 21 cacattcatt 4301 1 0.666666666666667 2 3 2 1 caccaaaaaa 4302 1 Inf 2 0 3 0 caccaacata 4303 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_172501 refGene chr3 54857447 - 84966 graph_last 1 5 caccaactgc 4304 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_175199 refGene chr19 58731940 - 70868 graph_last l 27 46 caccaatata 4305 1 Inf 2 0 3 0 caccaccact 4306 1 1.66666666666667 5 3 6 1 AK090280 knownGene chr2 152835364 + 80332 graph_last 0 3 caccacctat 4307 1 Inf 2 0 3 0 NM_016700 refGene chr14 27895234 - 40299 graph_last l 13 59 caccactggg 4308 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_009125 refGene chr5 120516209 - 106649 graph_last 0 7 caccaggccc 4309 1 Inf 2 0 3 0 NM_175394 refGene chr17 13124041 + 57142 graph_last 3 14 caccattcag 4310 1 0.333333333333333 2 6 3 2 caccccaccc 4311 1 1.33333333333333 4 3 5 1 cacccccaag 4312 1 0.833333333333333 5 6 6 2 genomic chr17 34242979 + 0 unique_long l 7 16 cacccccacc 4313 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011049 refGene chrX 19250049 + 147565 graph_last 9 35 caccccgact 4314 1 Inf 3 0 4 0 NM_026422 refGene chr2 36462206 + 73733 graph_last l 2 11 cacccgaggc 4315 1 Inf 5 0 6 0 NM_145516 refGene chr1 35567557 + 1446 graph_last l 104 173 caccctctca 4316 1 Inf 3 0 4 0 BC021509 knownGene chr5 129833375 - 107354 graph_second 0 6 caccgaagag 4317 1 Inf 5 0 6 0 NM_011624 refGene chr16 16496452 + 51849 graph_last b 5 28 caccgaggtg 4318 1 1 3 3 4 1 NM_027629 refGene chr7 92441942 + 123455 graph_last l 36 59 caccgtaatg 4319 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_025729 refGene chrX 75432564 + 149705 graph_last l 5 17 caccgtccaa 4320 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_175400 refGene chr2 4827980 + 71584 graph_last 1 8 cacctagcaa 4321 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008956 refGene chr10 82168653 - 14002 graph_last l 7 50 cacctcacca 4322 1 0.666666666666667 8 12 10 4 NM_019765 refGene chr5 122624954 - 106888 graph_last l 27 48 cacctccacg 4323 1 0.5 3 6 4 2 NM_026615 refGene chr2 30119407 + 73192 graph_last l 8 22 cacctcgtgg 4324 1 Inf 2 0 3 0 NM_172146 refGene chr5 77440850 + 104071 graph_last l 23 97 cacctgcttt 4325 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_028184 refGene chr7 136773177 - 126351 graph_last l 6 18 cacctggcct 4326 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_173429 refGene chr6 49045541 + 112534 graph_last l 13 31 cacctgggta 4327 1 0.666666666666667 2 3 3 1 genomic chr4 123813560 - 0 unique_long l 10 28 caccttactt 4328 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AV159709 all_est chr7 37289848 + 120669 graph_last l 24 73 caccttgagt 4329 1 0.888888888888889 8 9 10 3 NM_023644 refGene chr3 36912087 - 84230 graph_last l 5 16 cacctttagt 4330 1 Inf 3 0 4 0 NM_176841 refGene chr11 29409040 + 18533 graph_last l 3 17 cacgacaaga 4331 1 Inf 3 0 4 0 cacgaccatc 4332 1 Inf 2 0 3 0 NM_178641 refGene chr7 120901504 - 125346 graph_last l 8 25 cacgagaact 4333 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_008442 refGene chr13 105562255 + 37763 graph_last 2 10 cacgcaaagg 4334 1 0.666666666666667 2 3 2 1 genomic chr12_random 718993 + 0 unique_long l 4 21 cacgcccaag 4335 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_025396 refGene chr8 71933405 + 131081 graph_last l 28 185 cacgccgtgg 4336 1 1.66666666666667 10 6 13 2 cacgctcccg 4337 1 1.5 30 20 39 7 NM_019806 refGene chr2 174208871 + 81933 graph_last l 9 18 cacgctctac 4338 1 Inf 2 0 3 0 NM_009729 refGene chr17 23758121 - 57778 graph_last 31 76 cacgggcagc 4339 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_177215 refGene chrX 39285082 + 148272 graph_last l 12 41 cacgtagtgc 4340 1 0.444444444444444 4 9 5 3 genomic chr7 116527956 + 0 unique_long l 10 24 cacgtatgtt 4341 1 Inf 2 0 3 0 NM_178647 refGene chr16 65580084 + 54799 graph_last l 2 23 cacgtatttt 4342 1 1.66666666666667 5 3 6 1 cactaaggct 4343 1 1 3 3 4 1 NM_008020 refGene chr19 6971219 - 67714 graph_last 58 155 cactacacgg 4344 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_007896 refGene chr2 154393532 - 80505 graph_last 0 9 cactacataa 4345 1 Inf 3 0 4 0 NM_153555 refGene chr1 176055693 - 8542 graph_last l 26 51 cactactgag 4346 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cactagcctg 4347 1 Inf 2 0 3 0 cactagtttg 4348 1 Inf 2 0 3 0 cactcacgca 4349 1 2 6 3 8 1 NM_009282 refGene chr9 103386303 + 140777 graph_last 0 6 cactcagtat 4350 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_134135 refGene chr10 83399818 - 14154 graph_last l 26 43 cactccagat 4351 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_008872 refGene chr8 21640524 + 128550 graph_last 5 42 cactccccat 4352 1 0.666666666666667 2 3 3 1 genomic chr1 176054143 + 0 unique_long l 30 76 cactctggaa 4353 1 Inf 3 0 4 0 cactcttcta 4354 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cactgaactg 4355 1 2.66666666666667 8 3 11 1 cactgacagt 4356 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_172379 refGene chr14 15268275 - 39407 graph_last 12 50 cactgacgag 4357 1 3 9 3 12 1 NM_026374 refGene chr3 93181082 - 86978 graph_last l 4 13 cactgagctc 4358 1 Inf 5 0 6 0 NM_008235 refGene chr16 29774870 + 52697 graph_last 2 15 cactgcattt 4359 1 Inf 2 0 3 0 NM_008775 refGene chr9 47725036 - 137254 graph_last l 10 31 cactgccgtc 4360 1 Inf 2 0 3 0 NM_016793 refGene chr7 10300284 - 118858 graph_last 0 2 cactgcgtag 4361 1 Inf 2 0 3 0 NM_013540 refGene chr3 82524914 + 86190 graph_last l 8 28 cactgctttg 4362 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_008163 refGene chr11 115151099 + 25117 graph_last 3 21 cactggacag 4363 1 Inf 5 0 6 0 NM_019817 refGene chr15_random 21717553 - 50853 graph_last l 76 148 cactggctga 4364 1 1.22222222222222 11 9 15 3 NM_145138 refGene chr12 81290133 - 29841 graph_last 9 36 cactgggttg 4365 1 Inf 3 0 4 0 NM_008577 refGene chr19 8598528 - 67867 graph_last l 6 34 cactgtcttc 4366 1 Inf 3 0 4 0 NM_025347 refGene chr7_random 37896566 - 127287 graph_second l 4 10 cactgtgacc 4367 1 Inf 3 0 4 0 NM_007754 refGene chr11 76349856 - 21772 graph_last l 7 20 cactgtgcct 4368 1 Inf 2 0 3 0 NM_080465 refGene chr18 46175703 + 64548 graph_last l 23 41 cacttcaaac 4369 1 Inf 5 0 7 0 NM_026452 refGene chr8 96138183 + 132532 graph_last l 47 115 cacttcagga 4370 1 Inf 3 0 4 0 cacttgtaat 4371 1 0.5 3 6 4 2 NM_007936 refGene chr1 79107316 - 3765 graph_last l 5 20 cactttaatt 4372 1 Inf 4 0 5 0 cactttatta 4373 1 Inf 2 0 3 0 cactttcttg 4374 1 Inf 4 0 5 0 cactttgtgt 4375 1 Inf 3 0 4 0 cacttttatc 4376 1 Inf 2 0 3 0 NM_153457 refGene chr12 68119077 + 28767 graph_last l 53 116 cacttttttt 4377 1 Inf 3 0 4 0 cagaaacagg 4378 1 0.833333333333333 5 6 6 2 cagaaagccc 4379 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr6 126667416 - 0 unique_long l 4 13 cagaaagggt 4380 1 Inf 2 0 3 0 NM_008809 refGene chr18 61208902 + 65256 graph_last 0 6 cagaaatgct 4381 1 Inf 2 0 3 0 cagaacagct 4382 1 Inf 2 0 3 0 cagaagaaaa 4383 1 Inf 5 0 6 0 NM_025364 refGene chr10 132110957 + 16863 graph_last l 2 11 cagaagaaga 4384 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_019391 refGene chr7 134518182 + 126183 graph_last 0 9 cagaagacag 4385 1 Inf 4 0 5 0 cagaagatgt 4386 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008817 refGene chr7 6528153 + 118679 graph_last l 18 67 cagaagcttt 4387 1 0.5 3 6 4 2 NM_016876 refGene chr9 21445830 - 135590 graph_second l 4 9 cagaaggagc 4388 1 Inf 2 0 3 0 cagaaggcct 4389 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_024451 refGene chr5 137194397 + 107976 graph_last l 21 47 cagaagtcag 4390 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_177379 refGene chr9 32958080 + 136212 graph_last l 33 60 cagaatgagc 4391 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AF245444 knownGene chr4 124671216 + 97143 graph_last 1 16 cagaatttct 4392 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cagacaaaac 4393 1 1.66666666666667 5 3 7 1 cagacaaagc 4394 1 1 6 6 8 2 NM_010597 refGene chr3 66953051 + 85543 graph_second 0 2 cagacaagca 4395 1 Inf 2 0 3 0 cagacacaaa 4396 1 Inf 3 0 4 0 cagacagaac 4397 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_011714 refGene chr5 134074286 - 107673 graph_last l 3 13 cagacagatg 4398 1 Inf 2 0 3 0 NM_172536 refGene chr9 68171208 - 138745 graph_last 0 6 cagacctcag 4399 1 Inf 5 0 6 0 NM_016862 refGene chr19 55508522 - 70624 graph_last l 8 24 cagactaaac 4400 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_007481 refGene chr12 65256843 + 28541 graph_last l 26 70 cagactatgt 4401 1 Inf 3 0 4 0 cagactgctc 4402 1 0.695652173913043 16 23 21 8 NM_007880 refGene chr10 82257612 + 14018 graph_last 1 6 cagactggag 4403 1 1 3 3 4 1 AK129101 knownGene chr1 156265546 + 7258 graph_last 0 36 cagactgggg 4404 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_009976 refGene chr2 149268267 - 80122 graph_last l 47 71 cagactgttc 4405 1 Inf 4 0 5 0 NM_033134 refGene chr2 26663621 + 72943 graph_last l 27 60 cagacttctt 4406 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_023595 refGene chr2 125512553 + 78807 graph_last l 26 60 cagacttggt 4407 1 0.666666666666667 4 6 5 2 cagacttgtt 4408 1 1 3 3 4 1 NM_178716 refGene chr13 97285317 - 37271 graph_last l 9 28 cagagaatat 4409 1 1 3 3 4 1 cagagacagc 4410 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BB341914 all_est chr5 130656491 - 107421 graph_second 0 3 cagagcaaac 4411 1 Inf 2 0 3 0 NM_008641 refGene chr4 115215494 - 96387 graph_last l 13 76 cagagcccac 4412 1 0.888888888888889 8 9 11 3 cagagcctga 4413 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cagagctccc 4414 1 0.916666666666667 11 12 14 4 cagagctctt 4415 1 Inf 3 0 4 0 NM_182997 refGene chr3 100559517 + 87557 graph_last l 11 25 cagagctgct 4416 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_133756 refGene chr15 55119216 - 47000 graph_last 0 11 cagaggacat 4417 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_178576 refGene chr5 144183355 - 108464 graph_last l 5 26 cagaggccgc 4418 1 2.33333333333333 7 3 9 1 cagaggctgg 4419 1 Inf 2 0 3 0 NM_145353 refGene chr17 45643553 + 59546 graph_last l 12 49 cagagggtcc 4420 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AK129478 knownGene chr15 98385411 - 49699 graph_last l 7 13 cagagttacc 4421 1 Inf 2 0 3 0 NM_133869 refGene chr3 109640683 - 88149 graph_last l 17 52 cagataatgt 4422 1 0.666666666666667 2 3 2 1 genomic chr3 98860811 + 0 unique_long l 6 18 cagatactgt 4423 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cagatagata 4424 1 0.666666666666667 2 3 3 1 genomic chr1 136569374 + 0 unique_long l 13 33 cagataggaa 4425 1 Inf 2 0 3 0 cagatcaaga 4426 1 Inf 3 0 4 0 NM_018882 refGene chr8 96314887 - 132554 graph_last l 5 19 cagatcccga 4427 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_144517 refGene chr5 18158039 - 100799 graph_last l 4 25 cagatcccta 4428 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_028816 refGene chr7 118379509 - 125080 graph_last l 10 35 cagatcgtgt 4429 1 Inf 2 0 3 0 cagatctgaa 4430 1 1.33333333333333 4 3 5 1 cagatcttcg 4431 1 1.33333333333333 8 6 10 2 cagatgatgc 4432 1 Inf 3 0 4 0 NM_010611 refGene chr2 180923686 - 82446 graph_last l 71 158 cagatggttc 4433 1 1 6 6 8 2 NM_011170 refGene chr2 132080703 - 79291 graph_last l 47 76 cagattcaaa 4434 1 Inf 2 0 3 0 NM_029166 refGene chr10 92173298 + 14741 graph_last l 5 36 cagattgctg 4435 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_019773 refGene chrX 154481207 - 152754 graph_last 34 53 cagatttggg 4436 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_175335 refGene chr12 87067123 - 30264 graph_last l 6 32 cagattttaa 4437 1 Inf 3 0 4 0 cagcaacctt 4438 1 1.22222222222222 11 9 14 3 NM_008692 refGene chr4 119862874 + 96803 graph_last l 6 19 cagcaacgga 4439 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cagcaatctc 4440 1 1.22222222222222 11 9 14 3 NM_172584 refGene chr12 98310463 + 30755 graph_last 0 12 cagcacacaa 4441 1 Inf 4 0 5 0 AK077458 knownGene chr7 5711535 - 118653 graph_last 0 4 cagcaccagc 4442 1 Inf 2 0 3 0 NM_010119 refGene chr19 6345108 + 67664 graph_last 1 11 cagcacgaca 4443 1 Inf 2 0 3 0 BY528042 all_est chr14 43752545 + 41143 graph_last l 2 23 cagcacgctg 4444 1 0.333333333333333 2 6 3 2 cagcactgga 4445 1 Inf 2 0 3 0 NM_178694 refGene chr2 30371895 - 73220 graph_last l 34 102 cagcacttgg 4446 1 0.416666666666667 5 12 6 4 AK129093 knownGene chr6 35185790 + 111662 graph_last 1 11 cagcagattt 4447 1 Inf 4 0 5 0 NM_007988 refGene chr11 120358934 - 25618 graph_last 1 6 cagcagtaga 4448 1 Inf 2 0 3 0 NM_177622 refGene chr13 65410048 - 35834 graph_last 0 7 cagcagtgac 4449 1 Inf 2 0 3 0 cagcatacag 4450 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_013685 refGene chr18 70038308 + 65838 graph_last 0 8 cagcattgcc 4451 1 Inf 3 0 4 0 cagccaaatt 4452 1 Inf 3 0 4 0 cagccaaccc 4453 1 Inf 2 0 3 0 NM_024471 refGene chr5 64707758 + 103285 graph_last l 3 22 cagccaacga 4454 1 2 6 3 8 1 cagccacaca 4455 1 1 3 3 4 1 NM_010471 refGene chr4 128025000 - 97422 graph_last l 236 663 cagccacacg 4456 1 0.5 3 6 4 2 genomic chr4 129240676 - 0 unique_long l 22 104 cagccaggtg 4457 1 1.11111111111111 10 9 13 3 cagccagtga 4458 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_010597 refGene chr3 66950838 - 85543 graph_last l 67 141 cagccagtgt 4459 1 1.5 9 6 12 2 NM_054040 refGene chr17 3136310 - 56519 graph_last 1 7 cagcccaaaa 4460 1 Inf 3 0 4 0 NM_008854 refGene chr8 84858616 + 131766 graph_second 6 15 cagccctacc 4461 1 Inf 3 0 4 0 NM_178597 refGene chr14 15621704 - 39454 graph_last l 61 164 cagccctccc 4462 1 0.888888888888889 8 9 11 3 NM_138651 refGene chr2 132454242 + 79335 graph_last l 58 154 cagcctcagc 4463 1 Inf 5 0 7 0 cagcctgagc 4464 1 Inf 2 0 3 0 NM_175530 refGene chr7 16025872 - 119249 graph_last 1 11 cagcgccttg 4465 1 1.66666666666667 5 3 6 1 BQ084646 all_est chr5 32486158 + 101834 graph_last l 45 248 cagcgcgccc 4466 1 1.31034482758621 38 29 49 10 cagcgttgca 4467 1 Inf 3 0 4 0 NM_025668 refGene chr7 91901674 + 123410 graph_last l 43 101 cagcgtttga 4468 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_025514 refGene chr10 61850104 + 12754 graph_last l 3 13 cagctcacag 4469 1 Inf 2 0 3 0 NM_025974 refGene chr9 122956008 + 142184 graph_second 0 9 cagctcactg 4470 1 Inf 2 0 3 0 NM_019689 refGene chr9 60035936 + 138095 graph_last l 21 56 cagctcttgg 4471 1 2.33333333333333 7 3 9 1 cagctgacac 4472 1 1.66666666666667 5 3 6 1 genomic chr7 57187756 + 0 unique_long l 35 88 cagctgaccc 4473 1 3.33333333333333 10 3 13 1 NM_013671 refGene chr17 13082834 - 57140 graph_last l 33 53 cagctgcacc 4474 1 1 3 3 4 1 cagctgcatc 4475 1 1.66666666666667 5 3 6 1 cagctggcca 4476 1 Inf 4 0 5 0 cagctggtag 4477 1 1 3 3 4 1 NM_009333 refGene chr19 55920594 + 70663 graph_last 4 16 cagctgtacc 4478 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_080855 refGene chr8 123444312 + 134051 graph_last l 74 186 cagctgtctt 4479 1 0.65 13 20 17 7 NM_133994 refGene chr10 77975659 - 13696 graph_last 1 18 cagcttcgaa 4480 1 Inf 3 0 4 0 cagcttgaca 4481 1 Inf 3 0 4 0 NM_009790 refGene chr12 95768593 + 30604 graph_last l 111 171 cagcttgatg 4482 1 Inf 2 0 3 0 cagcttgtgt 4483 1 0.833333333333333 5 6 7 2 cagctttgct 4484 1 1.33333333333333 12 9 16 3 caggaaagtg 4485 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_009048 refGene chr10 18848638 + 10646 graph_last l 2 18 caggaaatgg 4486 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr10 96349474 - 0 unique_long l 7 16 caggaacaaa 4487 1 0.666666666666667 2 3 3 1 caggacactg 4488 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_183216 refGene chr19 44405963 + 70020 graph_last l 282 1147 caggactccg 4489 1 0.745454545454545 41 55 53 19 NM_010327 refGene chr16 18227773 - 52048 graph_last l 6 31 caggagatgt 4490 1 0.888888888888889 8 9 11 3 caggagcggc 4491 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_007952 refGene chr2 121703941 + 78601 graph_last 33 160 caggaggagt 4492 1 0.588235294117647 10 17 13 6 NM_011531 refGene chr1 135390859 + 6259 graph_second l 4 8 caggagtcct 4493 1 Inf 3 0 4 0 genomic chr14 40764448 - 0 unique_long l 13 41 caggagtctt 4494 1 0.666666666666667 4 6 5 2 AK008777 knownGene chr1 75820545 + 3596 graph_last 22 37 caggagttca 4495 1 Inf 2 0 3 0 caggcaaaaa 4496 1 0.666666666666667 6 9 8 3 caggcaaaac 4497 1 0.916666666666667 11 12 14 4 caggcaaaat 4498 1 Inf 5 0 6 0 caggcaaaca 4499 1 Inf 2 0 3 0 caggcaagac 4500 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026342 refGene chr11 57081259 - 20142 graph_last l 10 24 caggcacatc 4501 1 Inf 3 0 4 0 caggcagaac 4502 1 1.33333333333333 8 6 11 2 caggccaaac 4503 1 0.333333333333333 2 6 3 2 caggcccaaa 4504 1 Inf 5 0 6 0 caggccccaa 4505 1 Inf 2 0 3 0 caggcgaaca 4506 1 Inf 2 0 3 0 NM_025654 refGene chr11 101299916 + 23997 graph_last 1 9 caggcgtccc 4507 1 Inf 2 0 3 0 NM_009327 refGene chr5 113995054 + 106166 graph_last l 152 294 caggcttggg 4508 1 0.647058823529412 11 17 15 6 AK005166 knownGene chr9 111416979 + 141435 graph_last l 8 39 caggcttgtg 4509 1 0.888888888888889 8 9 11 3 BC037681 knownGene chr10 82339600 - 14031 graph_last l 47 102 cagggaaacc 4510 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_009681 refGene chr18 44969561 + 64486 graph_last l 24 50 cagggaatag 4511 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026772 refGene chr19 5963319 + 67624 graph_second 0 24 cagggacagc 4512 1 2 6 3 8 1 cagggactga 4513 1 Inf 5 0 6 0 cagggagggt 4514 1 0.444444444444444 4 9 5 3 cagggatgtt 4515 1 Inf 2 0 3 0 cagggcaggg 4516 1 1.66666666666667 5 3 6 1 cagggccttg 4517 1 Inf 2 0 3 0 NM_145836 refGene chr12 83111127 - 29976 graph_last 5 33 cagggcgaaa 4518 1 Inf 5 0 6 0 NM_178757 refGene chr7 15888954 + 119232 graph_last l 8 53 cagggcgaga 4519 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_172584 refGene chr12 98119016 - 30755 graph_last l 24 54 caggggcatc 4520 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_173439 refGene chr16 31942436 - 52908 graph_last 4 21 caggggtgga 4521 1 Inf 5 0 7 0 cagggtctgc 4522 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AA270490 all_est chr11 82981326 + 22365 graph_last l 56 182 cagggtctgg 4523 1 Inf 5 0 6 0 NM_011065 refGene chr11 68677618 + 20982 graph_last 0 5 cagggtgagc 4524 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_009536 refGene chr11 75330685 + 21637 graph_last 37 82 cagggtgatg 4525 1 Inf 4 0 5 0 genomic chr9 22639796 + 0 unique_long l 2 11 cagggtgggg 4526 1 Inf 2 0 3 0 caggtaaagc 4527 1 Inf 2 0 3 0 caggtattaa 4528 1 0.666666666666667 2 3 2 1 caggtcatta 4529 1 Inf 2 0 3 0 NM_011155 refGene chr7 14065982 + 119130 graph_last l 2 11 caggtgaagg 4530 1 Inf 3 0 4 0 caggtgagcg 4531 1 1.75 21 12 28 4 NM_029657 refGene chr16 4422071 - 51142 graph_last l 12 34 caggtgccat 4532 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_153420 refGene chr9 99223492 - 140561 graph_last 1 6 caggtgggtt 4533 1 0.666666666666667 2 3 2 1 caggtgtcca 4534 1 0.5 3 6 4 2 NM_177296 refGene chr6 29392712 - 111132 graph_last 19 58 caggttgaca 4535 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_025998 refGene chr4_random 10334812 + 100058 graph_last l 13 170 caggttggtt 4536 1 1.07142857142857 15 14 19 5 NM_181778 refGene chr17 24860742 - 57885 graph_last l 3 12 cagtaactca 4537 1 0.666666666666667 4 6 5 2 AK045717 all_mrna chr12 23115087 + 26743 graph_second 0 5 cagtacacag 4538 1 Inf 2 0 3 0 NM_025483 refGene chr16 56624392 + 54440 graph_last l 3 6 cagtatgaat 4539 1 Inf 2 0 3 0 NM_177613 refGene chr11 93798301 + 23199 graph_last 0 2 cagtattcta 4540 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr13 15850222 + 0 unique_long l 8 16 cagtcaatac 4541 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_148941 refGene chr9 86536290 - 139950 graph_last l 17 38 cagtcaccaa 4542 1 1.66666666666667 5 3 7 1 cagtcagcac 4543 1 1 6 6 8 2 NM_028710 refGene chr11 109237496 - 24794 graph_last l 5 16 cagtctaaaa 4544 1 Inf 2 0 3 0 cagtctctca 4545 1 1.09375 70 64 92 22 cagtctcttg 4546 1 Inf 2 0 3 0 NM_008449 refGene chr2 50107390 - 74424 graph_last l 31 65 cagtctgcca 4547 1 Inf 5 0 6 0 cagtgaaaaa 4548 1 1.33333333333333 4 3 5 1 AK129204 knownGene chr6 72554823 - 113768 graph_last l 8 28 cagtgaaaga 4549 1 Inf 4 0 5 0 NM_183106 refGene chr2 95028222 + 77131 graph_second 0 10 cagtgattct 4550 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cagtgatttc 4551 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_027274 refGene chr1 160644022 - 7588 graph_last 1 14 cagtgcagtg 4552 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_139304 refGene chr3 92770972 + 86909 graph_last 1 12 cagtgcctgt 4553 1 Inf 3 0 4 0 NM_027807 refGene chr9 55673597 - 137719 graph_last l 6 27 cagtggaaag 4554 1 Inf 2 0 3 0 NM_133789 refGene chr7 13884301 + 119095 graph_second 1 8 cagtggcctg 4555 1 Inf 5 0 7 0 BG090465 all_est chr7 32518984 - 120407 graph_last 0 3 cagtgggaag 4556 1 Inf 2 0 3 0 cagtgtacaa 4557 1 Inf 2 0 3 0 NM_007563 refGene chr6 34447393 + 111586 graph_last l 9 31 cagtgtgttc 4558 1 1 3 3 4 1 NM_133706 refGene chr11 78112829 + 21959 graph_last l 48 95 cagtgttacg 4559 1 1.33333333333333 4 3 5 1 cagttacatc 4560 1 2 6 3 8 1 NM_026493 refGene chr1 10136177 - 322 graph_last l 2 7 cagttagttg 4561 1 Inf 2 0 3 0 NM_008410 refGene chr14 64927587 - 42663 graph_last l 251 380 cagttataaa 4562 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_175752 refGene chr2 74006713 - 75776 graph_last 141 321 cagttattaa 4563 1 Inf 3 0 4 0 NM_008302 refGene chr17 44961714 + 59486 graph_last l 22 55 cagttcccct 4564 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_027151 refGene chr10 130559628 + 16681 graph_last l 49 242 cagttcccgt 4565 1 1.11764705882353 19 17 25 6 cagttctggc 4566 1 1.33333333333333 4 3 5 1 cagttcttga 4567 1 Inf 4 0 5 0 cagttgaagg 4568 1 0.666666666666667 8 12 11 4 NM_022882 refGene chr17 71658175 + 60980 graph_last l 5 19 cagttgatag 4569 1 Inf 4 0 5 0 NM_010894 refGene chr2 79814959 - 76114 graph_last l 7 44 cagttgcaat 4570 1 3.33333333333333 10 3 13 1 NM_007626 refGene chr15 105222880 - 50346 graph_last l 18 112 cagttgggtt 4571 1 0.8 16 20 21 7 cagttggttc 4572 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_144922 refGene chr7 20262073 + 119546 graph_last 15 64 cagttggttg 4573 1 2 6 3 8 1 NM_016792 refGene chr18 63768936 - 65404 graph_last l 103 198 cagttgtaaa 4574 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_175211 refGene chr2 33405962 - 73513 graph_last l 20 49 cagttgtgtg 4575 1 Inf 5 0 6 0 cagtttatgt 4576 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_028487 refGene chr13 110215403 - 38061 graph_last l 9 37 cagtttgggg 4577 1 Inf 4 0 5 0 NM_030886 refGene chr5 90741312 + 104585 graph_last l 5 15 cagttttccc 4578 1 1 3 3 4 1 cataaaaata 4579 1 Inf 2 0 3 0 cataaactgt 4580 1 Inf 5 0 6 0 genomic chr6 51937178 - 0 unique_long l 9 18 cataaatatg 4581 1 Inf 5 0 6 0 NM_027287 refGene chr3 156149077 - 90410 graph_last 0 6 cataagaaaa 4582 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cataaggata 4583 1 0.833333333333333 10 12 13 4 NM_133887 refGene chr4 131739931 - 97798 graph_last l 33 97 cataagtttc 4584 1 0.888888888888889 8 9 11 3 cataatgaat 4585 1 0.666666666666667 2 3 2 1 catacacaca 4586 1 Inf 2 0 3 0 AK044572 all_mrna chr5 17279210 + 100753 graph_last 0 6 catacacaga 4587 1 Inf 2 0 3 0 NM_054072 refGene chr18 37303742 + 64094 graph_last l 21 50 catacagtga 4588 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_139237 refGene chr4 41162047 - 92438 graph_last l 27 75 cataccagta 4589 1 0.416666666666667 5 12 7 4 NM_028071 refGene chr8 121589760 - 133927 graph_second 1 7 cataccatct 4590 1 Inf 2 0 3 0 catacctgaa 4591 1 1.66666666666667 15 9 19 3 NM_010308 refGene chr8 95252348 + 132442 graph_last l 3 30 catacctgac 4592 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_133933 refGene chr6 89552164 - 114764 graph_last l 15 37 catacgctca 4593 1 Inf 2 0 3 0 NM_144846 refGene chr15 65245115 + 47497 graph_last l 3 16 catacgtaat 4594 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_007705 refGene chr10 82480982 + 14053 graph_last l 26 87 catactccat 4595 1 1.33333333333333 8 6 10 2 NM_173788 refGene chr4 42940908 + 92665 graph_last l 10 16 catagacaca 4596 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cataggaaag 4597 1 Inf 2 0 3 0 catagtttaa 4598 1 0.583333333333333 7 12 9 4 NM_145599 refGene chr8 78222701 - 131420 graph_last 1 9 catatatttg 4599 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr17 66117569 - 0 unique_long l 10 17 catatcccca 4600 1 1 3 3 4 1 NM_013663 refGene chr17 28687262 + 58322 graph_last 29 68 catatccttt 4601 1 0.416666666666667 5 12 7 4 NM_198628 refGene chr2 27222712 - 72969 graph_last 8 19 catatgatga 4602 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_130447 refGene chr6 136139496 - 117512 graph_second 0 5 catatgcaca 4603 1 Inf 2 0 3 0 catatgtatg 4604 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AK089550 knownGene chr9 71330656 + 138996 graph_last 1 12 catatgtgtg 4605 1 Inf 2 0 3 0 NM_009822 refGene chr4 13839366 + 91400 graph_last 1 19 catattgctg 4606 1 1.66666666666667 5 3 6 1 AK012247 knownGene chr17 88203934 + 61969 graph_last 7 32 catatttttt 4607 1 Inf 2 0 3 0 catcaatgga 4608 1 Inf 2 0 3 0 catcacacaa 4609 1 0.666666666666667 2 3 2 1 catcacaccc 4610 1 Inf 2 0 3 0 NM_008442 refGene chr13 105561684 + 37763 graph_last 3 7 catcagaagc 4611 1 Inf 2 0 3 0 NM_019913 refGene chr15 79260523 - 48292 graph_last l 17 97 catcagcctc 4612 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_172381 refGene chr4 58552705 - 93579 graph_last l 15 59 catcattccg 4613 1 Inf 3 0 4 0 NM_053078 refGene chr18 33627012 + 63718 graph_last l 3 36 catcattggt 4614 1 0.5 3 6 4 2 catccaaaca 4615 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_053268 refGene chr9 98937492 - 140529 graph_last l 6 11 catccagccc 4616 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008517 refGene chr10 95866812 + 14944 graph_last l 15 56 catcccgtga 4617 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_177727 refGene chr2 179846426 + 82345 graph_last l 26 91 catcctctga 4618 1 0.647058823529412 11 17 14 6 NM_021273 refGene chr12 107236718 - 31356 graph_last l 1098 2751 catccttgat 4619 1 0.81578947368421 31 38 41 13 catccttgcc 4620 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_027242 refGene chr5 136222832 + 107903 graph_last l 7 46 catcggatgc 4621 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_010026 refGene chr15_random 2056594 + 50468 graph_last 0 47 catctagacg 4622 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_011294 refGene chr15 12133698 - 45363 graph_last l 13 70 catctagtga 4623 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_010310 refGene chr2 174704950 + 81983 graph_second 15 26 catctccgcc 4624 1 Inf 3 0 4 0 NM_028746 refGene chr4 19925510 + 91629 graph_second 0 2 catctggagt 4625 1 Inf 2 0 3 0 catcttcgcc 4626 1 1.66666666666667 10 6 13 2 NM_025847 refGene chr14 25659748 + 40115 graph_last l 10 17 cattaatttt 4627 1 0.666666666666667 2 3 3 1 Z36397 all_est chr15_random 6842823 - 50572 graph_last l 32 93 cattactcgt 4628 1 0.647058823529412 11 17 15 6 cattactgtc 4629 1 0.75 9 12 12 4 NM_018740 refGene chr11 69561848 + 21096 graph_last 25 61 cattataact 4630 1 1 3 3 4 1 NM_009810 refGene chr8 46497784 + 129758 graph_last 0 6 cattatagct 4631 1 Inf 3 0 4 0 cattcacccc 4632 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_177835 refGene chr1 55949983 - 2415 graph_last 4 20 cattcagatg 4633 1 Inf 3 0 4 0 NM_028099 refGene chr6 87352539 - 114535 graph_last l 6 16 cattctgaac 4634 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_007982 refGene chr15 74900345 - 47926 graph_last l 7 26 cattctgtta 4635 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_023130 refGene chr2 155492314 + 80608 graph_last l 18 107 cattcttcct 4636 1 3 9 3 12 1 cattgccttc 4637 1 3 9 3 12 1 NM_172990 refGene chr4 153094024 + 99705 graph_last 0 10 cattgctgcg 4638 1 Inf 3 0 4 0 genomic chr11 106876074 + 0 unique_long l 12 45 cattgtctga 4639 1 Inf 4 0 5 0 cattgtgtgg 4640 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_023324 refGene chr11 21048765 - 18098 graph_last 2 7 catttcctga 4641 1 0.666666666666667 2 3 2 1 catttcttac 4642 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_177214 refGene chr2 127492860 + 78926 graph_last l 3 11 catttgctag 4643 1 0.666666666666667 2 3 3 1 catttgttaa 4644 1 Inf 3 0 4 0 NM_021886 refGene chr13 99191319 - 37433 graph_last 0 4 cattttactt 4645 1 0.666666666666667 2 3 2 1 genomic chr12 103766563 + 0 unique_long l 6 46 cattttgttt 4646 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_013502 refGene chr5 31624409 - 101779 graph_last l 2 24 ccaaaattag 4647 1 Inf 3 0 4 0 NM_009548 refGene chr11 61020026 - 20524 graph_last l 112 164 ccaaagaacc 4648 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011297 refGene chr13_random 1841651 - 38627 graph_last 3 17 ccaaagccag 4649 1 Inf 3 0 4 0 NM_010699 refGene chr7 39739679 + 120908 graph_last 230 648 ccaaataaaa 4650 1 1.11538461538462 29 26 38 9 NM_008543 refGene chr18 75443166 + 66105 graph_last 2 12 ccaaattaaa 4651 1 Inf 2 0 3 0 ccaacactga 4652 1 1 26 26 34 9 ccaaccaagt 4653 1 Inf 2 0 3 0 NM_172804 refGene chr12 70096652 + 28903 graph_last l 27 60 ccaaccacat 4654 1 0.5 3 6 4 2 NM_017402 refGene chr8 12549021 + 128028 graph_last l 10 44 ccaaccccca 4655 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_198006 refGene chr1 38115320 - 1589 graph_last l 17 67 ccaacgccac 4656 1 1.33333333333333 4 3 5 1 ccaactgtag 4657 1 Inf 4 0 5 0 NM_181421 refGene chr5 120108704 + 106603 graph_last l 2 50 ccaactgtcg 4658 1 1.66666666666667 5 3 7 1 ccaactttca 4659 1 Inf 2 0 3 0 ccaagaatct 4660 1 0.785714285714286 11 14 15 5 ccaagattgt 4661 1 2 6 3 8 1 BG091334 all_est chr15_random 26269772 - 50943 graph_last l 8 33 ccaaggacag 4662 1 1.16666666666667 7 6 9 2 ccaagggact 4663 1 Inf 2 0 3 0 BC054112 knownGene chr1 85865443 + 4092 graph_last 0 32 ccaaggggga 4664 1 Inf 2 0 3 0 NM_182990 refGene chr2 85413222 + 76355 graph_last l 26 72 ccaagtcagg 4665 1 1.5 9 6 12 2 ccaagtgaca 4666 1 1 3 3 4 1 NM_153542 refGene chr10 63471892 + 12871 graph_last l 5 26 ccaagtgggg 4667 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_146259 refGene chr7 120009577 - 125268 graph_second 0 5 ccaagttggt 4668 1 Inf 2 0 3 0 NM_019743 refGene chr6 101888728 + 115566 graph_last 0 3 ccaataacag 4669 1 Inf 2 0 3 0 NM_172412 refGene chr5 136731881 + 107954 graph_last 0 12 ccaatagtac 4670 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_008891 refGene chr12 54451134 + 28226 graph_last l 8 36 ccaatctgtg 4671 1 1.83333333333333 11 6 14 2 NM_027275 refGene chr6 72840232 + 113806 graph_last 32 87 ccaatgaact 4672 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_008854 refGene chr8 84858879 + 131766 graph_last l 13 44 ccaattgtcc 4673 1 0.5 3 6 4 2 ccaatttaca 4674 1 0.555555555555556 5 9 6 3 AY325887 knownGene chr14 95977338 + 43794 graph_second 0 4 ccacaaaaaa 4675 1 Inf 2 0 3 0 ccacacagat 4676 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_170592 refGene chr2 31095613 - 73291 graph_last l 13 35 ccacacccag 4677 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_019681 refGene chr2 31565697 - 73338 graph_last l 17 66 ccacacctac 4678 1 0.5 3 6 4 2 ccacactgtc 4679 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_018783 refGene chr5 111379323 - 105955 graph_last l 5 13 ccacactgtg 4680 1 Inf 2 0 3 0 NM_007965 refGene chr12 104251134 + 31087 graph_last l 22 155 ccacagagct 4681 1 1.47058823529412 25 17 33 6 NM_025673 refGene chr15 12387096 + 45378 graph_last l 13 29 ccacatatgg 4682 1 0.333333333333333 2 6 3 2 ccaccaaaaa 4683 1 Inf 2 0 3 0 ccaccaatgg 4684 1 1 3 3 4 1 NM_173741 refGene chr17 25428890 - 57931 graph_last l 7 29 ccaccaccga 4685 1 Inf 3 0 4 0 BX525015 all_est chr16 91581876 - 55893 graph_second 1 3 ccaccactga 4686 1 0.666666666666667 2 3 2 1 CA539173 all_est chr4 148734500 + 99422 graph_last 11 25 ccaccacttc 4687 1 1.33333333333333 4 3 5 1 ccacccccac 4688 1 0.833333333333333 5 6 6 2 ccacctatcc 4689 1 2.66666666666667 8 3 11 1 NM_011664 refGene chr11 62124095 - 20639 graph_last 11 43 ccacctctca 4690 1 Inf 2 0 3 0 NM_019639 refGene chr5 124162910 + 107038 graph_last 6 19 ccacctctga 4691 1 Inf 2 0 3 0 NM_011162 refGene chr2 92999933 - 76972 graph_last l 118 242 ccacctggaa 4692 1 0.888888888888889 8 9 11 3 ccactcgtgg 4693 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_016711 refGene chr9 78092876 - 139564 graph_last l 48 96 ccactggtca 4694 1 Inf 2 0 3 0 ccacttactc 4695 1 0.833333333333333 5 6 6 2 ccacttctgg 4696 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_009875 refGene chr6 136327704 - 117541 graph_last l 11 46 ccactttggc 4697 1 2.66666666666667 8 3 10 1 AI046512 all_est chr13 46728893 + 34581 graph_last l 17 45 ccacttttga 4698 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ccagaacaga 4699 1 1.09352517985612 152 139 199 48 NM_022811 refGene chr4 44322177 + 92800 graph_last l 4 19 ccagaagcca 4700 1 Inf 2 0 3 0 ccagacacaa 4701 1 Inf 2 0 3 0 NM_172579 refGene chr12 78416723 + 29546 graph_last 0 8 ccagacactt 4702 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ccagagcttc 4703 1 Inf 2 0 3 0 NM_010398 refGene chr17 34913504 + 58954 graph_last l 34 154 ccagaggact 4704 1 1.29411764705882 22 17 29 6 ccagcacttg 4705 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_133971 refGene chr8 12325947 - 127998 graph_last 2 23 ccagcaggca 4706 1 0.416666666666667 5 12 6 4 AK080867 all_mrna chr2 119091964 - 78329 graph_last l 4 27 ccagccacag 4707 1 1 3 3 4 1 ccagccagcg 4708 1 3 9 3 12 1 NM_029039 refGene chr9 47509706 + 137229 graph_last l 4 21 ccagcccccc 4709 1 1 3 3 4 1 NM_026399 refGene chr8 85937999 + 131892 graph_last 52 122 ccagcccctc 4710 1 1 9 9 12 3 ccagccctgg 4711 1 Inf 4 0 5 0 NM_013415 refGene chr11 69171437 - 21037 graph_last l 58 189 ccagcctgaa 4712 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ccagcctggg 4713 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ccagcctggt 4714 1 Inf 5 0 6 0 NM_009059 refGene chr17 33575921 + 58793 graph_last l 28 60 ccagcctgtg 4715 1 1.33333333333333 4 3 5 1 ccagccttta 4716 1 Inf 3 0 4 0 NM_024468 refGene chr17 35948629 - 59043 graph_last l 11 22 ccagcggagc 4717 1 Inf 2 0 3 0 NM_031254 refGene chr17 47802919 + 59790 graph_last 0 8 ccagcgtgtg 4718 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ccaggcaagc 4719 1 Inf 2 0 3 0 ccaggccagt 4720 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_009147 refGene chr12 54364658 + 28217 graph_second 0 4 ccaggcccct 4721 1 Inf 2 0 3 0 ccaggccggg 4722 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ccaggcctag 4723 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_053167 refGene chr12 66138939 - 28631 graph_last 1 6 ccaggctcta 4724 1 0.666666666666667 2 3 3 1 M22432 knownGene chr9 81062390 + 139726 graph_last 0 13 ccaggcttga 4725 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ccaggggctt 4726 1 0.833333333333333 5 6 7 2 ccagggtgcc 4727 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ccaggtatga 4728 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_025403 refGene chr2 112487671 + 77936 graph_last l 28 176 ccaggttatt 4729 1 1 14 14 18 5 NM_008453 refGene chr5 64083995 + 103230 graph_last 2 38 ccagtacctg 4730 1 0.833333333333333 10 12 13 4 ccagtcaggt 4731 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ccagtcattt 4732 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_025591 refGene chr6 87785565 + 114569 graph_last l 7 18 ccagtcgcta 4733 1 Inf 2 0 3 0 ccagtctgtg 4734 1 2.66666666666667 8 3 11 1 NM_170588 refGene chr2 156720243 - 80719 graph_last 2 13 ccagtgatgg 4735 1 Inf 2 0 3 0 ccagtgggaa 4736 1 1 3 3 4 1 NM_019998 refGene chr4 47084591 - 93032 graph_last l 25 81 ccagtgtttc 4737 1 0.5 3 6 4 2 NM_025507 refGene chr12 83699313 - 30036 graph_second l 12 23 ccagttcgtg 4738 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ccagttctgg 4739 1 Inf 2 0 3 0 NM_146188 refGene chr7 28331257 - 120162 graph_last l 4 44 ccataaagaa 4740 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_009238 refGene chr13 28837201 + 33570 graph_last 0 19 ccataggact 4741 1 0.777777777777778 7 9 9 3 NM_027057 refGene chr1 81560398 + 3869 graph_last l 16 61 ccatatgtga 4742 1 1.66666666666667 5 3 6 1 ccatattatg 4743 1 0.5 6 12 8 4 ccatcaaaaa 4744 1 Inf 2 0 3 0 NM_172261 refGene chr11 94590223 + 23236 graph_second l 7 47 ccatcaatca 4745 1 Inf 5 0 6 0 NM_011068 refGene chr7 72318592 - 122378 graph_last l 3 10 ccatccaggc 4746 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008446 refGene chrX 90459736 - 150268 graph_last l 6 23 ccatccagtc 4747 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ccatccagtg 4748 1 Inf 3 0 4 0 CD776575 all_est chr7 56317998 + 121600 graph_last l 8 23 ccatcctaat 4749 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AK122502 knownGene chr1 74021697 - 3517 graph_last 0 14 ccatccttgg 4750 1 0.333333333333333 2 6 3 2 BC005773 knownGene chr10_random 174274 + 17005 graph_last 4 25 ccatcgagga 4751 1 Inf 4 0 5 0 ccattctgaa 4752 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ccattgatca 4753 1 0.642857142857143 9 14 12 5 ccatttgagc 4754 1 1.5 18 12 24 4 ccatttgatt 4755 1 Inf 5 0 6 0 ccatttttta 4756 1 1.66666666666667 5 3 7 1 cccaaagagt 4757 1 0.666666666666667 6 9 8 3 U70442 knownGene chr2 153136523 - 80366 graph_last l 2 16 cccaacactg 4758 1 1.33333333333333 4 3 5 1 cccaacgggg 4759 1 Inf 2 0 3 0 NM_023910 refGene chr5 136202212 + 107900 graph_last l 47 118 cccaactcca 4760 1 1 3 3 4 1 cccaagactc 4761 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_013768 refGene chr14 45597354 + 41288 graph_last 1 10 cccaagccag 4762 1 Inf 2 0 3 0 cccaaggaca 4763 1 Inf 3 0 4 0 cccaaggaga 4764 1 1.55555555555556 14 9 18 3 NM_181411 refGene chr11 20583829 - 18082 graph_last l 19 54 cccaagggtt 4765 1 Inf 4 0 5 0 cccacccact 4766 1 1 3 3 4 1 cccaccccaa 4767 1 Inf 2 0 3 0 NM_029646 refGene chr8 112373126 + 133399 graph_last l 7 67 cccaccccca 4768 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_019828 refGene chr2 156259985 - 80665 graph_second 0 5 cccacctttc 4769 1 Inf 4 0 5 0 cccactgcct 4770 1 1 3 3 4 1 NM_011360 refGene chr6 4379408 - 110009 graph_last l 9 24 cccactgtgt 4771 1 Inf 2 0 3 0 NM_011889 refGene chr15 83848583 + 48775 graph_second 1 7 cccagacttt 4772 1 Inf 4 0 5 0 genomic chr1 107609022 - 0 unique_long l 2 12 cccagagaag 4773 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_028990 refGene chr6 13377831 - 110447 graph_last 1 11 cccagagagg 4774 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cccagcatcc 4775 1 0.333333333333333 2 6 3 2 cccagcccac 4776 1 0.5 3 6 4 2 NM_033371 refGene chr15 78224690 + 48172 graph_last l 21 52 cccagccgga 4777 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_019963 refGene chr10 131569450 + 16777 graph_last l 3 12 cccagcctca 4778 1 Inf 2 0 3 0 cccagcctga 4779 1 Inf 2 0 3 0 cccagcgggg 4780 1 Inf 4 0 5 0 cccagctgag 4781 1 Inf 2 0 3 0 NM_053102 refGene chr3 148522611 + 90100 graph_last l 78 161 cccagctttc 4782 1 2.66666666666667 8 3 11 1 NM_025416 refGene chr3 97044715 + 87184 graph_second 0 19 cccaggcaaa 4783 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_175149 refGene chr8 126434727 - 134358 graph_last l 6 46 cccaggctca 4784 1 1.33333333333333 8 6 10 2 cccaggctga 4785 1 1.5 21 14 27 5 NM_175641 refGene chr7_random 1064432 - 126460 graph_last l 9 31 cccagtccct 4786 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cccataaaag 4787 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_021273 refGene chr12 107237164 - 31356 graph_second 7 24 cccatccaac 4788 1 Inf 5 0 7 0 BE991590 all_est chr4 127480357 + 97355 graph_last l 6 16 cccattctgc 4789 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ccccaaccag 4790 1 Inf 2 0 3 0 NM_133789 refGene chr7 13884799 + 119095 graph_last l 35 98 ccccaacccc 4791 1 1.5 9 6 12 2 ccccaagctc 4792 1 Inf 2 0 3 0 NM_017392 refGene chr3 111531621 - 88311 graph_last l 11 42 ccccaatcct 4793 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_010487 refGene chr9 22638223 - 135759 graph_last l 47 135 ccccacacac 4794 1 0.6875 22 32 29 11 ccccacagat 4795 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ccccacccat 4796 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ccccacccca 4797 1 0.833333333333333 5 6 6 2 ccccacctat 4798 1 Inf 2 0 3 0 NM_010413 refGene chrX 6491081 - 147060 graph_last l 4 13 ccccactcac 4799 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_029457 refGene chr16 21675358 + 52280 graph_last l 6 22 ccccactcca 4800 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ccccagagcg 4801 1 Inf 5 0 6 0 AK090138 knownGene chr11 77836993 + 21928 graph_last l 12 38 ccccaggccg 4802 1 Inf 2 0 3 0 ccccaggctg 4803 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_009497 refGene chr11 68663590 + 20978 graph_last l 280 678 cccccaattc 4804 1 0.652173913043478 15 23 19 8 NM_016793 refGene chr7 10306097 + 118858 graph_last 0 9 cccccaccac 4805 1 Inf 3 0 4 0 cccccacccc 4806 1 0.833333333333333 5 6 7 2 cccccagtct 4807 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cccccccccc 4808 1 Inf 4 0 5 0 NM_025617 refGene chr4 106060550 + 95810 graph_last l 46 189 ccccccgtca 4809 1 1.83333333333333 11 6 15 2 BE860919 all_est chrX 139922476 + 152158 graph_last l 10 19 ccccccttcc 4810 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011156 refGene chr10 46930144 - 12160 graph_last 0 7 cccccctttc 4811 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_027129 refGene chr2 131355781 + 79246 graph_last l 3 22 cccccgtgtc 4812 1 Inf 2 0 3 0 NM_028493 refGene chr13 73633737 - 36188 graph_last 0 6 ccccctgtgt 4813 1 Inf 4 0 5 0 NM_145954 refGene chr7 38137620 + 120758 graph_last l 10 41 cccctcctga 4814 1 1.16666666666667 7 6 9 2 cccctcttcc 4815 1 1.16666666666667 7 6 9 2 AK053040 all_mrna chr7 136871243 - 126360 graph_last 0 4 cccctgcccc 4816 1 Inf 2 0 3 0 NM_010137 refGene chr17 87579567 + 61902 graph_second 0 7 cccctgcctg 4817 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008228 refGene chr4 128431249 - 97479 graph_last 12 25 cccctggggt 4818 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_023044 refGene chr19 10852955 - 68039 graph_last l 50 111 ccccttattt 4819 1 0.888888888888889 8 9 10 3 NM_008422 refGene chr7 37667978 - 120698 graph_last l 29 71 ccccttccca 4820 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ccccttgcca 4821 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_145979 refGene chr6 127048350 + 116948 graph_second s 1 12 cccgaactgg 4822 1 Inf 5 0 7 0 cccgactctc 4823 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_007654 refGene chr4 42737772 + 92648 graph_last l 12 33 cccgagagtg 4824 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_144825 refGene chr11 77042260 - 21848 graph_last l 14 51 cccgcagcac 4825 1 0.666666666666667 8 12 10 4 NM_029802 refGene chr7 97772484 + 123904 graph_last l 5 52 cccgccctgg 4826 1 1 3 3 4 1 genomic chr13 76270275 - 0 unique_long l 2 10 cccgccgccc 4827 1 Inf 5 0 6 0 cccgcctctg 4828 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cccgctggtt 4829 1 Inf 2 0 3 0 cccggccaga 4830 1 Inf 4 0 5 0 NM_198167 refGene chr17 45092436 + 59504 graph_last 3 44 cccggctccc 4831 1 Inf 4 0 5 0 NM_010435 refGene chr16 18477129 - 52063 graph_last l 9 34 cccggctgtc 4832 1 Inf 2 0 3 0 cccggggcaa 4833 1 Inf 2 0 3 0 NM_146183 refGene chr7_random 1476992 - 126495 graph_last 12 78 cccggggcga 4834 1 1.07142857142857 15 14 20 5 genomic chr18 36300225 + 0 unique_long l 9 25 cccgtccctc 4835 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_021491 refGene chr8 107786134 - 133057 graph_last l 9 33 cccgtctgcc 4836 1 0.666666666666667 2 3 3 1 genomic chr11 19653265 + 0 unique_short s 0 7 cccgtgagcg 4837 1 Inf 5 0 6 0 NM_198326 refGene chr2 152253977 + 80294 graph_last l 28 121 cccgtgggga 4838 1 0.928571428571429 13 14 17 5 cccgtggttg 4839 1 Inf 5 0 6 0 NM_029767 refGene chr7 3771444 + 118489 graph_last l 136 512 cccgtgtgct 4840 1 1.38461538461538 72 52 94 18 AI840093 all_est chr7 15829660 + 119220 graph_second 1 5 cccgtgttct 4841 1 Inf 2 0 3 0 NM_007589 refGene chr7 13971461 - 119114 graph_last l 57 171 cccgttctcc 4842 1 0.65 13 20 17 7 ccctagaaac 4843 1 Inf 2 0 3 0 NM_178655 refGene chr3 130442791 - 89080 graph_last l 30 61 ccctatgtcg 4844 1 Inf 5 0 7 0 ccctcaccca 4845 1 0.666666666666667 8 12 11 4 NM_133964 refGene chr10 83760452 + 14204 graph_last 0 5 ccctccacca 4846 1 Inf 2 0 3 0 ccctcccccc 4847 1 Inf 3 0 4 0 NM_010788 refGene chrX 63633178 - 149222 graph_last l 13 29 ccctcctaaa 4848 1 Inf 5 0 7 0 ccctcctcag 4849 1 0.444444444444444 4 9 5 3 ccctcctccc 4850 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_172132 refGene chr17 56330940 + 60228 graph_last l 8 36 ccctcctcct 4851 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_015748 refGene chr19 41668099 - 69826 graph_last l 17 27 ccctctctca 4852 1 Inf 2 0 3 0 NM_172261 refGene chr11 94590474 + 23236 graph_last l 179 362 ccctctgtca 4853 1 1.22222222222222 11 9 15 3 NM_009557 refGene chr4 135073073 + 98136 graph_last l 5 14 ccctctgttc 4854 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_177143 refGene chr17 63133167 - 60499 graph_last l 4 8 ccctcttatt 4855 1 0.666666666666667 2 3 2 1 Y12229 knownGene chr10 12275530 - 10343 graph_second 0 4 ccctgacccc 4856 1 Inf 4 0 5 0 AK032339 knownGene chr17 32966326 - 58719 graph_last 2 22 ccctgactgt 4857 1 Inf 4 0 5 0 ccctgagggt 4858 1 0.416666666666667 5 12 7 4 NM_007393 refGene chr5 141627707 + 108227 graph_last l 345 1033 ccctgagtcc 4859 1 1.19230769230769 93 78 121 27 ccctgatttt 4860 1 1.75 35 20 46 7 NM_019953 refGene chr10 131603952 + 16782 graph_last l 10 40 ccctgcacag 4861 1 Inf 2 0 3 0 ccctgcagct 4862 1 Inf 4 0 5 0 ccctgccctg 4863 1 Inf 3 0 4 0 BC055753 knownGene chr10 43436694 + 11938 graph_last l 12 36 ccctgctgac 4864 1 Inf 4 0 5 0 BQ932078 all_est chr6 7707529 - 110207 graph_second 0 5 ccctgctgag 4865 1 Inf 4 0 5 0 NM_145396 refGene chr17 24294464 - 57819 graph_last l 15 49 ccctgctgca 4866 1 2.66666666666667 8 3 10 1 NM_010752 refGene chr5 138556830 - 108066 graph_last 0 7 ccctggagag 4867 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ccctgggttc 4868 1 1.10236220472441 140 127 183 44 ccctggtggc 4869 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_017380 refGene chr11 116867585 + 25295 graph_last l 12 43 ccctgtggcc 4870 1 1.5 9 6 12 2 NM_172400 refGene chr4 131168864 - 97727 graph_last l 16 70 ccctgtggtg 4871 1 2 6 3 8 1 AK015640 knownGene chr14 40942878 + 40993 graph_last l 6 15 ccctgtgtta 4872 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_011811 refGene chr1 80162592 - 3815 graph_last l 12 47 ccctgttcct 4873 1 0.777777777777778 7 9 9 3 NM_019400 refGene chr11 70514131 + 21202 graph_last l 20 58 cccttaagaa 4874 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_011251 refGene chr9 110494835 + 141285 graph_last 0 15 cccttaatcc 4875 1 Inf 2 0 3 0 cccttaatct 4876 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_021473 refGene chr4 115550511 - 96427 graph_last l 15 23 cccttagcgc 4877 1 Inf 2 0 3 0 cccttcactg 4878 1 1.83333333333333 11 6 14 2 cccttccctt 4879 1 1.76470588235294 30 17 39 6 AK129202 knownGene chr11 57657187 + 20189 graph_last 17 51 cccttctgcc 4880 1 0.833333333333333 5 6 6 2 ccctttgtca 4881 1 2.33333333333333 7 3 9 1 ccctttgtga 4882 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_028777 refGene chr11 116664499 + 25278 graph_last l 12 31 ccgaagaggc 4883 1 0.666666666666667 4 6 5 2 AK013082 knownGene chr11 106483984 - 24539 graph_last l 11 75 ccgaagctga 4884 1 0.823529411764706 14 17 18 6 ccgaaggatt 4885 1 Inf 2 0 3 0 NM_009919 refGene chr14 38521907 - 40807 graph_last 26 57 ccgaattacc 4886 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_023556 refGene chr5 113388856 + 106093 graph_last 2 48 ccgactgcct 4887 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_008540 refGene chr18 74019907 - 65990 graph_last l 8 21 ccgaggagag 4888 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_026977 refGene chr1 76693492 - 3685 graph_last 0 3 ccgaggctca 4889 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_030561 refGene chr17 28929599 + 58346 graph_last l 9 45 ccgatagagt 4890 1 1 3 3 4 1 NM_007507 refGene chr5 107403524 + 105658 graph_last l 10 29 ccgatgatca 4891 1 Inf 2 0 3 0 NM_178409 refGene chr12 94341403 - 30475 graph_second l 3 17 ccgcaaatgt 4892 1 Inf 2 0 3 0 NM_172506 refGene chr16 44463098 - 53898 graph_last l 3 17 ccgcagactg 4893 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_010135 refGene chr1 186002011 - 9208 graph_last l 11 38 ccgcaggcgt 4894 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_013507 refGene chr7 103000296 - 124245 graph_second 0 3 ccgccaagga 4895 1 Inf 2 0 3 0 ccgccaccgc 4896 1 Inf 2 0 3 0 NM_146119 refGene chr2 33234113 + 73490 graph_last 11 20 ccgcccaagt 4897 1 0.833333333333333 5 6 6 2 ccgcccttcg 4898 1 Inf 2 0 3 0 NM_022995 refGene chr2 173652574 - 81901 graph_last l 12 30 ccgcctgcaa 4899 1 Inf 4 0 5 0 NM_013680 refGene chrX 19413883 - 147587 graph_last l 49 219 ccgcctgtgg 4900 1 0.777777777777778 7 9 9 3 NM_019479 refGene chr1 93328174 - 4687 graph_last l 3 42 ccgctgcgtg 4901 1 0.833333333333333 10 12 13 4 NM_020009 refGene chr4 146567044 + 99166 graph_last 0 4 ccgctgtcct 4902 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008753 refGene chr10 83192093 + 14136 graph_last 5 9 ccgcttctta 4903 1 Inf 2 0 3 0 NM_010828 refGene chr10 18445817 + 10611 graph_last 1 5 ccggatttgc 4904 1 Inf 2 0 3 0 NM_172948 refGene chr11 116492047 + 25261 graph_second 0 9 ccggccaggc 4905 1 Inf 5 0 7 0 ccgggcgtgg 4906 1 0.333333333333333 2 6 3 2 genomic chr7 93057142 + 0 unique_long l 31 142 ccgggctggc 4907 1 1.78571428571429 25 14 33 5 NM_024171 refGene chr4 47089305 + 93033 graph_last 5 35 ccgggtccaa 4908 1 1 6 6 8 2 ccgggtggtg 4909 1 Inf 5 0 6 0 ccggtcaccg 4910 1 0.888888888888889 8 9 10 3 NM_029767 refGene chr7 3769910 + 118489 graph_second b 6 18 ccggtcgcca 4911 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_134029 refGene chr11 59415889 - 20368 graph_last l 28 89 ccggttcctc 4912 1 1 9 9 12 3 ccgtatccct 4913 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_010064 refGene chr2 71604443 + 75596 graph_second s 0 6 ccgtcgccta 4914 1 Inf 2 0 3 0 NM_011512 refGene chr2 27189366 - 72967 graph_last l 8 31 ccgtgcagca 4915 1 Inf 5 0 7 0 ccgtgggcat 4916 1 1.33333333333333 8 6 11 2 NM_027350 refGene chr18 64667346 + 65455 graph_last l 173 288 ccgtgtgttc 4917 1 1.33333333333333 8 6 10 2 NM_146087 refGene chr18 61709305 - 65292 graph_last l 5 19 ccgttcttct 4918 1 0.333333333333333 2 6 3 2 genomic chr17 46379372 - 0 unique_long l 3 16 ccgtttcttt 4919 1 1.33333333333333 4 3 5 1 cctaaaaaaa 4920 1 Inf 3 0 4 0 NM_028194 refGene chr5 72318092 - 103784 graph_last 3 15 cctaaaagag 4921 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_011100 refGene chr3 150651068 - 90234 graph_last l 38 103 cctaaaattc 4922 1 Inf 2 0 3 0 NM_183252 refGene chr1 43390024 + 1858 graph_last l 11 51 cctaaagatt 4923 1 0.5 6 12 8 4 cctaaagcaa 4924 1 Inf 2 0 3 0 cctaaagcta 4925 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr3 26285792 + 0 unique_long l 2 8 cctaactccg 4926 1 Inf 2 0 3 0 BY447293 all_est chr3 98322906 + 87343 graph_second 0 6 cctaagcacc 4927 1 Inf 2 0 3 0 cctaaggcta 4928 1 0.666666666666667 2 3 2 1 genomic chr11 53229377 + 0 unique_long l 3 44 cctaatgtct 4929 1 0.555555555555556 5 9 7 3 BC058979 knownGene chr11 77913457 + 21939 graph_last 6 18 cctacaagcc 4930 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_010477 refGene chr1 56378315 - 2455 graph_last 3 18 cctacagata 4931 1 0.5 3 6 4 2 NM_026147 refGene chr4 3762091 - 90957 graph_last 191 634 cctaccaaga 4932 1 0.901639344262295 55 61 72 21 cctaccaagt 4933 1 Inf 3 0 4 0 NM_054102 refGene chr1 154790569 + 7138 graph_last l 48 98 cctaccaata 4934 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_011789 refGene chr10 82662274 + 14076 graph_last l 7 43 cctaccagtt 4935 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_011975 refGene chr7 101564529 + 124129 graph_last 40 81 cctacctgca 4936 1 Inf 3 0 4 0 NM_007438 refGene chr7_random 37881398 + 127284 graph_last 511 1186 cctactaacc 4937 1 0.833333333333333 10 12 13 4 NM_010158 refGene chr15 70417261 - 47750 graph_last l 11 22 cctactcggc 4938 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cctacttaag 4939 1 Inf 4 0 5 0 cctagcagaa 4940 1 Inf 2 0 3 0 cctaggatag 4941 1 1.66666666666667 5 3 6 1 cctataaccc 4942 1 Inf 2 0 3 0 cctataatcc 4943 1 Inf 4 0 5 0 genomic chr4 136999969 + 0 unique_long l 13 41 cctatacgtc 4944 1 0.833333333333333 5 6 7 2 cctatcctag 4945 1 Inf 2 0 3 0 NM_028233 refGene chr17 85466789 - 61749 graph_last l 18 51 cctatgtcta 4946 1 1.66666666666667 5 3 6 1 cctcaaaaaa 4947 1 Inf 3 0 4 0 NM_198886 refGene chr17 34557187 + 58892 graph_last 1 33 cctcaaagag 4948 1 1.64285714285714 23 14 30 5 NM_027098 refGene chr1 38595773 + 1625 graph_last l 39 109 cctcaagagc 4949 1 0.75 9 12 12 4 NM_009274 refGene chr5 21633415 + 101027 graph_last l 10 31 cctcaaggaa 4950 1 1.33333333333333 8 6 10 2 NM_009983 refGene chr7 134433272 - 126175 graph_last l 270 537 cctcagcctg 4951 1 0.714285714285714 10 14 13 5 NM_025895 refGene chr5 44309173 + 102441 graph_last l 22 55 cctcagggat 4952 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_133962 refGene chr8 3369647 - 127568 graph_last 1 4 cctcaggtcg 4953 1 Inf 2 0 3 0 cctcatactc 4954 1 Inf 2 0 3 0 NM_007706 refGene chr10 97796712 - 15092 graph_last 1 6 cctcatatag 4955 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_133783 refGene chr2 32674974 + 73436 graph_last l 20 60 cctccaggtt 4956 1 Inf 3 0 4 0 NM_009536 refGene chr11 75336854 + 21637 graph_last l 42 180 cctccatcct 4957 1 1.41176470588235 24 17 31 6 NM_021789 refGene chr9 46175322 + 137077 graph_last 4 14 cctcccaaag 4958 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cctcccaccc 4959 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_054050 refGene chr2 30009257 + 73157 graph_last l 10 53 cctcccagtg 4960 1 0.666666666666667 6 9 8 3 NM_013651 refGene chr10 83170016 + 14132 graph_last l 8 47 cctccccctc 4961 1 Inf 4 0 5 0 NM_178252 refGene chr7 24426999 - 119943 graph_last l 11 49 cctcccgaca 4962 1 1.16666666666667 14 12 18 4 cctccctttt 4963 1 1.05882352941176 18 17 24 6 NM_019869 refGene chr19 4627158 + 67454 graph_last l 3 13 cctcctatgc 4964 1 Inf 2 0 3 0 AK053441 all_mrna chr8 79700182 + 131490 graph_last 0 4 cctcctccca 4965 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_177088 refGene chr11 106446098 + 24538 graph_last 0 15 cctcctctac 4966 1 Inf 3 0 4 0 NM_053089 refGene chr3 52923477 + 84799 graph_last l 9 20 cctcctggat 4967 1 1 3 3 4 1 NM_007564 refGene chr12 76096997 - 29355 graph_last 1 10 cctccttcac 4968 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_146083 refGene chr17 80910747 - 61430 graph_last l 11 28 cctcggagat 4969 1 0.833333333333333 5 6 7 2 AK129460 knownGene chr6 150356147 - 118289 graph_last l 4 13 cctcgttgtg 4970 1 Inf 4 0 5 0 cctctaatcc 4971 1 Inf 2 0 3 0 cctctcagta 4972 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_028906 refGene chr9 67476665 + 138646 graph_last l 17 45 cctctccagt 4973 1 Inf 4 0 5 0 BU935767 all_est chr9 117395512 - 141862 graph_second 2 10 cctctcgcaa 4974 1 Inf 2 0 3 0 NM_133705 refGene chr1 185002581 + 9123 graph_last l 9 27 cctctctgag 4975 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cctctctgga 4976 1 Inf 5 0 6 0 NM_011448 refGene chr11 112292894 + 24892 graph_last 4 15 cctctgcaag 4977 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BC031915 knownGene chr15 101648680 + 49947 graph_last l 11 43 cctctggtct 4978 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_018737 refGene chrX 150998194 + 152626 graph_last 0 38 cctgaacaca 4979 1 Inf 3 0 4 0 NM_029037 refGene chr8 24826959 - 128741 graph_last l 3 10 cctgaacact 4980 1 Inf 3 0 4 0 NM_008083 refGene chr16 42220064 - 53725 graph_last l 32 171 cctgaacttt 4981 1 1.08333333333333 13 12 17 4 NM_144918 refGene chr6 86835210 - 114503 graph_last l 8 42 cctgactggc 4982 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_199149 refGene chr7 16432459 + 119295 graph_second 2 14 cctgagatca 4983 1 Inf 2 0 3 0 NM_025860 refGene chr1 124176111 - 5729 graph_last 6 23 cctgaggaga 4984 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_012053 refGene chr15 78133107 + 48155 graph_second l 3 13 cctgagggta 4985 1 Inf 5 0 6 0 NM_172663 refGene chr2 49784551 + 74410 graph_second 1 5 cctgatctca 4986 1 Inf 2 0 3 0 cctgatcttt 4987 1 0.905263157894737 86 95 112 33 NM_025348 refGene chr7 3686433 + 118478 graph_last l 68 299 cctgatgtgc 4988 1 0.692307692307692 18 26 23 9 NM_017477 refGene chr6 89337169 + 114740 graph_last l 17 80 cctgcaagga 4989 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_026192 refGene chr15 104801432 - 50305 graph_last l 7 30 cctgcaccct 4990 1 2 6 3 8 1 cctgcactta 4991 1 Inf 2 0 3 0 cctgcagcag 4992 1 Inf 3 0 4 0 NM_009734 refGene chr11 119617387 - 25520 graph_last l 5 27 cctgcagctg 4993 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_057171 refGene chr17 34807771 + 58931 graph_last l 21 121 cctgccaaga 4994 1 0.875 28 32 36 11 cctgcccagg 4995 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cctgcctgga 4996 1 Inf 4 0 5 0 cctgcgatcc 4997 1 Inf 4 0 5 0 NM_029631 refGene chr9 108999775 - 141180 graph_last l 4 29 cctgctacct 4998 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_134129 refGene chr19 10634110 + 68016 graph_last 41 178 cctgctctgt 4999 1 0.75 15 20 20 7 NM_016776 refGene chr11 72022330 + 21273 graph_last 0 5 cctgctgcca 5000 1 Inf 2 0 3 0 NM_026452 refGene chr8 96105615 - 132532 graph_last l 3 12 cctgctgtta 5001 1 Inf 2 0 3 0 NM_145125 refGene chr16 97963899 - 56337 graph_last 0 5 cctgcttaaa 5002 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cctgcttcct 5003 1 1.16666666666667 7 6 9 2 AK034779 all_mrna chrX 93983155 - 150567 graph_last 1 6 cctggaaccc 5004 1 Inf 3 0 4 0 AK016936 knownGene chr6 124387762 + 116782 graph_last 0 12 cctggactga 5005 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_177699 refGene chr8 106838263 + 132950 graph_last l 55 134 cctggagcag 5006 1 0.75 9 12 12 4 cctggaggat 5007 1 0.5 3 6 4 2 cctggcactg 5008 1 0.777777777777778 7 9 9 3 cctggctaag 5009 1 Inf 2 0 3 0 cctggctcca 5010 1 Inf 5 0 6 0 genomic chr18 32616059 + 0 unique_long l 9 19 cctgggactt 5011 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_029632 refGene chr17 36700776 - 59094 graph_last l 11 24 cctgggatcc 5012 1 Inf 3 0 4 0 NM_016692 refGene chr19 9756619 - 67942 graph_last l 4 18 cctggggaag 5013 1 Inf 3 0 4 0 cctgggggaa 5014 1 Inf 4 0 5 0 cctgggggag 5015 1 Inf 2 0 3 0 cctggtgcag 5016 1 0.333333333333333 2 6 3 2 BB693657 all_est chr9_random 299963 - 142468 graph_last 0 11 cctggtgcct 5017 1 Inf 2 0 3 0 cctggtggtg 5018 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cctgtaaaaa 5019 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cctgtaaccc 5020 1 1.66666666666667 5 3 7 1 cctgtaagcc 5021 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cctgtaattc 5022 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026499 refGene chr2 163550668 + 81143 graph_last l 5 32 cctgtagacc 5023 1 Inf 5 0 7 0 cctgtcatcc 5024 1 Inf 2 0 3 0 cctgtccgtg 5025 1 Inf 2 0 3 0 NM_145585 refGene chr7 111695615 - 124695 graph_last l 7 26 cctgtcctgc 5026 1 2.33333333333333 7 3 9 1 cctgtgatcc 5027 1 1.5 9 6 12 2 cctgtgcatt 5028 1 Inf 4 0 5 0 cctgtgcgca 5029 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_021516 refGene chr12 107222368 + 31347 graph_last l 20 49 cctgtggttt 5030 1 1 6 6 8 2 NM_009208 refGene chr1 77110118 + 3713 graph_second 1 6 cctgtgtgac 5031 1 Inf 2 0 3 0 cctgttggag 5032 1 1 3 3 4 1 NM_008514 refGene chr6 135855714 - 117494 graph_last 2 11 ccttaagccc 5033 1 Inf 2 0 3 0 NM_009441 refGene chr16 96243480 + 56249 graph_last l 164 458 ccttacactt 5034 1 1 38 38 49 13 NM_172271 refGene chr3 110621594 - 88220 graph_last l 2 5 ccttcaaagt 5035 1 Inf 2 0 3 0 ccttcagtcc 5036 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_130454 refGene chr11 115470137 + 25135 graph_last 0 15 ccttccaaga 5037 1 Inf 2 0 3 0 ccttccaata 5038 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_144531 refGene chr4 140981255 - 98662 graph_last l 8 29 ccttcccaga 5039 1 2.33333333333333 7 3 9 1 ccttcccgat 5040 1 0.333333333333333 2 6 3 2 ccttcccttc 5041 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_023196 refGene chr3 133511254 + 89289 graph_last l 5 13 ccttcctgag 5042 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BC040467 knownGene chr10 86686833 - 14416 graph_last l 17 34 ccttctgggc 5043 1 Inf 3 0 4 0 NM_178606 refGene chr10 68910003 - 13179 graph_last 0 9 ccttgaaacc 5044 1 0.333333333333333 2 6 3 2 ccttgaatcc 5045 1 Inf 2 0 3 0 ccttgacggc 5046 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_018740 refGene chr11 69551467 + 21096 graph_last 0 13 ccttgatccc 5047 1 1.33333333333333 4 3 5 1 ccttgctaca 5048 1 Inf 3 0 4 0 NM_026421 refGene chr5 99137796 - 105093 graph_last l 26 74 ccttggcctc 5049 1 0.888888888888889 8 9 11 3 NM_152993 refGene chr2_random 3907842 - 82637 graph_last 0 15 ccttggtggc 5050 1 Inf 5 0 6 0 ccttgtaaaa 5051 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_009456 refGene chr16 16729199 - 51882 graph_last l 17 55 ccttgtcctg 5052 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BC055476 knownGene chr7 16109922 + 119258 graph_last l 53 93 ccttgtggga 5053 1 Inf 3 0 4 0 ccttgttcct 5054 1 Inf 2 0 3 0 cctttaaacc 5055 1 Inf 5 0 6 0 NM_021529 refGene chr12 50480927 + 28021 graph_second 0 3 cctttaacct 5056 1 Inf 2 0 3 0 cctttaatcg 5057 1 Inf 3 0 4 0 cctttagtcc 5058 1 0.869565217391304 20 23 26 8 AK008777 knownGene chr1 75831938 + 3596 graph_second 0 6 cctttatccc 5059 1 Inf 4 0 5 0 cctttatgtg 5060 1 0.333333333333333 2 6 3 2 cctttattcc 5061 1 0.888888888888889 8 9 11 3 cctttcaaaa 5062 1 2.33333333333333 7 3 9 1 cctttcatag 5063 1 Inf 4 0 5 0 cctttcatcc 5064 1 Inf 2 0 3 0 NM_011793 refGene chr19 5222028 - 67548 graph_last 17 89 cctttccctt 5065 1 0.666666666666667 8 12 11 4 cctttctaag 5066 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_176947 refGene chr12 60618652 + 28364 graph_last l 6 22 cctttctgcg 5067 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_177887 refGene chr5_random 412529 - 108970 graph_last 70 146 cctttctgtc 5068 1 2 6 3 8 1 cctttgagat 5069 1 1.09090909090909 60 55 79 19 NM_009898 refGene chr7_random 46677617 - 127457 graph_last l 24 107 cctttgagca 5070 1 0.666666666666667 8 12 10 4 NM_008541 refGene chr13 56515654 + 35272 graph_last 2 16 cctttgattc 5071 1 2.66666666666667 8 3 10 1 NM_028188 refGene chr3 91290308 - 86768 graph_last l 42 88 cctttgcccc 5072 1 0.666666666666667 4 6 5 2 cctttggtcc 5073 1 1.33333333333333 4 3 5 1 AK081459 knownGene chr9 3300318 + 134782 graph_last l 4 7 ccttttaagt 5074 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_021506 refGene chr8 61228980 + 130443 graph_last l 7 23 ccttttatgg 5075 1 1.66666666666667 5 3 6 1 ccttttcctt 5076 1 1.45 29 20 38 7 NM_008746 refGene chr7 70950306 + 122257 graph_last 3 9 cgaaagaagc 5077 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_009846 refGene chr10 45183534 - 12083 graph_last 0 32 cgaacaaaag 5078 1 2.66666666666667 8 3 11 1 cgaatctgga 5079 1 Inf 2 0 3 0 cgaatgagga 5080 1 Inf 4 0 5 0 NM_008095 refGene chr5 128802977 + 107251 graph_last l 20 53 cgaatgattt 5081 1 1 3 3 4 1 cgacaacgag 5082 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011695 refGene chr14 16733979 + 39565 graph_last l 51 160 cgaccagcag 5083 1 0.833333333333333 5 6 7 2 cgaccccggg 5084 1 Inf 4 0 5 0 NM_026844 refGene chr8 118590105 - 133780 graph_last b 3 19 cgacggaggc 5085 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026371 refGene chr6 136112602 + 117510 graph_last l 8 19 cgagaccctt 5086 1 Inf 3 0 4 0 cgagcagtgt 5087 1 Inf 2 0 3 0 NM_198167 refGene chr17 45055011 - 59504 graph_last l 29 112 cgaggacagc 5088 1 1.25 15 12 19 4 NM_011650 refGene chr1 120843396 + 5532 graph_last l 2 15 cgagggaaag 5089 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_013691 refGene chr3 91469670 + 86787 graph_last l 3 14 cgaggggggc 5090 1 0.333333333333333 2 6 3 2 BC057051 knownGene chr19_random 6988985 - 71187 graph_last l 8 34 cgagttcata 5091 1 0.5 3 6 4 2 NM_010633 refGene chr1 173947326 - 8356 graph_last l 149 284 cgatgcactg 5092 1 1.66666666666667 5 3 7 1 AA048119 all_est chr10 115754481 + 15901 graph_last 1 17 cgatggtggg 5093 1 1 3 3 4 1 NM_017470 refGene chr15 81047540 - 48452 graph_last l 8 30 cgatttgtac 5094 1 Inf 2 0 3 0 NM_080635 refGene chr15 52884425 - 46890 graph_second l 8 13 cgcaacacca 5095 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011131 refGene chr7 37306712 + 120671 graph_last l 3 18 cgcaagaagg 5096 1 Inf 3 0 4 0 AK036885 knownGene chr8 21804930 + 128557 graph_last 1 5 cgcaaggctg 5097 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr7_random 21173822 + 0 unique_short s 0 12 cgcaattcaa 5098 1 Inf 2 0 3 0 cgcacacaca 5099 1 2.33333333333333 14 6 18 2 BU604152 all_est chr7 10258729 - 118854 graph_last l 5 28 cgcacacata 5100 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_015740 refGene chr10 132197665 - 16882 graph_last l 42 143 cgcaccattg 5101 1 1.83333333333333 11 6 14 2 NM_080563 refGene chr12 20748194 - 26683 graph_last l 4 11 cgcacgtgca 5102 1 Inf 3 0 4 0 NM_009366 refGene chr14 68082376 - 42852 graph_last l 29 66 cgcagaacga 5103 1 0.5 6 12 8 4 NM_133206 refGene chr8 113317321 + 133479 graph_second 0 3 cgcagcaggc 5104 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_025985 refGene chr11 72255667 + 21283 graph_last l 5 11 cgcagctaca 5105 1 Inf 4 0 5 0 NM_026566 refGene chr15 103318973 + 50155 graph_last l 4 26 cgcaggctca 5106 1 1.66666666666667 5 3 6 1 cgcagggtct 5107 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_183172 refGene chr10 87338202 + 14472 graph_last l 5 39 cgcatacata 5108 1 Inf 5 0 6 0 NM_028710 refGene chr11 109100499 + 24794 graph_last l 11 28 cgcatttgcc 5109 1 Inf 3 0 4 0 NM_181419 refGene chr9 22892610 - 135780 graph_last 0 5 cgccaagcat 5110 1 Inf 2 0 3 0 cgccaccaaa 5111 1 Inf 2 0 3 0 cgccaccaca 5112 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cgccaccacc 5113 1 2 6 3 8 1 cgccaccacg 5114 1 1.66666666666667 5 3 6 1 cgccaccact 5115 1 Inf 5 0 6 0 NM_033474 refGene chr16 18011991 + 52029 graph_last l 6 23 cgccatcata 5116 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_144529 refGene chr7 115588627 + 124955 graph_last l 32 70 cgccattact 5117 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_026703 refGene chr2 36309432 - 73725 graph_last l 44 154 cgcccagaca 5118 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_011308 refGene chr11 61889224 - 20613 graph_last 7 31 cgccccatct 5119 1 0.416666666666667 5 12 6 4 AK010853 knownGene chr6 48287269 - 112478 graph_last l 3 23 cgccccgccc 5120 1 0.666666666666667 2 3 2 1 genomic chr11 68560614 + 0 unique_short s 0 4 cgcccggccc 5121 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_153178 refGene chr15 74773070 - 47882 graph_last 13 39 cgccctgcag 5122 1 Inf 3 0 4 0 NM_023209 refGene chr14 57544497 + 42234 graph_last l 2 14 cgccctggga 5123 1 Inf 4 0 5 0 NM_010906 refGene chr8 85570306 - 131845 graph_last l 14 48 cgcctctctc 5124 1 0.785714285714286 11 14 14 5 NM_025548 refGene chr7 24169909 + 119914 graph_last l 25 75 cgcctgtact 5125 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_027469 refGene chr8 107240512 - 133005 graph_last l 7 32 cgcgcttcct 5126 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_010592 refGene chr8 70968350 + 130976 graph_last b 49 185 cgcggactag 5127 1 1.5 9 6 12 2 NM_011417 refGene chr9 22310318 + 135693 graph_last l 38 179 cgcgtgccgg 5128 1 1.57692307692308 41 26 53 9 NM_025594 refGene chr18 36913799 + 64022 graph_last b 22 52 cgcgtggaac 5129 1 1.16666666666667 7 6 9 2 BY008069 all_est chr16 43612652 + 53830 graph_second 3 14 cgcgtgtaca 5130 1 Inf 2 0 3 0 NM_018814 refGene chr12 77994816 + 29514 graph_last b 15 41 cgcgttgtct 5131 1 0.833333333333333 5 6 7 2 cgctaccacg 5132 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026020 refGene chr7 133516299 + 126095 graph_last 3 9 cgctacgtcg 5133 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_015735 refGene chr19 10549868 + 68008 graph_last 2 6 cgctcagtgc 5134 1 Inf 2 0 3 0 NM_139311 refGene chr11 97260503 + 23541 graph_second 0 2 cgctgcagaa 5135 1 Inf 2 0 3 0 AK038968 knownGene chr8 12224592 - 127989 graph_last l 12 30 cgctgccata 5136 1 Inf 5 0 6 0 NM_010310 refGene chr2 174704945 - 81983 graph_last 16 41 cgctggatga 5137 1 Inf 2 0 3 0 NM_008343 refGene chr11 7104167 - 17543 graph_last l 6 47 cgctgtacag 5138 1 Inf 3 0 4 0 cgctgtattc 5139 1 Inf 5 0 6 0 NM_018828 refGene chr2 91396936 + 76767 graph_last l 6 27 cgctgttggg 5140 1 Inf 5 0 7 0 NM_198425 refGene chr7 21959792 - 119692 graph_last l 9 33 cgcttccgcc 5141 1 Inf 4 0 5 0 NM_008487 refGene chr3 90798930 - 86700 graph_last l 12 33 cgctttaggt 5142 1 1.66666666666667 5 3 6 1 W66880 all_est chr10 119616347 + 16047 graph_last 2 13 cgctttgcca 5143 1 Inf 5 0 6 0 AK013531 knownGene chr8 15635481 + 128237 graph_last l 32 129 cggaaactgc 5144 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011444 refGene chr6 145325109 - 117985 graph_second 0 4 cggaaccgga 5145 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr15 67450360 + 0 unique_short s 0 9 cggaaggcgg 5146 1 Inf 2 0 3 0 cggacaagct 5147 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cggacggctt 5148 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_010486 refGene chr4 89992410 - 94937 graph_second 3 7 cggactgtgc 5149 1 Inf 2 0 3 0 NM_021366 refGene chr7 56322102 - 121604 graph_second 0 2 cggagcgacc 5150 1 Inf 3 0 4 0 NM_198420 refGene chr15 78254070 - 48182 graph_last l 18 67 cggaggtcct 5151 1 2.33333333333333 7 3 9 1 BM948822 all_est chr17 56358803 - 60235 graph_last l 5 29 cggagttggc 5152 1 2.66666666666667 8 3 11 1 cggatcctga 5153 1 Inf 4 0 5 0 NM_172585 refGene chr13 9357027 + 32504 graph_last l 17 57 cggatctcct 5154 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_027353 refGene chr7 119285119 - 125169 graph_last 1 17 cggcacggca 5155 1 0.333333333333333 2 6 3 2 cggcagacag 5156 1 Inf 5 0 6 0 NM_007906 refGene chr2 180996097 - 82448 graph_second l 20 45 cggcagactg 5157 1 Inf 5 0 6 0 NM_133699 refGene chr12 17676661 + 26516 graph_last l 29 105 cggccactgg 5158 1 1.55555555555556 14 9 18 3 NM_020569 refGene chr4 149021423 - 99438 graph_last 6 19 cggcgagccg 5159 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr12 13064562 + 0 unique_short s 0 6 cggctcggtc 5160 1 Inf 2 0 3 0 NM_174991 refGene chr15 76290922 + 48001 graph_second l 5 10 cggctgagaa 5161 1 Inf 3 0 4 0 NM_008634 refGene chr13 97868509 + 37324 graph_last 9 19 cgggaaagca 5162 1 Inf 3 0 4 0 NM_138749 refGene chr15 90824776 - 49240 graph_last l 11 31 cgggacccca 5163 1 Inf 5 0 7 0 NM_013733 refGene chr17 55997519 - 60191 graph_last l 13 27 cgggagaaag 5164 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cgggagatgc 5165 1 1.10869565217391 51 46 67 16 NM_008131 refGene chr1 157362291 + 7351 graph_last 22 65 cgggaggaga 5166 1 Inf 2 0 3 0 NM_009279 refGene chrX 63392760 + 149195 graph_last l 17 33 cgggcaccta 5167 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cgggcgtcct 5168 1 Inf 2 0 3 0 NM_025835 refGene chr9 103410948 - 140823 graph_last l 9 41 cgggctccac 5169 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_134023 refGene chr11 4113341 + 17264 graph_last l 18 60 cggggaggcg 5170 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_010064 refGene chr2 71604438 - 75596 graph_last l 11 32 cggggaggga 5171 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr4 150452049 + 0 unique_long l 16 36 cggggcccgc 5172 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_130862 refGene chr11 119550464 + 25505 graph_last l 2 7 cgggtcaagg 5173 1 Inf 2 0 3 0 BY732140 all_est chr5 143716645 + 108420 graph_second 0 6 cgggtgctgg 5174 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cgggttgtct 5175 1 Inf 4 0 5 0 cggtccctaa 5176 1 Inf 2 0 3 0 NM_009867 refGene chr2 179710310 + 82311 graph_last l 4 41 cggtgagaca 5177 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_146176 refGene chr7 3716061 + 118482 graph_last 0 3 cggtggctgg 5178 1 Inf 2 0 3 0 NM_010753 refGene chr5 32721899 - 101848 graph_last l 4 30 cggtgtgcca 5179 1 Inf 3 0 4 0 NM_173446 refGene chr8 9260273 - 127807 graph_last l 18 37 cgtacagtat 5180 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_018810 refGene chr6 39494703 - 111972 graph_last 0 5 cgtaccctga 5181 1 Inf 2 0 3 0 cgtactcaat 5182 1 Inf 2 0 3 0 NM_023603 refGene chr4 125940891 + 97273 graph_last 13 41 cgtactgagc 5183 1 1.33333333333333 12 9 16 3 NM_025301 refGene chr7 97942114 - 123913 graph_last l 27 54 cgtatggctg 5184 1 Inf 5 0 7 0 NM_021549 refGene chr7 37781909 - 120715 graph_last 6 67 cgtcactgcc 5185 1 0.928571428571429 13 14 17 5 NM_025709 refGene chr2 34950213 - 73642 graph_last l 15 37 cgtccttcct 5186 1 2.33333333333333 7 3 9 1 cgtcgaaaaa 5187 1 Inf 2 0 3 0 NM_026071 refGene chr11 115120796 - 25109 graph_last 0 13 cgtctcacct 5188 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_175477 refGene chr7 19560631 + 119476 graph_last 1 11 cgtctggcag 5189 1 Inf 3 0 4 0 NM_029933 refGene chr3 99978135 - 87524 graph_last b 8 37 cgtgaaacgt 5190 1 2 6 3 8 1 cgtgagtgca 5191 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_025830 refGene chr8 109090978 + 133200 graph_last l 6 15 cgtgagtgtg 5192 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_020591 refGene chr11 68912604 + 21005 graph_last l 26 59 cgtgatggag 5193 1 Inf 2 0 3 0 NM_133955 refGene chr8 125459480 + 134287 graph_last l 12 30 cgtgcaagca 5194 1 Inf 2 0 3 0 NM_021563 refGene chr13 102309285 - 37606 graph_last 1 5 cgtgcaccta 5195 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cgtgcacgtg 5196 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_026003 refGene chr19 26363863 + 68879 graph_last l 33 89 cgtgcagaca 5197 1 2 12 6 16 2 NM_138670 refGene chr15 79758143 + 48320 graph_last l 5 20 cgtgcccagc 5198 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_025680 refGene chr2 158510168 + 80898 graph_last 1 22 cgtggcagct 5199 1 Inf 5 0 7 0 NM_030246 refGene chr12 79510635 + 29627 graph_last l 9 42 cgtgggatat 5200 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_025899 refGene chr7 112711791 + 124751 graph_last l 123 238 cgtgtattta 5201 1 0.916666666666667 11 12 14 4 NM_025801 refGene chr4 147263369 - 99238 graph_last l 4 35 cgtgtgggct 5202 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_027985 refGene chr4 146258705 + 99141 graph_last l 10 31 cgttattgtt 5203 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_021549 refGene chr7 37813240 - 120715 graph_last l 5 32 cgttcaccat 5204 1 1.33333333333333 4 3 5 1 AK048138 knownGene chr15 80705321 - 48408 graph_last l 59 103 cgttccacca 5205 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_022985 refGene chr7 76859514 - 122699 graph_last l 6 19 cgttgatctt 5206 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_010906 refGene chr8 85561389 + 131845 graph_last 12 30 cgttgctggg 5207 1 Inf 2 0 3 0 NM_009584 refGene chr5 19858012 + 100918 graph_last l 9 68 cgttggattc 5208 1 1.33333333333333 8 6 10 2 NM_033565 refGene chr11 53046206 + 19888 graph_last l 23 73 cgtttaatgt 5209 1 1.33333333333333 8 6 11 2 BC046514 knownGene chr7 21191572 + 119611 graph_last l 208 366 cgtttactgg 5210 1 0.888888888888889 8 9 11 3 NM_020558 refGene chr11 17166832 + 17869 graph_last l 2 15 cgtttgtaga 5211 1 Inf 2 0 3 0 NM_008974 refGene chr4 128752989 + 97529 graph_last 40 105 cgttttctga 5212 1 2.5 15 6 20 2 NM_177088 refGene chr11 106444277 + 24538 graph_last l 19 56 ctaaaaagtg 5213 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_020510 refGene chr11 102271794 + 24104 graph_last 1 7 ctaaagaagc 5214 1 Inf 3 0 4 0 NM_027269 refGene chr12 65082165 + 28520 graph_last 0 2 ctaaatatat 5215 1 Inf 2 0 3 0 NM_153792 refGene chr17 24103116 - 57802 graph_last l 12 44 ctaacagaat 5216 1 2 6 3 8 1 NM_010591 refGene chr4 94098628 - 95096 graph_last l 7 27 ctaacgcagc 5217 1 1 3 3 4 1 NM_031843 refGene chr2 25618086 + 72834 graph_last l 11 28 ctaactaact 5218 1 0.5 3 6 4 2 NM_175459 refGene chr19 27806158 - 68958 graph_last 0 475 ctaactagtt 5219 1 Inf 2 0 3 0 NM_021393 refGene chr2 25466341 - 72801 graph_last l 23 49 ctaactgaga 5220 1 Inf 5 0 7 0 ctaagaaaac 5221 1 Inf 3 0 4 0 ctaagactct 5222 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctaaggtggg 5223 1 2 6 3 8 1 ctaagtgaca 5224 1 Inf 2 0 3 0 NM_025891 refGene chr5 22755555 + 101139 graph_last l 22 81 ctaagtttct 5225 1 0.714285714285714 10 14 13 5 ctaataaaca 5226 1 1.66666666666667 5 3 7 1 ctaataaagc 5227 1 0.861386138613861 87 101 114 35 ctaatacata 5228 1 Inf 5 0 6 0 NM_175162 refGene chr8 47180740 + 129791 graph_last 1 10 ctaatctcgg 5229 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctaatcttct 5230 1 Inf 2 0 3 0 ctaatggcca 5231 1 Inf 3 0 4 0 NM_010025 refGene chrX 132126306 + 151844 graph_last 0 4 ctaatggcta 5232 1 Inf 2 0 3 0 NM_028227 refGene chr5 120351266 + 106621 graph_last 6 12 ctaattaaga 5233 1 Inf 2 0 3 0 NM_019499 refGene chr6 67139905 + 113462 graph_last 1 8 ctaattattt 5234 1 Inf 3 0 4 0 NM_019758 refGene chr2 91479660 + 76776 graph_last 16 46 ctacaaaaag 5235 1 1.66666666666667 5 3 7 1 genomic chr2 3245824 - 0 unique_long l 11 32 ctacaaaacg 5236 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_133786 refGene chr3 70613613 + 85766 graph_last 0 7 ctacaagtaa 5237 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_028223 refGene chr5 107615405 + 105683 graph_last l 8 23 ctacactgac 5238 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_011495 refGene chr3 41808086 + 84472 graph_last 0 2 ctacactttc 5239 1 Inf 2 0 3 0 NM_024427 refGene chr9 69506915 - 138896 graph_last l 3 13 ctacagacca 5240 1 Inf 5 0 6 0 AK122380 knownGene chr8 84801596 + 131761 graph_last l 67 149 ctacagttcc 5241 1 0.88235294117647 15 17 19 6 NM_013907 refGene chr19 45675006 - 70117 graph_last l 11 31 ctaccattgt 5242 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctacccctgg 5243 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_021513 refGene chr8 107381711 + 133021 graph_last l 14 33 ctacccggtt 5244 1 Inf 5 0 6 0 NM_012042 refGene chr6 47838029 + 112401 graph_last l 18 57 ctaccgcact 5245 1 1.33333333333333 8 6 11 2 NM_008306 refGene chr18_random 19020136 + 67120 graph_last l 12 51 ctacctagct 5246 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_148673 refGene chr11 43347418 + 19280 graph_last 0 12 ctaccttttg 5247 1 1.66666666666667 5 3 6 1 ctagaaccta 5248 1 Inf 2 0 3 0 NM_172616 refGene chr16 49299000 + 54153 graph_last 1 3 ctagaataga 5249 1 Inf 2 0 3 0 NM_009130 refGene chr9 78170170 - 139569 graph_last l 81 178 ctagacacct 5250 1 1.33333333333333 8 6 10 2 NM_175684 refGene chr18 38076245 + 64118 graph_last l 59 133 ctagagcgtg 5251 1 0.444444444444444 4 9 5 3 AK045300 knownGene chr5 73834449 + 103850 graph_last 2 15 ctagatcatt 5252 1 1 3 3 4 1 NM_009071 refGene chr18 10300949 - 62780 graph_last l 5 13 ctagatgttg 5253 1 Inf 2 0 3 0 NM_025692 refGene chr9 106592695 - 141043 graph_last l 15 33 ctagcaaggc 5254 1 1 3 3 4 1 ctagcagatt 5255 1 Inf 2 0 3 0 NM_011602 refGene chr4 42822772 - 92658 graph_last 1 14 ctagccagga 5256 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctagcctggg 5257 1 1 3 3 4 1 NM_172755 refGene chr8 70418108 - 130912 graph_last l 23 73 ctagctaaat 5258 1 1.66666666666667 5 3 7 1 ctaggagaag 5259 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctaggcaaat 5260 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctaggcaagc 5261 1 Inf 5 0 6 0 NM_175450 refGene chr10 82270894 + 14019 graph_last l 13 43 ctaggcagcc 5262 1 Inf 5 0 6 0 NM_017478 refGene chrUn_random 11887088 - 143090 graph_last 2 21 ctaggcaggc 5263 1 Inf 2 0 3 0 NM_145218 refGene chr5 129992486 + 107379 graph_last l 8 30 ctagggtaac 5264 1 0.5 3 6 4 2 X57780 knownGene chrM 2064 - 142531 graph_last 77 115 ctagtcccta 5265 1 Inf 2 0 3 0 NM_025795 refGene chr15 91058988 - 49261 graph_last l 4 19 ctagtcgcaa 5266 1 Inf 2 0 3 0 ctagtctctg 5267 1 Inf 2 0 3 0 NM_177682 refGene chr5 142836056 - 108348 graph_last l 41 77 ctagtgactg 5268 1 1.33333333333333 8 6 10 2 NM_011914 refGene chr5 32400879 - 101823 graph_last l 5 12 ctagtggaca 5269 1 Inf 2 0 3 0 NM_146087 refGene chr18 61708085 + 65292 graph_last l 4 12 ctagtggttt 5270 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ctagtgttga 5271 1 0.6 12 20 16 7 NM_146200 refGene chr7 118691607 - 125113 graph_last 35 108 ctagttcgga 5272 1 2 12 6 16 2 BC047049 knownGene chrX 28431006 - 147905 graph_last 0 7 ctatagtaga 5273 1 Inf 4 0 5 0 ctatattaac 5274 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_176927 refGene chr9 82817836 + 139805 graph_last l 5 15 ctatcaatga 5275 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_019811 refGene chr2 156115918 - 80658 graph_last l 40 67 ctatccttga 5276 1 1.66666666666667 5 3 6 1 AK088459 knownGene chr3 29524934 + 83838 graph_last s 3 11 ctatcgtcat 5277 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_144954 refGene chr16 16691812 + 51876 graph_last l 4 17 ctatctgccc 5278 1 1 3 3 4 1 NM_011026 refGene chr5 121995655 + 106813 graph_last 67 209 ctatcttgtc 5279 1 1.07142857142857 15 14 19 5 genomic chr4 47698632 + 0 unique_long l 2 7 ctatgaaatg 5280 1 Inf 2 0 3 0 NM_009190 refGene chr1 109119504 - 5287 graph_last 17 41 ctatgctata 5281 1 Inf 5 0 6 0 BE649194 all_est chr7 70596618 - 122234 graph_last 0 5 ctatggaatg 5282 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BC050210 knownGene chr1 37245345 - 1535 graph_last 1 18 ctatggatac 5283 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_009440 refGene chrX 93368218 - 150509 graph_last l 22 55 ctatgtgttg 5284 1 1 20 20 26 7 ctattaaaaa 5285 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_145422 refGene chr10 88338778 - 14527 graph_last l 50 161 ctattaaata 5286 1 0.416666666666667 5 12 7 4 NM_009551 refGene chr19 21463372 + 68566 graph_last 171 278 ctattcagca 5287 1 1.44444444444444 13 9 17 3 ctattgcctg 5288 1 Inf 3 0 4 0 NM_030228 refGene chr11 4958523 - 17342 graph_last 0 43 ctatttaatt 5289 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_175266 refGene chr9 113881394 + 141650 graph_last l 7 15 ctatttagta 5290 1 Inf 2 0 3 0 ctatttcaaa 5291 1 1.22222222222222 11 9 14 3 NM_023044 refGene chr19 10865765 - 68039 graph_last l 20 41 ctattttatt 5292 1 Inf 3 0 4 0 ctattttgtt 5293 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctcaaaggct 5294 1 1.33333333333333 4 3 5 1 ctcaagcacc 5295 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ctcaatccca 5296 1 1.33333333333333 8 6 11 2 NM_172964 refGene chr17 68184885 + 60835 graph_last 0 42 ctcacaagaa 5297 1 Inf 5 0 6 0 NM_080595 refGene chr11 4967702 + 17352 graph_last l 25 153 ctcacaaggg 5298 1 0.692307692307692 18 26 24 9 CK329701 all_est chr4 32325759 - 92022 graph_last 0 16 ctcacacaca 5299 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctcacaccta 5300 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_009147 refGene chr12 54331084 - 28217 graph_second 0 44 ctcacagaga 5301 1 1.33333333333333 4 3 5 1 ctcaccaaaa 5302 1 Inf 2 0 3 0 BC021827 knownGene chr16 43939034 + 53852 graph_last 3 12 ctcaccctgg 5303 1 Inf 2 0 3 0 NM_007508 refGene chr16 44062095 - 53860 graph_last l 42 142 ctcagaaagc 5304 1 0.5 3 6 4 2 NM_147176 refGene chr13 91665654 - 36900 graph_last l 28 54 ctcagagatg 5305 1 0.5 3 6 4 2 NM_011035 refGene chr7 90025637 + 123245 graph_last l 246 410 ctcagaggtc 5306 1 0.647058823529412 11 17 15 6 NM_175407 refGene chr10 44614990 - 12030 graph_last l 4 21 ctcagcgctg 5307 1 2.66666666666667 8 3 10 1 NM_025449 refGene chr9 110936232 + 141362 graph_last l 21 50 ctcagggtgc 5308 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_007792 refGene chr10 113495663 + 15785 graph_last 0 38 ctcagtaatg 5309 1 0.647058823529412 11 17 14 6 NM_175162 refGene chr8 47054021 - 129791 graph_last 0 11 ctcagtatca 5310 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BC054080 knownGene chr18 42931922 + 64364 graph_last l 4 11 ctcatagaag 5311 1 Inf 2 0 3 0 NM_011385 refGene chr4 153267828 - 99724 graph_last l 8 36 ctcatcaatt 5312 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_024219 refGene chr8 121050628 + 133890 graph_last l 56 134 ctcatccggc 5313 1 0.833333333333333 10 12 13 4 NM_026375 refGene chr1 183783465 - 9014 graph_last l 6 15 ctcattgcct 5314 1 Inf 2 0 3 0 ctcatttgca 5315 1 Inf 2 0 3 0 NM_023122 refGene chrX 154397432 + 152747 graph_last l 3 9 ctccaacata 5316 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_009142 refGene chr8 96065511 + 132522 graph_last l 78 152 ctccacagaa 5317 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026932 refGene chr4 117742000 + 96627 graph_last 6 21 ctccaccttg 5318 1 Inf 2 0 3 0 ctccactatg 5319 1 Inf 4 0 5 0 ctccaggaca 5320 1 Inf 2 0 3 0 ctccagggca 5321 1 1.83333333333333 11 6 15 2 NM_025485 refGene chr9 100987816 - 140653 graph_last l 8 31 ctccatccag 5322 1 0.5 3 6 4 2 ctcccacaca 5323 1 Inf 2 0 3 0 BC019627 all_mrna chr2 175874706 + 82059 graph_last 7 13 ctcccacatt 5324 1 Inf 2 0 3 0 ctcccacctt 5325 1 0.777777777777778 7 9 9 3 ctcccatcct 5326 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_145417 refGene chr1 138182748 - 6496 graph_last l 14 42 ctccccctag 5327 1 2 6 3 8 1 NM_007829 refGene chr17 33554062 + 58791 graph_last l 3 29 ctccccgtgc 5328 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_010811 refGene chr14 15600211 + 39447 graph_last 0 10 ctccctcctg 5329 1 Inf 3 0 4 0 NM_011717 refGene chr17 32017896 - 58646 graph_last l 2 16 ctccctctgc 5330 1 0.5 3 6 4 2 NM_025794 refGene chr3 81427520 + 86145 graph_last l 25 64 ctccctgttg 5331 1 Inf 5 0 7 0 ctcccttctg 5332 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_016902 refGene chr2 127992365 - 78970 graph_last 3 15 ctccgattcc 5333 1 1 3 3 4 1 BU558383 all_est chr11 67260041 + 20870 graph_last l 19 41 ctccggctgc 5334 1 Inf 2 0 3 0 NM_023799 refGene chr19 45886931 - 70128 graph_last 0 6 ctccgtatgt 5335 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011882 refGene chr1 157213774 + 7344 graph_second 0 8 ctccgtggtg 5336 1 Inf 5 0 6 0 ctcctaaccc 5337 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_009224 refGene chr7 38523465 + 120795 graph_last l 72 177 ctcctaatct 5338 1 0.65 13 20 17 7 NM_025947 refGene chr2 155872360 - 80627 graph_last 0 13 ctcctacctt 5339 1 Inf 2 0 3 0 ctcctcaaat 5340 1 1.5 18 12 24 4 ctcctcagag 5341 1 1.33333333333333 4 3 5 1 BC030905 knownGene chr10 61961291 + 12761 graph_last 6 19 ctcctccctc 5342 1 Inf 2 0 3 0 NM_011655 refGene chr17 35501335 - 58992 graph_last l 23 98 ctcctcctgc 5343 1 1.42857142857143 20 14 26 5 NM_009454 refGene chr2 79285572 + 76085 graph_last l 15 125 ctcctgaagg 5344 1 1.66666666666667 15 9 20 3 NM_172665 refGene chr2 72246348 + 75652 graph_last l 2 14 ctcctgagtg 5345 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_007513 refGene chr5 147341163 - 108697 graph_last l 6 32 ctcctgcaga 5346 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_021549 refGene chr7 37782274 - 120715 graph_last 36 97 ctcctgtact 5347 1 1.44444444444444 13 9 17 3 ctcctgtctt 5348 1 Inf 3 0 4 0 NM_145970 refGene chr8 84997505 - 131770 graph_last l 3 12 ctcctgttta 5349 1 Inf 2 0 3 0 genomic chr1 38874482 - 0 unique_long l 7 23 ctccttgcat 5350 1 Inf 3 0 4 0 NM_026998 refGene chrUn_random 77607289 - 146279 graph_last l 38 98 ctccttgtat 5351 1 1.33333333333333 8 6 11 2 NM_010311 refGene chr10 77156594 + 13630 graph_last l 23 49 ctcgagaggc 5352 1 0.5 3 6 4 2 NM_175187 refGene chr13 82399746 + 36507 graph_last l 5 19 ctcgagggaa 5353 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctcgagtttc 5354 1 0.666666666666667 8 12 10 4 BB734897 all_est chr2 40859858 - 74034 graph_second 0 4 ctcgcgggtc 5355 1 Inf 3 0 4 0 NM_009021 refGene chr11 59796627 + 20386 graph_last l 13 51 ctcgcttctg 5356 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_023465 refGene chr4 147679039 + 99296 graph_last l 7 34 ctcgctttgg 5357 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_019827 refGene chr16 38048116 + 53446 graph_last l 18 74 ctcggattca 5358 1 0.785714285714286 11 14 14 5 ctcgtctgta 5359 1 Inf 3 0 4 0 NM_173863 refGene chr7 73004123 - 122459 graph_last l 3 12 ctcgtgcaca 5360 1 Inf 3 0 4 0 NM_026313 refGene chr11 93887493 - 23162 graph_last l 6 24 ctcgtttggc 5361 1 Inf 4 0 5 0 NM_008408 refGene chr9 37505818 - 136446 graph_last 0 7 ctctaggtcc 5362 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BC051163 knownGene chr9 59655800 - 138042 graph_last l 14 38 ctctcagctg 5363 1 Inf 2 0 3 0 NM_010818 refGene chr16 45530003 - 53971 graph_last l 39 76 ctctccctat 5364 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_026543 refGene chr11 49858631 + 19656 graph_last l 3 30 ctctccggaa 5365 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_028860 refGene chr11 4379131 - 17283 graph_last l 19 47 ctctctgtgg 5366 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_130796 refGene chr13 112419552 - 38203 graph_last l 6 9 ctctcttaaa 5367 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctctcttcta 5368 1 1.11764705882353 19 17 25 6 NM_011660 refGene chr4 57696420 - 93535 graph_last 68 243 ctctgaaaag 5369 1 0.888888888888889 8 9 10 3 NM_030245 refGene chr1 169989237 - 8174 graph_last 1 9 ctctgctaca 5370 1 Inf 3 0 4 0 NM_145147 refGene chr5_random 37811655 - 109723 graph_last l 6 28 ctctggagcc 5371 1 1.33333333333333 4 3 5 1 genomic chr11 30013082 - 0 unique_long l 19 65 ctctggatgg 5372 1 2.66666666666667 8 3 10 1 NM_013499 refGene chr1 199079076 - 9876 graph_last 2 17 ctctgtctgt 5373 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_007896 refGene chr2 154393537 + 80505 graph_last 37 126 ctctgtggaa 5374 1 1.5 18 12 24 4 ctctgttttc 5375 1 0.666666666666667 4 6 5 2 ctcttactac 5376 1 1.33333333333333 8 6 11 2 NM_177730 refGene chr4 4692333 - 90991 graph_last l 5 17 ctcttatatg 5377 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctcttcccac 5378 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_010488 refGene chr4 109064181 - 96128 graph_last l 8 41 ctcttccctg 5379 1 Inf 5 0 7 0 ctcttggaga 5380 1 Inf 2 0 3 0 NM_008800 refGene chr15 105854386 + 50399 graph_last l 123 248 ctcttggtct 5381 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_177899 refGene chr8 69946642 - 130841 graph_last l 5 16 ctcttgtaag 5382 1 Inf 5 0 6 0 BB627239 all_est chr7 88645332 + 123128 graph_last 0 102 ctgaaaaaaa 5383 1 1.33333333333333 8 6 11 2 NM_007863 refGene chr11 101663710 - 24019 graph_last l 4 25 ctgaaagtga 5384 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctgaaatgat 5385 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_152821 refGene chr8 32624840 + 129055 graph_last l 8 31 ctgaacaagg 5386 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_133839 refGene chr2 50612691 - 74446 graph_last l 12 38 ctgaacacat 5387 1 0.555555555555556 5 9 6 3 ctgaacatct 5388 1 1.18947368421053 113 95 147 33 ctgaactcaa 5389 1 Inf 4 0 5 0 NM_145221 refGene chr14 21475876 - 39847 graph_last 4 18 ctgaactgga 5390 1 Inf 2 0 3 0 NM_030677 refGene chr12 72713587 + 29087 graph_last 0 4 ctgaagagca 5391 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctgaagattc 5392 1 0.666666666666667 8 12 10 4 NM_022653 refGene chr10 83453087 + 14157 graph_last l 10 33 ctgaagcagt 5393 1 1.66666666666667 5 3 6 1 ctgaagggcc 5394 1 Inf 4 0 5 0 ctgaaggtgg 5395 1 Inf 2 0 3 0 ctgaagtgat 5396 1 1 3 3 4 1 NM_139063 refGene chr13 38579447 - 34135 graph_last l 12 44 ctgaagtggg 5397 1 Inf 5 0 6 0 ctgaataaaa 5398 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011306 refGene chr17 33664773 - 58807 graph_last l 25 63 ctgaatatgg 5399 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_033370 refGene chr7 106137142 - 124433 graph_last l 20 52 ctgaatgcat 5400 1 Inf 3 0 4 0 NM_177622 refGene chr13 65553897 - 35834 graph_last 0 4 ctgaatgctt 5401 1 Inf 3 0 4 0 NM_025374 refGene chr17 30256207 - 58484 graph_last 8 38 ctgacaagga 5402 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_138599 refGene chr16 57604903 - 54473 graph_second 1 4 ctgacaatag 5403 1 Inf 3 0 4 0 AK052347 knownGene chr5 82309570 + 104262 graph_last 0 5 ctgacagtcc 5404 1 Inf 2 0 3 0 NM_010486 refGene chr4 89992630 - 94937 graph_last l 16 36 ctgacccact 5405 1 Inf 5 0 6 0 NM_153792 refGene chr17 24102327 + 57802 graph_last l 22 48 ctgaccgctc 5406 1 Inf 2 0 3 0 ctgactctta 5407 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctgactggag 5408 1 Inf 2 0 3 0 NM_145552 refGene chr4 124005958 + 97111 graph_last l 4 36 ctgactgtga 5409 1 1.66666666666667 5 3 6 1 ctgacttaag 5410 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ctgacttttc 5411 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_172599 refGene chr14 39306342 + 40896 graph_last 0 4 ctgagaagaa 5412 1 Inf 2 0 3 0 ctgagaccct 5413 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_027507 refGene chr1 88021236 + 4300 graph_last l 31 113 ctgagacctg 5414 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_008300 refGene chr11 52886881 - 19879 graph_last l 14 41 ctgagcagaa 5415 1 Inf 5 0 7 0 NM_008292 refGene chr18 50208305 - 64722 graph_last l 11 29 ctgagccaga 5416 1 Inf 4 0 5 0 NM_145553 refGene chr4 131786850 - 97804 graph_last 9 20 ctgagcggtt 5417 1 Inf 3 0 4 0 NM_031392 refGene chr9 111192363 - 141407 graph_last l 28 137 ctgagctgca 5418 1 1 12 12 16 4 NM_009045 refGene chr19 5505654 + 67580 graph_last l 13 33 ctgagctgtg 5419 1 0.833333333333333 5 6 6 2 ctgaggcagc 5420 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctgaggggcg 5421 1 1 3 3 4 1 BC019747 knownGene chr1 23541811 - 941 graph_last l 52 121 ctgaggtagt 5422 1 Inf 5 0 7 0 ctgagtacac 5423 1 Inf 2 0 3 0 NM_008440 refGene chr1 94964234 + 4783 graph_last 0 3 ctgagtggag 5424 1 Inf 2 0 3 0 ctgagtgtgg 5425 1 1.33333333333333 8 6 10 2 NM_029546 refGene chr10 80299537 - 13876 graph_last l 7 17 ctgataacta 5426 1 Inf 4 0 5 0 NM_027954 refGene chr8 85747055 + 131861 graph_last 0 5 ctgatattgt 5427 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_138666 refGene chr3 26284644 - 83641 graph_second 1 10 ctgatcaatg 5428 1 Inf 2 0 3 0 NM_009862 refGene chr16 18440248 + 52054 graph_last l 20 72 ctgatccagc 5429 1 2.33333333333333 7 3 9 1 BU743647 all_est chr12 77707507 - 29506 graph_last l 22 34 ctgatctcag 5430 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008666 refGene chr12 24563738 + 26811 graph_last l 66 128 ctgatgtgaa 5431 1 1 9 9 12 3 NM_009538 refGene chr10 12938892 + 10383 graph_last 0 3 ctgatttaga 5432 1 Inf 2 0 3 0 ctgatttcca 5433 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_178623 refGene chr11 5682384 + 17417 graph_last 1 8 ctgcaaacag 5434 1 Inf 2 0 3 0 CB844252 all_est chr10 71490739 + 13365 graph_second 0 33 ctgcaactgt 5435 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011239 refGene chr16 17858972 - 52007 graph_last l 11 45 ctgcaagggt 5436 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_134022 refGene chr11 70603249 + 21213 graph_second l 4 14 ctgcaattat 5437 1 Inf 4 0 5 0 NM_007828 refGene chr10 83553534 + 14173 graph_last l 13 81 ctgcacagtg 5438 1 1.33333333333333 12 9 16 3 NM_147151 refGene chr17 34574112 + 58894 graph_last l 39 82 ctgcaccaag 5439 1 2.66666666666667 8 3 11 1 ctgcaccacc 5440 1 1 3 3 4 1 NM_026360 refGene chr6 136423521 + 117554 graph_last l 12 34 ctgcacctct 5441 1 Inf 5 0 7 0 NM_013908 refGene chr2 25771883 + 72848 graph_last l 26 134 ctgcactcct 5442 1 1.33333333333333 8 6 10 2 NM_007415 refGene chr1 184694356 + 9082 graph_last l 11 28 ctgcactggg 5443 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ctgcactttg 5444 1 Inf 2 0 3 0 ctgcagaaag 5445 1 Inf 5 0 7 0 ctgcagcacc 5446 1 Inf 5 0 6 0 ctgcagcctg 5447 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_080448 refGene chr6 114823998 + 116098 graph_last l 4 14 ctgcagttta 5448 1 Inf 2 0 3 0 ctgcagtttt 5449 1 Inf 2 0 3 0 NM_016709 refGene chr13 52603003 - 34947 graph_last l 20 78 ctgcattaag 5450 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ctgcattttt 5451 1 Inf 4 0 5 0 AA145074 all_est chr8 41943301 + 129549 graph_last 22 83 ctgccaactt 5452 1 0.928571428571429 13 14 17 5 NM_133930 refGene chr6 115252951 + 116143 graph_last l 18 81 ctgccagctc 5453 1 1 3 3 4 1 ctgccagggt 5454 1 Inf 2 0 3 0 ctgcccactg 5455 1 Inf 2 0 3 0 ctgcccagcg 5456 1 Inf 4 0 5 0 NM_153131 refGene chr13 54782585 + 35093 graph_last l 9 25 ctgcccttct 5457 1 Inf 3 0 4 0 NM_016965 refGene chr2 80863021 - 76174 graph_last l 73 316 ctgccgccgc 5458 1 1.5 18 12 23 4 AJ292189 knownGene chr2 9889336 - 71892 graph_last l 3 13 ctgccggcct 5459 1 Inf 3 0 4 0 NM_053246 refGene chr8 96147147 - 132535 graph_second 0 46 ctgcctgaaa 5460 1 0.555555555555556 5 9 6 3 ctgcctgaga 5461 1 Inf 5 0 7 0 NM_178397 refGene chr13 54444423 + 35057 graph_last 1 7 ctgcctgcaa 5462 1 Inf 2 0 3 0 NM_007632 refGene chr17 47051730 + 59732 graph_last l 16 60 ctgccttaat 5463 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_023502 refGene chr3 52736357 + 84774 graph_last l 1 8 ctgcgatgag 5464 1 Inf 2 0 3 0 BE632211 all_est chrUn_random 7803125 + 142887 graph_last 0 698 ctgcggcttc 5465 1 0.652173913043478 15 23 19 8 genomic chr3 86772029 - 0 unique_short s 0 4 ctgcgtgtcg 5466 1 Inf 2 0 3 0 ctgctagcac 5467 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_009871 refGene chr11 80051754 + 22184 graph_last l 45 226 ctgctatgaa 5468 1 1.19230769230769 31 26 41 9 BC046969 knownGene chr1 37119858 - 1517 graph_last l 6 16 ctgctcacct 5469 1 Inf 2 0 3 0 NM_025299 refGene chr18 80184080 + 66345 graph_last l 40 95 ctgctcagta 5470 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_009560 refGene chr7 21286744 + 119616 graph_last l 12 24 ctgctgagac 5471 1 Inf 2 0 3 0 NM_144822 refGene chr10 61727850 + 12734 graph_last l 13 43 ctgctgatgc 5472 1 Inf 2 0 3 0 ctgctgctgc 5473 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctgctggtgg 5474 1 1.33333333333333 8 6 11 2 ctgctttcat 5475 1 Inf 2 0 3 0 ctgctttcca 5476 1 0.888888888888889 8 9 11 3 NM_025710 refGene chr13 30428947 + 33688 graph_last 0 2 ctggaaacaa 5477 1 Inf 2 0 3 0 BB647300 all_est chr12 79131294 + 29599 graph_last l 4 31 ctggaaacag 5478 1 Inf 3 0 4 0 NM_130858 refGene chr11 95093593 - 23294 graph_last l 15 38 ctggaactgt 5479 1 0.555555555555556 5 9 6 3 NM_133925 refGene chr6 28997434 - 111090 graph_last l 4 12 ctggaagatg 5480 1 Inf 4 0 5 0 NM_028767 refGene chr17 47311223 - 59759 graph_last l 3 24 ctggacacct 5481 1 0.666666666666667 4 6 5 2 ctggacactg 5482 1 1 14 14 18 5 BC021314 knownGene chr14 18925192 - 39678 graph_last l 7 28 ctggactaaa 5483 1 0.5 3 6 4 2 AK089817 knownGene chr9 120863517 + 142042 graph_last 0 2 ctggagattg 5484 1 Inf 2 0 3 0 ctggagccaa 5485 1 Inf 2 0 3 0 ctggagcctt 5486 1 Inf 2 0 3 0 NM_133218 refGene chr3 9541736 - 82994 graph_second 0 8 ctggaggcag 5487 1 Inf 2 0 3 0 NM_013739 refGene chr13 55301110 - 35163 graph_last l 5 15 ctggaggcca 5488 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctggagttac 5489 1 Inf 2 0 3 0 ctggatttca 5490 1 Inf 2 0 3 0 NM_145590 refGene chr7 120358554 + 125303 graph_last l 3 18 ctggcacaca 5491 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ctggcacgca 5492 1 0.333333333333333 2 6 3 2 BC020022 knownGene chr12 54579239 - 28237 graph_last l 20 67 ctggcagggg 5493 1 0.666666666666667 2 3 2 1 genomic chr1 184901244 - 0 unique_long l 2 8 ctggccaact 5494 1 Inf 4 0 5 0 ctggccagga 5495 1 Inf 5 0 6 0 ctggccatct 5496 1 2.33333333333333 14 6 18 2 AK014847 all_mrna chr9 81211252 - 139743 graph_last 0 14 ctggccattc 5497 1 Inf 4 0 5 0 NM_010435 refGene chr16 18477372 - 52063 graph_last l 17 51 ctggccctag 5498 1 Inf 5 0 6 0 NM_024177 refGene chr11 115637509 - 25172 graph_last l 24 76 ctggcctctc 5499 1 1 3 3 4 1 ctggcctgga 5500 1 Inf 3 0 4 0 NM_080850 refGene chr1 95312758 + 4805 graph_last l 8 23 ctggccttac 5501 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctggccttca 5502 1 Inf 2 0 3 0 ctggccttga 5503 1 Inf 2 0 3 0 NM_026035 refGene chr11 58802669 + 20297 graph_last 12 45 ctggcgatgc 5504 1 Inf 2 0 3 0 NM_025412 refGene chr15 77603606 - 48102 graph_last l 4 50 ctggcgtgag 5505 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_173048 refGene chr11 115113017 + 25047 graph_last l 4 19 ctggctagaa 5506 1 Inf 3 0 4 0 ctggctcaca 5507 1 Inf 4 0 5 0 NM_029231 refGene chr11 69964265 - 21136 graph_last 1 18 ctggctgatt 5508 1 1 6 6 8 2 BI676999 all_est chr14 35905534 + 40677 graph_second 0 3 ctggctgcaa 5509 1 Inf 2 0 3 0 NM_138748 refGene chr2 30721474 + 73259 graph_last 40 128 ctggctttgt 5510 1 1.5 9 6 12 2 AW492734 all_est chr3 82503662 - 86186 graph_last 0 3 ctgggaaaca 5511 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_020022 refGene chr5 133426544 + 107619 graph_last l 31 94 ctgggaaagc 5512 1 1.33333333333333 8 6 10 2 ctgggaagct 5513 1 Inf 2 0 3 0 NM_172415 refGene chr4 139388833 - 98497 graph_last l 7 31 ctgggaccct 5514 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_009336 refGene chr3 97823540 + 87276 graph_last l 7 48 ctgggaccgg 5515 1 1.22222222222222 11 9 14 3 ctgggagcat 5516 1 Inf 4 0 5 0 NM_013514 refGene chr14 62156344 - 42537 graph_last l 146 324 ctgggagggg 5517 1 0.416666666666667 5 12 6 4 NM_009872 refGene chr1 76438520 + 3664 graph_last l 52 134 ctgggagttg 5518 1 Inf 4 0 5 0 AA048119 all_est chr10 115754445 - 15901 graph_last 97 197 ctgggatcat 5519 1 1.08333333333333 13 12 17 4 NM_026187 refGene chr1 76731152 - 3689 graph_last l 20 64 ctgggatcca 5520 1 0.5 3 6 4 2 ctgggccact 5521 1 Inf 2 0 3 0 ctgggcccag 5522 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_025364 refGene chr10 132094355 + 16863 graph_last 1 6 ctgggcctca 5523 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctgggctctg 5524 1 1 3 3 4 1 NM_020267 refGene chr2 102515763 - 77380 graph_last l 42 96 ctgggcttga 5525 1 0.666666666666667 6 9 8 3 ctggggaagt 5526 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_172633 refGene chr18 86489173 + 66659 graph_last l 8 23 ctgggggctc 5527 1 0.666666666666667 2 3 3 1 genomic chr8 69423982 + 0 unique_long l 7 18 ctgggggggc 5528 1 1 3 3 4 1 AK003337 knownGene chr7 4828780 - 118571 graph_last l 2 14 ctgggggtcc 5529 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ctggggtggg 5530 1 0.862068965517241 25 29 33 10 NM_011785 refGene chr1 180947586 - 8786 graph_last l 18 127 ctgggtaact 5531 1 1.58333333333333 19 12 25 4 NM_025965 refGene chr13 37956710 - 34086 graph_last l 18 51 ctgggtagtt 5532 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_134096 refGene chr15 89446655 + 49173 graph_last l 28 104 ctgggtctcc 5533 1 1.66666666666667 5 3 6 1 ctggtaacac 5534 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_023850 refGene chr2 93230019 + 76987 graph_last l 75 134 ctggtacgtt 5535 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_018875 refGene chrX 91114723 - 150314 graph_last l 7 25 ctggtagctg 5536 1 0.333333333333333 2 6 3 2 ctggtcaggc 5537 1 Inf 2 0 3 0 NM_021492 refGene chr7_random 36635318 + 127253 graph_second 1 12 ctggtgaagg 5538 1 Inf 2 0 3 0 ctggtggcaa 5539 1 Inf 2 0 3 0 ctggtggctg 5540 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008997 refGene chr17 33385280 - 58766 graph_last 20 98 ctggtgggca 5541 1 0.785714285714286 11 14 14 5 NM_009030 refGene chr4 128222870 - 97446 graph_last l 5 19 ctggtgggtt 5542 1 Inf 4 0 5 0 NM_177445 refGene chr1 131064399 - 5998 graph_last 47 76 ctggtggtgg 5543 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AW106530 all_est chr19 31710253 + 69242 graph_last 0 25 ctggtgttgt 5544 1 Inf 2 0 3 0 NM_016670 refGene chr17 31258639 + 58561 graph_second l 7 16 ctggttcata 5545 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_027400 refGene chr18 66333589 - 65580 graph_last l 4 19 ctggttggag 5546 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctggtttata 5547 1 Inf 2 0 3 0 NM_011668 refGene chr7 52384572 + 121425 graph_last 3 26 ctgtaaacaa 5548 1 Inf 3 0 4 0 genomic chr19 29300333 - 0 unique_long l 7 17 ctgtaaactc 5549 1 1.33333333333333 4 3 5 1 ctgtaaatag 5550 1 1 3 3 4 1 ctgtaaatgt 5551 1 0.571428571428571 8 14 11 5 NM_013668 refGene chrX 139971503 + 152165 graph_last l 7 39 ctgtaataaa 5552 1 0.333333333333333 2 6 3 2 ctgtaatctt 5553 1 Inf 4 0 5 0 NM_028152 refGene chr19 41974918 - 69845 graph_last 0 5 ctgtaatgac 5554 1 Inf 2 0 3 0 NM_016696 refGene chr1 94806737 + 4762 graph_last l 37 70 ctgtacaggg 5555 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_054102 refGene chr1 154790211 + 7138 graph_last 3 9 ctgtacatac 5556 1 Inf 2 0 3 0 NM_019962 refGene chr1 139100464 + 6571 graph_last l 17 102 ctgtacattt 5557 1 1.2 24 20 31 7 ctgtagatgc 5558 1 Inf 3 0 4 0 NM_026768 refGene chr17 45523590 - 59532 graph_last l 8 25 ctgtaggaag 5559 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_029826 refGene chr18 76954446 + 66184 graph_last 9 38 ctgtaggtat 5560 1 Inf 4 0 5 0 ctgtaggtga 5561 1 1.06779661016949 126 118 164 41 AK122545 knownGene chr4 107089546 - 95919 graph_last l 42 93 ctgtatattc 5562 1 1 6 6 8 2 NM_008565 refGene chr16 15224446 - 51773 graph_last 1 9 ctgtatgtag 5563 1 Inf 5 0 7 0 NM_020005 refGene chr17 53357076 + 60083 graph_last l 5 13 ctgtatgttc 5564 1 1 3 3 4 1 NM_021448 refGene chr18 25268369 + 63413 graph_last l 49 141 ctgtcaaaga 5565 1 0.888888888888889 8 9 11 3 genomic chr16 20017777 - 0 unique_long l 13 18 ctgtcaggat 5566 1 Inf 2 0 3 0 ctgtcatctt 5567 1 1.66666666666667 5 3 7 1 ctgtccactg 5568 1 Inf 2 0 3 0 NM_027230 refGene chr2 166398317 - 81423 graph_last l 22 57 ctgtccgtta 5569 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_028328 refGene chr3 98455382 + 87367 graph_last 0 8 ctgtctcaaa 5570 1 Inf 3 0 4 0 NM_011256 refGene chr5 123054732 - 106944 graph_last l 30 88 ctgtctggcc 5571 1 0.5 3 6 4 2 ctgtcttctg 5572 1 Inf 5 0 6 0 NM_172771 refGene chr9 56481377 - 137771 graph_last l 43 75 ctgtgaaata 5573 1 0.666666666666667 4 6 5 2 genomic chr11 100718543 + 0 unique_long l 5 17 ctgtgaagcc 5574 1 Inf 3 0 4 0 ctgtgaccca 5575 1 Inf 2 0 3 0 ctgtgcaaac 5576 1 0.333333333333333 2 6 3 2 ctgtgctggg 5577 1 Inf 2 0 3 0 NM_008441 refGene chr4 147349004 - 99242 graph_last 2 9 ctgtgcttgc 5578 1 Inf 4 0 5 0 ctgtggaaga 5579 1 0.777777777777778 7 9 9 3 ctgtgtaaag 5580 1 1.33333333333333 8 6 11 2 NM_009149 refGene chr8 112785666 - 133441 graph_last l 24 80 ctgtgtaatt 5581 1 Inf 4 0 5 0 NM_011951 refGene chr12 33832632 - 27251 graph_last 8 35 ctgtgttagg 5582 1 Inf 5 0 7 0 NM_009536 refGene chr11 75336791 - 21637 graph_last l 26 78 ctgtgtttca 5583 1 Inf 3 0 4 0 ctgttagaac 5584 1 Inf 4 0 5 0 NM_021556 refGene chr13 117233248 - 38426 graph_last 15 31 ctgttatggc 5585 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ctgttcagtg 5586 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AK122296 knownGene chr3 97199625 - 87208 graph_last 2 10 ctgttcctga 5587 1 0.666666666666667 2 3 2 1 genomic chr13 43723207 + 0 unique_long l 8 47 ctgttgaatg 5588 1 2.66666666666667 8 3 10 1 NM_153540 refGene chr9 124376085 - 142293 graph_last l 12 37 ctgtttcctg 5589 1 Inf 2 0 3 0 NM_194462 refGene chr5 4057659 + 100160 graph_last 0 2 ctgtttggca 5590 1 Inf 2 0 3 0 AK122548 knownGene chr2 36003323 + 73710 graph_last l 7 41 ctgtttgggt 5591 1 0.833333333333333 5 6 7 2 BC044772 knownGene chr12 19510819 + 26628 graph_last l 43 59 ctgtttttac 5592 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cttaaaaaaa 5593 1 1 3 3 4 1 cttaaactgc 5594 1 Inf 2 0 3 0 NM_010771 refGene chr18 35775083 + 63875 graph_last l 15 55 cttaataaaa 5595 1 0.666666666666667 4 6 5 2 cttaattaag 5596 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_198013 refGene chr11 87749208 + 22857 graph_last 5 17 cttacgagga 5597 1 Inf 4 0 5 0 NM_194341 refGene chr11 83572365 + 22428 graph_last l 5 25 cttactctga 5598 1 1 3 3 4 1 NM_176860 refGene chr9 42608114 - 136851 graph_last l 8 19 cttaggggac 5599 1 Inf 3 0 4 0 NM_053202 refGene chr6 100582410 - 115476 graph_last l 10 31 cttagtctaa 5600 1 Inf 3 0 4 0 NM_030238 refGene chr12 106234921 - 31229 graph_last l 6 19 cttagtgttt 5601 1 Inf 2 0 3 0 NM_025279 refGene chr13 58182509 - 35372 graph_last l 13 21 cttataataa 5602 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_025333 refGene chr19 10425547 - 68003 graph_last l 11 34 cttataatgg 5603 1 Inf 5 0 7 0 NM_026604 refGene chr1 24184013 - 978 graph_last 7 17 cttattaaaa 5604 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cttcaagtat 5605 1 Inf 2 0 3 0 AK006380 all_mrna chr8 71288460 + 131021 graph_last 0 20 cttcaagtct 5606 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_153782 refGene chr11 109331499 + 24799 graph_last l 16 35 cttcactcac 5607 1 Inf 4 0 5 0 cttcagaagt 5608 1 Inf 2 0 3 0 BC057382 knownGene chr14 44059587 - 41177 graph_last l 15 34 cttcatcatc 5609 1 1 6 6 8 2 cttcatctga 5610 1 Inf 2 0 3 0 NM_178923 refGene chr16 91561773 - 55890 graph_last 74 327 cttccccggg 5611 1 1.64705882352941 28 17 36 6 NM_173755 refGene chr11 116043449 - 25222 graph_last 25 58 cttcccgggc 5612 1 1 3 3 4 1 cttcccgggg 5613 1 Inf 2 0 3 0 NM_133937 refGene chr6 115376406 + 116150 graph_last l 80 189 cttccctaat 5614 1 0.5 6 12 8 4 cttccctgtt 5615 1 Inf 2 0 3 0 cttccgtgaa 5616 1 Inf 2 0 3 0 cttccgtggg 5617 1 Inf 2 0 3 0 cttcctgccg 5618 1 Inf 3 0 4 0 cttcctgcta 5619 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_024181 refGene chr2 80715323 + 76160 graph_last l 11 24 cttcctggag 5620 1 Inf 2 0 3 0 NM_025287 refGene chr11 95075316 + 23280 graph_last l 26 64 cttcggatgt 5621 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_024194 refGene chr3 162412720 + 90676 graph_last 0 23 cttcgtgttc 5622 1 Inf 2 0 3 0 NM_177833 refGene chr18_random 24375 + 66769 graph_last 0 11 cttctagact 5623 1 Inf 2 0 3 0 cttctcattt 5624 1 0.857142857142857 30 35 39 12 cttctctgtc 5625 1 Inf 2 0 3 0 NM_025750 refGene chr13 34921092 - 33907 graph_last l 22 85 cttctctgtg 5626 1 0.777777777777778 7 9 9 3 BI415812 all_est chr5 117010843 - 106432 graph_last l 2 24 cttctcttct 5627 1 Inf 5 0 6 0 cttctcttgt 5628 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_026932 refGene chr4 117746150 + 96627 graph_last 0 4 cttctgctcg 5629 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_009188 refGene chr8 73466745 + 131203 graph_last l 12 36 cttctgggga 5630 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cttctggtgt 5631 1 0.833333333333333 5 6 6 2 NM_178884 refGene chr1 77037020 + 3711 graph_last l 40 92 cttctgtctc 5632 1 1 3 3 4 1 cttctgttcc 5633 1 0.833333333333333 5 6 7 2 cttcttactg 5634 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_010771 refGene chr18 35743371 + 63875 graph_last 3 10 cttcttgaat 5635 1 0.666666666666667 2 3 2 1 cttcttgtgt 5636 1 0.555555555555556 5 9 6 3 cttctttatt 5637 1 Inf 2 0 3 0 BC030462 knownGene chr3 17675112 + 83295 graph_last l 4 12 cttgaatttc 5638 1 Inf 2 0 3 0 NM_009168 refGene chr17 55904784 + 60185 graph_last l 11 35 cttgacaggt 5639 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_028190 refGene chr17 25874601 + 58002 graph_last 4 9 cttgacctgt 5640 1 Inf 2 0 3 0 cttgacttta 5641 1 Inf 2 0 3 0 cttgaggccc 5642 1 Inf 2 0 3 0 NM_178606 refGene chr10 68908458 - 13179 graph_last l 10 29 cttgaggtac 5643 1 Inf 3 0 4 0 cttgattttt 5644 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cttgcaagtg 5645 1 1.5 18 12 24 4 NM_054040 refGene chr17 3137164 - 56519 graph_last 0 5 cttgcaccca 5646 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_181066 refGene chr5 139451798 + 108110 graph_last 8 14 cttgcacggc 5647 1 Inf 2 0 3 0 cttgccaaga 5648 1 Inf 2 0 3 0 BC045204 knownGene chr11 120861844 + 25687 graph_last 1 10 cttgcccagg 5649 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_173401 refGene chr4 146266322 - 99145 graph_last l 27 62 cttgcctaga 5650 1 0.5 3 6 4 2 Y00769 knownGene chr8 130643980 + 134632 graph_last 0 71 cttgctctgt 5651 1 2 6 3 8 1 NM_009298 refGene chr2 27157709 - 72965 graph_last 0 22 cttgctggct 5652 1 Inf 2 0 3 0 CF949846 all_est chr6 150526298 - 118305 graph_last 1 4 cttgcttggt 5653 1 Inf 2 0 3 0 NM_026025 refGene chr15 95235825 - 49499 graph_last l 58 112 cttggcgagc 5654 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_183149 refGene chr17 24275433 + 57814 graph_last l 10 45 cttggctgag 5655 1 1 3 3 4 1 BC026435 knownGene chr4 44686007 - 92828 graph_last l 16 44 cttgggttcc 5656 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_009481 refGene chrX 11223795 - 147308 graph_last 1 8 cttggtactt 5657 1 Inf 3 0 4 0 NM_020601 refGene chrX 67443652 + 149423 graph_last 1 4 cttggtgaat 5658 1 Inf 3 0 4 0 NM_199024 refGene chr18 23185703 - 63282 graph_last l 21 37 cttgtactag 5659 1 1 3 3 4 1 BB672243 all_est chr5 111254180 - 105942 graph_last l 50 254 cttgtagctg 5660 1 0.844827586206897 49 58 64 20 cttgtattta 5661 1 Inf 4 0 5 0 cttgtcactc 5662 1 Inf 5 0 6 0 cttgtcatca 5663 1 Inf 2 0 3 0 NM_009744 refGene chr16 23588583 - 52412 graph_last l 5 22 cttgtcgtta 5664 1 0.666666666666667 2 3 3 1 CA951410 all_est chr11 74632052 - 21537 graph_second 0 2 cttgtctgta 5665 1 Inf 2 0 3 0 cttgttctct 5666 1 Inf 3 0 4 0 NM_019772 refGene chr7 108055306 + 124527 graph_last 30 79 cttgtttagt 5667 1 0.555555555555556 5 9 6 3 ctttaaaaaa 5668 1 Inf 2 0 3 0 NM_010771 refGene chr18 35750208 + 63875 graph_last l 12 24 ctttaacaaa 5669 1 Inf 3 0 4 0 ctttaatttt 5670 1 0.333333333333333 2 6 3 2 CF893244 all_est chr15 67380588 - 47620 graph_second l 9 26 ctttaccctt 5671 1 Inf 3 0 4 0 ctttacctag 5672 1 1 3 3 4 1 NM_153055 refGene chr10 44426250 + 12010 graph_last l 6 13 ctttagaact 5673 1 0.666666666666667 2 3 2 1 ctttaggctt 5674 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_008229 refGene chr10 38126090 + 11616 graph_last l 16 92 ctttatgtga 5675 1 1.22222222222222 11 9 15 3 NM_025321 refGene chr1 174987404 - 8431 graph_last 0 72 ctttcaatcc 5676 1 1.66666666666667 5 3 6 1 genomic chr7 91581895 - 0 unique_long l 5 12 ctttcatagg 5677 1 Inf 2 0 3 0 AK122572 knownGene chr12 5124193 - 26077 graph_last l 3 7 ctttcatcat 5678 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_013834 refGene chr8 22347179 + 128587 graph_last 2 40 ctttccctgc 5679 1 1.33333333333333 12 9 16 3 NM_019707 refGene chr8 121107678 + 133851 graph_last l 5 12 ctttctactg 5680 1 Inf 2 0 3 0 ctttctcaaa 5681 1 0.888888888888889 8 9 10 3 NM_144859 refGene chr17 64375162 - 60598 graph_last l 61 136 ctttctcact 5682 1 0.833333333333333 5 6 7 2 ctttctcagt 5683 1 Inf 2 0 3 0 NM_145556 refGene chr4 146730674 - 99182 graph_last 0 12 ctttctcatc 5684 1 1 3 3 4 1 NM_029402 refGene chr18 3435730 + 62399 graph_last 0 5 ctttctcccc 5685 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_027216 refGene chr11 112750530 - 24952 graph_last l 6 15 ctttctgccg 5686 1 Inf 2 0 3 0 NM_010198 refGene chr11 69367368 - 21068 graph_last l 3 25 ctttctgtaa 5687 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_021899 refGene chr6 124785286 + 116818 graph_last l 3 16 ctttcttaat 5688 1 Inf 3 0 4 0 ctttcttctc 5689 1 Inf 2 0 3 0 ctttgcaatg 5690 1 1.75 21 12 28 4 NM_178628 refGene chr12 65860812 + 28595 graph_last l 3 8 ctttgcagtg 5691 1 Inf 2 0 3 0 NM_020494 refGene chr12 98979953 - 30809 graph_last 0 13 ctttgctgtg 5692 1 Inf 5 0 7 0 NM_028933 refGene chr11 100760543 - 23933 graph_last l 9 29 ctttgggagt 5693 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_180600 refGene chr9 57323307 + 137839 graph_last l 12 32 ctttggggtt 5694 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ctttggtttc 5695 1 Inf 2 0 3 0 NM_172707 refGene chr5 30841807 + 101693 graph_last l 61 109 ctttgtagtg 5696 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_178804 refGene chr5 47416305 - 102556 graph_last l 11 23 ctttgttggg 5697 1 0.666666666666667 2 3 3 1 ctttgtttgc 5698 1 0.666666666666667 2 3 3 1 cttttaaaaa 5699 1 Inf 5 0 7 0 cttttaatcc 5700 1 Inf 2 0 3 0 AK005756 knownGene chr2 25839904 + 72862 graph_last 0 10 cttttaattc 5701 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_015822 refGene chr14 95903029 - 43767 graph_last l 21 46 cttttcaaga 5702 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_009536 refGene chr11 75336524 - 21637 graph_last l 36 116 cttttcagca 5703 1 1.44444444444444 13 9 17 3 cttttcttat 5704 1 Inf 3 0 4 0 cttttgactt 5705 1 Inf 2 0 3 0 NM_009503 refGene chr4 42269923 - 92606 graph_last 6 49 cttttgagtt 5706 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_133679 refGene chr16 93125087 - 56032 graph_last 3 27 cttttgctat 5707 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008721 refGene chr2 25675748 + 72840 graph_last 0 9 cttttggcag 5708 1 Inf 2 0 3 0 cttttggctt 5709 1 Inf 4 0 5 0 NM_008300 refGene chr11 52912066 - 19879 graph_last l 3 7 cttttgtcga 5710 1 Inf 2 0 3 0 NM_178710 refGene chr9 52926935 - 137588 graph_last l 7 13 ctttttaatt 5711 1 Inf 2 0 3 0 NM_145962 refGene chr11 35432424 + 18936 graph_last 15 47 ctttttatac 5712 1 2.33333333333333 7 3 9 1 ctttttcttt 5713 1 3 9 3 12 1 AB071988 knownGene chr13 55851693 - 35223 graph_second 1 5 ctttttgaca 5714 1 Inf 2 0 3 0 cttttttcaa 5715 1 Inf 2 0 3 0 cttttttctc 5716 1 Inf 2 0 3 0 gaaaaaaaaa 5717 1 1.20930232558140 52 43 68 15 gaaaaaatat 5718 1 0.666666666666667 2 3 2 1 genomic chr1 58317986 + 0 unique_long l 4 32 gaaaaaggaa 5719 1 1.66666666666667 5 3 7 1 gaaaaaggat 5720 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_024209 refGene chr2 39498981 - 73998 graph_last l 7 18 gaaaaagtag 5721 1 0.666666666666667 2 3 3 1 gaaaaataaa 5722 1 Inf 3 0 4 0 gaaaaattga 5723 1 Inf 2 0 3 0 NM_031877 refGene chr10 42467126 - 11865 graph_second l 6 14 gaaaaattta 5724 1 Inf 2 0 3 0 gaaaacacct 5725 1 Inf 5 0 6 0 gaaaacatta 5726 1 Inf 5 0 6 0 gaaaaccaga 5727 1 Inf 2 0 3 0 NM_012018 refGene chr2 35451678 + 73679 graph_last 0 7 gaaaagaatg 5728 1 Inf 2 0 3 0 gaaaagcagg 5729 1 Inf 2 0 3 0 NM_011879 refGene chr18 36866536 + 64015 graph_last 0 4 gaaaagcccc 5730 1 Inf 2 0 3 0 NM_026558 refGene chr4 12105653 - 91349 graph_last l 33 52 gaaaagcctt 5731 1 0.666666666666667 4 6 5 2 gaaaagtcca 5732 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_177295 refGene chr9 7208292 + 134950 graph_second 1 6 gaaaagtgcc 5733 1 1 3 3 4 1 AK089380 knownGene chr14 64089586 - 42613 graph_last l 9 40 gaaaataaaa 5734 1 0.833333333333333 5 6 6 2 gaaaataaac 5735 1 Inf 5 0 7 0 gaaaataaga 5736 1 Inf 2 0 3 0 gaaaataatg 5737 1 Inf 3 0 4 0 AK089567 all_mrna chrUn_random 8590960 + 142895 graph_last 0 5 gaaaatgaaa 5738 1 Inf 3 0 4 0 NM_010579 refGene chr2 156445276 + 80686 graph_last 0 7 gaaaatgagc 5739 1 Inf 2 0 3 0 gaaaatgcca 5740 1 Inf 3 0 4 0 NM_016710 refGene chrX 98936465 - 150790 graph_last 0 4 gaaaatgctg 5741 1 Inf 2 0 3 0 NM_025382 refGene chr4 133658415 - 98024 graph_last l 5 32 gaaaattgtc 5742 1 0.416666666666667 5 12 6 4 NM_177911 refGene chr9 125472087 - 142375 graph_last l 21 52 gaaacaatgc 5743 1 1 3 3 4 1 NM_027280 refGene chr8 89494165 + 132138 graph_last l 4 35 gaaacacaga 5744 1 0.666666666666667 2 3 3 1 gaaacagcag 5745 1 Inf 2 0 3 0 gaaacaggat 5746 1 Inf 2 0 3 0 gaaacagtgg 5747 1 Inf 2 0 3 0 gaaacattct 5748 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011185 refGene chr17 15145003 + 57300 graph_last l 2 9 gaaaccactg 5749 1 Inf 3 0 4 0 gaaaccagga 5750 1 0.666666666666667 2 3 2 1 gaaacctgtc 5751 1 Inf 4 0 5 0 gaaacgagag 5752 1 1.33333333333333 8 6 10 2 genomic chr8 125233281 + 0 unique_long l 41 105 gaaacgcaga 5753 1 0.583333333333333 7 12 9 4 gaaactaaaa 5754 1 Inf 3 0 4 0 NM_010931 refGene chr17 56251540 + 60221 graph_last 0 10 gaaactaaac 5755 1 Inf 3 0 4 0 gaaactgaac 5756 1 Inf 3 0 4 0 gaaacttgct 5757 1 Inf 2 0 3 0 gaaacttggg 5758 1 Inf 5 0 7 0 gaaagaaagc 5759 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_028355 refGene chr4 106273974 + 95845 graph_last 1 3 gaaagaaatt 5760 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_009803 refGene chr1 175076870 - 8438 graph_last l 16 77 gaaagaggga 5761 1 1.66666666666667 5 3 7 1 gaaagcaaaa 5762 1 Inf 2 0 3 0 NM_009357 refGene chr6 84896240 - 114355 graph_last l 6 32 gaaagcactc 5763 1 Inf 3 0 4 0 NM_028250 refGene chr1 159027420 + 7414 graph_last l 5 22 gaaagccctc 5764 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_009572 refGene chr15 59317132 - 47200 graph_last l 37 72 gaaagctcaa 5765 1 Inf 5 0 7 0 NM_145517 refGene chr1 54618708 - 2355 graph_last 3 13 gaaaggaagc 5766 1 Inf 4 0 5 0 NM_027493 refGene chr14 24529140 + 40010 graph_last l 12 26 gaaaggaggt 5767 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_007965 refGene chr12 104251129 - 31087 graph_last l 5 20 gaaaggccac 5768 1 Inf 2 0 3 0 gaaaggcgtg 5769 1 Inf 2 0 3 0 gaaagggagg 5770 1 1.16666666666667 7 6 9 2 gaaagggatg 5771 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_018799 refGene chr4 128521641 + 97495 graph_last l 10 55 gaaagggctg 5772 1 0.666666666666667 6 9 8 3 gaaagttact 5773 1 Inf 4 0 5 0 NM_007470 refGene chr16 31003726 - 52787 graph_last l 293 627 gaaagttggc 5774 1 0.666666666666667 2 3 2 1 gaaagtttct 5775 1 Inf 2 0 3 0 NM_026131 refGene chr13 55284194 - 35158 graph_last l 60 150 gaaataaaca 5776 1 0.666666666666667 2 3 3 1 gaaataaagt 5777 1 0.5 3 6 4 2 gaaataaatg 5778 1 0.666666666666667 2 3 3 1 gaaataataa 5779 1 0.666666666666667 2 3 2 1 gaaataatgt 5780 1 0.833333333333333 5 6 6 2 gaaataattt 5781 1 0.666666666666667 2 3 3 1 gaaatacatt 5782 1 Inf 2 0 3 0 gaaatacctt 5783 1 Inf 2 0 3 0 NM_023879 refGene chr14 44042280 - 41170 graph_last 0 4 gaaatagtgg 5784 1 Inf 2 0 3 0 NM_010906 refGene chr8 85571676 - 131845 graph_second l 7 12 gaaatatccc 5785 1 1 3 3 4 1 genomic chr2 70313241 - 0 unique_long l 2 9 gaaatccaaa 5786 1 Inf 3 0 4 0 gaaatcccaa 5787 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_011125 refGene chr2 165452995 + 81322 graph_last l 16 52 gaaatcctca 5788 1 0.666666666666667 2 3 3 1 gaaatctggc 5789 1 1 3 3 4 1 AK129377 knownGene chr5 23453821 - 101201 graph_last l 8 18 gaaatcttcc 5790 1 Inf 2 0 3 0 NM_021372 refGene chr11 20551640 + 18076 graph_last 5 30 gaaatgagca 5791 1 0.666666666666667 2 3 2 1 gaaatgctgc 5792 1 0.416666666666667 5 12 6 4 gaaatggcct 5793 1 Inf 5 0 6 0 NM_010905 refGene chr4 97160444 + 95218 graph_last 1 8 gaaatgggga 5794 1 Inf 3 0 4 0 NM_178800 refGene chr7 119655881 + 125235 graph_last l 4 16 gaaatggggc 5795 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_009679 refGene chr16 20166291 - 52163 graph_last 0 10 gaaatggggg 5796 1 Inf 2 0 3 0 NM_011042 refGene chr15 104593003 + 50270 graph_last 85 352 gaaatgtaag 5797 1 0.775 31 40 41 14 NM_027782 refGene chr14 3507196 + 38868 graph_last l 13 28 gaaatgtctg 5798 1 0.333333333333333 2 6 3 2 gaaatgtctt 5799 1 Inf 2 0 3 0 NM_026329 refGene chr19 9214887 + 67913 graph_last l 48 165 gaaatgttgt 5800 1 2 12 6 16 2 gaaatttaaa 5801 1 0.804347826086957 37 46 48 16 NM_024438 refGene chr2 80993238 + 76197 graph_last 2 5 gaacaactcc 5802 1 Inf 2 0 3 0 NM_027890 refGene chr10 77780245 - 13687 graph_last 0 0 gaacaacttg 5803 1 Inf 2 0 3 0 NM_011294 refGene chr15 12136506 - 45363 graph_last 102 243 gaacaatgga 5804 1 1.5 18 12 24 4 gaacacctgg 5805 1 0.666666666666667 2 3 2 1 gaacacttct 5806 1 1 3 3 4 1 NM_133941 refGene chr7 125600101 - 125602 graph_last l 14 51 gaacagaacc 5807 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_172512 refGene chr3 97919894 - 87291 graph_last l 130 345 gaacaggcag 5808 1 0.9 36 40 47 14 gaacagtgtg 5809 1 Inf 4 0 5 0 gaacatattt 5810 1 Inf 3 0 4 0 NM_027360 refGene chr12 107529636 - 31397 graph_last 192 512 gaacatcact 5811 1 1.4 28 20 36 7 AK122446 knownGene chr6 123076982 - 116748 graph_last l 18 32 gaacatccct 5812 1 Inf 3 0 4 0 NM_008017 refGene chr4 52142560 + 93249 graph_last 1 2 gaacattgag 5813 1 Inf 2 0 3 0 NM_134037 refGene chr11 100060301 + 23847 graph_last 1 23 gaacatttca 5814 1 Inf 5 0 6 0 gaaccaaccc 5815 1 Inf 3 0 4 0 gaacccaaca 5816 1 1.66666666666667 5 3 7 1 gaaccctgag 5817 1 0.916666666666667 11 12 15 4 NM_016679 refGene chr9 21799363 - 135629 graph_last 1 45 gaaccctgtc 5818 1 1 3 3 4 1 gaaccttttt 5819 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_015792 refGene chr2 11746392 - 72011 graph_last l 12 40 gaacgcactg 5820 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_016723 refGene chr14 94522924 + 43717 graph_last l 26 82 gaacgcgacc 5821 1 0.571428571428571 8 14 11 5 NM_008946 refGene chr11 70098721 + 21147 graph_last b 35 205 gaacgcgacg 5822 1 0.758620689655172 22 29 29 10 NM_023564 refGene chr11 69426158 + 21080 graph_last 0 16 gaacgctggg 5823 1 Inf 5 0 7 0 NM_011550 refGene chr11 100755085 + 23932 graph_last l 15 33 gaactaactg 5824 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_013897 refGene chr9 52641811 + 137562 graph_last l 39 114 gaactatgtt 5825 1 0.833333333333333 5 6 6 2 gaactcaatg 5826 1 0.666666666666667 2 3 2 1 BB769017 all_est chr18 46668174 - 64566 graph_last l 4 18 gaactgattg 5827 1 Inf 2 0 3 0 NM_144879 refGene chr1 194682531 + 9611 graph_last 2 25 gaactgtaat 5828 1 Inf 4 0 5 0 NM_019763 refGene chr4 140346870 - 98583 graph_last l 5 24 gaactgtcgc 5829 1 Inf 3 0 4 0 gaactgttgg 5830 1 Inf 2 0 3 0 gaacttaaag 5831 1 1 3 3 4 1 NM_174997 refGene chr1 35501828 - 1439 graph_last l 16 91 gaacttatgt 5832 1 2.66666666666667 8 3 11 1 NM_134469 refGene chr3 91299823 - 86769 graph_last 29 130 gaacttgcaa 5833 1 0.647058823529412 11 17 14 6 NM_133971 refGene chr8 12333881 - 127998 graph_last l 7 23 gaactttgga 5834 1 0.444444444444444 4 9 5 3 gaagaaaaca 5835 1 0.666666666666667 2 3 3 1 gaagaaagaa 5836 1 1.33333333333333 4 3 5 1 gaagaaatca 5837 1 0.666666666666667 6 9 8 3 NM_025690 refGene chr9 73064483 + 139145 graph_last l 5 18 gaagaagcaa 5838 1 1.66666666666667 5 3 6 1 gaagaaggaa 5839 1 0.333333333333333 2 6 3 2 AK078240 knownGene chr2 59495398 + 74840 graph_last l 116 162 gaagaataat 5840 1 1.33333333333333 4 3 5 1 gaagacccag 5841 1 Inf 2 0 3 0 NM_028177 refGene chr7 114172041 - 124850 graph_last 56 165 gaagacgaat 5842 1 0.666666666666667 2 3 2 1 gaagacgacg 5843 1 0.416666666666667 5 12 7 4 NM_008831 refGene chr11 95264137 + 23305 graph_last 1 32 gaagacttcc 5844 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_008478 refGene chrX 63457577 - 149204 graph_last l 13 55 gaagacttga 5845 1 0.888888888888889 8 9 10 3 NM_026170 refGene chr17 26263613 + 58032 graph_last l 54 99 gaagagacgc 5846 1 0.833333333333333 5 6 6 2 gaagagataa 5847 1 Inf 4 0 5 0 gaagagattc 5848 1 0.333333333333333 2 6 3 2 NM_145066 refGene chr6 13631060 - 110464 graph_last l 5 21 gaagagcatt 5849 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_028774 refGene chr5 144936667 + 108523 graph_last l 11 32 gaagagcgtc 5850 1 Inf 2 0 3 0 gaagagctga 5851 1 Inf 2 0 3 0 NM_173182 refGene chr3 28279486 - 83767 graph_second 0 3 gaagaggcca 5852 1 Inf 2 0 3 0 gaagataggg 5853 1 0.666666666666667 2 3 2 1 gaagatgagc 5854 1 0.857142857142857 12 14 16 5 gaagatggag 5855 1 1.33333333333333 12 9 16 3 gaagattact 5856 1 Inf 5 0 6 0 NM_023149 refGene chr18 84379726 - 66578 graph_last 22 83 gaagcaccag 5857 1 1.33333333333333 8 6 11 2 NM_007687 refGene chr19 5351164 + 67562 graph_last 686 2388 gaagcaggac 5858 1 0.980314960629921 249 254 325 88 gaagcaggcc 5859 1 0.666666666666667 2 3 3 1 gaagccaact 5860 1 Inf 2 0 3 0 gaagccactc 5861 1 Inf 2 0 3 0 gaagccaggg 5862 1 2.66666666666667 8 3 11 1 AI509169 all_est chr15 86611376 - 48990 graph_last l 9 58 gaagccagtg 5863 1 1.33333333333333 8 6 11 2 gaagccatcc 5864 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_010310 refGene chr2 174691376 + 81983 graph_last 1 8 gaagcctccc 5865 1 Inf 2 0 3 0 gaagctctgg 5866 1 Inf 3 0 4 0 gaagctgaag 5867 1 Inf 4 0 5 0 gaaggacaaa 5868 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011817 refGene chr13 51592324 + 34899 graph_last l 5 27 gaaggaccct 5869 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_025875 refGene chr3 99406370 + 87482 graph_last 7 30 gaaggactaa 5870 1 Inf 5 0 7 0 NM_010110 refGene chrX 88985507 + 150221 graph_last l 4 32 gaaggagctg 5871 1 1.33333333333333 8 6 11 2 NM_009278 refGene chr2 70161031 + 75501 graph_last l 42 83 gaaggaggac 5872 1 Inf 3 0 4 0 NM_175229 refGene chr17 23415303 + 57745 graph_last 16 49 gaaggagtct 5873 1 0.555555555555556 5 9 6 3 gaaggagtta 5874 1 1.22222222222222 11 9 14 3 NM_009951 refGene chr11 95546809 - 23338 graph_last 0 9 gaaggatggg 5875 1 Inf 5 0 6 0 NM_146036 refGene chr12 83511063 + 30015 graph_second 3 8 gaaggccgtg 5876 1 Inf 2 0 3 0 NM_010048 refGene chr16 17445588 - 51970 graph_last l 28 55 gaaggcctct 5877 1 1.33333333333333 4 3 5 1 gaagggatga 5878 1 Inf 2 0 3 0 NM_007964 refGene chr5 106923005 - 105612 graph_last l 5 22 gaagggatgt 5879 1 Inf 4 0 5 0 NM_011947 refGene chr11 105820324 + 24455 graph_last l 2 13 gaagggccaa 5880 1 Inf 2 0 3 0 NM_175366 refGene chr7_random 13762587 + 126800 graph_last l 4 18 gaagggccag 5881 1 3 9 3 12 1 NM_026620 refGene chr2 117520320 + 78246 graph_last l 3 11 gaaggggacg 5882 1 0.666666666666667 2 3 3 1 AK080973 knownGene chr4 74395566 - 94336 graph_last l 27 53 gaagggtatt 5883 1 0.5 3 6 4 2 NM_139140 refGene chr15 101065191 + 49881 graph_last 2 11 gaaggtagtg 5884 1 Inf 3 0 4 0 BB672728 all_est chr9 15197267 - 135332 graph_last l 2 23 gaaggtgctt 5885 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_178733 refGene chr7 23951234 - 119894 graph_last 3 16 gaagtaataa 5886 1 0.5 3 6 4 2 NM_028320 refGene chr1 137342255 + 6416 graph_last l 21 46 gaagtacgtc 5887 1 Inf 2 0 3 0 NM_172662 refGene chr2 45060147 + 74209 graph_last 0 2 gaagtataag 5888 1 Inf 2 0 3 0 gaagtcaaaa 5889 1 0.888888888888889 8 9 10 3 gaagtcaata 5890 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_178670 refGene chr18 77765337 - 66230 graph_last l 6 16 gaagtcacat 5891 1 Inf 3 0 4 0 NM_009278 refGene chr2 70156794 + 75501 graph_last l 5 16 gaagtcagtg 5892 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_010907 refGene chr12 50839559 - 28042 graph_last 2 13 gaagtcattg 5893 1 Inf 2 0 3 0 NM_172768 refGene chr9 41413125 - 136743 graph_last l 39 128 gaagtccagt 5894 1 1.33333333333333 8 6 10 2 NM_011605 refGene chr10 93515597 - 14837 graph_last 0 5 gaagtcctac 5895 1 Inf 2 0 3 0 NM_011809 refGene chr16 97545956 + 56313 graph_last l 22 49 gaagtcctca 5896 1 0.666666666666667 2 3 3 1 gaagtgacag 5897 1 1 3 3 4 1 gaagtgaccc 5898 1 1.33333333333333 8 6 10 2 NM_007658 refGene chr9 112493430 + 141497 graph_last 0 6 gaagtgaggc 5899 1 Inf 3 0 4 0 gaagtgtaag 5900 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_010367 refGene chr6 95195006 - 115188 graph_last l 6 15 gaagtgtatg 5901 1 Inf 3 0 4 0 CF729916 all_est chr5 28735759 + 101489 graph_last 0 20 gaagtgtgag 5902 1 1.33333333333333 4 3 5 1 gaagtgtggg 5903 1 Inf 2 0 3 0 NM_019697 refGene chr6 21587070 + 110721 graph_last l 13 26 gaagttgcca 5904 1 Inf 2 0 3 0 gaagttttta 5905 1 2 6 3 8 1 NM_020508 refGene chr17 31857496 - 58619 graph_last l 16 53 gaataaacac 5906 1 0.833333333333333 5 6 7 2 gaataaagag 5907 1 3.66666666666667 11 3 14 1 gaataactgc 5908 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AF172088 knownGene chr7 110054749 - 124600 graph_last l 7 21 gaataagata 5909 1 Inf 2 0 3 0 gaataaggtg 5910 1 Inf 2 0 3 0 NM_010928 refGene chr3 101035351 + 87584 graph_last 0 2 gaatagagac 5911 1 Inf 2 0 3 0 gaatagataa 5912 1 1.66666666666667 5 3 6 1 NM_011490 refGene chr2 167562060 - 81504 graph_last l 14 34 gaatataagt 5913 1 Inf 4 0 5 0 gaatatggaa 5914 1 Inf 3 0 4 0 gaatatgttc 5915 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_010243 refGene chr4 25605115 - 91868 graph_last 7 13 gaatcatttg 5916 1 Inf 3 0 4 0 gaatccaact 5917 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_177616 refGene chr11 4039068 + 17252 graph_last l 3 33 gaatctattt 5918 1 0.5 3 6 4 2 gaatctttag 5919 1 0.833333333333333 5 6 6 2 gaatctttcc 5920 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_011710 refGene chr12 104429059 - 31112 graph_last l 21 48 gaatgagcct 5921 1 0.666666666666667 2 3 3 1 BC049262 knownGene chr10 101633849 + 15243 graph_last 0 1 gaatgctgat 5922 1 Inf 2 0 3 0 gaatgtaaat 5923 1 Inf 4 0 5 0 NM_009536 refGene chr11 75336796 + 21637 graph_last l 188 733 gaattaacat 5924 1 1.4 56 40 73 14 AK086101 all_mrna chr15 19169680 + 45575 graph_last 0 35 gaattcaaaa 5925 1 0.555555555555556 5 9 7 3 NM_007564 refGene chr12 76095440 + 29355 graph_last 3 11 gaattcaaag 5926 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_013688 refGene chr17 44936211 - 59482 graph_last l 29 104 gaattccaag 5927 1 0.444444444444444 4 9 5 3 NM_015803 refGene chr14 51373185 - 41718 graph_last l 7 21 gaattgcacg 5928 1 Inf 2 0 3 0 NM_018743 refGene chr8 22040354 - 128571 graph_last l 10 83 gaattgcgga 5929 1 0.75 9 12 12 4 gaattggaac 5930 1 Inf 2 0 3 0 NM_011431 refGene chr11 102502400 - 24135 graph_last l 7 45 gaattttatt 5931 1 1.66666666666667 5 3 6 1 gacaaactgt 5932 1 Inf 2 0 3 0 CA320703 all_est chr2 22896745 + 72631 graph_last l 46 101 gacaaaggat 5933 1 Inf 2 0 3 0 AF053980 knownGene chr11 7076056 + 17536 graph_last l 41 119 gacaaagggg 5934 1 0.333333333333333 2 6 3 2 gacaaaggtg 5935 1 Inf 5 0 7 0 gacaaataaa 5936 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_020615 refGene chr2 9997538 - 71910 graph_last l 130 447 gacaacgcca 5937 1 1.30769230769231 34 26 45 9 NM_025690 refGene chr9 73062584 + 139145 graph_last l 7 26 gacaactgat 5938 1 1 3 3 4 1 gacaacttca 5939 1 Inf 2 0 3 0 gacaagaagg 5940 1 Inf 2 0 3 0 NM_182650 refGene chr6 51936062 - 112726 graph_last l 32 83 gacaagtata 5941 1 0.529411764705882 9 17 12 6 gacaagtccc 5942 1 Inf 2 0 3 0 NM_029761 refGene chr2_random 1107769 - 82579 graph_last 11 66 gacaataaaa 5943 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_018759 refGene chr5 104989290 + 105485 graph_last l 4 9 gacaatcaca 5944 1 Inf 2 0 3 0 NM_025320 refGene chr16 31659899 - 52869 graph_last l 39 89 gacaatcaga 5945 1 1.16666666666667 7 6 9 2 NM_199009 refGene chr7 98025386 - 123922 graph_last l 3 14 gacaatcagg 5946 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_008323 refGene chrX 63382172 - 149194 graph_last 27 68 gacaatgaaa 5947 1 0.666666666666667 2 3 2 1 genomic chr6 101890413 - 0 unique_long l 3 9 gacaatgctc 5948 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_011551 refGene chr11 101970178 - 24060 graph_last l 24 52 gacaatggac 5949 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_133701 refGene chr2 181503626 + 82502 graph_last l 34 60 gacaatgggc 5950 1 Inf 3 0 4 0 gacaatttgg 5951 1 Inf 3 0 4 0 gacacagagg 5952 1 Inf 5 0 6 0 NM_172282 refGene chr8 13956330 - 128119 graph_last 1 6 gacacagcag 5953 1 Inf 2 0 3 0 NM_019402 refGene chr14 45986924 + 41330 graph_last l 9 27 gacacatctc 5954 1 0.333333333333333 2 6 3 2 AK129332 knownGene chr12 46823497 + 27708 graph_last 0 8 gacaccagaa 5955 1 Inf 2 0 3 0 NM_017406 refGene chr17 34302091 + 58879 graph_last l 16 48 gacaccaggg 5956 1 1.66666666666667 5 3 7 1 gacacccagg 5957 1 1.66666666666667 5 3 6 1 gacacccatt 5958 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_178060 refGene chr11 98350996 + 23676 graph_last l 5 12 gacaccgtcc 5959 1 Inf 3 0 4 0 gacacgagtc 5960 1 Inf 3 0 4 0 gacactcgtg 5961 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_175217 refGene chr5 141386267 - 108208 graph_last l 32 83 gacactggct 5962 1 1.33333333333333 4 3 5 1 NM_178728 refGene chr5 19763447 + 100910 graph_last 7 29 gacagaacat 5963 1 2.33333333333333 7 3 9 1 NM_024268 refGene chr8 124262829 + 134110 graph_last l 12 32 gacagacgga 5964 1 Inf 3 0 4 0 AF008649 knownGene chr17 36825307 + 59106 graph_last l 173 341 gacagatgga 5965 1 0.5 6 12 8 4 gacagatttt 5966 1 Inf 2 0 3 0 NM_010308 refGene chr8 95243976 + 132442 graph_last l 4 25 gacagcagcc 5967 1 Inf 5 0 6 0 gacagccagg 5968 1 0.666666666666667 4 6 5 2 BY721317 all_est chr5_random 24593139 + 109488 graph_last l 5 22 gacagccctg 5969 1 0.5 3 6 4 2 NM_010025 refGene chrX 132123021 + 151844 graph_second 0 4 gacaggcagt 5970 1 Inf 2 0 3 0 AK129454 knownGene chr11 23472540 - 18292 graph_last l 15 56 gacaggcatt 5971 1 1.22222222222222 11 9 14 3 NM_028020 refGene chr4 154020423 + 99824 graph_last l 9 50 gacagtaatg 5972 1 0.833333333333333 5 6 6 2 gacagtgtgg 5973 1 0.666666666666667 2 3 2 1 gacagtgttc 5974 1 Inf 2 0 3 0 NM_010628 refGene chr9 113124542 + 141572 graph_last 0 5 gacagttggg 5975 1 0.666666666666667 2 3 2 1 gacatagctg 5976 1 Inf 3 0 4 0 NM_010715 refGene chr7_random 30149648 - 127127 graph_last l 4 15 gacatctccc 5977 1 Inf 5 0 7 0 NM_181278 refGene chr13 55479556 - 35197 graph_last l 5 9 gacattaaaa 5978 1 Inf 2 0 3 0 NM_013691 refGene chr3 91451964 + 86787 graph_last l 16 56 gacattaaag 5979 1 Inf 3 0 4 0 NM_008708 refGene chr2 3247329 + 71475 graph_last l 19 63 gacattagtc 5980 1 1.16666666666667 7 6 9 2 gacattcttg 5981 1 Inf 3 0 4 0 gacattgatt 5982 1 0.571428571428571 8 14 11 5 NM_019686 refGene chr9 56661808 - 137777 graph_last l 20 59 gacatttcct 5983 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_016910 refGene chr11 84906272 + 22556 graph_last 1 33 gaccaaaaaa 5984 1 Inf 3 0 4 0 NM_010151 refGene chr13 76266506 - 36347 graph_second 2 5 gaccacatcc 5985 1 Inf 3 0 4 0 NM_017475 refGene chr4 122894155 + 97014 graph_last l 22 83 gaccacggtg 5986 1 1.66666666666667 5 3 7 1 NM_007459 refGene chr7 133751634 - 126113 graph_last 16 107 gaccacgtgg 5987 1 2.5 15 6 19 2 NM_010948 refGene chr4 132418597 - 97881 graph_last 4 11 gaccagcacc 5988 1 Inf 5 0 7 0 NM_133826 refGene chr1 5189337 + 121 graph_last l 50 149 gaccagtgga 5989 1 3.33333333333333 10 3 13 1 NM_010718 refGene chr11 3206463 + 17171 graph_last l 3 15 gaccatacaa 5990 1 1 3 3 4 1 NM_012008 refGene chrUn_random 73979332 - 145982 graph_last l 5 14 gaccatagaa 5991 1 Inf 2 0 3 0 gaccatccct 5992 1 3.66666666666667 11 3 14 1 NM_197989 refGene chr11 78321904 - 22000 graph_last l 30 63 gaccattgca 5993 1 Inf 3 0 4 0 NM_007783 refGene chr9 59908888 - 138073 graph_last 1 8 gacccaccta 5994 1 0.666666666666667 2 3 2 1 AI450247 all_est chr2 173485821 - 81884 graph_last 0 4 gacccagcaa 5995 1 Inf 2 0 3 0 NM_018877 refGene chr3 97996525 + 87305 graph_last l 9 24 gacccaggct 5996 1 Inf 3 0 4 0 gaccccagga 5997 1 Inf 2 0 3 0 gacccccggt 5998 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_178926 refGene chr17 56698621 - 60268 graph_last l 4 18 gaccctcagt 5999 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_133873 refGene chr4 145975375 - 99102 graph_last l 1 7 gaccctccac 6000 1 Inf 3 0 4 0 NM_146041 refGene chr13 31707643 - 33757 graph_last l 3 12 gaccctcgac 6001 1 1 3 3 4 1 NM_013457 refGene chr5 33178320 + 101907 graph_last l 14 23 gaccctggca 6002 1 0.666666666666667 2 3 2 1 NM_031408 refGene chr5_random 31025212 + 109595 graph_last l 13 32 gacccttggg 6003 1 0.833333333333333 5 6 7 2 NM_016884 refGene chr14 43945078 + 41160 graph_last 0 18 gaccgaggat 6004 1 1.66666666666667 5 3 6 1 gaccgcaggg 6005 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_145625 refGene chr15 104303755 - 50229 graph_last 3 9 gaccgctatg 6006 1 Inf 2 0 3 0 gaccgctgca 6007 1 0.666666666666667 4 6 5 2 NM_145622 refGene chrUn_random 76317974 - 146151 graph_last l 4 16 gaccgtgagt 6008 1 Inf 2 0 3 0 NM_176947 refGene chr12 60629241 - 28364 graph_last l 16 58 gaccgtggag 6009 1 3.66666666666667 11 3 14 1 NM_025633 refGene chr2 71866025 + 75631 graph_last l 4 19 gaccgtggtc 6010 1 0.666666666666667 2 3 3 1 gaccgtggtg 6011 1 1.66666666666667 10 6 13 2 NM_026274 refGene chr8 95942168 + 132503 graph_last 1 16 gacctatttc 6012 1 Inf 3 0 4 0 NM_007933 refGene chr11 70232702 + 21160 graph_last l 2 7 gacctcattc 6013 1 0.666666666666667 2 3 3 1 NM_153126 refGene chr2 103957579 - 77477 graph_last 3 16 gacctctctc 6014 1 Inf 3 0 4 0 gacctgaaac 6015 1 Inf 2 0 3 0 NM_008568 refGene chr5 136635605 + 107939 graph_last l 68 253 gacctgagta 6016 1 2.5 15 6 20 2 NM_053272 refGene chr4 105446521 + 95749 graph_last l 15 34 gacctgctct 6017 1 1.66666666666667 5 3 7 1 gacctggagc 6018 1 Inf 3 0 4 0 NM_010123 refGene chr19 60550365 + 70976 graph_last l 5 23 gacctgtggg 6019 1 1